Conformation and dynamics of arylthiol self-assembled monolayers on Au(111)

Langmuir

Volumn 23, Issue 24, 2007, Pages 12208-12216

  Dirama, Taner E ^a   Johnson, Joel A ^b  

^a UNIVERSAL TECHNOLOGY CORPORATION   (United States)

^b AIR FORCE RESEARCH LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MOLECULAR CONFORMATIONS; PHENYL GROUPS; THIOL MOLECULES;

CONFORMATIONS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; GOLD COMPOUNDS; MOLECULAR DYNAMICS; STRUCTURE (COMPOSITION);

SELF ASSEMBLED MONOLAYERS;

GOLD; HYDROCARBON; THIOL DERIVATIVE;

ARTICLE; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; CONFORMATION; QUANTUM THEORY; SCANNING ELECTRON MICROSCOPY; SURFACE PROPERTY; TIME;

COMPUTER SIMULATION; GOLD; HYDROCARBONS, CYCLIC; MICROSCOPY, ELECTRON, SCANNING; MOLECULAR CONFORMATION; QUANTUM THEORY; SULFHYDRYL COMPOUNDS; SURFACE PROPERTIES; TIME FACTORS;

EID: 36749039819     PISSN: 07437463     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/la7015963     Document Type: Article

References (47)

1. Adams, D. M.; Brus, L.; Chidsey, C. E. D.; Creager, S.; Creutz, C.; Kagan, C. R.; Kamat, P. V.; Lieberman, M.; Lindsay, S.; Marcus, R. A.; Metzger, R. M.; Michel-Beyerle, M. E.; Miller, J. R.; Newton, M. D.; Rolison, D. R.; Sankey, O.; Schanze, K. S.; Yardley, J.; Zhu, X. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 6668.
2. Gooding, J. J.; Mearns, F.; Yang, W.; Liu, J. Electroanalysls 2003, 15, 81.
3. Chaki, N. K.; Vijayamohanan, K. Biosens. Bioelectron. 2002, 17, 1.
4. Xia, Y.; Whitesides, G. M. Angew. Chem., Int. Ed. 1998, 37, 550.
5. Lio, A.; Charych, D. H.; Salmeron, M. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 3800.
6. Scherer, J.; Vogt, M. R.; Magnussen, O. M.; Behm, R. J. Langmuir 1997, 13, 7045.
7. Nitzan, A.; Ratner, M. A. Science 2003, 300, 1384.
8. Fenter, P.; Eisenberger, P.; Liang, K. S. Phys. Rev. Lett. 1993, 70, 2447.
9. Mar, W.; Klein, M. L. Langmuir 1994, 10, 9.
10. Ulman, A. Chem. Rev. 1996, 96, 1533.
11. Schreiber, F. Prog. Surf. Sci. 2000, 65, 151.
12. Love, J. C.; Estroff, L. A.; Kriebel, J. K.; Nuzzo, R. G.; Whitesides, G. M. Chem. Rev. 2005, 105, 1103.
13. Vericat, C.; Vela, M. E.; Salvarezza, R. C. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 3258.
14. Vericat, C.; Vela, M. E.; Benitez, G. A.; Gago, J. A. M.; Torrelles, X.; Salvarezza, R. C. J. Phys.: Condens. Matter 2006, 18, R867.
15. Kornilovitch, P. E.; Bratkovsky, A. M. Phys. Rev. B 2001, 64, 195413.
16. Krstic, P. S.; Dean, D. J.; Zhang, X.-G.; Keffer, D.; Leng, Y. S.; Cummings, P. T.; Wells, J. C. Comput. Mater. Sci. 2003, 28, 321.
17. Hong, S.; Reifenberger, R.; Tian, W.; Datta, S.; Henderson, J. I.; Kubiak, C. P. Superlattices Microstruct. 2000, 28, 289.
18. Jung, H. H.; Won, Y. D.; Shin, S.; Kim, K. Langmuir 1999, 15, 1147.
19. Kim, Y.-H.; Jang, S. S.; Goddard, W. A., III. J. Chem. Phys. 2005, 122, 244703.
20. Collard, D. M.; Fox, M. A. Langmuir 1991, 7, 1192.
21. Schlenoff, J. B.; Li, M.; Ly, H. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12528.
22. Bumm, L. A.; Arnold, J. J.; Cygan, M. T.; Dunbar, T. D.; Burgin, T. P.; Jones, L., II; Aliara, D. L.; Tour, J. M.; Weiss, P. S. Science 1996, 271, 1705.
23. Ramachandran, G. K.; Hopson, T. J.; Rawlett, A. M.; Nagahara, L. A.; Primak, A.; Lindsay, S. M. Science 2003, 300, 1413.
24. Howell, S.; Kuila, D.; Kasibhatla,B.; Kubiak, C. P.; Janes, D.; Reifenberger, R. Langmuir 2002, 18, 5120.
25. Vandamme, N.; Schouteden, K.; Snauwaert, J.; Lievens, P.; Van Haesendonck, C. Surf. Sci. 2006, 600 2894.
26. Barriet, D.; Yam, C. M.; Shmakova, O. E.; Jamison, A. C.; Lee, T. R. Langmuir 2007, 23, 8866.
27. Abduaini, A.; Kera, S.; Aoki, M.; Okudaira, K. K.; Ueno, N.; Harada, Y. J. Electron Spedrosc. Relat. Phenom. 1998, 88-97, 849.
28. Pugmire, D. L.; Tarlov, M. J.; van Zee, R. D.; Naciri, J. Langmuir 2003, 19, 3720.
29. Wang, J.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157.
30. Dirama, T. E. Ph.D. thesis, University of Akron, Akron, OH, 2005.
31. Mayo, S. L.; Olafson, B. D.; Goddard, W. A. J. Phys. Chem. 1990, 94, 8897.
32. Jang, S. S.; Jang, Y. H.; Kim, Y. H.; Goddard, W. A.; Flood, A. H.; Laursen, B. W.; Tseng, H. R.; Stoddart, J. F.; Jeppesen, J. O.; Choi, J. W.; Steuerman, D. W.; Delonno, E.; Heath, J. R. J. Am. Chem. Soc 2005, 127, 1563.
33. Lavrich, D. J.; Wetterer, S. M.; Bernasek, S. L.; Scoles, G. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3456.
34. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A.; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024.
35. T. E. Dirama, S. V. Neely, and J. A. Johnson, unpublished results.
36. Fenter, P.; Schreiber, F.; Zhou, L.; Eisenberger, P.; Forrest, S. R. Phys. Rev. B 1997, 56, 3046.
37. Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, T. E., III; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Merz, K. M.; Wang, B.; Pearlman, D. A.; Crowley, M.; Brozell, S.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Beroza, P.; Schafmeister, C.; Caldwell, J. W.; Ross, W. S.; Kollman, P. A. AMBER 8, University of California, San Francisco, CA, 2004.
38. Jakalian, A.; Bush, B. L.; Jack, D. B.; Bayly, C. I. J. Comput. Chem. 2000, 21, 132.
39. Tao, Y. T.; Wu, C. C.; Eu, J. Y.; Lin, W. L.; Wu, K. C.; Chen, C. H. Langmuir 1997, 13, 4018.
40. Plimpton, S. J. Comput. Phys. 1995, 117, 1.
41. Hockney, R. W.; Eastwood, J. W. Computer Simulation Using Particles; McGraw-Hill: New York, 1981.
42. Verlet, L. Phys. Rev. 1967, 159, 98.
43. Nosé, S. J. Chem. Phys. 1984, 81, 511.
44. Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695.
45. Leung, T. Y. B.; Schwartz, B.; Scoles, G.; Schreiber, F.; Ulman, A. Surf. Sci. 2000, 458, 34.
46. Yourdshahyan, Y.; Zhang, H. K.; Rappe, A. M. Phys. Rev. B 2001, 63, 081405.
47. Dhirani, A. A.; Zehner, R. W.; Hsung, R. P.; Guyot-Sionnest, P.; Sita, L. R. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3319.