Intramolecular disulfide bridges as a phototrigger to monitor the dynamics of small cyclic peptides

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 38, 2007, Pages 11297-11302

  Kolano, Christoph ^a   Helbing, Jan ^a   Bucher, Götz ^b   Sander, Wolfram ^b   Hamm, Peter ^a  

^a UNIVERSITY OF ZURICH   (Switzerland)

^b RUHR UNIVERSITY BOCHUM   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

INFRARED SPECTROSCOPY; PEPTIDES; VIBRATIONAL SPECTRA;

CYSTEINYL RADICALS; PEPTIDE BACKBONE; PHOTOTRIGGERS;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 35148887268     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp074184g     Document Type: Article

References (63)

1. Williams, S.; Causgrove, T. P.; Gilmanshin, R.; Fang, K. S.; Callender, R. H.; Woodruff, W. H.; Dyer, R. B. Biochemistry 1996, 35, 691.
2. Kolano, C. Nachweis und Charakterisierung reaktiver Intermediate aus den Bereichen der Organischen, Bioorganischen und Metallorganischen Chemie mittels zeitaufgelöster STEP/SCAN FT-IR Spektroskopie. Dissertation, Ruhr-Universität Bochum, 2003.
3. Hermann, H.; Grevels, F. W.; Henne, A.; Schaffner, K. J. Phys. Chem. 1982, 86, 5151.
4. Lindqvist, L. C. R. Hebd. Seances Acad. Sci., Ser. C 1966, 263, 852.
5. Gerwert, K.; Hess, B.; Michel, H.; Buchanan, S. FEBS Lett. 1988, 232, 303.
6. Balakrishnan, G.; Hu, Y.; Case, M. A.; Spiro, T. G. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 19877.
7. Mikhonin, A. V.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13789.
8. Jas, G. S.; Eaton, W. A.; Hofrichter, J. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 261.
9. Ervin, J.; Sabelko, J.; Gruebele, M. J Photochem. Photobiol., B 2000, 54, 1.
10. Cordes, T.; Weinrich, D.; Kempa, S.; Riesselmann, K.; Herre, S.; Hoppmann, C.; Rueck-Braun, K.; Zinth, W. Chem. Phys. Lett. 2006, 428, 167.
11. Rehm, S.; Lenz, M. O.; Mensch, S.; Schwalbe, H.; Wachtveitl, J. Chem. Phys. 2006, 323, 28.
12. Erdelyi, M.; Karlen, A.; Gogoll, A. Chem. - Eur. J. 2005, 12, 403.
13. Fierz, B.; Satzger, H.; Root, C.; Gilch, P.; Zinth, W.; Kiefhaber, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 2163.
14. Satzger, H.; Root, C.; Renner, C.; Behrendt, R.; Moroder, L.; Wachtveitl, J.; Zinth, W. Chem. Phys. Lett. 2004, 396, 191.
15. Bredenbeck, J.; Helbing, J.; Kumita, J. R.; Woolley, G. A.; Hamm, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 2379.
16. Aemissegger, A.; Krautler, V.; van Gunsteren, W. F.; Hilvert, D. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 2929.
17. Helbing, J.; Bregy, H.; Bredenbeck, J.; Pfister, R.; Hamm, P.; Huber, R.; Wachtveitl, J.; De Vico, L.; Olivucci, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8823.
18. Volk, M.; Kholodenko, Y.; Lu, H. S. M.; Gooding, E. A.; DeGrado, W. F.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 8607.
19. Bredenbeck, J.; Helbing, J.; Sieg, A.; Schrader, T.; Zinth, W.; Renner, C.; Behrendt, R.; Moroder, L.; Wachtveitl, J.; Hamm, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 6452.
20. Pieroni, O.; Fissi, A.; Angelini, N.; Lenci, F. Acc. Chem. Res. 2001, 34, 9.
21. Mayer, G.; Heckel, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 4900.
22. Pelliccioli Anna, P.; Wirz, J. Photochem. Photobiol. Sci. 2002, 1, 441.
23. McCray, J. A.; Trentham, D. R. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1989, 18, 239.
24. Helbing, J.; Bredenbeck, J.; Hamm, P. Biophys. J. 2003, 84, 482A.
25. Bredenbeck, J.; Helbing, J.; Behrendt, R.; Renner, C.; Moroder, L.; Wachtveitl, J.; Hamm, P. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 8654.
26. Allin, C.; Ahmadian, M. R.; Wittinghofer, A.; Gerwert, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 7754.
27. Allin, C.; Gerwert, K. Biochemistry 2001, 40, 3037.
28. Kolano, C.; Sander, W. Eur. J. Org. Chem. 2003, 1074.
29. Kolano, C.; Bucher, G.; Schade, O.; Grote, D.; Sander, W. J. Org. Chem. 2005, 70, 6609.
30. Vecchio, G.; Dose, K.; Salvatore, G. Eur. J. Biochem. 1968, 5, 422.
31. Permyakov, E. A.; Permyakov, S. E.; Deikus, G. Y.; Morozova-Roche, L. A.; Grishchenko, V. M.; Kalinichenko, L. P.; Uversky, V. N. Proteins: Struct. Funct. Gen. 2003, 51, 498.
32. Stubbe, J.; van der Donk, W. A. Chem. Rev. 1998, 98, 705.
33. Henriksen, T. Scand. J. Clin. Lab. Invest. Suppl. 1968, 106, 7.
34. Gaucher, G. M.; Mainman, B. L.; Armstrong, D. A. Can. J. Chem. 1973, 51, 2443.
35. Lu, H. S. M.; Volk, M.; Kholodenko, Y.; Gooding, E.; Hochstrasser, R. M.; DeGrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7173.
36. Volk, M. Eur. J. Org. Chem. 2001, 2605.
37. Kolano, C.; Helbing, J.; Kozinski, M.; Sander, W.; Hamm, P. Nature 2006, 444, 469.
38. Kolano, C.; Gomann, K.; Sander, W. Eur. J. Org. Chem. 2004, 4167.
39. Grant, D. W.; Stewart, J. H. Photochem. Photobiol. 1984, 40, 285.
40. Morine, G. H.; Kuntz, R. R. Photochem. Photobiol. 1981, 33, 1.
41. Bredenbeck, J.; Helbing, J.; Hamm, P. Rev. Sci. Instrum. 2004, 75, 4462.
42. Hamm, P.; Kaindl, R. A.; Stenger, J. Opt. Lett. 2000, 25, 1798.
43. Branik, M.; Kessler, H. Chem. Ber. 1975, 108, 2176.
44. Bats, J. W.; Fuess, H.; Kessler, H.; Schuck, R. Chem. Ber. 1980, 113, 520.
45. Rao, C. P.; Balaram, P.; Rao, C. N. R. Biopolymers 1983, 22, 2091.
46. Kessler, H. Angew. Chem. 1982, 94, 509;
47. Angew. Chem., Int. Ed. 1982, 21, 512.
48. Hamm, P.; Ohline, S. M.; Zinth, W. J. Chem. Phys. 1997, 106, 519.
49. Ogawa, A.; Doi, M.; Tsuchii, K.; Hirao, T. Tetrahedron Lett. 2001, 42, 2317.
50. Lassmann, G.; Kolberg, M.; Bleifuss, G.; Graslund, A.; Sjoberg, B. M.; Lubitz, W. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 2442.
51. Barron, L. B.; Waterman, K. C.; Filipiak, P.; Hug, G. L.; Nauser, T.; Schoneich, C. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2247.
52. Tsubomura, H.; Mulliken, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1960, 82, 5966.
53. Zhu, J.; Liu, Z.; Cao, W.; Feng, X. Chin. Sci. Bull 1998, 43, 1798.
54. Brownridge, S.; Passmore, J.; Sun, X. Can. J. Chem. 1998, 76, 1220.
55. Rozental, E.; Goldberg, M.; Basch, H.; Hoz, S. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2004, 674, 153.
56. Bucher, G.; Lu, C. Y.; Sander, W. ChemPhysChem 2005, 6, 2607.
57. Bent, D. V.; Hayon, E. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 2606.
58. Numerical Data and Functional Relationship in Science and Technology; Hellwege, K. H., Ed.; Landolt-Börnstein (New Series); Springer-Verlag: Berlin, 1998; Group II, Vol 18, Subvol. E2.
59. Wang, J.; Doubleday, C., Jr.; Turro, N. J. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 3962.
60. Doubleday, C., Jr.; Turro, N. J.; Wang, J. F. Acc. Chem. Res. 1989, 22, 199.
61. Barton, D. H. R.; Charpiot, B.; Ingold, K. U.; Johnston, L. J.; Motherwell, W. B.; Scaiano, J. C.; Stanforth, S. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3607.
62. Mutter, M. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 8307.
63. Huang, F.; Nau, W. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 2269.