Probability distribution analysis of single-molecule fluorescence anisotropy and resonance energy transfer

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 34, 2007, Pages 10253-10262

  Kalinin, Stanislav ^a   Felekyan, Suren ^a   Antonik, Matthew ^a,b   Seidel, Claus A M ^a  

^a HEINRICH HEINE UNIVERSITY   (Germany)

^b UNIVERSITY OF KANSAS   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANISOTROPY; BIOMOLECULES; FLUORESCENCE; RESONANCE;

ANISOTROPY HISTOGRAMS; PHOTON NUMBERS; PROBABILITY DISTRIBUTION ANALYSIS; SHOT NOISE BROADENING;

PROBABILITY DISTRIBUTIONS;

EID: 34548591465     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp072293p     Document Type: Article

References (40)

1. Deniz, A. A.; Dahan, M.; Grunwell, J. R.; Ha, T. J.; Faulhaber, A. E.; Chemla, D. S.; Weiss, S.; Schultz, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 3670-3675.
2. Ha, T. Methods 2001, 25, 78-86.
3. Schuler, B.; Lipman, E. A.; Eaton, W. A. Nature 2002, 419, 743-747.
4. Lipman, E. A.; Schüler, B.; Bakajin, O.; Eaton, W. A. Science 2003, 301, 1233-1235.
5. Rothwell, P. J.; Berger, S.; Kensch, O.; Felekyan, S.; Antonik, M.; Wöhrl, B. M.; Restle, T.; Goody, R. S.; Seidel, C. A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 1655-1660.
6. Margittai, M.; Widengren, J.; Schweinberger, E.; Schröder, G. F.; Felekyan, S.; Haustein, E.; König, M.; Fasshauer, D.; Grubmüller, H.; Jahn, R.; Seidel, C. A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 15516-15521.
7. Diez, M.; Zimmermann, B.; Börsch, M.; König, M.; Schweinberger, E.; Steigmiller, S.; Reuter, R.; Felekyan, S.; Kudryavtsev, V.; Seidel, C. A. M.; Gräber, P. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 135-141.
8. Schuler, B.; Lipman, E. A.; Steinbach, P. J.; Kumke, M.; Eaton, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 2754-2759.
9. Joo, C.; McKinney, S. A.; Nakamura, M.; Rasnik, I.; Myong, S.; Ha, T. Cell 2006, 126, 515-527.
10. Eggeling, C.; Berger, S.; Brand, L.; Fries, J. R.; Schaffer, J.; Volkmer, A.; Seidel, C. A. M. J. Biotechnol. 2001, 86, 163-180.
11. Kühnemuth, R.; Seidel, C. A. M. Single Mol. 2001, 2, 251-254.
12. Widengren, J.; Kudryavtsev, V.; Antonik, M.; Berger, S.; Gerken, M.; Seidel, C. A. M. Anal. Chem. 2006, 78, 2039-2050.
13. Kapanidis, A. N.; Lee, N. K.; Laurence, T. A.; Doose, S.; Margeat, E.; Weiss, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 8936-8941.
14. Lee, N. K.; Kapanidis, A. N.; Wang, Y.; Michalet, X.; Mukhopadhyay, J.; Ebright, R. H.; Weiss, S. Biophys. J. 2005, 88, 2939-2953.
15. Lee, N. K.; Kapanidis, A. N.; Koh, H. R.; Korlann, Y.; Ho, S. O.; Kim, Y.; Gassman, N.; Kim, S. K.; Weiss, S. Biophys. J. 2007, 92, 303-312.
16. Förster, T. Ann. Phys. 1948, 2, 55-75.
17. Haas, E. Chem. Phys. Chem. 2005, 6, 858-870.
18. Antonik, M.; Felekyan, S.; Gaiduk, A.; Seidel, C. A. M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 6970-6978.
19. Nir, E.; Michalet, X.; Hamadani, K. M.; Laurence, T. A.; Neuhauser, D.; Kovchegov, Y.; Weiss, S. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 22103-22124.
20. Watkins, L. P.; Chang, H. Y.; Yang, H. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 5191-5203.
21. Watkins, L. P.; Yang, H. Biophys. J. 2004, 86, 4015-4029.
22. Gopich, I.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 2005, 014707.
23. Kask, P.; Palo, K.; Ullmann, D.; Gall, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 13756-13761.
24. Forkey, J. N.; Quinlan, M. E.; Goldman, Y. E. Prog. Biophys. Mol. Biol. 2000, 74, 1-35.
25. Schaffer, J.; Volkmer, A.; Eggeling, C.; Subramaniam, V.; Striker, G.; Seidel, C. A. M. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 331-336.
26. Ha, T.; Laurence, T. A.; Chemla, D. S.; Weiss, S. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 6839-6850.
27. Rosenberg, S. A.; Quinlan, M. E.; Forkey, J. N.; Goldman, Y. E. Ace. Chem. Res. 2005, 38, 583-593.
28. Karolin, J.; Fa, M.; Wilczynska, M.; Ny, T.; Johansson, L. B. A. Biophys. J. 1998, 74, 11-21.
29. Fries, J. R.; Brand, L.; Eggeling, C.; Köllner, M.; Seidel, C. A. M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 6601-6613.
30. Lakowicz, J. R. Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2nd ed.; Kluwer Academic/Plenum Publishers: New York, 1999.
31. Valeur, B. Molecular Fluorescence: Principles and Applications; Wiley-VCH Verlag: Weinheim, 2002.
32. Koshioka, M.; Saski, K.; Masuhara, H. Appl. Spectrosc. 1995, 49, 224-228.
33. Rigler, R.; Mets, Ü. SPIE 1992, 1921, 239-248.
34. Kask, P.; Palo, K.; Fay, N.; Brand, L.; Mets, Ü.; Ullmann, D.; Jungmann, J.; Pschorr, J.; Gall, K. Biophys. J. 2000, 78, 1703-1713.
35. Brochon J. C. Methods of Enzymology; Academic Press: New York, 1994; Vol. 240; pp 262-311.
36. Livesey, A. K.; Skilling, J. Acta Crystallogr, Sect. A 1985, 41, 113-122.
37. Vinogradov, S. A.; Wilson, D. F. Appl. Spectrosc. 2000, 54, 849-855.
38. Enderlein, J.; Robbins, D. L.; Ambrose, W. P.; Goodwin, P. M.; Keller, R. A. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 3626-3632.
39. Laurence, T. A.; Kapanidis, A. N.; Kong, X. X.; Chemla, D. S.; Weiss, S. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 3051-3067.
40. Dix, J. A.; Horn, E. F. Y.; Verkman, A. S. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 1896-1906.