The mechanism of cyclic nucleotide hydrolysis in the phosphodiesterase catalytic site

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 17, 2007, Pages 4547-4552

  Salter, E Alan ^a   Wierzbicki, Andrzej ^a  

^a UNIVERSITY OF SOUTH ALABAMA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTATIONAL METHODS; ENZYMES; HYDROLYSIS; MATHEMATICAL MODELS; PHOSPHATES;

BIMETAL SYSTEM; CATALYTIC SITE; MODEL CYCLIC SUBSTRATES; THERAPEUTIC PURPOSES;

NUCLEOTIDES;

EID: 34249097646     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp066582     Document Type: Article

References (22)

1. Corbin, J. D.; Francis, S. H. J. Biol. Chem. 1999, 274, 13729-13732.
2. Schmidt, D.; Dent, G.; Rabe, K. F. Clin. Exp. Allergy 1999, 29, 99-109.
3. Cortijo, J.; Bou, J.; Beleta, J.; Cardelus, I.; Llenas, J.; Morcillo, E.; Oristwood, R. W. Br. J. Pharmacol. 1993, 108, 562-568.
4. Rabe, K. F.; Tenor, H.; Dent, G.; Schudt, C.; Liebig, S.; Magnussen, H. Am. J. Physiol. 1993, 264, L458-L464.
5. Hidaka, H.; Endo, T. Protein Phosphorylation 1984, 16, 245-259.
6. Thompson, W. J.; Piazza, G. A.; Li, H.; Liu, L.; Fetter, J.; Zhu, B.; Sperl, G.; Ahnen, D.; Pamukcu, R. Cancer Res. 2000, 60, 3338-3342.
7. Xu, R. X.; Hassell, A. M.; Vanderwall, D.; Lambert, M. H.; Holmes, W. D.; Luther, M. A.; Rocque, W. J.; Milburn, M. V.; Zhao, Y.; Ke, H.; Nolle, R. T. Science 2000, 288, 1822-1825.
8. Xu, R. X.; Rocque, W. J.; Lambert, M. H.; Vanderwall, D. E.; Luther, M. A.; Nolte, R. T. J. Mol. Biol. 2004, 337, 355-365.
9. Huai, Q.; Colicelli, J.; Ke, H. Biochemistry 2003, 42, 13220-13226.
10. Coderre, J. A.; Mehdi, S.; Gerlt, J. A. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 1872-1875.
11. Burgers, P. M. J.; Eckstein, F.; Hunnerman, D. H.; Baraniak, J.; Kinas, R. W.; Lesiak, K.; Stec, W. J. J. Biol. Chem. 1979, 254, 9959-9961.
12. Zhang, K. Y. J.; Card, G. L.; Suzuki, Y.; Artis, D. R.; Fong, D.; Guette, S.; Hsieh, D.; Neiman, J.; West, B. L.; Zhang, C.; Milbum, M. V.; Kim, S.-H.; Schlessinger, J.; Bollag, G. Mol. Cell 2004, 15, 279-286.
13. Sung, B.-J.; et al. Nature 2003, 425, 98-101.
14. Houslay, M. D.; Adams, D. R. Biochem. J. 2003, 370, 1-18.
15. Zhan, C.-G.; Zheng, F. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2835-2838.
16. Xiong, Y.; Lu, H.-T.; Li, Y.; Yang, G.-F.; Zhan, C.-G. Biophys. J. 2006, 1858-1867.
17. Frisch, M. J.; et al. Gaussian 03, Revision D.01; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
18. Dapprich, S.; Komáromi, I.; Byun, K. S.; Morokuma, K.; Frisch, M. J. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1999, 461-462, 1-21.
19. Wang, H.; Liu, Y.; Huai, Q.; Cai, J.; Zoraghi, R.; Francis, S. H.; Corbin, J. D.; Robinson, H.; Xin, Z.; Lin, G.; Ke, H. J. Biol. Chem. 2006, 281, 21469-21479.
20. Card, G. L.; Blasdel, L.; England, B. P.; Zhang, C.; Suzuki, Y.; Gillette, S.; Fong, D.; Ibrahim, P. N.; Artis, D. R.; Bollag, G.; Milburn, M. V.; Kim, S.-H.; Schlessinger, J.; Zhang, K. Y. J. Nat. Biotechnol. 2005, 25, 201-207.
21. Chen, X.; Zhan, C.-G. J. P.hys. Chem. A 2004, 108, 3789-3797.
22. Huai, Q.; Wang, H.; Sun, Y.; Kim, H.-Y.; Liu, Y.; Ke, H. Structure 2003, 11, 865-873.