Molecular dynamics simulation of thermal unfolding of Thermatoga maritima DHFR

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 9, Issue 6, 2007, Pages 711-718

  Pang, Jiayun ^a   Allemann, Rudolf K ^a  

^a CARDIFF UNIVERSITY   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DIHYDROFOLATE REDUCTASE;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; DIMERIZATION; ENZYMOLOGY; ESCHERICHIA COLI; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN DENATURATION; PROTEIN FOLDING; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; TEMPERATURE; THERMOTOGA MARITIMA; TIME;

COMPUTER SIMULATION; DIMERIZATION; ESCHERICHIA COLI; MODELS, CHEMICAL; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN DENATURATION; PROTEIN FOLDING; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; TEMPERATURE; TETRAHYDROFOLATE DEHYDROGENASE; THERMOTOGA MARITIMA; TIME FACTORS;

EID: 33846889293     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b611210b     Document Type: Article

References (30)

1. T. Dams R. Jaenicke Biochemistry 1999 38 9169 9178
2. V. Wilquet J. A. Gaspar M. van de Lande M. van de Casteele C. Legrain E. M. Meiering N. Glansdorff Eur. J. Biochem. 1998 255 628 637
3. G. Maglia M. H. Javed R. K. Allemann Biochem. J. 2003 374 529 535
4. J. Y. Pang J. Z. Pu J. L. Gao D. G. Truhlar R. K. Allemann J. Am. Chem. Soc. 2006 128 8015 8023
5. H. S. Kim S. M. Damo S. Y. Lee D. Wemmer J. P. Klinman Biochemistry 2005 44 11428 11439
6. T. Dams G. Auerbach G. Bader U. Jacob T. Ploom R. Huber R. Jaenicke J. Mol. Biol. 2000 297 659 672
7. M. R. Sawaya J. Kraut Biochemistry 1997 36 586 603
8. P. T. R. Rajagopalan S. Lutz S. J. Benkovic Biochemistry 2002 41 12618 12628
9. T. Dams R. Jaenicke Hyperthermophilic Enzymes, Part. B 2001 331 305 317
10. S. L. Kazmirski A. Li V. Daggett J. Mol. Biol. 1999 290 283 304
11. D. O. V. Alonso V. Daggett Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 133 138
12. U. Mayor C. M. Johnson V. Daggett A. R. Fersht Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 13518 13522
13. K. Wong J. Clarke C. J. Bond J. L. Neira S. M. Freund A. R. Fersht V. Daggett J. Mol. Biol. 2000 296 1257 1282
14. R. Day B. J. Bennion S. Ham V. Daggett J. Mol. Biol. 2002 322 189 203
15. B. J. Bennion V. Daggett Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 5142 5147
16. B. J. Bennion M. L. DeMarco V. Daggett Biochemistry 2004 43 12955 12963
17. R. Day V. Daggett Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 13445 13450
18. R. Day V. Daggett Protein Sci. 2005 14 1242 1252
19. M. Eleftheriou R. S. Germain A. K. Royyuru R. H. Zhou J. Am. Chem. Soc. 2006 128 13388 13395
20. C. Frieden Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1990 87 4413 4416
21. R. S. Swanwick P. J. Shrimpton R. K. Allemann Biochemistry 2004 43 4119 4127
22. Y. Y. Sham B. Y. Ma C. J. Tsai R. Nussinov Proteins: Struct., Funct. Genet. 2002 46 308 320
23. V. Tsui D. A. Case J. Am. Chem. Soc. 2000 122 2489 2498
24. V. Tsui D. A. Case Biopolymers 2000 56 275 291
25. G. D. Hawkins C. J. Cramer D. G. Truhlar Chem. Phys. Lett. 1995 246 122 129
26. G. D. Hawkins C. J. Cramer D. G. Truhlar J. Phys. Chem. 1996 100 19824 19839
27. P. H. Hunenberger A. E. Mark W. F. van Gunsteren J. Mol. Biol. 1995 252 492 503
28. A. Kidera N. Go J. Mol. Biol. 1995 225 457 475
29. Y. Y. Sham B. Y. Ma C. J. Tsai R. Nussinov Protein Sci. 2001 10 135 148
30. A. G. Purkiss J. T. Macdonald J. M. Goodfellow C. Slingsby Mol. Simul. 2004 30 333 340