Vibrational coupling between amide-I and amide-A modes revealed by femtosecond two color infrared spectroscopy

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 107, Issue 18, 2003, Pages 3384-3396

  Rubtsov, Igor V ^a   Wang, Jianping ^a   Hochstrasser, Robin M ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

VIBRATIONAL COUPLING;

BAND STRUCTURE; CONFORMATIONS; HYDROGEN BONDS; INFRARED SPECTROSCOPY; POLARIZATION;

POLYAMIDES;

EID: 0038394415     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp021922m     Document Type: Article

References (63)

1. Hamm, P.; Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6123.
2. Asplund, M. C.; Zanni, M. T.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8219.
3. Woutersen, S.; Hamm, P. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11316.
4. Piryatinski, A.; Tretiak, S.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Raman Spectrosc. 2000, 31, 125.
5. Zanni, M. T.; Asplund, M. C.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 2001, 114, 4579.
6. Zanni, M. T.; Hochstrasser, R. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 516.
7. Gnanakaran, S.; Hochstrasser, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12886.
8. Scheurer, C.; Piryatinski, A.; Mukamel, S. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3114.
9. Ge, N.-H.; Hochstrasser, R. M. Phys. Chem. Commun. 2002, 3, 1.
10. Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 2001, 266, 273.
11. Zanni, M. T.; Gnanakaran, S.; Stenger, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6520.
12. Ge, N.-H.; Zanni, M. T.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 962.
13. Mukamel, S. Principles of Nonlinear Spectroscopy; Oxford University Press: New York, 1995.
14. Woutersen, S.; U., E.; Bakker, H. J. Science 1997, 278, 658.
15. Laenen, R.; Gale, G. M.; Lascoux, N. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 10708.
16. West, W., Ed. Chemical Applications of Spectroscopy; Interscience Publishers, Inc.: New York, 1956.
17. Miyazawa, T. J. Mol. Spectrosc. 1960, 4, 168.
18. Neel, J. Pure Appl. Chem. 1972, 31, 201.
19. Tonan, K.; Ikawa, S. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6960.
20. McQuade, D. T.; McKay, S. L.; Powell, D. R.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 8528,
21. Krimm, S.; Bandekar, J. Adv. Protein Chem. 1986, 38, 181.
22. Bradbury, E. M.; Elliott, A. Spectrochim. Acta 1963, 19, 995.
23. Miyazawa, T. Aspects Protein Struct., Proc. Symp., Madras 1963, 257.
24. Miyazawa, T.; Blott, E. R. J. Am. Chem. Soc. 1961, 83, 712.
25. Rey-Lafon, M.; Forel, M. T.; Garrigou-Lagrange, C. Spectrochim. Acta, Part A 1973, 29, 471.
26. Dwivedi; Krimm, S. Macromolecules 1982, 15, 177.
27. Torri, H.; Tasumi, M. J. Chem. Phys. 1992, 96, 3379.
28. Abbott, N. B.; Elloit, A. Proc. R. Soc. A 1956, 234, 247.
29. Hamm, P.; Lim, M.; DeGrado, W. F.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 2000, 112, 1907.
30. Woutersen, S.; Hamm, P. J. Chem. Phys. 2001, 114, 2727.
31. Heilweil, E. J.; Moore, R.; Rothenberger, G.; Velsko, S.; Hochstrasser, R. M. Laser Chem. 1983, 3, 109.
32. Heilweil, E. J.; Cassassa, M. P.; Cavangah, R. R.; Stephenson, J. C. J. Chem. Phys. 1986, 85, 5004.
33. Owrutsky, J. C., Li, M., Culver, J. P., Sarisky, M. J., Yodh, A. G., Hochstrasser, R. H., Eds. Vibrational Dynamics of Condensed-Phase Molecules Studied by Ultrafast Infrared Spectroscopy, 1994; Vol. 74.
34. Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 7629.
35. Laubereau, A.; Kaiser, W. Rev. Mod. Phys. 1978, 50, 607.
36. Rubtsov, I. V.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 9165-9171.
37. Rubtsov, I. V.; Wang, J.-P.; Hochstrasser, R. M. The 13th International Conference on Ultrafast Phenomena; Vancouver, Canada, 2002.
38. Graener, H.; Ye, T. Q.; Laubereau, A. J. Chem. Phys. 1989, 91, 1043.
39. Graener, H.; Laubereau, A. J. Phys. Chem. 1991, 95, 3447.
40. Dlott, D. D. Abstr. Pap. J. Am. Chem. Soc. 2000, 220, PHYS.
41. Owrutsky, J. C.; Culver, J. P.: Li, M.; Kim, Y. R.; Sarisky, M. J.; Yeganeh, M. S.; Hochstrasser, R. M.: Yodh, A. G. Springer Ser. Chem. Phys. 1993, 55, 345.
42. Fujino, T.; Kashitani, M.; Onda, K.; Wada, A.; Domen, K.: Hirose, C.; Ishida, M.; Goto, F.; Kano, S. S. J. Chem. Phys. 1998, 109, 2460.
43. Onda, K.; Tanabe, K.; Noguchi, H.; Wada, A.; Shido, T.; Yamaguchi, A.; Iwasawa, Y. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 11456.
44. Germer, T. A.; Stephenson, J. C.; Heilweil, E. J.; Cavangah, R. R. Phys. Rev. Lett. 1993, 71, 3327.
45. Wynne, K.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1995, 193, 211.
46. Hamm, P. Chem. Phys. 1995, 200, 415.
47. Bratos, S.; Leicknam, J. C. J. Mol. Liq. 1995, 64, 151.
48. Laenen, R.; Simeonidis, K. Chem. Phys. Lett. 1999, 299, 589.
49. Owrutsky, J. C.; Li, M.; Locke, B.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 4842.
50. Madison, V.; Kopple. K. D. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 4855.
51. Baldoni, H. A.; Rodriguez, A. M.; Zamora, M. A.; Zamarbide, G. N.; Enriz, R. D.; Farkas, O.; Csaszar, P.; Torday, L. L.; Sosa, C. P.; Jakli, I.; Perzel, A.; Papp, J. G.; Hollosi, M.; Csizmadia, I. G. J. Mol. Struct. 1999, 465, 79.
52. Hamm, P.; Lim, M.; DeGrado, W. F.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 2036.
53. Hamm, P.; Hochstrasser, R. M. In Ultrafast Infrared and Raman Spectroscopy, Fayer, M. D., Ed.; Marcel Dekker Inc.: New York, 2000; p 273.
54. Marsh, D.; Muller, M. Biophys. J. 2000, 78, 2499.
55. Fasman, G. D. Poly-α-amino Acids; Marcel Dekker: New York, 1967.
56. Creighton, T. E. Proteins; W. H. Freeman & Co.: New York, 1983.
57. Ramachandran, G. N. Biochim. Biophys. Acta 1974, 359, 298.
58. Bohm, H.-J.; Brode, S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 7129.
59. Frey, R. F.; Coffin, J.; Newton, S. Q.; Ramek, M.; Cheng, V. K. W.; Momany, F. A.; Schafer, L. J. Am. Chem. Soc. 1992. 114, 5369.
60. Grubbs, W. T.; Dougherty, T. P.; Heilweil, E. J. J. Phys. Chem. 1995, 99, 10716.
61. Laenen, R.; Simeonidis, K,; Laubereau, A. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 408.
62. Ambroseo, J. R.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 1988, 89, 5956.
63. Oxtoby, D. W. Adv. Chem. Phys. 1979, 40, 1.