Proteomic analysis of rice leaf sheath during drought stress

Journal of Proteome Research

Volumn 5, Issue 2, 2006, Pages 396-403

  Ali, Ghulam Muhammad ^a   Komatsu, Setsuko ^a  

^a NATIONAL INSTITUTE OF AGROBIOLOGICAL SCIENCES   (Japan)

Author keywords

Actin depolymerizing factor; Drought; Leaf sheath; Proteomics; Rice

Indexed keywords

ABSCISIC ACID; ACTIN DEPOLYMERIZING FACTOR; ANAZOLENE SODIUM; SUPEROXIDE DISMUTASE;

ARTICLE; COLD STRESS; CULTIVAR; DROUGHT STRESS; LIGHT HARVESTING SYSTEM; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; OSMOTIC STRESS; PLANT LEAF; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN EXPRESSION; PROTEOMICS; RICE; SALT STRESS; SEEDLING;

ELECTROPHORESIS, GEL, TWO-DIMENSIONAL; GENE EXPRESSION REGULATION, PLANT; NATURAL DISASTERS; ORYZA SATIVA; PEPTIDE MAPPING; PLANT LEAVES; PLANT PROTEINS; PLANTS, GENETICALLY MODIFIED; SEEDLING; SEQUENCE ANALYSIS, PROTEIN;

EID: 32344442922     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr050291g     Document Type: Article

References (50)

1. Widawsky, D. A.; O'Toole, J. C. In Prioritizing the Rice Biotechnology Research Agenda in Eastern Indea; Ed.; The Rockefeller Foundation: New York, USA 1990.
2. Cabuslay, G.; Ito, O.; Alejar, A. In. Genetic Improvement of Rice for Water-limitated Envilonments; O'Toole, J., Ito, O., Hardy, B., Eds.; International Rice Institute: Manila, 1999; pp 99-116.
3. Tabaeizadeh, Z. Int. Rev. Cytol. 1998, 182, 193-247.
4. Zhang, J. X.; Nguyen, H. T.; Blum, A. J. Exp. Bot. 1999, 50, 291-302.
5. Chaves, M. M. J. Exp. Bot. 1991, 42, 1-16.
6. Osmond, C. B., Grace, S. C. J. Exp. Bot. 1995, 46, 1351-1362.
7. Borsani, O.; Diaz, P.; Agius, M. F.; Valpuesta, V.; Monza J. Plant Sci. 2001, 161, 757-763.
8. Mittler, R.; Zilinskas, B. A. Plant J. 1994, 5, 397-405.
9. Mata, C. G.; Lamattina, L. Plant Physiol. 2001, 126, 1196-1204.
10. Zhang, X.; Zhang, L.; Dong, F.; Gao, J.; Galbraith, D. W.; Song, C. P. Plant Physiol. 2001, 126, 1438-1448.
11. Zhu, J. K. Annu. Rev. Plant Biol. 2002, 53, 247-273.
12. Zhu, J. K. Annu. Rev. Plant Biol. 2002, 53, 247-273.
13. Yamane, K.; Hayakawa, K.; Kawasaki, M.; Taniguchi, M.; Miyake, H. J. Plant Physiol. 2003, 260, 1219-1327.
14. Bajji, M.; Lutts, S.; Kinet, J. J. Plant Sci. 2001, 160, 669-681.
15. Smirnoff, N. Curr. Opin. Biotechnol. 1998, 9, 214-219.
16. Schurr, U.; Heckenberger, U.; Herdel, K.; Walter, A.; Feil, R. J. Exp. Bot. 2000, 51, 1515-1529.
17. Narusaka, Y.; Narusaka, M.; Aki, M.; Umezawa, T.; Ishida, J.; Nakajima, M.; Enju, A.; Shinozaki, K. Plant Mol. Biol. 2004, 55, 327-342.
18. Salekdeh, G. H.; Siopongco, J.; Wade, L. J.; Ghareyazie, B.; Bennet, J. Proteomics 2002, 2, 1131-1145.
19. Taylor, N. L.; Heazlewood, J. L.; Day, D. A.; Millar, A. H. Mol. Cell Proteomics 2005, 4, 1122-1133.
20. Hajheidari, M.; Abdollahian-Noghabi, M.; Askari, H.; Heidari, M.; Sadeghian, S. Y.; Ober, E. S., Hosseini Salekdeh, G. Proteomics 2005, 950-960.
21. Sasaki, T.; Burr, B. Curr. Opin. Plant Biol. 2000, 3, 138-141.
22. Devos, M. K.; Gale, D. M. Plant Cell. 2000, 12, 637-646.
23. Yu, J.; Hu, S.; Wang, J.; Wong, G. K.; Li, S.; Liu, B.; Deng, Y.; Dai, L.; Zhou, Y.; Zhang, X.; Cao, M.; Liu, J.; Sun, J.; Tang, J.; Chen, Y.; Huang, X.; Lin, W.; Ye, C.; Tong, W.; Cong, L.; Geng, J.; Han, Y.; Li, L.; Li, W.; Hu, G.; Huang, X.; Li, W.; Li, J.; Liu, Z.; Li, L.; Liu, J.; Qi, Q.; Liu, J.; Li, L.; Li, T.; Wang, X.; Lu, H.; Wu, T.; Zhu, M.; Ni, P.; Han, H.; Dong, W.; Ren, X.; Feng, X.; Cui, P.; Li, X.; Wang, H.; Xu, X.; Zhai, W.; Xu, Z.; Zhang, J.; He, S.; Zhang, J.; Xu, J.; Zhang, K.; Zheng, X.; Dong, J.; Zeng, W.; Tao, L.; Ye, J.; Tan, J.; Ren, X.; Chen, X.; He, J.; Liu, D.; Tian, W.; Tian, C.; Xia, H.; Bao, Q.; Li, G.; Gao, H.; Cao, T.; Wang, J.; Zhao, W.; Li, P.; Chen, W.; Wang, X.; Zhang, Y.; Hu, J.; Wang, J.; Liu, S.; Yang, J.; Zhang, G.; Xiong, Y.; Li, Z.; Mao, L.; Zhou, C.; Zhu, Z.; Chen, R.; Hao, B.; Zheng, W.; Chen, S.; Guo, W.; Li, G.; Liu, S.; Tao, M.; Wang J.; Zhu L.; Yuan, L.; Yang, H. Science 2002, 296, 79-92.
24. Goff, S. A.; Ricke, D.; Lan, T.-H.; Presting, G.; Wang, R.; Dunn, M.; Glazebrook, J.; Sessions, A.; Oeller, P.; Varma, H.; Hadley, D.; Hutchison, D.; Martin, C.; Katagiri, F.; Lange, B. M.; Moughamer, T.; Xia, Y.; Budworth, P.; Zhong, J.; Miguel, T.; Paszkowski, U.; Zhang, S.; Colbert, M.; Sun, W.-I.; Chen, L.; Cooper, B.; Park, S.; Wood, T. C.; Mao, L.; Quail, P.; Wing, R.; Dean, R.; Yu, Y.; Zharkikh, A.; Shen, R.; Sahasrabudhe, S.; Thomas, A.; Cannings, R.; Gutin, A.; Pruss, D.; Reid, J.; Tavtigian, S.; Mitchell, J.; Eldregde, G.; Scholl, T.; Miller, R. M.; Bhatnagar, S.; Adey, N.; Rubano, T.; Tusneem, N.; Robinson, R.; Feldhaus, J.; Macalma, T.; Oliphant, A.; Briggs, S. Science 2002, 296, 92-100.
25. Sasaki, T.; Matsumoto, T.; Yamamoto, K.; Sakata, K.; Baba, T.; Katayose, Y.; Wu, J.; Niimura, Y.; Cheng, Z.; Nagamura, Y.; Antonio, B. A.; Kanamori, H.; Hosokawa, S.; Masukawa, M.; Arikawa, K.; Chiden, Y.; Hayashi, M.; Okamoto, M.; Ando, T.; Aoki, H.; Arita, K.; Hamada, M.; Harada, C.; Hijishita, S.; Honda, M.; Ichikawa, Y.; Idonuma, A.; Iijima, M.; Ikeda, M.; Ikeno, M.; Ito, S.; Ito, T.; Ito, Y.; Ito, Y.; Iwabuchi, A.; Kamiya, K.; Karasawa, W.; Katagiri, S.; Kikuta, A.; Kobayashi, N.; Kono, I.; Machita, K.; Maehara, T.; Mizuno, H.; Mizubayashi, T.; Mukai, Y.; Nagasaki, H.; Nakashima, M.; Nakama, Y.; Nakamichi, Y.; Nakamura, M.; Namiki, N.; Negishi, M.; Ohta, I.; Ono, N.; Saji, S.; Sakai, K.; Shibata, M.; Shimokawa, T.; Shomura, A.; Song, J.; Takazaki, Y.; Terasawa, K.; Tsuji, K.; Waki, K.; Yamagata, H.; Yamane, H.; Yoshiki, S.; Yoshihara, R.; Yukawa, K.; Zhong, H.; Iwama, H.; Endo, T.; Ito, H.; Hahn, J.; Kim, H.-L.; Eun, M.-Y.; Yano, M.; Jiang, J.; Gojobori T. Nature 2002, 420, 312-316.
26. Feng, Q.; Zhang, Y.; Hao, P.; Wang, S.; Fu, G.; Huang, Y.; Li, Y.; Zhu, J.; Liu, Y.; Hu, X.; Jia, P.; Zhang, Y.; Zhao, Q.; Ying, K.; Yu, S.; Tang, Y.; Weng, Q.; Zhang, L.; Lu, Y.; Mu, J.; Lu, Y.; Zhang, L. S.; Yu, Z.; Fan, D.; Liu, X.; Lu, T.; Li, C.; Wu, Y.; Sun, T.; Lei, H.; Li, T.; Hu, H.; Guan, J.; Wu, M.; Zhang, R.; Zhou, B.; Chen, Z.; Chen, L.; Jin, Z.; Wang, R.; Yin, H.; Cai, Z.; Ren, S.; Lv, G.; Gu, W.; Zhu, G.; Tu, Y.; Jia, J.; Zhang, Y.; Chen, J.; Kang, H.; Chen, X.; Shao, C.; Sun, Y.; Hu, Q.; Zhang, X.; Zhang, W.; Wang, L.; Ding, C.; Sheng, H.; Gu, J.; Chen, S.; Ni, L.; Zhu, F.; Chen, W.; Lan, L.; Lai, Y.; Cheng, Z.; Gu, M.; Jiang, J.; Li, J.; Hong, G.; Xue, Y.; Han, B. Sequence and analysis of rice chromosome 4. Nature 2002, 420, 316-320.
27. Komatsu, S.; Konishi, H.; Shen, S.; Yang, G. Mol. Cell. Proteomics 2003, 2, 2-10.
28. Komatsu, S.; Tanaka, N. Proteomics, 2004, 4, 938-949.
29. Zhong, B.; Karibe, H.; Komatsu, S.; Ichimura, H.; Nagamura, Y.; Sasaki T.; Hirano, H. Breed. Sci. 1997, 47, 245-251.
30. O'Farrell, P. H. J Biol. Chem. 1975, 250, 4007-4021.
31. Cleveland, D. W.; Fischer, S. G.; Kirschner, M. W.; Laemmli, U.K. J. Biol Chem. 1977, 252, 1102-1106.
32. Saga, R. F. Plant Biol. 2001, 3, 202-213.
33. Bevan, M.; Bancroft, I.; Bent, E.; Love, K.; Goodman, H.; Dean, C.; Bergkamp, R.; Dirkse, W.; van Staveren, M.; Stiekema, W.; Drost, L.; Ridley, P.; Hudson, S. A.; Patel, K.; Murphy, G.; Piffanelli, P.; Wedler, H.; Wedler, E.; Wambutt, R.; Weitzenegger, T.; Pohl, T. M.; Terryn, N.; Gielen, J.; Villarroel, R.; De Clerck, R.; Van Montagu, M.; Lecharny, A.; Auborg, S.; Gy, I.; Kreis, M.; Lao, N.; Kavanagh, T.; Hempel, S.; Kotter, P.; Entian, K. D.; Rieger, M.; Schaeffer, M.; Funk, B.; Mueller-Auer, S.; Silvey, M.; James, R.; Montfort, A.; Pons, A.; Puigdomenech, P.; Douka, A.; Voukelatou, E.; Milioni, D.; Hatzopoulos, P.; Piravandi, E.; Obermaier, B.; Hubert, H.; Dusterhoft, A.; Moores, T.; Jones, J. D. G.; Eneva, T.; Palme, K.; Benes, V.; Rechman, S.; Ansorge, W.; Cooke, R.; Berger, C.; Delseny, M.; Voet, M.; Volckaert, G.; Mewes, H. W.; Klosterman, S.; Schueller, C.; Chalwatzis, N. 1998, 391, 485-488.
34. Kim, S. D.; Kim, S. G.; Hwang du, H.; Kang, S. Y.; Koo, S. C.; Cho, M. J.; Kang, K. Y. Plant Cell Rep. 2004, 23, 256-262.
35. Rebeille, F.; Neuburger, M.; Douce, R. Biochem J. 1994, 302, 223-228.
36. Wasteneys, G. O.; Galway, M. E. Annu. Rev. Plant Biol. 2003, 54, 691-722.
37. Ouellet, F.; Carpentier, E.; Cope, M. J. T. V.; Monroy, A. F.; Sarhan, F. Plant Physiol. 2001, 125, 360-368.
38. Luan, S. Plant Cell Environ. 2002, 25, 229-237.
39. Bohnert, H. J.; Nelson, D. E.; Jensen, R. G. Plane Cell 1995, 7, 1099-1111.
40. Badger, M. R.; Caemmerer, S.; Ruuska, S.; Nakano, H. Philos. Trans. R. Soc. London B Biol. Sci. 2000, 355, 1433-1446.
41. Kaminaka, H.; Monta, S.; Tokumoto, M.; Masumura, T.; Tanaka, K. Free Radic. Res. 1999, 31, S219-225.
42. Ishida, H.; Makino, A.; Mae, T. J. Biol Chem. 1999, 274, 5222-5226.
43. Cornic, G.; Fresneau, C. Ann. Bot. 2002, 89, 887-894.
44. Li, X. P.; Muller-Moule, P.; Gilmore, A. M.; Niyogi, K. K. Proc. Natl. Acad. Sci. 2002, 99, 15222-15227.
45. Huo, C. M.; Zhao, B. C.; Ge, R. C.; Ahen, Y. Z.; Huang, Z. J. Yi Chun Xue Bao 2004, 31, 1408-1414.
46. Dietz, K. J.; Horling, F.; Konig, J.; Baier, M. J. J. Exp. Bot. 2002, 53, 1321-1329.
47. Shikanai, T.; Takeda, T.; Yamauchi, H.; Sano, S.; Tomizawa, K. I.; Yokota, A.; Shigeoka, S. FEBS Lett. 1888, 428, 47-51.
48. Manjunath, A.; Lee, C.-H.; VanWinkle, P.; Bailey-Serres, J. Plant Physiol. 1998, 117, 997-1006.
49. Hirata, Y.; Andoh, T.; Asahara, T.; Kikushi, A. Mol. Biol. Cell 2003, 14, 302-312.
50. Yan, S.; Tang, Z.; Su, W.; Sun, W. Proteomics 2005, 5, 235-244.