Characterization of photoinduced isomerization and back-isomerization of the cyanine dye cy5 by fluorescence correlation spectroscopy

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 104, Issue 27, 2000, Pages 6416-6428

  Widengren, Jerker ^a,b   Schwil̈le, Petra ^a  

^a MAX PLANCK INSTITUTE FOR BIOPHYSICAL CHEMISTRY   (Germany)

^b KAROLINSKA INSTITUTE   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPOSITION EFFECTS; EMISSION SPECTROSCOPY; FLUORESCENCE; ISOMERIZATION; ISOMERS; MATHEMATICAL MODELS; NITROGEN COMPOUNDS; PHOTOCHEMICAL REACTIONS; RATE CONSTANTS; SOLVENTS; THERMAL EFFECTS; VISCOSITY;

FLUORESCENCE CORRELATION SPECTROSCOPY (FCS); PHOTOSTATIONARY EQUILIBRIUM;

DYES;

EID: 0033702974     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp000059s     Document Type: Article

References (87)

1. Ernst, L. A.; Gupta, R. K.; Mujumdar, R. B.; Waggoner, A. S. Cytometry 1989, 10, 3.
2. Mujumdar, R. B.; Ernst, L. A.; Mujumdar, S. R.; Waggoner, A. S. Cytometry 1989, 10, 11.
3. Southwick; P. L.; Ernst, L. A.; Tauriello, E. W.; Parker, S. R.; ' Mujumdar, R. B.; Mujumdar, S. R.; Clever, H. A.; Waggoner, A. S. Cytometry 1990, U, 418.
4. Soper, S. A.; Mattingly, Q. L.; Vegunta, P. Anal. Cliem. 1993, 65, 740.
5. Sargent, P. B. Neuroimage 1994, l, 288.
6. Soper, S. A.; Mattingly, Q. L. J. Am. Chem. Soc. 1994,116, 3744.
7. Williams, D. C.; Soper, S. A. Anal. Cliem. 1995, 67, 3427.
8. Sauer, M.; Drexhage, K. H.; Zander, C.; Wolfrum, J. Chem. Phys. Lett. 1996, 254, 223.
9. Sauer, M.; Arden-Jacob, J.; Drexhage, K. H.; Gobel, F.; Lieberwirth, U.; Muhlegger, K.; Muller, R.; Wolfrum, J.; Zander, C. Bioimaging 1998, 6, 14.
10. Kühn, H. J. Chem. Phys. 1949, 17, 1198.
11. Schäfer. F. P. Dye lasers; Schäfer, F. P., Ed.; Springer-Verlag: Heidelberg, 1973.
12. Lansdorp, P. M.; Smith, C.; Safford, M.; Terstappen, L. W. M. M.; Thomas, T. E. Cytometry 1991, 12, 723.
13. Galbraith, W.; Wagner, M. C. E.; Chao, J.; Abaza, M.; Ernst, L. A.; Nederlof, M. A.; Hartsock, R. J.; Taylor, L.; Waggoner, A. S. Cytometry 1991, 12, 579.
14. Ballard, S. G.; Ward, D. C. J. Histochem. Cytochem. 1993, 41, 1755.
15. Schwüle, P.; Meyer-Almes, F. J.; Rigler, R. Biophys. J. 1997, 72, 1878.
16. Aubin, J. E. J. Histochem. Cytochem. 1979, 27, 36.
17. Noonberg, S. B.; Weiss, T. L.; Garovoy, M. R.; Hunt, C. A. Antisense Res. dei. 1992, 2, 303.
18. Ballou, B.; Fisher, G. W.; Deng, J. S.; Hakala, T. R.; Srivastava, M.; Farkas, D. L. Cancer Detect. Prev. 1998, 22, 251.
19. Chatterjee, S.; Gattschalk, P.; Davis, P. P.; Schuster, G. B. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 2326.
20. Shank. C. V.; Ippen. E. P. Dye lasers; Schäfer, F. P., Ed.; Springer-Verlag: Heidelberg, 1973.
21. Maeda. M. Laser Dyes; Academic Press: Tokyo, 1984.
22. Dragsten, P. R.; Webb, W. W. Biochemistry 1978, 17, 5228.
23. Krieg, M.; Redmond, R. W. Photochem. Photobiol. 1993,57,472.
24. Benniston, A. C.; Harriman, A. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1998, 94, 1841.
25. Benniston, A. C.; Harriman, A.; Mcavoy, C. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1998, 94, 519.
26. Korobov, V. E.; Chibisov, A. K. RUSS. Chem. Rev. 1983, 52, 27.
27. Dempster, D. N.; Morrow, T.; Rankin, R.; Thompson, G. F. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1971, 68, 1479.
28. Kuzmin, V. A.; Darmanyan, A. P. Chem. Phys. Lett. 1978,54, 159.
29. Chibisov, A. K. J. Photochem. 1977, 6, 199.
30. Chibisov, A. K.; Zakharova, G. V.; Gömer, H.; Sogulyaev, Y. A.; Mushkalo, I. L.; Tolmachev, A. I. J. Phys. Chem. 1995, 99, 886.
31. Sundström, V.; Gillbro, T. J. Phys. Chem. 1982, 56, 1788.
32. Åkesson, E.; Hakkarainen, A.; Laitinen, E.; Helenius, V.; Gillbro, T.; Korppi-Tommola, J.; Sundström, V. J. Chem. Phys. 1991, 95, 6508.
33. He'bert, P.; Baldacchino, G.; Gustavsson, T.; Mialocq, J. C. J. Photochem. Photobiol. A 1994, 84, 45.
34. Baraldi, L; Camevali, A.; Momicchioli, F.; Ponterini, G. Spectrochim. Acta. A 1993, 49A, 471.
35. Khimenko, V.; Chibisov, A. K.; Görner, H. J. Phys. Chem. 1997, 101, 7304.
36. Chibisov, A. K.; Zakharova, G. V.; Görner, H. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1996, 92, 4917.
37. Chibisov, A. K.; Görner, H. J. Photochem. Photobiol, A 1997,105, 261.
38. Velsko, S. R; Waldeck, D. H.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1983, 78, 249.
39. Dempster, D. N.; Morrow, T.; Rankin, R.; Thompson, G. F. Chem. Phys. Lett. 1973,18, 488.
40. Rulliere, C. Chem. Phys. Lett. 1976, 43, 303.
41. Redmond, R. W.; Kochevar, I. E.; Krieg, M.; Smith, G.; McGimpsey, W. G. J. Phys. Chem. 1997, 101, 2773.
42. West, W.; Pearce, S.; Grum, F. J. Phys. Chem. 1967, 7l, 1316.
43. Ponterini, G.; Momicchioli, F. Chem. Phys. 1991, 151, 111.
44. DiPaolo, R. E.; Scaffardi, L. B.; Duchowicz, R.; Bilmes, G. M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 13796.
45. Vaveliuk, P.; Scaffardi, L. B.; Duchowicz, R. J. Phys. Chem. 1996, 700, 11630.
46. Rentsch, S.; Döpel, E.; Petrov, V. Appl. Phys. B 1988, B46, 357.
47. Cooper, W.; Rome, K. A. J. Phys. Chem. 1974, 78, 16.
48. Aramendia, P. F.; Negri, R. M.; San Roma'n, E. J. Phys. Chem. 1994, 98, 3165.
49. Noukakis, D.; Vanderauweraer, M.; Toppet, S.; Deschryver, F. C. J. Phys. Chem. 1995, 99, 11860.
50. Velsko, S. P.; Fleming, G. R. Chem. Phys. 1982, 65, 59.
51. Sauerwein, B.; Murphy, S.; Schuster, G. B. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 7920.
52. Arthurs, E. G.; Bradley, D. J.; Roddie, A. G. Opf. Commun. 1973, 8, 118.
53. Aramendia, P. F.; Duchowicz, R.; Scaffardi, L.; Tocho, J. O. J. . Phys. Chem. 1990, 94, 1389.
54. Bilmes, G. M.; Tocho, J. O.; Braslavsky, S. E. Chem. Phys. Lett. 1987, 134, 335.
55. Bilmes, G. M.; Tocho, J. O.; Braslavsky, S. E. J. Phys. Chem. 1988, 92, 5958.
56. Zhu, X. R.; Harris, J. M. Chem. Phys. 1988, 124, 321.
57. Ghelli, S.; Ponterini, G. J. Mot. Struct. 1995, 355, 193.
58. Momicchioli, F.; Baraldi, I.; Ponterini, G. Spectrochim. Ada A I990, 46A, 775.
59. Momicchioli, F.; Baraldi, I. Berthier, G. Chem. Phys. 1988, 123, 103.
60. Rodriguez, J.; Scherlis, D.; Estrin, D.; Aramendia, P. F.; Negri, R. M. J. Phys. Chem. 1997, 101, 6998.
61. Mägde, D.; Elson, E. L.; Webb, W. W. Phys. Rev. Lett: 1972, 29, 705.
62. Elson, E. L.; Mägde, D. Biopolymers 1974, 13, 1.
63. Mägde, D.; Elson, E. L.; Webb, W. W. Biopolymers 1974,13, 29.
64. Ehrenberg, M.; Rigler, R. Chem. Phys. 1974, 4, 390.
65. Rigler. R.; Widengren. J. Bioscience; Klinge, B., Owman, C., Eds.; Lund University Press: Lund, Sweden, 1990.
66. Rigler. R.; Widengren. J.; Mets. U. Fluorescence Spectroscopy; Wolfbeis, O. S., Ed.; Springer-Verlag: Berlin, 1992.
67. Rigler, R.; Mets, Ü. SPIE 1992, 1921, 239.
68. Mets, Ü.; Rigler, R. J. Fluorcsc. 1994, 4, 259.
69. Rigler, R.; Mets, Ü.; Widengren, J.; Kask, P. Eur. Biophys. J. 1993, 22, 169.
70. Widengren, J.; Mets, Ü.; Rigler, R. J. Phys. Chem. 1995,99, 13368.
71. Chen, F. A.; Tusak, A.; Pentoney, S.; Konrad, K.; Lew, C.; Koh, E.; Sternberg, J. J. Chromatogr. 1993, 652, 355.
72. Araso'n, S. R.; Pecora, R. J. Chem. Phys. 1976, 64, 1791.
73. Widengren, J.; Rigler, R.; Mets, Ü. J. Fhtoresc. 1994, 4, 255.
74. Palmer, A. G.; Thompson, N. L. Biophys. J. 1987, 51, 339.
75. Widengren, J.; Dapprich, J.; Rigler, R. Chem. Phys. 1997, 216, 417.
76. Widengren, J.; Mets, Ü.; Rigler, R. Chem. Phys. 1999, 250, 171.
77. Schwüle, P.; Kummer, S.; Heikai, A. H.; Moerner, W. E.; Webb, W. W. Proc. Nail. Acad. Sei. U.S.A. 2000, 97, 151.
78. Widengren, J.; Rigler, R. Bioimaging 1996, 4, 149.
79. Eggeling, C.; Widengren, J.; Rigler, R.; Seidel, C. Anal. Chem. 1998, 70, 2651.
80. Sauer. M. Dissertation. Heidelberg University, 1995.
81. Sauer, M.; Angerer, B.; Han, K. T.; Zander, C. Phys. Chem. Chem. Phys. 1999, /,247l.
82. Eggeling. C.; Widengren. J.; Rigler. R.; Seidel. C. A. M. Applied fluorescence in chemistry, biology and medicine; Rettig, W., Strehmel, B., Schrader, S., Seifert, H., Eds.; Springer-Verlag: Berlin, 1999.
83. Drexhage. K. H. Dye lasers; Schäfer, F.'P., Ed.; Springer-Verlag: Heidelberg, 1973.
84. Murphy, S.; Schuster, G. B. J. Phys. Chem. 1995, 99, 8516.
85. Graness, A.; Rentsch, S.; Weracke, W.; Tscholl, T. J.; Wigmann, H. J.; Pfeiffer, M.; Lau, A. Teubner-Texte Phys. 1986, 10, 227.
86. Widengren, J.; Rigler, R. Cell. Mol. Biol. 1998, 44, 857.
87. Deniz, A. D.; Dahan, M.; Grunwell, J. R.; Ha, T.; Falhaber, A. E.; Chemla, D. S.; Weiss, S.; Schultz, P. G. Proc. Natl. Acad. Sei. U.S.A. 1999, 96, 3670.