Transient species involved in catalytic dioxygen/peroxide activation by hemoproteins: Possible involvement of protonated Compound I species

Dalton Transactions

Volumn , Issue 21, 2005, Pages 3477-3482

  Silaghi Dumitrescu, Radu ^a   Cooper, Chris E ^a  

^a UNIVERSITY OF ESSEX   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTROMERISM; FERRIC HYDROPEROXO; HEMEPROTEINS; SPIN DIPOLE COUPLINGS;

CATALYSIS; ELECTRONIC STRUCTURE; FERMI LEVEL; IRON; OXYGEN; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; REACTION KINETICS;

PROTEINS;

HEMOPROTEIN; OXYGEN; PEROXIDE; PROTON;

ANISOTROPY; ARTICLE; BINDING SITE; CATALYSIS; CHEMISTRY; METABOLISM; PROTEIN BINDING;

ANISOTROPY; BINDING SITES; CATALYSIS; HEMEPROTEINS; OXYGEN; PEROXIDES; PROTEIN BINDING; PROTONS;

EID: 27744527982     PISSN: 14779226     EISSN: 14779234     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b505440k     Document Type: Article

References (48)

1. H. B. Dunford, Peroxidases in Chemistry and Biology, ed. J. Everse, K. E. Everse and M. B. Grisham, CRC Press, Boca Raton, FL, 1991, vol. II, pp. 2-17.
2. A. N. P. Hiner, E. L. Raven, R. N. F. Thorneley, G. Garcia-Canovas and J. N. Rodriguez-Lopez, J. Inorg. Biochem., 2002, 91, 27.
3. G. H. Loew and D. L. Harris, Chem. Rev., 2000, 100, 407.
4. T. L. Poulos, Adv. Inorg. Chem., 1988, 7, 1.
5. S. Shaik, S. P. de Visser, F. Ogliaro, H. Schwarz and I. Schroder, Curr. Opin. Chem. Biol., 2002, 6, 556.
6. E. I. Solomon, PNAS, 2003, 100, 3589.
7. B. M. Hoffman, Acc. Chem. Res., 2003, 36, 522.
8. M. Sono, M. P. Roach, E. D. Coulter and J. H. Dawson, Chem. Rev., 1996, 96, 2841.
9. J. H. Dawson, R. H. Holm, R. H. Trudell, G. Barth, R. E. Linder, E. Nunnernberg, C. Djerassi and S. C. Tang, J. Am. Chem. Soc., 1976, 98, 3707.
10. I. Schlichting, J. Berendzen, K. Chu, R. M. Sweet, D. Ringe, G. A. Petsko and S. G. Sligar, Science, 2000, 287, 1615.
11. R. Silaghi-Dumitrescu, J. Biol. Inorg. Chem., 2004, 9, 471.
12. S. Shaik, S. Cohen, S. P. de Visser, P. K. Sharma, D. Kumar, S. Kozuch, F. Ogliaro and D. Danovich, Eur. J. Inorg. Chem., 2004, 207.
13. R. Silaghi-Dumitrescu, I. Silaghi-Dumitrescu, E. D. Coulter and D. M. Kurtz, Jr., Inorg. Chem., 2003, 42, 446.
14. R. Davydov, J. D. Satterlee, H. Fujii, A. Sauer-Masarwa, D. H. Busch and B. M. Hoffman, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 16340.
15. R. Kappl, M. Hoehn-Berlage, J. Huettermann, N. Bartlett and M. C. Symons, Biochim. Biophys. Acta, 1985, 827, 327.
16. R. Davydov, V. Kofman, H. Fuji, T. Yoshida, M. Ikeda-saito and B. M. Hoffman, J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 1798.
17. R. Davydov, T. M. Makris, V. Kofman, D. E. Werst, S. L. Sligar and B. M. Hoffman, J. Am. Chem. Soc., 2001, 123, 1403.
18. R. Davydov, I. M. MacDonald, T. M. Makris, S. G. Sugar and B. M. Hoffman, J. Am. Chem. Soc., 1999, 121, 10654.
19. D. E. Benson, K. S. Suslick and S. G. Sligar, Biochemistry, 1997, 36, 5104.
20. D. Harris, G. Loew and L. Waskell, J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 4308.
21. T. A. Jackson, E. Yikilmaz, A. F. Miller and T. C. Brunold, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 10833.
22. R. Carrasco, I. Morgenstern-Badarau and J. Cano, Chem. Commun., 2003, 436.
23. R. Silaghi-Dumitrescu and I. Silaghi-Dumitrescu, Rev. Roum. Chim., 2004, 3-4, 257.
24. I. G. Denisov, T. M. Makris and S. G. Sligar, J. Biol. Chem., 2002, 277, 42706.
25. G. I. Berglund, G. H. Carlsson, A. T. Smith, H. Szoke, A. Henriksen and J. Hajdu, Nature, 2002, 417, 463.
26. R. Davydov, A. Ledbetter-Rogers, P. Martasek, M. Larukhin, M. Sono, J. H. Dawson, B. S. Siler Masters and B. M. Hoffman, Biochemistry, 2002, 41.
27. R. M. Davydov, T. Yoshida, M. Ikeda-Saito and B. M. Hoffman, J. Am. Chem. Soc., 1999, 121, 10656.
28. C. A. Bonagura, B. Bhaskar, H. Shimizu, M. Sundaramoorthy, D. E. McRee, D. B. Goodin and T. L. Poulos, Biochemistry, 2003, 42, 5600.
29. D. L. Harris and G. H. Loew, J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 8941.
30. B. Meunier, S. P. de Visser and S. Shaik, Chem. Rev., 2004, 104, 3947.
31. J. J. Dwyer, A. Gittis, D. A. Karp, E. E. Lattman, D. S. Spencer, W. S. Stites and B. Garcia-Moreno, Biophys J, 2000, 79, 1610.
32. R. Davydov, T. Matsui, H. Fujii, M. Ikeda-Saito and B. M. Hoffman, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 16208.
33. R. Silaghi-Dumitrescu, Proc. Rom. Acad. Ser. B, 2004, 3, 149.
34. M. Chiesa, E. Giamello, C. Paganini, Z. Sojka and D. Murphy, J. Chem. Phys., 2002, 116, 4266.
35. R. Silaghi-Dumitrescu and D. M. Kurtz, Jr., Chemtracts: Inorg. Chem., 2003, 16, 722.
36. N. Lehnert and E. I. Solomon, J. Biol. Inorg. Chem., 2003, 8, 294.
37. M. Filatov, N. Harris and S. Shaik, Angew. Chem. Int. Ed., 1999, 38, 3510.
38. F. Ogliaro, S. de Visser and S. Shaik, J. Inorg. Biochem., 2002, 91, 554.
39. S. P. de Visser and S. Shaik, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 7413.
40. P. R. Ortiz de Montellano, Biochimie, 1995, 77, 581.
41. V. Guallar, M. H. Baik, S. J. Lippard and R. A. Friesner, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2003, 100, 6998.
42. V. Guallar, D. L. Harris, V. S. Batista and W. H. Miller, J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 1430.
43. S. D. Copley, Curr. Opin. Chem. Biol, 2003, 7, 265.
44. P. J. O'Brien and D. Herschlag, Chem. Biol., 1999, 6, R91.
45. A. D. Becke, Phys. Rev. B, 1988, 35, 3098.
46. J. P. Perdew, Phys. Rev. B, 1986, 33, 8822.
47. Spartan 5.0, Wavefunction, Inc., 18401 Von Karman, Avenue Suite 370, Irvine, CA 92612, USA, 1997.
48. Gaussian98(Revision A.1), M. J.Frisch, G.W.Trucks, H.B.Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, R. E. Stratmann, J. C. Burant, S. Dapprich, J. M. Millam, A. D. Daniels, K. N. Kudin, M. C. Strain, O. Farkas, J. Tomasi, V. Barone, M. Cossi, R. Cammi, B. Mennucci, C. Pomelli, C. Adamo, S. Clifford, J. Ochterski, G. A. Petersson, P. Y. Ayala, Q. Cui, K. Morokuma, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. Cioslowski, J. V. Ortiz, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, C. Gonzalez, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. G. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, M. Head-Gordon, E. S. Replogle and J. A. Pople, Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 1998.