Structure and properties of α-synuclein and other amyloids determined at the amino acid level

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 102, Issue 43, 2005, Pages 15477-15482

  Del Mar, Charyl ^a   Greenbaum, Eric A ^a   Mayne, Leland ^a   Englander, S Walter ^a   Woods Jr , Virgil L ^b  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALPHA SYNUCLEIN; AMINO ACID; AMYLOID; AMYLOID BETA PROTEIN;

AMINO ACID ANALYSIS; ARTICLE; DERIVATIZATION; HUMAN; HYDROGEN BOND; MOLECULAR INTERACTION; NONHUMAN; PHASE SEPARATION; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN AGGREGATION; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN STRUCTURE; STRUCTURE ANALYSIS; THERMODYNAMICS;

ALPHA-SYNUCLEIN; AMYLOID; CIRCULAR DICHROISM; HYDROGEN BONDING; MASS SPECTROMETRY;

EID: 27344436619     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0507405102     Document Type: Article

References (66)

1. Dobson, C. M. (2001) Philos. Trans. R. Soc. London B 356, 133-145.
2. Eanes, E. D. & Glenner, G. G. (1968) J. Histochem. Cytochem. 16, 673-677.
3. Sunde, M. & Blake, C. C. (1997) Adv. Protein Chem. 50, 123-159.
4. Sunde, M. & Blake, C. C. (1998) Q. Rev. Biophys. 31, 1-39.
5. Benzinger, T. L., Gregory, D. M., Burkoth, T. S., Miller-Auer, H., Lynn, D. G., Botto, R. E. & Meredith, S. C. (2000) Biochemistry 39, 3491-3499.
6. Torok, M., Milton, S. C., Kayed, R., Wu, P., McIntyre, T., Glabe, C. G. & Langen, R. (2002) J. Biol. Chem. 277, 40810-40815.
7. Tycko, R. (2004) Curr. Opin. Struct. Biol. 14, 96-103.
8. Sumner, M. O. & Serpell, L. C. (2004) J. Mol. Biol. 335, 1279-1288.
9. Nelson, R., Sawaya, M. R., Balbirnie, M., Madsen, A. O., Riekel, C., Grothe, R. & Eisenberg, D. (2005) Nature 435, 773-778.
10. Bai, Y., Milne, J. S., Mayne, L. & Englander, S. W. (1993) Proteins 17, 75-86.
11. Connelly, G. P., Bai, Y., Jeng, M. F. & Englander, S. W. (1993) Proteins 17, 87-92.
12. Krishna, M. M. G., Hoang, L., Lin, Y. & Englander, S. W. (2004) Methods 34, 51-64.
13. Ernst, R. R., Bodenhausen, G. & Wokaun, A. (1987) Principles of Nuclear Magnetic Resonance in One and Two Dimensions (Clarendon, Oxford).
14. Wuthrich, K. (1986) NMR of Proteins and Nucleic Acids (Wiley, New York).
15. Bax, A. (1994) Curr. Opin. Struct. Biol. 4, 738-744.
16. Wand, A. J. & Englander, S. W. (1996) Curr. Opin. Biotechnol. 7, 403-408.
17. Rosa, J. J. & Richards, F. M. (1979) J. Mol. Biol. 133, 399-416.
18. Englander, S. W., Calhoun, D. B., Englander, J. J., Kallenbach, N. R., Liem, R. K. H., Malin, E. L., Mandai, C. & Rogero, J. R. (1980) Biophys. J. 32, 577-590.
19. Englander, J. J., Rogero, J. R. & Englander, S. W. (1985) Anal. Biochem. 147, 234-244.
20. Englander, S. W. & Englander, J. J. (1994) in Methods in Enzymology, eds. Everse, J., Vandegriff, K. D. & Winslow. R. M. (Academic, New York), Vol. 232, pp. 26-42.
21. Zhang, Z. & Smith, D. L. (1993) Protein Sci. 2, 522-531.
22. Engen, J. R. & Smith, D. L. (2001) Anal. Biochem. 73, 256A-265A.
23. Hoofnagle, A. N., Resing, K. A. & Ahn, N. G. (2003) Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 32, 1-25.
24. Eyles, S. J. K. & Igor, A. (2004) Methods 34, 88-99.
25. Norris, E. H., Giasson, B. I. & Lee, V. M. (2004) Curr. Top. Dev. Biol. 60, 17-54.
26. Kheterpal, I., Zhou, S., Cook, K. D. & Wetzel, R. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 13597-13601.
27. Kheterpal, I., Lashuel, H. A., Hartley, D. M., Walz, T., Lansbury, P. T., Jr., & Wetzel, R. (2003) Biochemistry 42, 14092-14098.
28. Nazabal, A., Maddelein, M.-L., Bonneu, M., Saupe, S. J. & Schmitter, J.-M. (2005) J. Biol. Chem. 280, 13220-13228.
29. Whittemore, N. A., Mishra, R., Kheterpal, I., Williams, A. D., Wetzel, R. & Serpersu, E. H. (2005) Biochemistry 44, 4434-4441.
30. Kraus, M., Bienert, M. & Krause, E. (2003) Rapid Commun. Mass Spectrom. 17, 222-228.
31. Wang, S. S., Tobler, S. A., Good, T. A. & Fernandez, E. J. (2003) Biochemistry 42, 9507-9514.
32. Ippel, J. H., Olofsson, A., Schleucher, J., Lundgren, E. & Wijmenga, S. S. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 8648-8653.
33. Hoshino, M., Katou, H., Hagihara, Y., Hasegawa, K., Naiki, H. & Goto, Y. (2002) Nat. Struct. Biol. 9, 332-336.
34. Kuwata, K., Matumoto, T., Cheng, H., Nagayama, K., James, T. L. & Roder, H. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 14790-14795.
35. Ritter, C., Maddelein, M. L., Siemer, A. B., Luhrs, T., Ernst, M., Meier, B. H., Saupe, S. J. & Riek, R. (2005) Nature 435, 844-848.
36. Yamaguchi, K., Katou, H., Hoshino, M., Hasegawa, K., Naiki, H. & Goto, Y. (2004) J. Mol. Biol. 338, 559-571.
37. Giasson, B. I., Murray, I. V., Trojanowski, J. Q. & Lee, V. M. (2001) J. Biol. Chem. 276, 2380-2386.
38. Englander, J. J., DelMar, C., Li, W., Englander, S. W., Kim, J. S., Stranz, D. D., Hamuro, Y. & Woods, V. L., Jr. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 7057-7062.
39. Pantazatos, D., Kim, J. S., Klock, H. E., Stevens, R. C., Wilson, I. A., Lesley, S. A. & Woods, V. L., Jr. (2004) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 751-756.
40. Weinreb, P. H., Zhen, W., Poon, A. W., Conway, K. A. & Lansbury, P. T., Jr. (1996) Biochemistry 35, 13709-13715.
41. Der-Sarkissian, A., Jao, C. C., Chen, J. & Langen, R. (2003) J. Biol. Chem. 278, 37530-37535.
42. Chien, P., Weissman, J. S. & DePace, A. H. (2004) Annu. Rev. Biochem. 73, 617-656.
43. Kheterpal, I., Williams, A. D., Murphy, C., Bledsoe, B. & Wetzel, R. (2001) Biochemistry 40, 11757-11767.
44. Miake, H., Mizusawa, H., Iwatsubo, T. & Hasegawa, M. (2002) J. Biol. Chem. 277, 19213-19219.
45. Ueda, K., Fukushima, H., Masliah, E., Xia, Y., Iwai, A., Yoshimoto, M., Otero, D. A., Kondo, J., Ihara, Y. & Saito, T. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 11282-11286.
46. Han, H., Weinreb, P. H. & Lansbury, P. T., Jr. (1995) Chem. Biol. 2, 163-169.
47. Greenbaum, E. A., Graves, C. L., Mishizen-Eberz, A. J., Lupoli, M. A., Lynch, D. R., Englander, S. W., Axelsen, P. H. & Giasson, B. I. (2005) J. Biol. Chem. 280, 7800-7807.
48. Murray, I. V., Giasson, B. I., Quinn, S. M., Koppaka, V., Axelsen, P. H., Ischiropoulos, H., Trojanowski, J. Q. & Lee, V. M. (2003) Biochemistry 42, 8530-8540.
49. Kessler, J. C., Rochet, J. C. & Lansbury, P. T. J. (2003) Biochemistry 42, 672-678.
50. Makin, O. S., Atkins, E., Sikorski, P., Johansson, J. & Serpell, L. C. (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102, 315-320.
51. Jha, A. K., Colubri, A., Zaman, M. H., Koide, S., Sosnick, T. R. & Freed, K. F. (2005) Biochemistry 44, 9691-9702.
52. Chothia, C. (1984) Annu. Rev. Biochem. 53, 537-572.
53. Ptitsyn, O. B. (1995) Trends Biochem. Sci. 20, 376-379.
54. Antzutkin, O. N., Balbach, J. J., Leapman, R. D., Rizzo, N. W., Reed, J. & Tycko, R. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 13045-13050.
55. Lansbury, P. T., Costa, P. R., Griffiths, J. M., Simon, E. J., Auger, M., Halverson, K. J., Kocisko, D. A., Hendsch, Z. S., Ashburn, T. T., Spencer, R. G. S. et al. (1995) Nat. Struct. Biol. 2, 990-998.
56. Balbach, J. J., Ishii, Y., Antzutkin, O. N., Leapman, R. D., Rizzo, N. W., Dyda, F., Reed, J. & Tycko, R. (2000) Biochemistry 39, 13748-13759.
57. Petkova, A. T., Buntkowsky, G., Dyda, F., Leapman, R. D., Yau, W. M. & Tycko, R. (2004) J. Mol. Biol. 335, 247-260.
58. Gordon, D., Balbach, J., Tycko, R. & Meredith, S. C. (2004) Biophys. J. 86, 428-434.
59. Petkova, A. T., Ishii, Y., Balbach, J. J., Antzutkin, O. N., Leapman, R. D., Delaglio, F. & Tycko, R. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 16742-16747.
60. Perutz, M., Finch, J., Berriman, J. & Lesk, A. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 5591-5595.
61. Wetzel, R. (2002) Structure 10, 1031-1036.
62. Bai, Y., Milne, J. S., Mayne, L. & Englander, S. W. (1994) Proteins 20, 4-14.
63. Bai, Y., Sosnick, T. R., Mayne, L. & Englander, S. W. (1995) Science 269, 192-197.
64. Bai, Y. & Englander, S. W. (1996) Proteins 24, 145-151.
65. Rumbley, J., Hoang, L., Mayne, L. & Englander, S. W. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 105-112.
66. Maity, H., Maity, M., Krishna, M. M. G., Mayne, L. & Englander, S. W. (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102, 4741-4746.