Vibrational stark effects on carbonyl, nitrile, and nitrosyl compounds including heme ligands, CO, CN, and NO, studied with density functional theory

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 108, Issue 20, 2004, Pages 6450-6457

  Dalosto, Sergio D ^a,b   Vanderkooi, Jane M ^a   Sharp, Kim A ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

^b YALE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHROMOPHORES; CORRELATION METHODS; CYANIDES; ELECTRIC FIELD EFFECTS; INFRARED RADIATION; LIGHT ABSORPTION; MOLECULAR STRUCTURE; MOLECULAR VIBRATIONS; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY; STARK TUNING RATES; VIBRATIONAL FREQUENCY; VIBRATRONAL STARK EFFECT (VSE) SPECTROSCOPY;

PROTEINS;

EID: 2642588311     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0310697     Document Type: Article

References (50)

1. Stubner, M.; Hecht, C.; Friedrich, J. Biophys. J, 2002, 83, 3553.
2. Stubner. M.; Hecht, C.: Friedrich, J. J. Phys. Chem Chem Phys. 2002, 4, 6080.
3. Pal, S. K.; Peon, J.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99. 1763.
4. Anni, H.; Vanderkooi. J. M.; Sharp, K. A.; Yonetani, T.; Hopkins, S. C.; Herenyi, L.; Fidy, J. Biochemistry 1994, 33, 3475.
5. Manas, E. S.; Wright, W. W.; Sharp, K. A.; Friedrich, J.; Vanderkooi, J. M. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 6932.
6. Prabhu, N. V.; Dalosto, S. D.; Sharp, K. A.; Wright, W. W.; Vanderkooi, J. M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 5561.
7. Rasnik, I.; Sharp. K.; Fee, J. A.; Vanderkooi, J. M. J. Phys. Chem. B 2001. 105, 282.
8. Cohen, B. E.; McAnaney, T. B.; Park. E. S.; Jan, Y. N.; Boxer, S. G.; Jan, L. Y. Science 2002, 296, 1700.
9. Getahun. Z.; Huang, C. Y.; Wang, T.: De Leon, B.; Degrado. W. F.; Gai, F. J. Am. Chem. Soc. 2003, 725, 405.
10. Bublitz, G. U.; Boxer, S. G. Annu. Rev. Phys. Chem. 1997, 48, 213.
11. Park, E. S.; Boxer, S. G. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 5800.
12. Andrews, S. S.; Boxer, S. G. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 11853.
13. Andrews, S. S.; Boxer, S. G. J. Phys. Chem. A 2002, 700, 469.
14. Chattopadhyay, A.; Boxer, S. G. J. Am. Chem. Soc. 1995. 117, 1449.
15. Reimers, J. R.; Hush. N. S. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 10580.
16. Thomas, M. R.; Brown D.; Franzen S.; Boxer, S. G. Biochemistry 2001. 40, 15047.
17. Liptay, W. Excited States 1974, 7, 129.
18. Bishop, D. M. Rev. Mod. Phys. 1990, 62, 343.
19. Bauschlicher, C. W., Jr. Chem. Phys. Lett. 1985, 118, 307.
20. Martí, J.; Luis, J. M.; Duran, M. Mol. Phys. 2000, 98. 513.
21. Hush, N. S.; Reimers, J. R. J. Phys. Chem. 1995, 99, 15798.
22. Lambert, D. K. J. Chem. Phys. 1988, 89, 3847.
23. Lambert, D. K. J. Chem. Phys. 1991, 94, 6237.
24. (a) Bishop, D. M. J. Chem. Phys. 1993, 98, 3179.
25. (b) Bishop, D. M. J. Chem. Phys. 1993, 99, 4875.
26. Brewer, S. H.; Franzen, S. J. Chem. Phys. 2003, 779, 851.
27. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
28. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
29. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372.
30. Adamo, C.; Barone, V. J. Chem. Phys. 1998, 108, 664.
31. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham. M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez. C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, revision E.2: Gaussian. Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
32. Schaefer, A.; Huber, C.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 1994, 100, 5829.
33. Dalosto, S. D.; Prabhu, N. V.; Vanderkooi, J. M.; Sharp, K. A. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 1884.
34. Ghosh, A.; Bocian, D. F. J. Phys. Chem. 1996, 100, 6363.
35. Bottcher, C. J. F. Theory of Electric Polarization; Elsevier Press: Amsterdam, 1973.
36. Reimers, J. R.; Hall, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1999, 127, 3730.
37. Pombeiro, A. J. L. Inorg. Chem. Commun. 2001, 4, 585.
38. Franzen, S. J. Am. Chem. Soc. 2001, 124, 13271.
39. Rovira, C.; Schulze, B.: Eichinger, M.; Evanseck, J. D.; Parrinello, M. Biophys. J. 2001, 87, 435.
40. Sigfridsson, E.; Ryde, U. J. Biol. Inorg. Chem. 1999, 4, 99.
41. Kushkuley, B.; Stavrov, S. S. Biophys. J. 1996, 70, 1214.
42. Head-Gordon, M.; Tully, J. C. Chem. Phys. 1993, 175, 37.
43. Nayak, S. K.; Nooijen, M.; Bernasek, S. L.; Biaha, P. J. Phys. Chem. 2001, 105, 164.
44. Park, E. S.; Thomas, M. R.; Boxer. S. G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12297.
45. Wondimagegn, T.; Ghosh, A. J. Am. Chem. Soc, 2001, 123, 5680.
46. Al-Mustafa, J. I. Vib. Spectrosc. 2002a, 30, 139.
47. Reddy, K. S.; Yonetani, T.; Tsuneshige, A.; Chance, B.; Kushkuley, B.; Stavrov, S. S.; Vanderkooi, J. M. Biochemistry 1996, 35, 5562.
48. Al-Mustafa, J. I. Vib. Spectrosc. 2002b, 951, 1.
49. Park, E. S.; Andrews, S. S.; Hu, R. B.; Boxer, S. G. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 9813.
50. Fujii, H. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 5936.