-
6
-
-
19944369519
-
-
Nam, K.; Gao, J.; York, D. M. J. Chem. Theor. Comp. 2005, 1, 2-13.
-
(2005)
J. Chem. Theor. Comp.
, vol.1
, pp. 2-13
-
-
Nam, K.1
Gao, J.2
York, D.M.3
-
8
-
-
0041786771
-
-
Li, G.; Zhang, X.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 8643-8653.
-
(2003)
J. Phys. Chem. B
, vol.107
, pp. 8643-8653
-
-
Li, G.1
Zhang, X.2
Cui, Q.3
-
10
-
-
34548059996
-
-
Schaefer, P.; Riccardi, D.; Cui, Q. J. Chem. Phys. 2005, 123, 014905.
-
(2005)
J. Chem. Phys.
, vol.123
, pp. 014905
-
-
Schaefer, P.1
Riccardi, D.2
Cui, Q.3
-
13
-
-
84986513644
-
-
Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 11(6), 700-733.
-
(1990)
J. Comput. Chem.
, vol.11
, Issue.6
, pp. 700-733
-
-
Field, M.J.1
Bash, P.A.2
Karplus, M.3
-
14
-
-
2642585833
-
-
Riccardi, D.; Li, G.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 6467-6478.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 6467-6478
-
-
Riccardi, D.1
Li, G.2
Cui, Q.3
-
16
-
-
0037115887
-
-
Das, D.; Eurenius, K. P.; Billings, E. M.; Sherwood, P.; Chattfield, D. C.; Hodošček, M.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10534-10547.
-
(2002)
J. Chem. Phys.
, vol.117
, pp. 10534-10547
-
-
Das, D.1
Eurenius, K.P.2
Billings, E.M.3
Sherwood, P.4
Chattfield, D.C.5
Hodošček, M.6
Brooks, B.R.7
-
18
-
-
0001763714
-
-
Reuter, N.; Dejaegere, A.; Maigret, B.; Karplus, M. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 1720-1735.
-
(2000)
J. Phys. Chem. A
, vol.104
, pp. 1720-1735
-
-
Reuter, N.1
Dejaegere, A.2
Maigret, B.3
Karplus, M.4
-
19
-
-
0000411659
-
-
Gao, J.; Amara, P.; Alhambra, C.; Field, M. J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4714-4721.
-
(1998)
J. Phys. Chem. A
, vol.102
, pp. 4714-4721
-
-
Gao, J.1
Amara, P.2
Alhambra, C.3
Field, M.J.4
-
20
-
-
0001582558
-
-
Zhang, Y.; Lee, T.; Yang, W. J. Chem. Phys. 1999, 770, 46-54.
-
(1999)
J. Chem. Phys.
, vol.770
, pp. 46-54
-
-
Zhang, Y.1
Lee, T.2
Yang, W.3
-
21
-
-
19944408652
-
-
Konig, P. H.; Hoffmann, M.; Frauenheim, T.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 9082-9095.
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 9082-9095
-
-
Konig, P.H.1
Hoffmann, M.2
Frauenheim, T.3
Cui, Q.4
-
23
-
-
0035249196
-
-
Im, W.; Bernéche, S.; Roux, B. J. Chem. Phys. 2001, 114(7), 2924-2937.
-
(2001)
J. Chem. Phys.
, vol.114
, Issue.7
, pp. 2924-2937
-
-
Im, W.1
Bernéche, S.2
Roux, B.3
-
25
-
-
25844522123
-
-
Schaefer, P.; Sampson, N.; Vrielink, A.; Cui, Q. in preparation
-
Schaefer, P.; Sampson, N.; Vrielink, A.; Cui, Q. in preparation.
-
-
-
-
27
-
-
0025234587
-
-
Anderson, D. E.; Becktel, W. J.; Dahlquist, F. W. Biochemistry 1990, 29, 2403-2408.
-
(1990)
Biochemistry
, vol.29
, pp. 2403-2408
-
-
Anderson, D.E.1
Becktel, W.J.2
Dahlquist, F.W.3
-
28
-
-
0026345864
-
-
Dao-pin, S.; Anderson, D. E.; Baase, W. A.; Dahlquist, F. W.; Matthews, B. W. Biochemistry 1991, 30, 11521-11529.
-
(1991)
Biochemistry
, vol.30
, pp. 11521-11529
-
-
Dao-Pin, S.1
Anderson, D.E.2
Baase, W.A.3
Dahlquist, F.W.4
Matthews, B.W.5
-
29
-
-
0035940421
-
-
Ondrechen, M. J.; Clifton, J. G.; Ringe, D. Proc. Natl. Acad. Sci. 2001, 22, 12473-12478.
-
(2001)
Proc. Natl. Acad. Sci.
, vol.22
, pp. 12473-12478
-
-
Ondrechen, M.J.1
Clifton, J.G.2
Ringe, D.3
-
34
-
-
33751500123
-
-
Lim, C.; Bashford, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. 1991, 95, 5610-5620.
-
(1991)
J. Phys. Chem.
, vol.95
, pp. 5610-5620
-
-
Lim, C.1
Bashford, D.2
Karplus, M.3
-
35
-
-
0035138053
-
-
Gordon, M.; Freitag, M. A.; Bandyopadhyay, P.; Jensen, J. H.; Kairys, V.; Stevens, W. J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 293-307.
-
(2001)
J. Phys. Chem. A
, vol.105
, pp. 293-307
-
-
Gordon, M.1
Freitag, M.A.2
Bandyopadhyay, P.3
Jensen, J.H.4
Kairys, V.5
Stevens, W.J.6
-
36
-
-
84961973524
-
-
Li, H.; Hains, A. W.; Everts, J. E.; Robertson, A. D.; Jensen, J. H. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 3486-3494.
-
(2002)
J. Phys. Chem. B
, vol.106
, pp. 3486-3494
-
-
Li, H.1
Hains, A.W.2
Everts, J.E.3
Robertson, A.D.4
Jensen, J.H.5
-
37
-
-
0001430625
-
-
Konecny, R.; Li, J.; Fisher, C. L.; Dillet, V.; Bashford, D.; Noodleman, D. A. Inorg. Chem. 1999, 38, 940.
-
(1999)
Inorg. Chem.
, vol.38
, pp. 940
-
-
Konecny, R.1
Li, J.2
Fisher, C.L.3
Dillet, V.4
Bashford, D.5
Noodleman, D.A.6
-
39
-
-
0028305457
-
-
Antosiewicz, J.; McCammon, J. A.; Gilson, M. K. J. Mol. Biol. 1994, 238, 415-436.
-
(1994)
J. Mol. Biol.
, vol.238
, pp. 415-436
-
-
Antosiewicz, J.1
McCammon, J.A.2
Gilson, M.K.3
-
40
-
-
84988087911
-
-
Gilson, M. K.; Sharp, K. A.; Honig, B. J. Comp. Chem. 1987, 9, 327-335.
-
(1987)
J. Comp. Chem.
, vol.9
, pp. 327-335
-
-
Gilson, M.K.1
Sharp, K.A.2
Honig, B.3
-
41
-
-
0023060081
-
-
Warshel, A.; Sussman, F.; King, G. Biochemistry 1986, 25, 8368-8372.
-
(1986)
Biochemistry
, vol.25
, pp. 8368-8372
-
-
Warshel, A.1
Sussman, F.2
King, G.3
-
42
-
-
0035451052
-
-
Sham, Y. Y.; Chu, Z. T.; Warshel, A. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2001, 44, 400-417.
-
(2001)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.44
, pp. 400-417
-
-
Sham, Y.Y.1
Chu, Z.T.2
Warshel, A.3
-
43
-
-
0035451052
-
-
Schutz, C. N.; Warshel, A. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2001, 44, 400-417.
-
(2001)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.44
, pp. 400-417
-
-
Schutz, C.N.1
Warshel, A.2
-
44
-
-
1842607440
-
-
Simonson, T.; Carlsson, J.; Case, D. A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4167-4180.
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.126
, pp. 4167-4180
-
-
Simonson, T.1
Carlsson, J.2
Case, D.A.3
-
47
-
-
0344778061
-
-
Still, W. C.; Tempczyk, A.; Hawley, R. C.; Hendrickson, T. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 6127-6129.
-
(1990)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.112
, pp. 6127-6129
-
-
Still, W.C.1
Tempczyk, A.2
Hawley, R.C.3
Hendrickson, T.4
-
50
-
-
0037058103
-
-
Grabowski, P.; Riccardi, D.; Gomez, M. A.; Asthagiri, D.; Pratt, L. R. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 9145-9148.
-
(2002)
J. Phys. Chem. A
, vol.106
, pp. 9145-9148
-
-
Grabowski, P.1
Riccardi, D.2
Gomez, M.A.3
Asthagiri, D.4
Pratt, L.R.5
-
51
-
-
0000301294
-
-
Tissandier, M.; Cowen, K.; Feng, W.; Gundlach, E.; Cohen, M.; Earhart, A.; Coe, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 7787-7794.
-
(1998)
J. Phys. Chem. A
, vol.102
, pp. 7787-7794
-
-
Tissandier, M.1
Cowen, K.2
Feng, W.3
Gundlach, E.4
Cohen, M.5
Earhart, A.6
Coe, J.7
-
54
-
-
0037180863
-
-
S̈trajbl, M.; Hong, G.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 13333-13343.
-
(2002)
J. Phys. Chem. B
, vol.106
, pp. 13333-13343
-
-
S̈trajbl, M.1
Hong, G.2
Warshel, A.3
-
55
-
-
1542742143
-
-
Yang, W.; Bitetti-Putzer, R.; Karplus, M. J. Chem. Phys. 2004, 120, 2618-2628.
-
(2004)
J. Chem. Phys.
, vol.120
, pp. 2618-2628
-
-
Yang, W.1
Bitetti-Putzer, R.2
Karplus, M.3
-
59
-
-
1542779956
-
-
Elstner, M.; Porezag, D.; Jungnickel, G.; Elstner, J.; Haugk, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S.;Seifert, G. Phys. Rev. B 1998, 58(11), 7260-7268.
-
(1998)
Phys. Rev. B
, vol.58
, Issue.11
, pp. 7260-7268
-
-
Elstner, M.1
Porezag, D.2
Jungnickel, G.3
Elstner, J.4
Haugk, M.5
Frauenheim, T.6
Suhai, S.7
Seifert, G.8
-
60
-
-
0242558240
-
-
Elstner, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S. THEOCHEM 2003, 632, 29.
-
(2003)
THEOCHEM
, vol.632
, pp. 29
-
-
Elstner, M.1
Frauenheim, T.2
Suhai, S.3
-
61
-
-
0345491105
-
-
Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.
-
(1988)
Phys. Rev. B
, vol.37
, pp. 785-789
-
-
Lee, C.1
Yang, W.2
Parr, R.G.3
-
66
-
-
26844534384
-
-
Krishnan, R.; Binkley, J. S.; Seeger, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1980, 72, 650-654.
-
(1980)
J. Chem. Phys.
, vol.72
, pp. 650-654
-
-
Krishnan, R.1
Binkley, J.S.2
Seeger, R.3
Pople, J.A.4
-
67
-
-
0035138648
-
-
Cui, Q.; Elstner, M.; Kaxiras, E.; Frauenheim, T.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105(2), 569-585.
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, Issue.2
, pp. 569-585
-
-
Cui, Q.1
Elstner, M.2
Kaxiras, E.3
Frauenheim, T.4
Karplus, M.5
-
68
-
-
0000218385
-
-
Lyne, P. D.; Hodoscek, M.; Karplus, M. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 3462-3471.
-
(1999)
J. Phys. Chem. A
, vol.103
, pp. 3462-3471
-
-
Lyne, P.D.1
Hodoscek, M.2
Karplus, M.3
-
71
-
-
7044239742
-
-
Kollman, P. Chem. Rev. 1993, 93, 2395-2417.
-
(1993)
Chem. Rev.
, vol.93
, pp. 2395-2417
-
-
Kollman, P.1
-
74
-
-
33751143432
-
-
Hummer, G.; Pratt, L. R.; Garcia, A. E. J. Chem. Phys. 1996, 100, 1206-1215.
-
(1996)
J. Chem. Phys.
, vol.100
, pp. 1206-1215
-
-
Hummer, G.1
Pratt, L.R.2
Garcia, A.E.3
-
75
-
-
0000123071
-
-
Bogusz, S., III; T. E. C.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 1998, 108, 7070-7084.
-
(1998)
J. Chem. Phys.
, vol.108
, pp. 7070-7084
-
-
Bogusz III, S.1
C., T.E.2
Brooks, B.R.3
-
77
-
-
0343005873
-
-
Weber, W.; Hünenberger, P. H.; McCammon, J. A. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 3668-3675.
-
(2000)
J. Phys. Chem. B
, vol.104
, pp. 3668-3675
-
-
Weber, W.1
Hünenberger, P.H.2
McCammon, J.A.3
-
81
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comp. Chem. 1983, 4(2), 187-217.
-
(1983)
J. Comp. Chem.
, vol.4
, Issue.2
, pp. 187-217
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
82
-
-
33645961739
-
-
Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593.
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 8577-8593
-
-
Essmann, U.1
Perera, L.2
Berkowitz, M.L.3
-
83
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
86
-
-
33646940952
-
-
Rychaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341.
-
(1977)
J. Comput. Phys.
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Rychaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.3
-
87
-
-
36449003554
-
-
Martyna, G. J.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1994, 107, 4177-4189.
-
(1994)
J. Chem. Phys.
, vol.107
, pp. 4177-4189
-
-
Martyna, G.J.1
Tobias, D.J.2
Klein, M.L.3
-
88
-
-
0026009211
-
-
Dao-pin, S.; Söderlind, E.; Baase, W. A.; Wozniak, J. A.; Sauer, U.; Matthews, B. W. J. Mol. Biol. 1991, 221, 873-887.
-
(1991)
J. Mol. Biol.
, vol.221
, pp. 873-887
-
-
Dao-Pin, S.1
Söderlind, E.2
Baase, W.A.3
Wozniak, J.A.4
Sauer, U.5
Matthews, B.W.6
-
89
-
-
0041784950
-
-
Jr., A. D. M.; Bashford, D.; Bellot, M.; Jr., R. L. D.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; III., W. E. R.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586-3616
-
-
M. Jr., A.D.1
Bashford, D.2
Bellot, M.3
D. Jr., R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-McCarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
R. III, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
90
-
-
25844502264
-
-
Range, K.; Riccardi, D.; Elstner, M.; Cui, Q.; York, D., in preparation
-
Range, K.; Riccardi, D.; Elstner, M.; Cui, Q.; York, D., in preparation.
-
-
-
-
91
-
-
25844526214
-
-
Elstner, M.; Cui, Q., work in progress
-
Elstner, M.; Cui, Q., work in progress.
-
-
-
-
92
-
-
0032558947
-
-
Petersson, G. A.; Malick, D. K.; Wilson, W. G.; Ochterski, J. W.; Montgomery, J. A.; Frisch, M. J. J. Chem. Phys. 1998, 109, 10570-10579.
-
(1998)
J. Chem. Phys.
, vol.109
, pp. 10570-10579
-
-
Petersson, G.A.1
Malick, D.K.2
Wilson, W.G.3
Ochterski, J.W.4
Montgomery, J.A.5
Frisch, M.J.6
-
93
-
-
0041401966
-
-
Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Trucks, G. W.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1991, 94, 7221.
-
(1991)
J. Chem. Phys.
, vol.94
, pp. 7221
-
-
Curtiss, L.A.1
Raghavachari, K.2
Trucks, G.W.3
Pople, J.A.4
-
98
-
-
0000642138
-
-
Darden, T.; Pearlman, D.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1998, 109, 10921-10935.
-
(1998)
J. Chem. Phys.
, vol.109
, pp. 10921-10935
-
-
Darden, T.1
Pearlman, D.2
Pedersen, L.G.3
-
100
-
-
0032831070
-
-
Burley, S. K.; Almo, S. C.; Bonanno, J. B.; Capel, M.; Chance, M. R.; Gaasterland, T.; Lin,D.; Sali, A.; Studier, F. W.; Swaminathan, S. Nature Genet. 1999, 23, 151-157.
-
(1999)
Nature Genet.
, vol.23
, pp. 151-157
-
-
Burley, S.K.1
Almo, S.C.2
Bonanno, J.B.3
Capel, M.4
Chance, M.R.5
Gaasterland, T.6
Lin, D.7
Sali, A.8
Studier, F.W.9
Swaminathan, S.10
-
103
-
-
0027563464
-
-
Yang, A.; Gunner, M. R.; Sampogna, R.; Sharp, K.; Honig, B. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1993, 15, 252-265.
-
(1993)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.15
, pp. 252-265
-
-
Yang, A.1
Gunner, M.R.2
Sampogna, R.3
Sharp, K.4
Honig, B.5
|