-
1
-
-
0003880161
-
-
Garland Publishing: New York
-
Alberts, B.; Bray, D.; Lewis, J.; Raff, M.; Roberts, K.; Watson, J. D. Molecular biology of the Cell, 3rd ed.; Garland Publishing: New York, 1994.
-
(1994)
Molecular Biology of the Cell, 3rd Ed.
-
-
Alberts, B.1
Bray, D.2
Lewis, J.3
Raff, M.4
Roberts, K.5
Watson, J.D.6
-
2
-
-
0033576277
-
-
Michel, H. Biochem. 1999, 38, 15129-15140.
-
(1999)
Biochem.
, vol.38
, pp. 15129-15140
-
-
Michel, H.1
-
6
-
-
0012154673
-
-
Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Redfern, P. C.; Rassolov, V.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1998, 109, 7764.
-
(1998)
J. Chem. Phys.
, vol.109
, pp. 7764
-
-
Curtiss, L.A.1
Raghavachari, K.2
Redfern, P.C.3
Rassolov, V.4
Pople, J.A.5
-
7
-
-
0041401966
-
-
Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Trucks, G. W.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1991, 94, 7221.
-
(1991)
J. Chem. Phys.
, vol.94
, pp. 7221
-
-
Curtiss, L.A.1
Raghavachari, K.2
Trucks, G.W.3
Pople, J.A.4
-
9
-
-
0001242209
-
-
Svensson, M.; Humbel, S.; Morokuma, K. J. Chem. Phys. 1996, 105, 3654.
-
(1996)
J. Chem. Phys.
, vol.105
, pp. 3654
-
-
Svensson, M.1
Humbel, S.2
Morokuma, K.3
-
10
-
-
84961973524
-
-
Li, H.; Hains, A. W.; Everts, J. E.; Robertson, A. D.; Jensen, J. H. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 3486-3494.
-
(2002)
J. Phys. Chem. B
, vol.106
, pp. 3486-3494
-
-
Li, H.1
Hains, A.W.2
Everts, J.E.3
Robertson, A.D.4
Jensen, J.H.5
-
11
-
-
0001430625
-
-
Konecny, R.; Li, J.; Fisher, C. L.; Dillet, V.; Bashford, D.; Noodleman, D. A. Inorg. Chem. 1999, 38, 940.
-
(1999)
Inorg. Chem.
, vol.38
, pp. 940
-
-
Konecny, R.1
Li, J.2
Fisher, C.L.3
Dillet, V.4
Bashford, D.5
Noodleman, D.A.6
-
12
-
-
33751500123
-
-
Lim, C.; Bashford, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. 1991, 95, 5610-5620.
-
(1991)
J. Phys. Chem.
, vol.95
, pp. 5610-5620
-
-
Lim, C.1
Bashford, D.2
Karplus, M.3
-
14
-
-
0037149134
-
-
Klicic, J. J.; Friesner, R. A.; Liu, S. Y.; Guida, W. C. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1327-1335.
-
(2002)
J. Phys. Chem. A
, vol.106
, pp. 1327-1335
-
-
Klicic, J.J.1
Friesner, R.A.2
Liu, S.Y.3
Guida, W.C.4
-
21
-
-
0027563464
-
-
Yang, A. S.; Gunner, M. R.; Sampogna, R.; Sharp, K.; Honig, B. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1993, 15, 252.
-
(1993)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.15
, pp. 252
-
-
Yang, A.S.1
Gunner, M.R.2
Sampogna, R.3
Sharp, K.4
Honig, B.5
-
22
-
-
0028305457
-
-
Antosiewicz, J.; McCammon, J. A.; Gilson, M. K. J. Mol. Biol. 1994, 238, 415.
-
(1994)
J. Mol. Biol.
, vol.238
, pp. 415
-
-
Antosiewicz, J.1
McCammon, J.A.2
Gilson, M.K.3
-
23
-
-
0035451052
-
-
Schutz, C. N.; Warshel, A. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2001, 44, 400.
-
(2001)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.44
, pp. 400
-
-
Schutz, C.N.1
Warshel, A.2
-
25
-
-
0029665693
-
-
Antosiewicz, J.; McCammon, J. A.; Gilson, M. K. Biochemistry 1996, 35, 7819-7833.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 7819-7833
-
-
Antosiewicz, J.1
McCammon, J.A.2
Gilson, M.K.3
-
26
-
-
0031670370
-
-
van Vlijmen, H. W. T.; Schaefer, M.; Karplus, M. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1998, 33, 145-158.
-
(1998)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.33
, pp. 145-158
-
-
Van Vlijmen, H.W.T.1
Schaefer, M.2
Karplus, M.3
-
27
-
-
0026611315
-
-
Langen, R.; Brayer, G. D.; Berghuis, A. M.; McLendon, G.; Sherman, F.; Warshel, A. J. Mol. Biol. 1992, 224, 589.
-
(1992)
J. Mol. Biol.
, vol.224
, pp. 589
-
-
Langen, R.1
Brayer, G.D.2
Berghuis, A.M.3
McLendon, G.4
Sherman, F.5
Warshel, A.6
-
28
-
-
0000671518
-
-
Sham, Y.; Chu, Z. T.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 4458-4472.
-
(1997)
J. Phys. Chem. B
, vol.101
, pp. 4458-4472
-
-
Sham, Y.1
Chu, Z.T.2
Warshel, A.3
-
29
-
-
84962367344
-
-
K. B., Boyd, D. B., Eds.; VCH: New York
-
Gao, J. In Reviews in Computational Chemistry; Lipkowitza, K. B., Boyd, D. B., Eds.; VCH: New York, 1996; Vol. 7, p 119.
-
(1996)
Reviews in Computational Chemistry; Lipkowitza
, vol.7
, pp. 119
-
-
Gao, J.1
-
30
-
-
84986513644
-
-
Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 11, 700-733.
-
(1990)
J. Comput. Chem.
, vol.11
, pp. 700-733
-
-
Field, M.J.1
Bash, P.A.2
Karplus, M.3
-
34
-
-
0036286654
-
-
Simonson, T.; Archontis, G.; Karplus, M. Acc. Chem. Res. 2002, 35, 430.
-
(2002)
Acc. Chem. Res.
, vol.35
, pp. 430
-
-
Simonson, T.1
Archontis, G.2
Karplus, M.3
-
36
-
-
0041734330
-
-
Formaneck, M. S.; Li, G.; Zhang, X.; Cui, Q. J. Theor. Comput. Chem. 2002, 1, 53-67.
-
(2002)
J. Theor. Comput. Chem.
, vol.1
, pp. 53-67
-
-
Formaneck, M.S.1
Li, G.2
Zhang, X.3
Cui, Q.4
-
38
-
-
0030890485
-
-
Warshel, A.; Papazyan, A.; Muegge, I. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 143-152.
-
(1997)
J. Biol. Inorg. Chem.
, vol.2
, pp. 143-152
-
-
Warshel, A.1
Papazyan, A.2
Muegge, I.3
-
39
-
-
0037473550
-
-
Olsson, M. H. M.; Hong, G. Y.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 5025-5039.
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.125
, pp. 5025-5039
-
-
Olsson, M.H.M.1
Hong, G.Y.2
Warshel, A.3
-
42
-
-
0023060081
-
-
Warshel, A.; Sussman, F.; King, G. Biochemistry 1986, 25, 8368.
-
(1986)
Biochemistry
, vol.25
, pp. 8368
-
-
Warshel, A.1
Sussman, F.2
King, G.3
-
45
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341.
-
(1977)
J. Comput. Phys.
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.3
-
49
-
-
0029757992
-
-
Roux, B.; Nina, M.; Pomes, R.; Smith, J. Biophys. J. 1996, 71, 670.
-
(1996)
Biophys. J.
, vol.71
, pp. 670
-
-
Roux, B.1
Nina, M.2
Pomes, R.3
Smith, J.4
-
50
-
-
0003871536
-
-
Becker, O. M., Mackerell, A. D. J., Roux, B., Watanabe, M., Eds.; Marcel Dekker: New York
-
Simonson, T. In Computational biochemistry and biophysics; Becker, O. M., Mackerell, A. D. J., Roux, B., Watanabe, M., Eds.; Marcel Dekker: New York, 2001.
-
(2001)
Computational Biochemistry and Biophysics
-
-
Simonson, T.1
-
53
-
-
36849121788
-
-
Herschbach, D. R.; Johnston, H. S.; Rapp, D. J. Chem. Phys. 1959, 31, 1652-1661.
-
(1959)
J. Chem. Phys.
, vol.31
, pp. 1652-1661
-
-
Herschbach, D.R.1
Johnston, H.S.2
Rapp, D.3
-
55
-
-
0037058103
-
-
Grabowski, P.; Riccardi, D.; Gomez, M. A.; Asthagiri, D.; Pratt, L. R. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 9145-9148.
-
(2002)
J. Phys. Chem. A
, vol.106
, pp. 9145-9148
-
-
Grabowski, P.1
Riccardi, D.2
Gomez, M.A.3
Asthagiri, D.4
Pratt, L.R.5
-
56
-
-
0000301294
-
-
Tissandier, M.; Cowen, K.; Feng, W.; Gundlach, E.; Cohen, M.; Earhart, A.; Coe, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 7787-7794.
-
(1998)
J. Phys. Chem. A
, vol.102
, pp. 7787-7794
-
-
Tissandier, M.1
Cowen, K.2
Feng, W.3
Gundlach, E.4
Cohen, M.5
Earhart, A.6
Coe, J.7
-
58
-
-
0037180863
-
-
Strajbl, M.; Hong, G. Y.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 13333-13343.
-
(2002)
J. Phys. Chem. B
, vol.106
, pp. 13333-13343
-
-
Strajbl, M.1
Hong, G.Y.2
Warshel, A.3
-
60
-
-
84962352816
-
-
Simonson, T.; Calimet, N. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2002, 49, 37-48.
-
(2002)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.49
, pp. 37-48
-
-
Simonson, T.1
Calimet, N.2
-
61
-
-
1542779956
-
-
Elstner, M.; Porezag, D.; Jungnickel, G.; Elsner, J.; Haugk, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S.; Seigert, G. Phys. Rev. 1998, B58, 7260-7268.
-
(1998)
Phys. Rev.
, vol.B58
, pp. 7260-7268
-
-
Elstner, M.1
Porezag, D.2
Jungnickel, G.3
Elsner, J.4
Haugk, M.5
Frauenheim, T.6
Suhai, S.7
Seigert, G.8
-
62
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
63
-
-
0000036869
-
-
Neria, E.; Fischer, S.; Karplus, M. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1902-1921.
-
(1996)
J. Chem. Phys.
, vol.105
, pp. 1902-1921
-
-
Neria, E.1
Fischer, S.2
Karplus, M.3
-
64
-
-
0033466066
-
-
Bohr, H. G.; Jalkanen, K. J.; Elstner, M.; Frimand, K.; Suhai, S. Chem. Phys. 1999, 246, 13-36.
-
(1999)
Chem. Phys.
, vol.246
, pp. 13-36
-
-
Bohr, H.G.1
Jalkanen, K.J.2
Elstner, M.3
Frimand, K.4
Suhai, S.5
-
65
-
-
0034656826
-
-
Elstner, M.; Jalkanen, K. J.; Knapp-Mohammady, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S. Chem. Phys. 2000, 256, 15-27.
-
(2000)
Chem. Phys.
, vol.256
, pp. 15-27
-
-
Elstner, M.1
Jalkanen, K.J.2
Knapp-Mohammady, M.3
Frauenheim, T.4
Suhai, S.5
-
66
-
-
0035863003
-
-
Elstner, M.; Jalkanen, K. J.; Knapp-Mohammady, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S. Chem. Phys. 2001, 263, 203-219.
-
(2001)
Chem. Phys.
, vol.263
, pp. 203-219
-
-
Elstner, M.1
Jalkanen, K.J.2
Knapp-Mohammady, M.3
Frauenheim, T.4
Suhai, S.5
-
67
-
-
0035138648
-
-
Cui, Q.; Elstner, M.; Kaxiras, E.; Frauenheim, T.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 569-585.
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, pp. 569-585
-
-
Cui, Q.1
Elstner, M.2
Kaxiras, E.3
Frauenheim, T.4
Karplus, M.5
-
68
-
-
4143095330
-
-
Kendall, R. A.; Dunning, T. H., Jr.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 1992, 96, 6796.
-
(1992)
J. Chem. Phys.
, vol.96
, pp. 6796
-
-
Kendall, R.A.1
Dunning Jr., T.H.2
Harrison, R.J.3
-
69
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A. D., Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L., Jr.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E., III.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stole, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Kraplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586-3616
-
-
Mackerell Jr., A.D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack Jr., R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-Mccarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher III, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stole, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Kraplus, M.29
more..
-
70
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217.
-
(1983)
J. Comput. Chem.
, vol.4
, pp. 187-217
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
73
-
-
34250928962
-
-
Born, M. Z. Phys. 1920, 1, 45.
-
(1920)
Z. Phys.
, vol.1
, pp. 45
-
-
Born, M.1
-
74
-
-
0003475941
-
-
van Gunsteren, W., Weiner, P., Wilkinson, A., Eds.; ESCOM Science: Leiden
-
van Gunsteren, W.; Beutler, T.; Fratemali, F.; King, P.; Mark, A.; Smith, P. In Computer simulation of biomolecules systems; van Gunsteren, W., Weiner, P., Wilkinson, A., Eds.; ESCOM Science: Leiden, 1993.
-
(1993)
Computer Simulation of Biomolecules Systems
-
-
Van Gunsteren, W.1
Beutler, T.2
Fratemali, F.3
King, P.4
Mark, A.5
Smith, P.6
-
76
-
-
0141566583
-
-
Elstner, M.; Cui, Q.; Munih, P.; Kaxiras, E.; Frauenheim, T.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2003, 24, 565-581.
-
(2003)
J. Comput. Chem.
, vol.24
, pp. 565-581
-
-
Elstner, M.1
Cui, Q.2
Munih, P.3
Kaxiras, E.4
Frauenheim, T.5
Karplus, M.6
|