@-tides as reporters for molecular associations

Journal of the American Chemical Society

Volumn 127, Issue 12, 2005, Pages 4193-4198

  Phillips, Scott T ^a   Blasdel, Landy K ^a   Bartlett, Paul A ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; ASSOCIATION REACTIONS; CONFORMATIONS; DIMERIZATION; MOLECULAR DYNAMICS; ORGANIC SOLVENTS; POLYPEPTIDES;

1,6-DIHYDRO-3(2H)-PYRIDINONE; CIRCULAR DICHROISM (CD); MOLECULAR ASSOCIATIONS; OLIGOPEPTIDES;

KETONES;

1,6 DIHYDRO 3(2H) PYRIDINONE; AMINO ACID; OLIGOPEPTIDE; PYRIDONE DERIVATIVE; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; BETA SHEET; CIRCULAR DICHROISM; CONCENTRATION (PARAMETERS); CONFORMATION; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR INTERACTION; MOLECULAR STABILITY; PROTEIN FOLDING; QUANTITATIVE ASSAY; SENSITIVITY ANALYSIS;

CIRCULAR DICHROISM; DIMERIZATION; OLIGOPEPTIDES; PEPTIDES, CYCLIC; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; PYRIDONES; THERMODYNAMICS;

EID: 16244401938     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja045122w     Document Type: Article

References (53)

1. Venkatraman, J.; Shankaramma, S. C.; Balaram, P. Chem. Rev. 2001, 101, 3131-3152.
2. Baltzer, L.; Nilsson, H.; Nilsson, J. Chem. Rev. 2001, 101, 3153-3164.
3. Uetz, P.; Giot, L.; Cagney, G.; Mansfield, T. A.; Judson, R. S.; Knight, J. R.; Lockshon, D.; Narayan, V.; Srinivasan, M.; Pochart, P.; Qureshi-Emili, A.; Li, Y.; Godwin, B.; Conover, D.; Kalbfleisch, T.; Vijayadamodar, G.; Yang, M.; Johnston, M.; Fields, S.; Rothberg, J. M. Nature 2000, 403, 623-627.
4. Archakov, A. I.; Govorun, V. M.; Dubanov, A. V.; Ivanov, Y. D.; Veselovsky, A. V.; Lewi, P.; Janssen, P. Proteomics 2003, 3, 380-391.
5. Stanfield, R. L.; Wilson, I. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 1995, 5, 103-113.
6. Syud, F. A.; Espinosa, J. F.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 11577-11578.
7. Santiveri, C. M.; Santoro, J.; Rico, M.; Jimenez, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14903-14909.
8. Gellman, S. H. Curr. Opin. Chem. Biol. 1998, 2, 717-725.
9. Nesloney, C. L.; Kelly, J. W. Bioorg. Med. Chem. 1996, 4, 739-766.
10. Bush, C. A.; Sarkar, S. K.; Kopple, K. D. Biochemistry 1978, 17, 4951-4954.
11. Wu, P.; Brand, L. Anal. Biochem. 1994, 218, 1-13.
12. Golemis, E. Protein-Protein Interactions; Cold Spring Harbor Laboratory Press: New York, 2002.
13. Smith, E. A.; Corn, R. M. Appl. Spectrosc. 2003, 57, 320A-332A.
14. Cooper, A. Thermodynamics of Protein-Protein and Peptide Interactions; Kluwer Academic: Dordrecht, The Netherlands, 2001.
15. Bohm, H.-J.; Schneider, G. Protein-Ligand Interactions; Wiley-VCH GmbH & Co. KGaA, 2003.
16. Permyakov, E. A. Luminescent Spectroscopy of Proteins; CRC Press: Ann Arbor, MI, 1993.
17. Berova, N.; Nakanishi, K.; Woody, R. W. Circular Dichroism Principles and Applications, 2nd ed.; John Wiley & Sons: New York, 2000.
18. Distefano, M. D.; Zhong, A.; Cochran, A. G. J. Mol. Biol. 2002, 322, 179-188.
19. Searle, M. S.; Platt, G. W.; Bofill, R.; Simpson, S. A.; Ciani, B. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 1991-1994.
20. Phillips, S. T.; Blasdel, L. K.; Bartlett, P. A. J. Org. Chem. 2005, 70, in press.
21. Searle, M. S. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 2001, 1011-1020.
22. Phillips, S. T.; Rezac, M.; Abel, U.; Kossenjans, M.; Bartlett, P. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 58-66.
23. Stanger, H. E.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4236-4237.
24. Honda, S.; Yamasaki, K.; Sawada, Y.; Morii, H. Structure 2004, 12, 1507-1518.
25. Schenck, H. L.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4869-4870.
26. Espinosa, J. F.; Syud, F. A.; Gellman, S. H. Protein Sci. 2002, 11, 1492-1505.
27. Cochran, A. G.; Skelton, N. J.; Starovasnik, M. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 5578-5583.
28. Doig, A. J. Chem. Commun. 1997, 2153-2154.
29. Hughes, E.; Burke, R. M.; Doig, A. J. J. Biol. Chem. 2000, 275, 25109-25115.
30. Sharman, G. J.; Griffiths-Jones, S. R.; Jourdan, M.; Searle, M. S. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12318-12324.
31. Ramirez-Alvarado, M.; Kortemme, T.; Blanco, F. J.; Serrano, L. Bioorg. Med. Chem. 1999, 7, 93-103.
32. Cochran, A. G.; Tong, R. T.; Starovasnik, M. A.; Park, E. J.; McDowell, R. S.; Theaker, J. E.; Skelton, N. J. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 625-632.
33. Russell, S. J.; Blandl, T.; Skelton, N. J.; Cochran, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 388-395.
34. Russell, S. J.; Cochran, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12600-12601.
35. Haque, T. S.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2303-2304.
36. Smith, C. K.; Regan, L. Science 1995, 270, 980-982.
37. Smith, C. K.; Regan, L. Acc. Chem. Res. 1997, 30, 153-161.
38. Ciani, B.; Jourdan, M.; Searle, M. S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9038-9047.
39. Searle, M. S.; Griffiths-Jones, S. R.; Skinner-Smith, H. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 11615-11620.
40. Blasie, C. A.; Berg, J. M. Biochemistry 1997, 36, 6218-6222.
41. Kiehna, S. E.; Waters, M. L. Protein Sci. 2003, 12, 2657-2667.
42. Syud, F. A.; Stanger, H. E.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 8667-8677.
43. Stanger, H. E.; Syud, F. A.; Espinosa, J. F.; Giriat, I.; Muir, T.; Gellman, S. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 12015-12020.
44. Tatko, C. D.; Waters, M. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2028-2034.
45. Maynard, A. J.; Sharman, G. J.; Searle, M. S. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 1996-2007.
46. Griffiths-Jones, S. R.; Maynard, A. J.; Searle, M. S. J. Mol. Biol. 1999, 292, 1051-1069.
47. Espinosa, J. F.; Munoz, V.; Gellman, S. H. J. Mol. Biol. 2001, 306, 397-402.
48. Tatko, C. D.; Waters, M. L. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9372-9373.
49. Espinosa, J. F.; Gellman, S. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2000, 39, 2330-2332.
50. Cho, Y. R.; Maguire, A. J.; Try, A. C.; Westwell, M. S.; Groves, P.; Williams, D. H. Chem. Biol. 1996, 3, 207-215.
51. Mackay, J. P.; Gerhard, U.; Beauregard, D. A.; Maplestone, R. A.; Williams, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 4573-4580.
52. Williams, D. H.; Westwell, M. S. Chem. Soc. Rev. 1998, 27, 57-63.
53. Phillips, S. T.; Piersanti, G.; Rüth, M.; Gubernator, N.; van Lengerich, B.; Bartlett, P. A. Org. Lett. 2004, 6, 4483-4485.