Comparative Quantitative Structure-Activity Relationship Studies on Anti-HIV Drugs

Chemical Reviews

Volumn 99, Issue 12, 1999, Pages 3525-3601

  Garg, Rajni ^a   Gupta, Satya P ^b   Gao, Hua ^c   Babu, Mekapati Suresh ^b   Debnath, Asim Kumar ^d   Hansch, Corwin ^a  

^a POMONA COLLEGE   (United States)

^b BIRLA INSTITUTE OF TECHNOLOGY AND SCIENCE   (India)

^c PFIZER INC   (United States)

^d NEW YORK BLOOD CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0346207528     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr9703358     Document Type: Article

References (207)

1. Barre-Sinoussi, F.; Chermann, J.-C.; Rey, F.; Nugeyre, M. T.; Chamaret, S.; Gruest, J.; Dauguet, C.; Axler-Blin, C.; Vezinet-Brun, F.; Rouzioux, C.; Rozenbaum, W.; Montagnier, L. Science 1983, 220, 868.
2. (a) Popovic, M.; Sarngadharan, M. G.; Read, E.; Gallo, R. C. Science 1984, 224, 497.
3. (b) Gallo, R. C.; Salahuddin, S. Z.; Popovic, M.; Shearer, G. M.; Kaplan, M.; Haynes, B. F.; Palker, T. J.; Redfield, R.; Oleske, J.; Safai, B.; White, G.; Foster, P.; Markham, P. D. Science 1984, 224, 500.
4. Gallo, R. C.; Montagnier, L. Sci. Am. 1988, 259, 40.
5. Coffin, J.; Hasse, A.; Levy, J. A.; Montagnier, L.; Oroszlan, S.; Teich, N.; Temin, H.; Toyoshmia, K.; Varmus, H.; Vogt, P.; Weiss, R. Science 1986, 232, 697.
6. Levy, J. A. JAMA 1989, 261, 2997 and references therein.
7. Clavel, F.; Guyader, M.; Guetard, D.; Salle, M.; Montagnier, L.; Alizon, M. Nature (London) 1986, 324, 691.
8. Guyader, M.; Emerman, M.; Sonigo, P.; Clavel, F.; Montagnier, L.; Alizon, M. Nature (London) 1987, 326, 662.
9. Bowen, D. L.; Lane, H. C.; Fauci, A. S. Ann. Intern. Med. 1985, 103, 704.
10. Embretson, J.; Zupancic, M.; Ribas, J. L.; Burke, L.; Racz, P.; Tenner-Racz, K.; Haase, A. T. Nature (London) 1993, 362, 359.
11. (a) Isselbacher, K. J.; Eugene, B.; Wilson, J.; Martin, J. B.; Fauci, A. S.; Dennis, L. K. In Harrison's Principles of Internal Medicine, 13th ed.; McGraw-Hill: New York, 1994; Vol. 1.
12. (b) Gallo, R. C. Sci. Am. 1987, 46.
13. Fauci, A. S. Science 1988, 239, 617.
14. De Clercq, E. J. Med. Chem. 1995, 38, 2491.
15. Hussey, R. E.; Richardson, N. E.; Kowalski, M.; Brown, N. R.; Chang, H.-C.; Siliciano, R. F.; Dorfman, T.; Walker, B.; Sodroski, J.; Reinherz, E. L. Nature (London) 1988, 331, 78.
16. Broder, S.; Yarchoan, R.; Collins, J. M. Lancet 1985, 2, 627.
17. Lorentsen, K. J.; Hendrix, C. W.; Collins, J. M.; Komhauser, D. M.; Petty, B. G.; Klecker, R. W.; Flexner, C.; Eckel, R. H.; Lietman, P. S. Ann. Intern, Med. 1989, 111, 561.
18. Balzarini, J.; Neyts, J.; Schols, D.; Hosoya, M.; Van Damme, E.; Peumans, W.; De. Clercq, E. Antiviral Res. 1992, 18, 191.
19. Balzarini, J.; Schols, D.; Neyts, J.; Van Damme, E.; Peumans, W.; De Clercq, E. Antimicro. Agents Chemother. 1991, 35, 410.
20. Nakashima, H.; Masuda, M.; Murakami, T.; Koyanagi, Y.; Matsumoto, A.; Fujii, N.; Yamamoto, N. Antimicrob. Agents Chemother. 1992, 36, 1249.
21. Jansen, R. W.; Molema, G.; Pauwels, R.; Schols, D.; De Clercq, E.; Meijer, D. K. F. Mol. Pharmacol. 1991, 39, 818.
22. Jansen, R. W.; Schols, D.; Pauwels, R.; De Clercq, E.; Meijer, D. K. F. Mol. Pharmacol. 1993, 44, 1003.
23. (a) Mayaux, J. F.; Bousseau, A.; Pauwels, R.; Huet, T.; Henin, Y.; Dereu, N.; Evers, M.; Soler, F.; Poujade, C.; De Clercq, E.; Pecq, J.-B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 3564.
24. (b) Debnath, A. K.; Radigam, L.; Jiang, S. J. Med. Chem. 1999, 42, 3202.
25. Rossamann, M. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 4625.
26. De Clercq, E. Med. Res. Rev. 1993, 13, 229.
27. De Clercq, E. Exp. Opin. Invest. Drugs 1994, 3, 253.
28. Fesen, M. R.; Kohn, K. W.; Leteurtre, F.; Pommier, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 2399.
29. Fesen, M. R.; Pommier, Y.; Leteurtre, F.; Hiroguchi, S.; Yung, J.; Kohn, K. W. Biochem. Pharmacol. 1994, 48, 595.
30. Mayaux, J. F.; Huet, T.; Pernelle, C.; Becquart, J.; Gueguen, J. C.; Tahraui, L.; Evers, M.; Henin, Y.; Bousseau, A.; Dereu, N. Abstracts of the NIH Conference on Retroviral Integrase, Bethesda, MD, January 19-20, 1995.
31. Stein, C. A.; Cheng, Y.-C. Science 1993, 261, 1004.
32. Kohl, N. E.; Emini, N. A.; Schleif, W. A.; Davis, L. J.; Heimbach, J. C.; Dixon, R. A. F.; Scolnick, E. M.; Sigal, I. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 4686.
33. Peng, C.; Ho, B. K; Chang, T. W.; Chang, N. T. J. Virol. 1989, 63, 2550.
34. Wlodawer, A.; Ericson, J. W. Annu. Rev. Biochem. 1993, 62, 543.
35. Appelt, K. Perspect. Drug Discovery Des. 1993, 1, 23.
36. Boehme, R. E.; Borthwick, A. D.; Wyatt, P. G. Annu. Rep. Med. Chem. 1995, 30, 139.
37. Babine, R. E.; Bender, S. L. Chem. Rev. 1997, 97, 1359.
38. Jacobsen, H.; Yasargil, K.; Winslow, D. L.; Craig, J. C.; Krohn, A.; Duncan, I. B.; Mous, J. Virology 1995, 206, 527.
39. Ratner, L.; vander Heyden, N. AIDS Res. Human Retrov. 1993, 9, 291.
40. BioByte Corporation, C-QSAR database, 201W Fourth St., Suite no. 204, Claremont, CA 91711-4707.
41. Hansch, C.; Gao, H.; Hoekman, D. In Comparative QSAR; Devillers, J., Ed.; Taylor & Francis: Washington, DC, 1998.
42. Hansch, C.; Leo, A.; Hoekman, D. Exploring QSAR:Hydrophobic, Electronic and Steric Constants; American Chemical Society: Washington, DC, 1995.
43. Hansch, C.; Leo, A. Exploring QSAR: Fundamentals and Applications in Chemistry and Biology; American Chemical Society: Washington, DC, 1995.
44. Verloop, A. The STERIMOL Approach to Drug Design; Marcel Dekker: New York, 1987.
45. Huang, P.; Farquhar, D.; Plunkett, W. J. Biol. Chem. 1990, 265, 11914.
46. De Clercq, E. AIDS Res. Human Retrov. 1992, 8, 119.
47. Althaus, I. W.; Chou, J. J.; Gonzales, A. J.; Deibel, M. R.; Chou, K. C.; Kezdy, F. J.; Romero, D. L.; Thomas, R. C.; Aristoff, P. A.; Tarpley, W. G.; Reusser, F. Biochem. Pharmacol. 1994, 47, 2017.
48. Hansch, C. Acc. Chem. Res. 1993, 26, 147.
49. Jacobo-Molina, A.; Ding, J.; Nanni, R. G.; Clark, A. D., Jr.; Lu, X.; Tantillo, C.; Williams, R. L.; Kamer, G.; Ferris, A. L.; Clark, P.; Hizi, A.; Hughes, S. H.; Arnold, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 6320.
50. Nanni, R. G.; Ding, J.; Jacobo, M. A.; Hughes, S. H.; Arnold, E. Perspect. Drug Discovery Des. 1993, 1, 129.
51. Pauwels, R.; Andries, K.; Desmyter, J.; Schols, D.; Kukla, M. J.; Breslin, H. J.; Raeymaeckers, A.; Van Gelder, J.; Woestenborghs, R.; Heykants, J.; Schellekens, K.; Janssen, M. A. C.; De Clercq, E.; Janssen, P. A. J. Natute (London) 1990, 343, 470.
52. Debyser, Z.; Pauwels, R.; Andries, K.; Desmyter, J.; Kukla, M. J.; Janssen, P. A. J.; De Clercq, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 1451.
53. Miyasaka, T.; Tanaka, H.; Baba, M.; Hayakawa, H.; Walker, R. T.; Balzarini, J.; De Clercq, E. J. Med. Chem. 1989, 32, 2507.
54. Baba, M.; Tanaka, H.; De Clercq, E.; Pauwels, R.; Balzarini, J.; Schols, D.; Nakashima, H.; Perno, C. F.; Walker, R. T.; Miyasaka, T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1989, 765, 1375.
55. Merluzzi, V. J.; Hargrave, K. D.; Labadia, M.; Grozinger, K.; Skoog, M.; Wu, J. C.; Shih, C.-K.; Eckner, K.; Hattox, S.; Adams, J. Rosehthal, A. S.; Faanes, R.; Eckner, R. J.; Karp, R. A.; Sullivan, J. L. Science 1990, 250, 1411.
56. Goldman, M. E.; Nunberg, J. H.; O'Brien, J. A.; Quintero, J. C.; Schleif, W. A.; Freund, K. F.; Gaul, S. L.; Saari, W. S.; Wai, J. S.; Hoffman, J. M.; Anderson, P. S.; Hupe, D. J.; Emini, E. A.; Stern, A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 6863.
57. Romero, D. L.; Busso, M.; Tan, C. K.; Reusser, F.; Palmer, J. R.; Poppe, S. M.; Aristoff, P. A.; Downey, K. M.; So, A. G.; Resnick, L.; Tarpley, W. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 8806.
58. Balzarini, J.; Pérez-Pérez, M.-J.; San-Felix, A.; Schols, D.; Perno, C. F.; Vandamme, A. M.; Camarasa, M. J.; De Clercq, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 4392.
59. Pauwels, R.; Andries, K.; Debyser, Z.; Van Daele, P.; Schols, D.; Stoffels, P.; De Vreese, K.; Woestenborghs, R.; Vandamme, A. M.; Janssen, C. G. M.; Anne, J.; Cauwenbergh, G.; Desmyter, J.; Heykants, J.; Janseen, M. A. C.; De Clercq, E.; Janssen, P. A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 1711.
60. Balzarini, J.; Karlsson, A.; Pérez-Pérez, M.-J.; Camarasa, M. J.; De Clercq, E. Virology 1993, 196, 576.
61. Vasudevachari, M. B.; Battista, C.; Lane, H. C.; Psallidopoulos, M. C.; Zhao, B.; Cook, J.; Palmer, J. R.; Romero, D. L.; Tarpley, W. G.; Salzman, N. P. Virology 1992, 790, 269.
62. Smith, M. S.; Brian, E. L.; Pagano, J. S. J. Virol. 1987, 61, 3769.
63. Kukla, M. J.; Breslin, H. J.; Pauwels, R.; Fedde, C. L.; Miranda, M.; Scott, M. K.; Sherrill, R. G.; Raeymackers, A.; Van Gelder, J.; Andries, K.; Janssen, M. A. C.; De Clercq, E.; Janssen, P. A. J. J. Med. Chem. 1991, 34, 746.
64. Kukla, M. J.; Breslin, H. J.; Diamond, C. J.; Grous, P. P.; Ho, C. Y.; Miranda, M.; Rodgers, J. D.; Sherril, R. G.; De Clercq, E.; Pauwels, R.; Andries, K.; Moens, L. J.; Janssen, M. A. C.; Janssen, P. A. J. J. Med. Chem. 1991, 34, 3187.
65. Breslin, H. J.; Kukla, M. J.; Ludovici, D. W.; Mohrbacher, R.; Ho, W.; Miranda, M.; Rodgers, J. D.; Hitchens, T. K.; Leo, G.; Gauthier, D. A.; Ho, C. Y.; Scott, M. K.; De Clercq, E.; Pauwels, R.; Andries, K.; Janssen, M. A. C.; Janssen, P. A. J. J. Med. Chem. 1995, 38, 771.
66. (a) Ho, W.; Kukla, M. J.; Breslin, H. J.; Ludovici, D. W.; Grous, P. P.; Diamond, C. J.; Miranda, M.; Rodgers, J. D.; Ho, C. Y.; De Clercq, E.; Pauwels, R.; Andries, K.; Janssen, M. A. C.; Janssen, P. A. J. J. Med. Chem. 1995, 38, 794.
67. (b) Cramer, R. D., III; Bunce, J. D.; Patterson, D. E.; Frank, I. E. Quant. Struct.-Act. Relat. 1988, 7, 18.
68. Gupta, S. P.; Garg, R. J. Enzyme Inhib. 1996, 11, 23.
69. Pauwels, R.; Andries, K.; Debyser, Z.; Kukla, M. J.; Schols, D.; Breslin, H. J.; Woestenborghs, R.; Desmyter, J.; Janssen, M. A. C.; De Clercq, E.; Janssen, P. A. J. Antimicrob. Agents Chemother. 1994, 38, 2863.
70. (a) Hansch, C.; Hoekman, D.; Gao, H. Chem Rev. 1996, 96, 1045.
71. (b) Leo, A. Chem. Rev. 1993, 93, 1281.
72. (a) Tanaka, H.; Takashima, H.; Ubasawa, M.; Sekiya, K.; Nitta, I.; Baba, M.; Shigeta, S.; Walker, R. T.; De Clercq, E.; Miyasaka, T. J. Med. Chem. 1992, 35, 337.
73. (b) Hansch C.; Zhang, L. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1992, 2, 1165.
74. Tanaka, H.; Takashima, H.; Ubasawa, M.; Sekiya, K.; Nitta, I.; Baba, M.; Shigeta, S.; Walker, R. T.; De Clercq. E.; Miyasaka, T. J. Med. Chem. 1992, 35, 4713.
75. Tanaka, H.; Takashima, H.; Ubasawa, M.; Sekiya, K.; Inouye, N.; Baba, M.; Shigeta, S.; Walker, R.T.; De Clercq, E.; Miyasaka, T. J. Med. Chem. 1995, 38, 2860.
76. Garg, R.; Kurup, A.; Gupta, S. P. Quant. Struct.-Act. Relat. 1997, 16, 20.
77. Baba, M.; Shigeta, S.; Tanaka, H.; Miyasaka, T.; Ubasawa, M.; Umezu, K.; Walker, R. T.; Pauwels, R.; De Clercq, E. Antiviral Res. 1992, 17, 245.
78. Balzarini, J.; Baba, M.; De Clercq, E. Antimicrob. Agents Chemother. 1995, 39, 998.
79. Tanaka, H.; Baba, M.; Hayakawa, H.; Sakamaki, T.; Miyasaka, T.; Ubasawa, M.; Takashima, H.; Sekiya, K.; Nitta, I.; Shigeta, S.; Walker, R. T.; Balzarini, J.; De Clercq, E. J. Med. Chem. 1991, 34, 349.
80. Pontkis, R.; Benhida, R.; Aubertin, A.-M.; Grierson, D. S.; Monneret, C. J. Med. Chem. 1997, 40, 1845.
81. Kim, D.-K.; Gam, J.; Kim, Y.-W.; Lim, J.; Kim, H.-T.; Kim, K. H. J. Med. Chem. 1997, 40, 2363.
82. (a) Miyasaka, T.; Tanaka, H.; Baba, M.; Hayakawa, H.; Walker, R. T.; Balzarini, J.; De Clercq, E. J. Med. Chem. 1989, 32, 2507.
83. (b) Baba, M.; Tanaka, H.; De Clercq, E.; Pauwels, R.; Balzarini, J.; Schols, D.; Nakashima, H.; Perno, C.-F.; Walker, R. T.; Miyasaka, T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1989, 165, 1375.
84. (c) Tanaka, M.; Baba, M.; Ubasawa, M.; Takashima, H.; Sekiya, K.; Nitta, I.; Shigeta, S.; Walker, R. T.; De Clercq, E.; Miyasaka, T. J. Med. Chem. 1991, 34, 1394,
85. (d) Tanaka, H.; Baba, M.; Saito, S.; Miyasaka, T.; Takashima, H.; Sekiya, K.; Ubasawa, M.; Nitta, I.; Walker, R. T.; Nakashima, H.; De Clercq, E. J. Med. Chem. 1991, 34, 1508.
86. (e) Tanaka, H.; Baba, M.; Ubasawa, M.; Takashima, H.; Sekiya, K.; Miyasaka, T.; Nitta, I.; Walker, R. T.; De Clercq, E. Collec. Czech. Chem. Commun. 1990, 55, 89.
87. (f) Tanaka, H.; Baba, M.; Hayakawa, H.; Haraguchi, K.; Miyasaka, T.; Ubasawa, M.; Takashima, H.; Sekiya, K.; Nitta, I.; Walker, R. T.; De Clercq, E. Nucleosides Nucleotides 1991, 10, 397.
88. Luco, J. M.; Ferretti, F. H. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1997, 37, 392.
89. Kier, L. B.; Hall, L. H. In Molecular Connectivity in Chemistry and Drug Research; Bawden, D., Ed.; Research Studies Press Ltd.: Letchworth, Hertfordshire, England, 1986; Chapter 3, p 43.
90. (a) Abraham, M. H.; McGowan, J. C. Chromotographicia 1987, 23, 243.
91. (b) Abraham, M. H. Chem. Soc. Rev. 1993, 22, 73.
92. Kier, L. B.; Hall, L. H. Quant. Struct.-Act. Relat. 1991, 10, 134.
93. Wold, S. Technometrics 1978, 20, 397.
94. Hopkins, A. L.; Ren, J.; Esnouf, R. M.; Willcox, B. E.; Jones, E. Y.; Ross, C.; Miyasaka, T.; Walker, R. T.; Tanaka, H.; Stammers, D. K.; Stuart, D. I. J. Med. Chem. 1996, 39, 1589.
95. Kireev, D. B.; Chrétien, J. R.; Grierson, D. S.; Monneret, C. J. Med. Chem. 1997, 40, 4257.
96. Garg, R.; Gupta, S. P. J. Enzyme Inhib. 1997, 11, 171.
97. (a) Camarasa, M. J.; Pérez-Pérez, M.-J.; San-Felix, A.; Balzarini, J.; De Clercq, E. J. Med. Chem. 1992, 35, 2721.
98. (b) Pérez-Pérez, M.-J.; San-Felix, A.; Balzarini, J.; De Clercq, E.; Camarasa, M. J. J. Med. Chem. 1992, 35, 2988.
99. (c) San-Felix, A.; Sonsoles, V.; Pérez-Pérez, M.-J.; Balzarini, J.; De Clercq, E.; Camarasa, M J. J. Med. Chem. 1994, 37, 453.
100. Balzarini, J.; Pérez-Pérez, M.-J.; San-Félix, A.; Schols, D.; Perno, C.-F.; Vandamme, A.-M.; Camarasa, M.-J.; De Clercq, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 4392.
101. Alvarez, R.; Velazquez, S.; San-Felix, A.; Aquaro, S.; De Clercq, E.; Perno, C.-F.; Karlsson, A.; Balzarini, J.; Camarasa, M. J. J. Med. Chem. 1994, 37, 4185.
102. Kelly, T. A.; Proudfoot, J. R.; McNeil, D. W.; Patel, U. R.; David, E.; Hargrave, K. D.; Grob, P. M.; Cardozo, M.; Agarwal, A.; Adams, J. J. Med. Chem. 1995, 38, 4839.
103. Hargrave, K. D.; Proudfoot, J. R.; Grozinger, K. G.; Cullen, E.; Kapadia, S. R.; Patel, U. R.; Fuchs, V. U.; Mauldin, S. C.; Vitous, J.; Behnke, M. L.; Klunder, J. M.; Pal, K.; Skiles, J. W.; McNeil, D. W.; Rose, J. M.; Chow, G. C.; Skoog, M. T.; Wu, J. C.; Schmidt, G.; Engel, W. W.; Eberlein, W. G.; Saboe, T. D.; Campbell, S. J.; Rosenthal, A. S.; Adams, J. J. Med. Chem. 1991, 34, 2231.
104. Klunder, J. M.; Hargrave, K. D.; West, M. A.; Kullen, E.; Pal, K.; Behnke, M. L.; Kapadia, S. R.; McNeil, D. W.; Wu, J. C.; Chow, G. C.; Adams, J. J. Med. Chem. 1992, 35, 1887.
105. Hoffman, J. M.; Wai, J. S.; Thomas, C. M.; Levin, R. B.; O'Brein, J. A.; Goldman, M. E. J. Med. Chem. 1992, 35, 3784.
106. Saari, W. S.; Wai, J. S.; Fisher, T. E.; Thomas, C. M.; Hoffman, J. M.; Rooney, C. S.; Smith, A. M.; Jones, J. H.; Bamberger, D. L.; Goldman, M. E.; O'Brein, J. A.; Nunberg, J. H.; Quintero, J. C.; Schleif, W. A.; Emini, E. A.; Anderson, P. S. J. Med. Chem. 1992, 35, 3792.
107. Hoffman, J. M.; Smith, A. M.; Rooney, C. S.; Fisher, T. E.; Wai, J. S.; Thomas, C. M.; Bamberger, D. L.; Barnes, J. L.; Williams, T. M.; Jones, J. H.; Olson, B. D.; O'Brein, J. A.; Goldman, M. E.; Nunberg, J. H.; Quintero, J. C.; Schleif, W. A.; Emini, E. A.; Anderson, P. S. J. Med. Chem. 1993, 36, 953.
108. Wai, J. S.; Williams, T. M.; Bamberger, D. L.; Fisher, T. E.; Hoffman, J. M.; Hudcosky, R. J.; MacTough, S. C.; Rooney, C. S.; Saari, W. S.; Thomas, C. M.; Goldman, M. E.; O'Brien, J. A.; Emini, E. A.; Nunberg, J. H.; Quintero, J. C.; Schleif, W. A.; Anderson, P. S. J. Med. Chem. 1993, 36, 249.
109. Garg, R.; Gupta, S. P. J. Enzyme Inhib. 1997, 12, 1.
110. Pauwels, R.; Andries, K.; Debyser, Z.; Daele, P. V.; Schols, D.; Stoffels, P.; De Vreese, K.; Woestenborghs, R.; Vandamme, A.-M.; Janssen, C. G. M.; Anne, J.; Cauwenbergh, G.; Desmyter, J.; Heykants, J.; Janssen, M. A. C.; De Clercq, E.; Janssen, P. A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 1711.
111. Artico, M.; Silverstri, R.; Massa, S.; Loi, A. G.; Cornas, S.; Piras, G.; La Colla, P. J. Med. Chem. 1996, 39, 522.
112. Hanasaki, Y.; Watanabe, H.; Katsuura, K.; Takayama, H.; Shirakawa, S.; Yamaguchi, K.; Sakai, S.-I.; Ijichi, K.; Fujiwara, M.; Konno, K.; Yokota, T.; Shigeta, S.; Baba, M. J. Med. Chem. 1995, 38, 2038.
113. Ijichi, K.; Fujiwara, M.; Hanasaki, Y.; Watanabe, H.; Katsuura, K.; Takayama, H.; Shirakawa, S.; Sakai, S.-I.; Shigeta, S.; Konno, K.; Yokota, T.; Baba, M. Antimicrob. Agents Chemother. 1995, 39, 2337.
114. Yu, K. -L.; Bronson, J. J.; Yang, H.; Patick, A.; Alam, M.; Brankovan, V.; Datema, R.; Hitchcock, M. J. M.; Martin, J. C. J. Med. Chem. 1993, 36, 2726.
115. (a) McGuigan. C.; Pathirana, R. N.; Balzarini, J.; De Clercq, E. J. Med. Chem. 1993, 36, 1048.
116. (b) Siddiqui, A. Q.; Ballatore, C.; McGuigan. C.; De Clereq, E.; Balzarini, J. J. Med. Chem. 1999, 42, 393.
117. Tatematsu, H.; Kilkuskie, R. E.; Corrigan, A. J.; Bodner, A. J.; Lee, K.-H. J. Nat. Prod. 1991, 54, 632.
118. Wyatt, P. G.; Bethell, R. C.; Cammack, N.; Charon, D.; Dodic, N.; Dumaitre, B.; Evans, D. N.; Green, D. V. S.; Hopewell, P. L.; Humber, D. C.; Lamont, R. B.; Orr, D. C.; Plested, S. J.; Ryan, D. M.; Sollis, S. L.; Storer, R.; Weingarten, G. G. J. Med. Chem. 1995, 38, 1657.
119. Doubell, P. C. J.; Oliver, D. W. Arzneim.-Forsch. 1992, 42, 65.
120. Strekowski, L.; Mokrosz, J. L.; Honkan, V. A.; Czarny, A.; Cegla, M. T.; Wydra, R. L.; Patterson, S. E.; Schinazi, R. F. J. Med. Chem. 1991, 34, 1739.
121. Balzarini, J.; Brouwer, W. G.; Felauer, E. E.; De Clercq, E.; Karlsson, A. Antiviral Res. 1995, 27, 219.
122. Balzarini, J.; van Aerschot, A.; Pauwels, R.; Baba, M.; Schols, D.; Herdewijn, P.; De Clercq, E. Mol. Pharmacol. 1989, 35, 571.
123. Herdewijn. P. A. M.; van Aerschot, A.; Balzarini, J.; De Clercq, E. Med. Chem. Res. 1991, 1, 9.
124. Balzarini, J.; Baba, M.; Pauwels, R.; Herdewijn, P.; De Clercq, E. Biochem. Pharmacol. 1988, 37, 2847.
125. (a) Mahmoudian, M. Pharm. Res. 1991, 8, 43.
126. (b) Chu, K. C.; Schinazi, R. F.; Ahn. M. K.; Ultas, G. V.; Gu, Z. P. J. Med. Chem. 1989, 32, 612.
127. (c) Lin, T.-S.; Guo, J.-Y.; Schinazi, R. F.; Chu, C. K.; Xiang, J.-N.; Prusoff, W. H. J. Med. Chem. 1988, 31, 336.
128. Herdewijn, P.; Balzarini, J.; Baba, M.; Pauwels, R.; van Aerschot, A.; Janssen, G.; De Clercq, E. J. Med. Chem. 1988, 31, 2040.
129. Murakami, K.; Shirasaka, T.; Yoshioka, H.; Kojima, E.; Aoki, S.; Ford, H., Jr.; Driscoll, J. S.; Kelley, J. A.; Mitsuya, H. J. Med. Chem. 1991, 34, 1606.
130. Freeman, G. A.; Shaver, S. R.; Rideout, J. L.; Short, S. A. Bioorg. Med. Chem. 1995, 3, 447.
131. McGuigan, C.; Davies, M.; Pathirana, R.; Mahmood, N.; Hay, A. J. Antiviral Res. 1994, 24, 69.
132. Romines, K. R.; Thaisrivongs, S. Drugs Future 1995, 20, 377.
133. Olson, G. L.; Bolin, D. R.; Bonner, M. P.; Bos, M.; Cook, C. M.; Fry, D. C.; Graves, B. J.; Hatada, M.; Hill, D. E.; Kahn, M.; Madison, V. S.; Rusiecki, V. K.; Sarabu, R.; Sepinwall, J.; Vincet, G. P.; Voss, M. E. J. Med. Chem. 1993, 36, 3039.
134. See, for example: Maligres, P. E.; Upadhyay, V.; Rossen, K.; Cianciosi, S. J.; Purick, R. M.; Eng, K. K.; Reamer, R. A.; Askin, D.; Volante, R. P.; Reider, P. J. Tetrahedron Lett. 1995, 36, 2195.
135. Nugiel, D. A.; Jacobs, K.; Worley, T.; Patel, M.; Kaltenbach R. F., III; Meyer, D. T.; Jadhav, P. K.; DeLucca, G. V.; Smyser, T. E.; Klabe, R. M.; Bacheler, L. T.; Rayner, M. M.; Seitz, S. P. J. Med. Chem. 1996, 39, 2156.
136. Lam, P. Y. S.; Ru, Y.; Jadhav, P. K.; Aldrich, P. E.; DeLucca, G. V.; Eyerman, C. J.; Chang, C.-H.; Emmett, G.; Holler, E. R.; Danekar, W. F.; Li, L.; Confalone, P. N.; McHugh, R. J.; Han, Q.; Li, R.; Markwalder, J. A.; Seitz, S.P.; Sharpe, T. R.; Bacheler, L. T.; Rayner, M. M.; Klabe, R. M.; Shum, L.; Winslow, D. L.; Kornhauser, D. M.; Jackson, D. A.; Erickson-Viitanen, S.; Hodge, C. N. J. Med. Chem. 1996, 39, 3514.
137. Gupta, S. P.; Babu, M. S.; Garg, R.; Sowmya, S. J. Enzyme Inhib. 1998, 13, 399.
138. (a) Jadhav, P. K.; Woerner, F. J.; Lam, P. Y. S.; Hodge, C. N.; Eyermann, C. J.; Man, H.-W.; Daneker, W, F.; Bacheler, L. T.; Rayner, M. M.; Meek, J. L.; Erickson-Viitanen, S.; Jackson, D. A.; Calabrese, J. C.; Schadt, M.; Chang, C.-H. J. Med. Chem. 1998, 41, 1446.
139. (b) Gupta, S. P.; Babu, M. S. Bioorg. Med. Chem. 1999, 7, 1.
140. Wilkerson, W. W.; Akamike, E.; Cheatham, W. W.; Hollis, A. Y.; Collins, R. D.; DeLucca, I.; Lam, P. Y. S.; Ru, Y. J. Med. Chem. 1996, 39, 4299.
141. Wilkerson, W. W.; Dax, S.; Cheatham, W. W. J. Med. Chem. 1997, 40, 4079.
142. Han, Q.; Chang, C.-H.; Li, R.; Ru, Y.; Jadhav, P. K.; Lam, P. Y. S. J. Med. Chem. 1998, 41, 2019.
143. Romines, K. R.; Watenpaugh, K. D.; Tomick, P. K.; Howe, W. J.; Morris, J. K.; Lovasz, K. D.; Mulichak, A. M.; Finzel, B. C.; Lynn, J. C.; Horng, M.-M.; Schwende, F. J.; Ruwart, M. J.; Zipp, G. L.; Chong, K.-T.; Dolak, L. A.; Toth, L. N.; Howard, G. M.; Rush, B. D.; Wilkinson, K. F.; Possert, P. L.; Dalga, R. J.; Hinshaw, R. R. J. Med. Chem. 1995, 38, 1884.
144. Romines, K. R.; Watenpaugh, K. D.; Howe, W. J.; Tomich, P. K.; Lovasz, K. D.; Morris, J. K.; Janakiraman, M. N.; Lynn, J. C.; Horng, M.-M.; Chog, K.-T.; Hinshaw, R. R.; Dolak, L. A. J. Med. Chem. 1995, 38, 4463.
145. Romines, K. R.; Morris, J. K.; Howe, W. J.; Tomich, P. K.; Horng, M.-M.; Chong, K.-T.; Hinshaw, R. R.; Anderson, D. J.; Strohbach, J. W.; Turner, S. R.; Mizsak, S. A. J. Med. Chem. 1996, 39, 4125.
146. Skulnick, H. I.; Johnson, P. D.; Aristoff, P. A.; Morris, J. K.; Lovasz, K. D.; Howe, W. J.; Watenpaugh, K. D.; Janakiraman, M. N.; Anderson, D. J.; Reischer, R. J.; Schwartz, T. M.; Banitt, L. S.; Tomich, P. K.; Lynn, J. C.; Horng, M.-M.; Chong, K.-T.; Hinshaw, R. R.; Dolak, L. A.; Seest, E. P.; Schwende, F. J.; Rush, B. D.; Howard, G. M.; Toth, L. N.; Wilkinson, K. R.; Kakuk, T. J.; Johnson, C. W.; Cole, S. L.; Zaya, R. M.; Zipp, G. L.; Possert, P. L.; Dalga, R. J.; Zhong, W.-Z.; Williams, M. G.; Romines, K. R. J. Med. Chem. 1997, 40, 1149.
147. Gupta, S. P.; Babu, M. S.; Kaw. N. J. Enzyme Inhib. 1999, 14, 109.
148. Tait, B. D.; Hagen, S.; Domagala, J.; Ellsworth, E. L.; Gajda, C.; Hamilton, H. W.; Vara Prasad, J. V. N.; Ferguson, D.; Graham, N.; Hupe, D.; Nouhan, C.; Tummino, P. J.; Humblet, C.; Lunney, E. A.; Pavlovsky, A.; Rubin, J.; Gracheck, S. J.; Baldwin, E. T.; Bhat, T. N.; Erickson, J. W.; Gulnik, S. V.; Liu, B. J. Med. Chem. 1997, 40, 3781.
149. Vara Prasad, J. V. N.; Para, K. S.; Tummino, P. J.; Ferguson, D.; Mcquade, E. J.; Lunney, E. A.; Rapundalo, S. T.; Batley, B. L.; Hingorani, G.; Domagala, J. M.; Gracheck, S. J.; Bhat, T. N.; Liu, B.; Baldwin, E. T.; Erickson, J. W.; Sawyer, T. K. J. Med. Chem. 1995, 38, 898.
150. Vazquez, M. L.; Bryant, M. L.; Clare, M.; Decrescenzo, G. A.; Doherty, E. M.; Freskos, J. N.; Getman, D. P.; Houseman, K. A.; Julien, J. A.; Kocan, G. P.; Mueller, R. A.; Shieh, H.-S.; Stallings, W. C.; Stegeman, R. A.; Talley, J. J. J. Med. Chem. 1995, 38, 581.
151. Billich, A.; Charpiot, B.; Fricker, G.; Gstach, H.; Lehr, P.; Peichl, P.; Scholz, D.; Rosenwirth, B. Antiviral Res. 1994, 25, 215.
152. Desolms, S. J.; Giuliani, E. A.; Guare, J. P.; Vacca, J. P.; Sanders, W. M.; Graham, S. L.; Wiggins, J. M.; Darke, P. L.; Sigal, I. S.; Zugay, J. A.; Emini, E. A.; Schleif, W. A.; Quintero, J. C.; Anderson, P. S.; Huff, J. R. J. Med. Chem. 1991, 34, 2852.
153. Thompson, S. K.; Murthy, K. H. M.; Zhao, B.; Winborne, E.; Green, D. W.; Fisher, S. M.; Desjarlais, R. L.; Tomaszek, T. A., Jr.; Meek, T. D.; Gleason, J. G.; Abdel-Meguid, S. S. J. Med. Chem. 1994, 37, 3100.
154. Hansch, C.; Gao, H. Chem Rev. 1997, 97, 2995.
155. Gupta, S. P.; Babu, M. S.; Sowmya, S. Bioorg. Med. Chem. 1998, 6, 2185.
156. Umezawa, H.; Aoyagi, T.; Morishima, H.; Matsuzaki, M.; Hamada, M.; Takeuchi, T. J. Antibiot. 1970, 23, 259.
157. Katoh, I.; Yasunaga, T.; Ikawa, Y.; Yoshinaka, Y. Nature (London) 1987, 329, 654.
158. Krausslich, H.G.; Schneider, H.; Zybarth, G.; Carter, C. A.; Wimmer, E. J. Virol. 1988, 62, 4393.
159. Richards, A. D.; Roberts, R.; Dunn, B. M.; Graves, M. C.; Kay, J. FEBS Lett. 1989, 247, 113.
160. Darke, P. L.; Leu, C. T.; Davis, L. J.; Heimbach, J. C.; Diehl, R. E.; Hill, W. S.; Dixon, R. A. F.; Sigal, I. S. J. Biol. Chem. 1989, 264, 2307.
161. Nutt, R. F.; Brady, S. F.; Darke, P. L.; Ciccarone, T. M.; Colton, C. D.; Nutt, E. M.; Rodkey, J. A.; Bennett, C. D.; Waxman, L. H.; Sigal, I. S.; Anderson, P. S.; Veber, D. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 7129.
162. Miller, M.; Schneider, J.; Sathyanarayana, B. K.; Toth, M. V.; Marshall, G. R.; Clawson, L.; Selk, L.; Kent, S. B. H.; Wlodawer, A. Science 1989, 246, 1149.
163. Fitzgerald, P. M. D.; McKeever, B. M.; Van Middlesworth, J. F.; Springer, J. P.; Heimbach, J. C.; Leu, C.-T.; Herber, W. K.; Dixon, R. A. F.; Darke, P. L. J. Biol. Chem. 1990, 265, 14209.
164. Erickson, J.; Neidhart, D. J.; VanDrie, J.; Kempf, D. J.; Wang, X. C.; Norbeck, D. W.; Plattner, J. J.; Rittenhouse, J. W.; Turon, M.; Wideburg, N.; Kohlbrenner, W. E.; Simmer, R.; Helfrich, R.; Paul, D. A.; Knigge, M. Science 1990, 249, 527
165. Swain, A. L.; Miller, M. M.; Green, J.; Rich, D. H.; Schneider, J.; Kent, S. B. H.; Wlodawer, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 8805.
166. Huff, J. R. J. Med. Chem. 1991, 34, 2305.
167. Getman, D. P.; DeCrescenzo, G. A.; Heintz, R. M.; Reed, K. L.; Talley, J. J.; Bryant, M. L.; Clare, M.; Houseman, K. A.; Marr, J. J.; Mueller, R. A.; Vazquez, M. L.; Shieh, H.-S.; Stallings, W. C.; Stegeman, R. A. J. Med. Chem. 1993, 36, 288.
168. Holloway, M. K.; Wai, J. M.; Halgren, T. A.; Fitzgerald, P. M. D.; Vacca, J. P.; Dorsey, B. D.; Levin, R. B.; Thompson, W. J.; Chen, L. J.; deSolms, S. J.; Gaffin, N.; Ghosh, A. K.; Giuliani, E. A.; Graham, S. L.; Guare, J. P.; Hungate, R. W.; Lyle, T. A.; Sanders, W. M.; Tucker, T. J.; Wiggins, M.; Wiscount, C. M.; Woltersdorf, O. W.; Young, S. D.; Darke, P. L.; Zugay, J. A. J. Med. Chem. 1995, 38, 305.
169. Ferguson, D. M.; Radmer, R. J.; Kollman, P. A. J. Med. Chem. 1991, 34, 2654.
170. Kempf, D. J.; Norbeck, D. W.; Codacovi, L.; Wang, X. C.; Kohlbrenner, W. E.; Wideburg, N. E.; Paul, D. A.; Knigge, M. F.; Vasavanonda, S.; Graig-Kennard, A.; Saldivar, A.; Rosenbrook, W., Jr.; Clement, J. J.; Plattner, J. J.; Erickson, J. J. Med. Chem. 1990, 33, 2687.
171. Wonacott, A.; Cooke, R.; Hayes, F. R.; Hann, M. M.; Jhoti, H.; McMeekin, P.; Mistry, A.; Murray-Rust, P.; Singh, O. M. P.; Weir, M. P. J. Med. Chem. 1993, 36, 3113.
172. Humber, D. C.; Bamford, M. J.; Bethell, R. C.; Cammack, N.; Cobley, K.; Evans, D. N.; Gray, N. M.; Hann. M. M.; Orr, D. C.; Saunders, J.; Shenoy, B. E. V.; Storer, R.; Weingarten, G. G.; Wyatt, P. G. J. Med. Chem. 1993, 36, 3120.
173. Waller, C. L.; Oprea, T. I.; Giolitti, A.; Marshall, G. R. J. Med. Chem. 1993, 36, 4152.
174. Oprea, T. I.; Waller, C. L.; Marshall, G. R. J. Med. Chem. 1994, 37, 2206.
175. Kroemer, R. T.; Ettmayer, P.; Hecht, P. J. Med. Chem. 1995, 38, 4917.
176. Chen, X.; Tropsha, A. J. Med. Chem. 1995, 38, 42.
177. Chen, P.; Cheng, P. T. W.; Alam, M.; Beyer, B. D.; Bisacchi, G. S.; Dejneka, T.; Evans, A. J.; Greytok, J. A.; Hermsmeier, M. A.; Humphreys, W. G.; Jacobs, G. A.; Kocy, O.; Lin, P.-F.; Lis, K. A.; Marella, M. A.; Ryono, D. E.; Sheaffer, A. K.; Spergel, S. H.; Sun, C.-Q.; Tino, J. A.; Vite, G.; Colonno, R. J.; Zahler, R.; Barrish, J. C. J. Med. Chem. 1996, 39, 1991.
178. Bridger, G. J.; Skerlj, R. T.; Thornton, D.; Padmanabhan, S.; Martelucci, S. A.; Henson, G. W.; Abrams, M. J.; Yamamoto, N.; De Vreese, K.; Pauwels, R.; De Clercq, E. J. Med. Chem. 1995, 38, 366.
179. Joao, H. C.; De Vreese, K.; Pauwels, R.; De Clercq, E.; Henson, G. W.; Bridger, G. J. J. Med. Chem. 1995, 38, 3865.
180. Inouye, Y.; Kanamori, T.; Yoshida, T.; Bu, X.; Shionoya, M.; Koike, T.; Kimura, E. Biol. Pharm. Bull. 1994, 17, 243.
181. Raghavan, K.; Buolamwini, J. K.; Fesen, M. R.; Pommier, Y.; Kohn, K. W.; Weinstein, J. N. J. Med. Chem. 1995, 38, 890.
182. Kohlstaedt, L. A.; Wang, J.; Friedman, J. M.; Rice, P. A.; Steitz, T. A. Science 1992, 256, 1783.
183. Ren, J.; Esnouf, R.; Garman, E.; Somers, D.; Ross, C.; Kirby, I.; Keeling, J.; Darby, G.; Jones, Y.; Stuart, D.; Stammers, D. Nature Struct. Biol. 1995, 2, 293.
184. Esnouf, R.; Ren, J.; Ross, C.; Jones, Y.; Stammers, D.; Stuart, D. Nature Struct. Biol. 1995, 2, 303.
185. Hopkins, A. L.; Ren, J.; Esnouf, R. M.; Willcox, B. E.; Jones, E. Y.; Ross, C.; Miyasaka, T.; Walker, R. T.; Tanaka, H.; Stammers, D. K.; Stuart, D. I. J. Med. Chem. 1996, 39, 1589.
186. Smerdon, S. J.; Jäger, J.; Wang, J.; Kohlstaedt, L. A.; Chirino, A. J.; Friedman, J. M.; Rice, P. A.; Steitz, T. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 3911.
187. Mui, P. W.; Jacober, S. P.; Hargrave, K. D.; Adams, J. J. Med. Chem. 1992, 35, 201.
188. Schäfer, W.; Friebe, W.-G.; Leinert, H.; Mertens, A.; Poll, T.; von der Saal, W.; Zilch, H.; Nuber, B.; Zeigler, M. L. J. Med. Chem. 1993, 36, 726.
189. Ding, J.; Das, K.; Moereels, H.; Koymans, L.; Andries, K.; Janssen, P. A. J.; Hughes, S. H.; Arnold, E. Nature Struct. Biol. 1995, 2, 407.
190. Mager, P. P.; De Clercq, E.; Takashima, H.; Ubasawa, M.; Sekiya, K.; Baba, M. Walther, H. Eur. J. Med. Chem. 1996, 31, 701.
191. Mager, P. P. Drug Des. Discovery 1996, 14, 241.
192. Mager, P. P. Drug Des. Discovery 1996, 14, 213.
193. Mager, P. P.; Walther, H. Drug Des. Discovery 1996, 14, 225.
194. Wang, S.; Milne, G. W. A.; Yan, X.; Posey, I. J.; Nicklaus, M. C.; Graham, L.; Rice, W. G. J. Med. Chem. 1996, 39, 2047.
195. Bernstein, F. C.; Koetzle, T. F.; Williams, G. J.; Meyer, E. F., Jr.; Brice, M. D.; Rodgers, J. R.; Kennard, O.; Shimanouchi, T.; Tasumi, M. Arch. Biochem. Biophys. 1978, 185, 584.
196. http:/www.niaid.nih.gov/daids/dtpdb/fdadrug.htm.
197. Hansch, C.; Bjorkroth, J. P.; Leo, A. J. Pharm. Sci. 1987, 76, 663.
198. Debnath, A. K. J. Med. Chem. 1999, 42, 249.
199. Debnath, A. K. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1998, 38, 761.
200. De Clercq, E. Il Farmaco 1999, 54, 26.
201. Spence, R. A.; Kati, W. M.; Anderson, K. S.; Johnson, K. A. Science 1995, 267, 988.
202. Das, K.; Ding. J.; Hsiou, Y.; Clark, A. D., Jr.; Moereels, H.; Koymans, L.; Andries, K.; Pauwels, R.; Janseen, P. A. J.; Boyer, P. L.; Clark, P.; Smith, R. H., Jr.; Smith, M. B. K.; Michejda, C. J.; Hughes, S. H.; Arnold, E. J. Mol. Biol. 1996, 264, 1085.
203. http://www.rcsb.org/pdb/.
204. Hodge, C. N.; Aldrich, P. E.; Bacheler, L. T.; Chang, C. H.; Eyermann, C. J.; Garber, S.; Grubb, M.; Jackson, D. A.; Jadhav, P. K.; Korant, B.; Lam, P. Y.; Maurin, M. B.; Meek, J. L.; Otto, M. J.; Rayner, M. M.; Reid, C.; Sharpe, T. R.; Shurn, L.; Winslow, D. L.; Erickson-Viitanen, S. Chem. Biol. 1996, 3, 301.
205. Ala, P. J.; Huston, E. E.; Klabe, R. M.; McCabe, D. D.; Duke, J. L.; Rizzo, C. J.; Korant, B. D.; DeLoskey, R. J.; Lam, P. Y.; Hodge, C. N.; Chang, C. H. Biochemistry 1997, 36, 1573.
206. Hansch, C.; Klein, T. Acc. Chem. Res. 1986, 19, 392.
207. Selassie, C. D.; Li, R.-L.; Poe, M.; Hansch, C. J. Med. Chem. 1991, 34, 46.