Genetic methods for deciphering virulence determinants of Mycobacterium tuberculosis

Methods in Enzymology

Volumn 358, Issue , 2002, Pages 67-99

  Braunstein, Miriam ^a   Bardarov, Stoyan S ^a   Jacobs, William R ^a  

^a UNIVERSITY OF NORTH CAROLINA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL DNA; GENE PRODUCT; GENOMIC DNA; HYGROMYCIN B; KANAMYCIN; VIRULENCE FACTOR;

ALLELE; ARTICLE; BACTERIAL GROWTH; BACTERIAL VIRULENCE; BACTERIOPHAGE; BACTERIUM MUTANT; BACTERIUM TRANSFORMATION; CONTROLLED STUDY; DNA TRANSFER; DNA TRANSPOSITION; GENETIC COMPLEMENTATION; GENETIC TRANSDUCTION; MUTAGENESIS; MYCOBACTERIUM SMEGMATIS; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; NONHUMAN; PHENOTYPE; PRIORITY JOURNAL; TRANSPOSON; TUBERCULOSIS;

BACTERIA (MICROORGANISMS); MYCOBACTERIUM; MYCOBACTERIUM SMEGMATIS; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; TRANSPOSONS;

EID: 0036436740     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1016/S0076-6879(02)58081-2     Document Type: Article

References (79)

1. S. T. Cole, R. Brosch, J. Parkhill, T. Garnier, C. Churcher, D. Harris, S. V. Gordon, K. Eiglmeier, S. Gas, C. E. Barry III, F. Tekaia, K. Badcock, D. Basham, D. Brown, T. Chillingworth, R. Connor, R. Davies, K. Devlin, T. Feltwell, S. Gentles, N. Hamlin, S. Holroyd, T. Hornsby, K. Jagels, A. Krogh, J. McLean, S. Moule, L. Murphy, K. Oliver, J. Osborne, M. A. Quail, M.-A. Rajandream, J. Rogers, S. Rutter, K. Seeger, T. Skelton, R. Squares, S. Squares, J. E. Sulston, K. Taylor, S. Whitehead, and B. G. Barrell, Nature 393, 537 (1998)
2. W. R. J. Jacobs, in "Molecular Genetics of Mycobacteria" (J. G. F. Hatfull and W. R. Jacobs, eds.), p. 1. ASM Press, Washington, D.C., 2000
3. W. R. Jacobs, Jr., G. V. Kalpana, J. D. Cirillo, L. Pascopella, S. B. Snapper, R. A. Udani, W. Jones, R. G. Barletta, and B. R. Bloom, Methods Enzymol. 204, 537 (1991)
4. V. Pelicic, J. M. Reyrat, and B. Gicquel. Mol. Microbiol. 28, 413 (1998)
5. J. A. Triccas and B. Gicquel, Immunol. Cell. Biol. 78, 311 (2000)
6. L. R. Camacho, D. Ensergueix, E. Perez, B. Gicquel, and C. Guilhot, Mol. Microbiol. 34, 257 (1999)
7. J. S. Cox, B. Chen, M. McNeil, and W. R. Jacobs, Jr., Nature 402, 79 (1999)
8. J. D. McKinney, K. Honer zu Bentrup, E. J. Munoz-Elias, A. Miczak, B. Chen, W. T. Chan, D. Swenson, J. C. Sacchettini, W. R. Jacobs, Jr., and D. G. Russell, Nature 406, 735 (2000)
9. S. B. Snapper, L. Lugosi, A. Jekkel, R. E. Melton, T. Kieser, B. R. Bloom, and W. R. Jacobs, Jr., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85, 6987 (1988)
10. M. Braunstein, unpublished results (1999)
11. M. S. Pavelka, Jr., and W. R. Jacobs, Jr., J. Bacteriol. 181, 4780 (1999)
12. A. Labidi, H. L. David, and D. Roulland-Dussoix, Ann. Inst. Pasteur Microbiol. 136B, 209 (1985)
13. C. K. Stover, V. F. de la Cruz, T. R. Fuerst, J. E. Burlein, L. A. Benson, L. T. Bennett, G. P. Bansal, J. F. Young, M. H. Lee, G. F. Hatfull, S. B. Snapper, R. G. Barletta, W. R. Jacobs, Jr., and B. R. Bloom, Nature 351, 456 (1991)
14. M. H. Lee, L. Pascopella, W. R. Jacobs, Jr., and G. F. Hatfull, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 3111 (1991)
15. C. Pashley and N. G. Stoker, in "Molecular Genetics of Mycobacteria" (J. G. F. Hatfull and W. R. Jacobs, eds.), p. 55. ASM Press, Washington, D.C., 2000
16. R. A. Weisberg, in "Escherichia Coli and Salmonella: Cellular and Molecular Biology" (F. C. Neidhardt, ed.), p. 2442. ASM Press, New York, 1996
17. S. Bardarov, J. Kriakov, C. Carriere, S. Yu, C. Vaamonde, R. A. McAdam, B. R. Bloom, G. F. Hatfull, and W. R. Jacobs, Jr., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94, 10961 (1997)
18. A. Aldovini, R. N. Husson, and R. A. Young, J. Bacteriol. 175, 7282 (1993)
19. B. J. Wards and D. M. Collins, FEMS Microbiol. Lett. 145, 101 (1996)
20. V. Balasubramanian, M. S. Pavelka, Jr., S. S. Bardarov, J. Martin, T. R. Weisbrod, R. A. McAdam, B. R. Bloom, and W. R. Jacobs, Jr., J. Bacteriol. 178, 273 (1996)
21. G. V. Kalpana, B. R. Bloom, and W. R. Jacobs, Jr., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 5433 (1991)
22. M. J. Colston, E. O. Davis, and K. G. Papavinasasundaram, in "Molecular Genetics of Mycobacteria" (J. G. F. Hatfull and W. R. Jacobs, eds.), p. 85. ASM Press, Washington, D.C., 2000
23. M. S. Pavelka, Jr., unpublished results (1998)
24. T. Parish, B. G. Gordhan, R. A. McAdam, K. Duncan, V. Mizrahi, and N. G. Stoker, Microbiology 145, 3497 (1999)
25. J. Hinds, E. Mahenthiralingam, K. E. Kempsell, K. Duncan, R. W. Stokes, T. Parish, and N. G. Stoker, Microbiology 145, 519 (1999)
26. T. Parish and N. G. Stoker, Microbiology 146, 1969 (2000)
27. M. K. Hondalus, S. Bardarov, R. Russell, J. Chan, W. R. Jacobs, Jr., and B. R. Bloom, Infect. Immun. 68, 2888 (2000)
28. F. X. Berthet, M. Lagranderie, P. Gounon, C. Laurent-Winter, D. Ensergueix, P. Chavarot, F. Thouron, E. Maranghi, V. Pelicic, D. Portnoi, G. Marchal, and B. Gicquel, Science 282, 759 (1998)
29. V. Pelicic, M. Jackson, J. M. Reyrat, W. R. Jacobs, Jr., B. Gicquel, and C. Guilhot, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94, 10955 (1997)
30. C. M. Berg and D. E. Berg, in "Escherichia Coli and Salmonella: Cellular and Molecular Biology" (F. C. Neidhardt, ed.), p. 2588. ASM Press, New York, 1996
31. N. Kleckner, J. Roth, and D. Botstein, J. Mol. Biol. 116, 125 (1977)
32. N. Kleckner, J. Bender, and S. Gottesman, Methods Enzymol. 204, 139 (1991)
33. B. M. Ahmer, J. van Reeuwijk, C. D. Timmers, P. J. Valentine, and F. Heffron, J. Bacteriol. 180, 1185 (1998)
34. P. I. Fields, R. V. Swanson, C. G. Haidaris, and F. Heffron, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 5189 (1986)
35. J. E. Shea, J. D. Santangelo, and R. G. Feldman, Curr. Opin. Microbiol. 3, 451 (2000)
36. K. E. Unsworth and D. W. Holden, Phil. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 355, 613 (2000)
37. S. L. Chiang, J. J. Mekalanos, and D. W. Holden, Ann. Rev. Microbiol. 53, 129 (1999)
38. M. Hensel, J. E. Shea, C. Gleeson, M. D. Jones, E. Dalton, and D. W. Holden, Science 269, 400 (1995)
39. J. M. Mei, F. Nourbakhsh, C. W. Ford, and D. W. Holden, Mol. Microbiol. 26, 399 (1997)
40. F. Cockerill III, G. Beebakhee, R. Soni, and P. Sherman, Infect. Immun. 64, 3196 (1996)
41. R. A. McAdam, C. Guilhot, and B. Gicquel, "Transposition in Mycobacteria." American Society for Microbiology, Washington, D.C., 1994
42. J. W. Dale, Eur. Respir. J. Suppl. 20, 633s (1995)
43. D. Thierry, A. Brisson-Noel, V. Vincent-Levy-Frebault, S. Nguyen, J. L. Guesdon, and B. Gicquel, J. Clin. Microbiol. 28, 2668 (1990)
44. D. Thierry, M. D. Cave, K. D. Eisenach, J. T. Crawford, J. H. Bates, B. Gicquel, and J. L. Guesdon, Nucleic Acids Res. 18, 188 (1990)
45. R. A. McAdam, P. W. Hermans, D. van Soolingen, Z. F. Zainuddin, D. Catty, J. D. van Embden, and J. W. Dale, Mol. Microbiol. 4, 1607 (1990)
46. E. P. Green, M. L. Tizard, M. T. Moss, J. Thompson, D. J. Winterbourne, J. J. McFadden, and J. Hermon-Taylor, Nucleic Acids Res. 17, 9063 (1989)
47. J. D. Cirillo, R. G. Barletta, B. R. Bloom, and W. R. Jacobs, Jr., J. Bacteriol. 173, 7772 (1991)
48. R. A. McAdam, T. R. Weisbrod, J. Martin, J. D. Scuderi, A. M. Brown, J. D. Cirillo, B. R. Bloom, and W. R. Jacobs, Jr., Infect. Immun. 63, 1004 (1995)
49. C. Guilhot, B. Gicquel, and C. Martin, FEMS Microbiol. Lett. 77, 181 (1992)
50. J. S. Cox, unpublished results (1998)
51. E. Dubnau, J. Chan, C. Raynaud, V. P. Mohan, M. A. Laneelle, K. Yu, A. Quemard, I. Smith, and M. Daffe, Mol. Microbiol. 36, 630 (2000)
52. M. S. Glickman, J. S. Cox, and W. R. Jacobs, Jr., Mol. Cell 5, 717 (2000)
53. T. P. Primm, S. J. Andersen, V. Mizrahi, D. Avarbock, H. Rubin, and C. E. Barry III, J. Bacteriol. 182, 4889 (2000)
54. M. Jackson, C. Raynaud, M. A. Laneelle, C. Guilhot, C. Laurent-Winter, D. Ensergueix, B. Gicquel, and M. Daffe, Mol. Microbiol. 31, 1573 (1999)
55. L. Y. Armitige, C. Jagannath, A. R. Wanger, and S. J. Norris, Infect. Immun. 68, 767 (2000)
56. M. S. Glickman, S. M. Cahill, and W. R. Jacobs, Jr., J. Biol. Chem. 276, 2228 (2001)
57. P. Chen, R. E. Ruiz, Q. Li, R. F. Silver, and W. R. Bishai, Infect. Immun. 68, 5575 (2000)
58. T. Parish and N. G. Stoker, J. Bacteriol. 182, 5715 (2000)
59. G. R. Stewart, S. Ehrt, L. W. Riley, J. W. Dale, and J. McFadden, Tuber. Lung Dis. 80, 237 (2000)
60. O. Dussurget, G. Stewart, O. Neyrolles, P. Pescher, D. Young, and G. Marchal, Infect. Immun. 69, 529 (2001)
61. J. E. Shea, M. Hensel, C. Gleeson, and D. W. Holden, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93, 2593 (1996)
62. N. Autret, I. Dubail, P. Trieu-Cuot, P. Berche, and A. Charbit, Infect. Immun. 69, 2054 (2001)
63. P. Lestrate, R. M. Delrue, I. Danese, C. Didembourg, B. Taminiau, P. Mertens, X. De Bolle, A. Tibor, C. M. Tang, and J. J. Letesson, Mol. Microbiol. 38, 543 (2000)
64. A. L. Jones, K. M. Knoll, and C. E. Rubens, Mol. Microbiol. 37, 1444 (2000)
65. T. E. Fuller, S. Martin, J. F. Teel, G. R. Alaniz, M. J. Kennedy, and D. E. Lowery, Microb. Pathog. 29, 39 (2000)
66. S. B. Snapper, R. E. Melton, S. Mustafa, T. Kieser, and W. R. Jacobs, Jr., Mol. Microbiol. 4, 1911 (1990)
67. J. Sambrook, E. F. Fritsch, and T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, NY, 1989
68. M. H. Larsen, in "Molecular Genetics of Mycobacteria" (J. G. F. Hatfull and W. R. Jacobs, eds.), p. 313. ASM Press, Washington, D.C., 2000
69. D. L. Provence and R. Curtiss III, in "Methods in General and Molecular Bacteriology" (P. Gerhardt, ed.), p. 317. American Society of Microbiology, Washington, D.C., 1994
70. V. Pelicic, J. M. Reyrat, and B. Gicquel, J. Bacteriol. 178, 1197 (1996)
71. J. D. McKinney, unpublished results (1998)
72. M. S. Glickman, unpublished results (1999)
73. M. Braunstein and W. R. Jacobs, Jr., unpublished results (2001)
74. W. R. Jacobs, Jr., M. Tuckman, and B. R. Bloom, Nature 327, 532 (1987)
75. C. Carriere, P. F. Riska, O. Zimhony, J. Kriakov, S. Bardarov, J. Burns, J. Chan, and W. R. Jacobs, Jr., J. Clin. Microbiol. 35, 3232 (1997)
76. J. Kriakov, unpublished results (2000)
77. M. E. Ford, C. Stenstrom, R. W. Hendrix, and G. F. Hatfull, Tuberc. Lung Dis. 79, 63 (1998)
78. M. R. Sanderson, P. S. Freemont, P. A. Rice, A. Goldman, G. F. Hatfull, N. D. Grindley, and T. A. Steitz, Cell 63, 1323 (1990)
79. S. Bardarov and W. R. Jacobs, Jr., unpublished results (2002)