Exciton delocalization and initial dephasing dynamics of purple bacterial LH2

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 104, Issue 34, 2000, Pages 8295-8307

  Book, L D ^a   Ostafin, A E ^a   Ponomarenko, I N ^a   Norris, J R ^a   Scherer, N F ^a,b  

^a UNIVERSITY OF CHICAGO   (United States)

^b UNIVERSITY OF NOTRE DAME   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHROMOPHORES; ELECTRON SPECTROSCOPY; ELECTRON TRANSITIONS; ENERGY TRANSFER; EXCITONS; MOLECULAR DYNAMICS; MONOMERS; PHOTONS; RELAXATION PROCESSES;

PUMP-PROBE SPECTRA; PURPLE BACTERIAL;

BACTERIA;

EID: 0034246904     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp000485d     Document Type: Article

References (94)

1. van Grondelle, R.; Dekker: J. P.; Gillbro, T.; Sundstrom, V. Biochim. Biophys. Acta 1994, 1187, 1.
2. Hu, X.; Ritz, T.; Damjanovic, A.; Schulten, K. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 3854.
3. Hu, X.; Schulten, K. Phys. Today 1997, 50, 28.
4. Schulten, K. In Simplicity and Complexity in Proteins and Nucleic Acids; Frauenfelder, H., Deisenhofer, J., Wolynes, P. G., Eds.; Dahlem University Press: Berlin,'1999; Vol. p 227.
5. Jungas, C.; Ranck, J.-L.; Rigaud, J.-L.; Joliot, P.; Verméglio, A. EMBOJ. 1999, 18, 534.
6. McDermott, G.; Prince, S. M.; Freer, A. A.; Hawthornthwaite-Lawless, A. M.; Papiz, M. Z.; Cogdell, R. J.; Issacs, N. W. Nature 1995, 374, 517.
7. Sauer, K.; Cogdell, R. J.; Prince, S. M.; Freer, A.; Issacs, N. W.; Scheer, H. Photochem. Photobiol. 1996, 64, 564.
8. Freer, A.; Prince, S.; Sauer, K.; Papiz, M.; Hawthornthwaite-Lawless, A.; McDermott, G.; Cogdell, R.; Issacs, N. W. Structure 1996,4, 449.
9. Alden, R. G.; Johnson, E.; Nagarajan, V.; Parson, W. W.; Law, C. J.; Cogdell, R. G. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 4667.
10. Linnanto, J.; Korppi-Tommola, J. E. I.; Helenius, V. M. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 8739.
11. Sturgis, J. N.; Robert, B. Photosyn. Res. 1996, 50, 5.
12. Cory, M. G.; Zerner, M. C.; Hu, X.; Schulten, K. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 7640.
13. Kumble, R.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 1998, 709, 855.
14. Leegwater, J. A. J. Phys. Chem. 1996, 700, 14403.
15. Meier, T.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7332.
16. Kuhn, O.; Sundström, V. J. Chem. Phys. 1997, 707, 4154.
17. Sundström, V.; Pullerits, T.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 1999, 703, 2327.
18. Reddy, N. R. S.; Small, G. J.; Siebert, M.; Picorel, R. Chem. Phys. Lett. 1991, 181, 391.
19. van Oijen, A. M.; Ketelaars, M.; Köhler, J.; Aartsma, T. J.; Schmidt, J. Science 1999, 255, 400.
20. Knapp, E. W. Chem. Phys. 1984, 85, 73.
21. Leupold, D.; Stiel, H.; Teuchner, K.; Nowak, F.; Sandner, W.; Ücker, B.; Scheer, H. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 4675.
22. Spano, F. C.; Mukamel, S. Phys. Rev. A 1989, 40, 5783.
23. Koolhaas, M. H. C.; van der Zwan, G.; Frese, R. N.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7262.
24. Koolhaas, M. H. C.; Frese, R. N.; Fowler, G. J. S.; Bibby, T. S.; Georgakopoulou, S.; van der Zwan, G.; Hunter, C. N.; van Grondelle, R. Biochemistry 1998, 37, 4693.
25. Monshouwer, R.; Abrahamsson, M.; van Mourik, F.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7241.
26. Chachisvilis, M.; Kuhn, O.; Pullerits, T.; Sundström, V. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7275.
27. Kennis, J. T. M.; Streltsov, A. M.; Fermentier, H.; Aartsma, T. J.; Amsesz, J. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 8369.
28. Novoderezhkin, V.; Monoshouwer, R.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 1999, 703, 10540.
29. Nagarajan, V.; Johnson, E. T.; Williams, J. C.; Parson, W. W. J. Phys. Chem. B 1999, 703, 2297.
30. Kennis, J. T. M.; Streltsov, A. M.; Aartsma, T. J,; Nozawa, T.; Amesz, J. J. Phys. Chem. 1996, 700, 2438.
31. Pullerits, T.; Chachisvilis, M.; Jones, M. R.; Hunter, C. N.; Sundström, V. Chem. Phys. Lett. 1994, 224, 355. '
32. Pullerits, T.; Chachisvilis, M.; Sundström, V. J. Phys. Chem. 1996, 700, 10787.
33. Savikhin, S.; Struve, W. S. Chem. Phys. 1996, 270, 91.
34. Kennis, J. T. M.; Streltsov, A. M.; Vulto, S. I. E.; Aartsma, T. J.; Nozawa, T.; Amesz, J. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7827.
35. Freiberg, A.; Jackson, J. A.; Lin, S.; Woodbury, N. W. J. Phys Chem. A 1998, 702, 4372.
36. Nagarajan, V.; Alden, R. G.; Williams, J. C.; Parson, W. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 13774.
37. Vulto, S. I. E.; Kennis, J. T. M.; Streltsov, A. M.; Amesz, J.; Aartsma, T. J. J. Phys. Chem. B 1999, 703, 878.
38. Jimenez, R.; van Mourik, F.; Yu, J. Y.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7350.
39. Scherer, P. O. J.; Fischer, S. F. Chem. Phys. 1984, 86, 269.
40. Meier, T.; Chemyak, V.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 1997, 707, 8759.
41. Zhang, W. M.; Meier, T.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 1998, 108, 7763.
42. Chernyak, V.; Zhang, W. M.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 1998, 709, 9587.
43. Book, L. D.; Mukamel, S.; Scherer, N. F., work in progress.
44. Davydov, A. S. Theory of Molecular Excitons; Plenum Press: New York, 1971.
45. Ultrafast Phenomena XI; Elsaesser, T., Fujimoto, J. G., Wiersma, D. A., Zinth, W., Eds.; Springer-Verlag: Berlin, 1998.
46. Mukamel, S. Principles of Nonlinear Optical Spectroscopy; Oxford University Press: New York, 1995.
47. de Boeij, W.; Pshenichnikov, M. S.; Wiersma, D. A. J. Phys. Chem. 1996, 700, 11806.
48. Joo, T.; Jia, Y.; Yu, J.-Y.; Lang, M. J.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1996, 104, 6089.
49. de Boeij, W. P.; Pshenichnikov, M. S.; Wiersma, D. A. Chem. Phys. Lett. 1996, 253, 53.
50. Book, L. D.; Scherer, N. F. J. Chem. Phys. 1999, 777, 792.
51. Wynne, K.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1993, 777, 179.
52. Wynne, K.; Hochstrasser, R. M. J. Roman Spectrosc. 1998, 26, 561.
53. Galli, C.; Wynne, K.; LeCours, S. M.; Therien, M. J.; HocHstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1993, 206, 493.
54. Arnett, D. C.; Kumble, R.; Visschers, R. W.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M.; Scherer, N. F. J. Phys. Chem. B, submitted for publication.
55. Arnett, D. C.; Kumble, R.; Visschers, R. W.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M.; Scherer, N. F. Proc. SPIE 1998, 3273, 244.
56. Savikhin, S.; Buck, D. R.; Strove, W. S. Chem. Phys. 1997,223, 303.
57. Arnett, D. C.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Scherer, N. F. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 2014.
58. Connolly, J. S.; Samuel, E. B.; Janzen, A. F. Photochem. Photobiol. 1982, 36, 565.
59. Vadeboncoeur, C.; Mamet-Bratley, M.; Gingras, G. Biochemistry 1979, 18, 4308.
60. Bradforth, S. E.; Jimenez, R.; van Mourik, F.; van Grondelle, R.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1995, 99, 16179.
61. Liau, Y.-H.; Unterreiner, A. N.; Arnett, D. C.; Scherer, N. F. Appl. Opt. 1999, 38, 7386.
62. Sweetser, J. N.; Fittinghoff, D. N.; Trebino, R. Opt. Lett. 1997, 22, 519.
63. Book, L. D.; Arnett, D. C.; Scherer, N. F. J. Chem. Phys., in press (2000).
64. Eckbreth, A. C. Appl. Phys. Lett. 1978, 32, 421.
65. Barkhuisjen, H.; de Beer, R.; Bovee, W. M. M. J.; van Ormondt, J. J. Magn. Reson. 1985, 67, 465.
66. Diers, J. R.; Bocian, D. F. J. Am. Chem. Soc. 1995, 777, 6629.
67. Nagasawa, Y.; Passino, S. A.; Joo, T.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1997, 706, 4840.
68. Hochstrasser, R. M.; Prasad, P. N. J. Chem. Phys. 1972,56, 2814.
69. Craig, D. P.; Dissado, L. A. Chem. Phys. 1976, 14, 89.
70. Horowitz, G.; Valat, P.; Garnier, F.; Kouki, F.; Wintgens, V. Opt. Mater. 1998, 9, 46.
71. Meier, T.; Zhao, Y.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. .1997, 707, 3876.
72. Cho, M.; Yu, J.-Y.; Joo, T.; Nagasawa, Y.; Passino, S. A.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 700, 11944.
73. Jordanides, X: J.; Lang, M. J.; Song, X.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1999, 705, 7995.
74. Arnett, D. C.; Book, L. D.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Scherer, N. F. J. Phys. Chem. B, submitted for publication.
75. Homg, M. L.; Gardecki, J. A.; Papazyan, A.; Maroncelli, M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 17311.
76. Oudar, J.-L. IEEE J. Quantum Electron. 1983, QE-19, 713.
77. Spano, F. C.; Kuklinski, J. R.; Mukamel, S. Phys. Rev. Lett. 1990, 65,211.
78. Renge, I.; Mauring, K.; Avarmaa, R. J. Lumin. 1987, 37, 207.
79. Wu, H.-M.; Reddy, N. R. S.; Small, G. J. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 651.
80. Bopp, M. A.; Sytnik, A.; Howard, T. D.; Cogdell, R. J.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 11271.
81. Förster, T. Naturwissenschaften 1946, 33, 166.
82. Pullerits, T.; Hess, S.; Herek, J. L.; Sundström, V. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 10560..
83. Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 5378.
84. Wu, H.-M.; Savikhin, S.; Reddy, N. R. S.; Jankowiak, R.; Cogdell, R. J.; Struve, W. S.; Small, G. J. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12022.
85. Kühn, O.; Sundström, V. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 3432.
86. Koepke, J.; Hu, X.; Muenke, C.; Schulten, K.; Michel, H. Structure 1996,4,581.
87. Scholes, G. D.; Harcourt, R. D.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 7302.
88. Scholes, G. D.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 1854.
89. Damjanovic, A.; Ritz, T.; Schulten, K. Phys. Rev. E1999, 59, 3293.
90. Laible, P. D.; Knox, R. S.; Owens, T. G. J. Phys. Chem. B 1998, 702, 1641.
91. Becker, M.; Nagarajan, V.; Parson, W. W. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 6840.
92. Mukamel, S.; Rupasov, V. Chem. Phys. Lett. 1995, 242, 17.
93. Nagarajan, V.; Parson, W. W. Biochemistry 1997, 36, 2300.
94. Cápek, V.; Tributsch, H. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 3711.