Identification of two distinct structural transitions in the dissociation of peptides from class II proteins of the major histocompatibility complex [2]

Journal of the American Chemical Society

Volumn 121, Issue 48, 1999, Pages 11225-11226

  McFarland, Benjamin J ^a   Sant, Andrea J ^b   Beeson, Craig ^a  

^a UNIVERSITY OF WASHINGTON   (United States)

^b UNIVERSITY OF CHICAGO   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MAJOR HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN CLASS 2;

DISSOCIATION; DISSOCIATION CONSTANT; HYDROGEN BOND; LETTER; MOLECULAR INTERACTION; PH; PROTEIN PROTEIN INTERACTION;

EID: 0033537018     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja9917767     Document Type: Letter

References (33)

1. Babbitt, B. P.; Allen, P. M.; Matsueda, G.; Haber, E.; Unanue, E. R. Nature 1985, 317, 359-361. Buus, S.; Sette, A.; Colon, S. M.; Jenis, D. M.; Grey, H. M. Cell 1986, 47, 1071-1077. Lanzavecchia, A.; Reid, P. A.; Watts, C. Nature 1992, 357, 249-252. Nelson, C. A.; Petzold, S. J.; Unanue, E. R. Nature 1994, 371, 250-252.
2. Babbitt, B. P.; Allen, P. M.; Matsueda, G.; Haber, E.; Unanue, E. R. Nature 1985, 317, 359-361. Buus, S.; Sette, A.; Colon, S. M.; Jenis, D. M.; Grey, H. M. Cell 1986, 47, 1071-1077. Lanzavecchia, A.; Reid, P. A.; Watts, C. Nature 1992, 357, 249-252. Nelson, C. A.; Petzold, S. J.; Unanue, E. R. Nature 1994, 371, 250-252.
3. Babbitt, B. P.; Allen, P. M.; Matsueda, G.; Haber, E.; Unanue, E. R. Nature 1985, 317, 359-361. Buus, S.; Sette, A.; Colon, S. M.; Jenis, D. M.; Grey, H. M. Cell 1986, 47, 1071-1077. Lanzavecchia, A.; Reid, P. A.; Watts, C. Nature 1992, 357, 249-252. Nelson, C. A.; Petzold, S. J.; Unanue, E. R. Nature 1994, 371, 250-252.
4. Babbitt, B. P.; Allen, P. M.; Matsueda, G.; Haber, E.; Unanue, E. R. Nature 1985, 317, 359-361. Buus, S.; Sette, A.; Colon, S. M.; Jenis, D. M.; Grey, H. M. Cell 1986, 47, 1071-1077. Lanzavecchia, A.; Reid, P. A.; Watts, C. Nature 1992, 357, 249-252. Nelson, C. A.; Petzold, S. J.; Unanue, E. R. Nature 1994, 371, 250-252.
5. Scott, C. A.; Peterson, P. A.; Teyton, L.; Wilson, I. A. Immunity 1998, 8, 319-329. Fremont, D. H.; Monnaie, D.; Nelson, C. A.; Hendrickson, W. A.; Unanue, E. R. Immunity 1998, 8, 305-317. Fremont, D. H.; Hendrickson, W. A.; Marrack, P.; Kappler, J. Science 1996, 272, 1001-1004. Jardetzky, T. S.; Brown, J. H.; Gorga, J. C.; Stern, L. J.; Urban, R. G.; Strominger, J. L.; Wiley, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 734-738. Ghosh, P.; Amaya, M.; Mellins, E.; Wiley, D. C. Nature 1995, 378, 457-462.
6. Scott, C. A.; Peterson, P. A.; Teyton, L.; Wilson, I. A. Immunity 1998, 8, 319-329. Fremont, D. H.; Monnaie, D.; Nelson, C. A.; Hendrickson, W. A.; Unanue, E. R. Immunity 1998, 8, 305-317. Fremont, D. H.; Hendrickson, W. A.; Marrack, P.; Kappler, J. Science 1996, 272, 1001-1004. Jardetzky, T. S.; Brown, J. H.; Gorga, J. C.; Stern, L. J.; Urban, R. G.; Strominger, J. L.; Wiley, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 734-738. Ghosh, P.; Amaya, M.; Mellins, E.; Wiley, D. C. Nature 1995, 378, 457-462.
7. Scott, C. A.; Peterson, P. A.; Teyton, L.; Wilson, I. A. Immunity 1998, 8, 319-329. Fremont, D. H.; Monnaie, D.; Nelson, C. A.; Hendrickson, W. A.; Unanue, E. R. Immunity 1998, 8, 305-317. Fremont, D. H.; Hendrickson, W. A.; Marrack, P.; Kappler, J. Science 1996, 272, 1001-1004. Jardetzky, T. S.; Brown, J. H.; Gorga, J. C.; Stern, L. J.; Urban, R. G.; Strominger, J. L.; Wiley, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 734-738. Ghosh, P.; Amaya, M.; Mellins, E.; Wiley, D. C. Nature 1995, 378, 457-462.
8. Scott, C. A.; Peterson, P. A.; Teyton, L.; Wilson, I. A. Immunity 1998, 8, 319-329. Fremont, D. H.; Monnaie, D.; Nelson, C. A.; Hendrickson, W. A.; Unanue, E. R. Immunity 1998, 8, 305-317. Fremont, D. H.; Hendrickson, W. A.; Marrack, P.; Kappler, J. Science 1996, 272, 1001-1004. Jardetzky, T. S.; Brown, J. H.; Gorga, J. C.; Stern, L. J.; Urban, R. G.; Strominger, J. L.; Wiley, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 734-738. Ghosh, P.; Amaya, M.; Mellins, E.; Wiley, D. C. Nature 1995, 378, 457-462.
9. Scott, C. A.; Peterson, P. A.; Teyton, L.; Wilson, I. A. Immunity 1998, 8, 319-329. Fremont, D. H.; Monnaie, D.; Nelson, C. A.; Hendrickson, W. A.; Unanue, E. R. Immunity 1998, 8, 305-317. Fremont, D. H.; Hendrickson, W. A.; Marrack, P.; Kappler, J. Science 1996, 272, 1001-1004. Jardetzky, T. S.; Brown, J. H.; Gorga, J. C.; Stern, L. J.; Urban, R. G.; Strominger, J. L.; Wiley, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 734-738. Ghosh, P.; Amaya, M.; Mellins, E.; Wiley, D. C. Nature 1995, 378, 457-462.
10. For example, see: Liang, M. N.; Beeson, C.; Mason, K.; McConnell, H. M. Int. Immunol. 1995, 7, 1397-1404.
11. k Alpha Chain 52-67 (Ea), ASFEAQGALANIAVDK.; Ovalbumin 323-335 A2 (OvaW), ISAAVHAAHAEIN; Mouse Invariant Chain 85-99 (mIi), KPVSQMR-MATPLLMR: Ovalbumin 326-336 (Ova-A), AVHAAHAEINE. Anchor residues, where known, are underlined. The two Ova motifs represent minimal, independent registers that give stable, monophasic dissociation kinetics.
12. XL size exclusion column connected to a fluorimeter set to detect fluorescein with excitation at 495 nm, emission at 525 nm. Fluorescence associated with the MHC protein was measured at a retention volume corresponding to ∼60 kDa.
13. Peccoud, J.; Dellabona, P.; Allen, P.; Benoist, C.; Mathis, D. EMBO J. 1990, 9, 4215-4223. Nelson, C. A.; Viner, N.; Young, S.; Petzold, S.; Benoist, C.; Mathis, D.; Unanue, E. R. J. Immunol. 1996, 156, 176-182.
14. Peccoud, J.; Dellabona, P.; Allen, P.; Benoist, C.; Mathis, D. EMBO J. 1990, 9, 4215-4223. Nelson, C. A.; Viner, N.; Young, S.; Petzold, S.; Benoist, C.; Mathis, D.; Unanue, E. R. J. Immunol. 1996, 156, 176-182.
15. Ceman, S.; Wu, S.; Jardetzky, T. S.; Sant, A. J. J. Exp. Med. 1998, 188, 2139-2150.
16. McFarland, B. J.; Beeson, C.; Sant, A. J. J. Immunol. 1999, in press.
17. d maintains its native structure.
18. The concentration of free peptide required for a measurable amount of binding to MHC protein is at least 100-fold higher than the concentration of peptide released from the protein.
19. Beeson, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10429-10433. Beeson, C.; McConnell, H. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 8842-8845. Beeson, C.; Anderson, T. G.; Lee, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 977-980. Sadegh-Nasseri, S.; Stern, L. J.; Wiley, D. C.; Germain, R. N. Nature 1994, 370, 647-650. Sadegh-Nasseri, S.; McConnell, H. M. Nature 1989, 337, 274-276.
20. Beeson, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10429-10433. Beeson, C.; McConnell, H. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 8842-8845. Beeson, C.; Anderson, T. G.; Lee, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 977-980. Sadegh-Nasseri, S.; Stern, L. J.; Wiley, D. C.; Germain, R. N. Nature 1994, 370, 647-650. Sadegh-Nasseri, S.; McConnell, H. M. Nature 1989, 337, 274-276.
21. Beeson, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10429-10433. Beeson, C.; McConnell, H. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 8842-8845. Beeson, C.; Anderson, T. G.; Lee, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 977-980. Sadegh-Nasseri, S.; Stern, L. J.; Wiley, D. C.; Germain, R. N. Nature 1994, 370, 647-650. Sadegh-Nasseri, S.; McConnell, H. M. Nature 1989, 337, 274-276.
22. Beeson, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10429-10433. Beeson, C.; McConnell, H. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 8842-8845. Beeson, C.; Anderson, T. G.; Lee, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 977-980. Sadegh-Nasseri, S.; Stern, L. J.; Wiley, D. C.; Germain, R. N. Nature 1994, 370, 647-650. Sadegh-Nasseri, S.; McConnell, H. M. Nature 1989, 337, 274-276.
23. Beeson, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10429-10433. Beeson, C.; McConnell, H. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 8842-8845. Beeson, C.; Anderson, T. G.; Lee, C.; McConnell, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 977-980. Sadegh-Nasseri, S.; Stern, L. J.; Wiley, D. C.; Germain, R. N. Nature 1994, 370, 647-650. Sadegh-Nasseri, S.; McConnell, H. M. Nature 1989, 337, 274-276.
24. -1.
25. Lee, J. M.; Kay, C. M.; Watts, T. H. Int. Immunol. 1992, 4, 889-897. Boniface, J. J.; Lyons, D. S.; Wettstein, D. A.; Allbriton, N. L.; Davis, M. M. J. Exp. Med. 1996, 183, 119-126. Runnels, H. A.; Moore, J. C.; Jensen, P. E. J. Exp. Med. 1996, 183, 127-136. Schmitt, L.; Boniface, J. J.; Davis, M. M.; McConnell, H. M. J. Mol. Biol. 1999, 286, 207-218.
26. Lee, J. M.; Kay, C. M.; Watts, T. H. Int. Immunol. 1992, 4, 889-897. Boniface, J. J.; Lyons, D. S.; Wettstein, D. A.; Allbriton, N. L.; Davis, M. M. J. Exp. Med. 1996, 183, 119-126. Runnels, H. A.; Moore, J. C.; Jensen, P. E. J. Exp. Med. 1996, 183, 127-136. Schmitt, L.; Boniface, J. J.; Davis, M. M.; McConnell, H. M. J. Mol. Biol. 1999, 286, 207-218.
27. Lee, J. M.; Kay, C. M.; Watts, T. H. Int. Immunol. 1992, 4, 889-897. Boniface, J. J.; Lyons, D. S.; Wettstein, D. A.; Allbriton, N. L.; Davis, M. M. J. Exp. Med. 1996, 183, 119-126. Runnels, H. A.; Moore, J. C.; Jensen, P. E. J. Exp. Med. 1996, 183, 127-136. Schmitt, L.; Boniface, J. J.; Davis, M. M.; McConnell, H. M. J. Mol. Biol. 1999, 286, 207-218.
28. Lee, J. M.; Kay, C. M.; Watts, T. H. Int. Immunol. 1992, 4, 889-897. Boniface, J. J.; Lyons, D. S.; Wettstein, D. A.; Allbriton, N. L.; Davis, M. M. J. Exp. Med. 1996, 183, 119-126. Runnels, H. A.; Moore, J. C.; Jensen, P. E. J. Exp. Med. 1996, 183, 127-136. Schmitt, L.; Boniface, J. J.; Davis, M. M.; McConnell, H. M. J. Mol. Biol. 1999, 286, 207-218.
29. Sadegh-Nasseri, S.; Germain, R. N. Immunol. Today 1992, 13, 43-46.
30. Sherman, M. A.; Weber, D. A.; Jensen, P. E. Immunity 1995, 3, 197-205.
31. Weber, D. A.; Evavold, B. D.; Jensen, P. E. Science 1996, 274, 618-620. Sloan, V. S.; Cameron, P.; Porter, G.; Gammon, M.; Amaya, M.; Mellins, E.; Zaller, D. M. Nature 1995, 375, 802-806. Kropshofer, H.; Vogt, A. B.; Moldenhauer, G.; Hammer, J.; Blum, J. S.; Hammerling, G. J. EMBO J. 1996, 15, 6144-6154.
32. Weber, D. A.; Evavold, B. D.; Jensen, P. E. Science 1996, 274, 618-620. Sloan, V. S.; Cameron, P.; Porter, G.; Gammon, M.; Amaya, M.; Mellins, E.; Zaller, D. M. Nature 1995, 375, 802-806. Kropshofer, H.; Vogt, A. B.; Moldenhauer, G.; Hammer, J.; Blum, J. S.; Hammerling, G. J. EMBO J. 1996, 15, 6144-6154.
33. Weber, D. A.; Evavold, B. D.; Jensen, P. E. Science 1996, 274, 618-620. Sloan, V. S.; Cameron, P.; Porter, G.; Gammon, M.; Amaya, M.; Mellins, E.; Zaller, D. M. Nature 1995, 375, 802-806. Kropshofer, H.; Vogt, A. B.; Moldenhauer, G.; Hammer, J.; Blum, J. S.; Hammerling, G. J. EMBO J. 1996, 15, 6144-6154.