Activation of RNA polymerase II by topologically linked DNA-tracking proteins

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 94, Issue 13, 1997, Pages 6718-6723

  Ouhammouch, Mohamed ^a   Sayre, Michael H ^b   Kadonaga, James T ^a   Geiduschek, E Peter ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b JOHNS HOPKINS BLOOMBERG SCHOOL OF PUBLIC HEALTH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA DIRECTED DNA POLYMERASE GAMMA; GLYCOPROTEIN GP 45; HYBRID PROTEIN; RNA POLYMERASE II; TRANSCRIPTION FACTOR; UNCLASSIFIED DRUG; VIRUS PROTEIN;

ANIMAL CELL; ARTICLE; CONTROLLED STUDY; DNA SEQUENCE; DROSOPHILA MELANOGASTER; EMBRYO; ENZYME ACTIVATION; ESCHERICHIA COLI; HERPES SIMPLEX VIRUS; NONHUMAN; NUCLEOSOME; PRIORITY JOURNAL; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; TRANSCRIPTION INITIATION; TRANSCRIPTION REGULATION;

ANIMALS; DNA POLYMERASE III; DROSOPHILA MELANOGASTER; ENZYME ACTIVATION; ESCHERICHIA COLI; RECOMBINANT FUSION PROTEINS; RNA POLYMERASE II; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; TRANS-ACTIVATION (GENETICS);

ANIMALIA; DROSOPHILA MELANOGASTER; ESCHERICHIA COLI; HERPES; MELANOGASTER; PROKARYOTA; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SIMPLEXVIRUS;

EID: 0031009814     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.94.13.6718     Document Type: Article

References (61)

1. Wedel, A., Weiss, D. S., Popham, D., Droge, P. & Kustu, S. (1990) Science 248, 486-490.
2. Su, W., Porter, S., Kustu, S. & Echols, H. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 5504-5508.
3. Ptashne, M. & Gann, A. A. (1990) Nature (London) 346, 329-331.
4. Green, M. R. (1993) Harvey Lect. 88, 67-96.
5. Tjian, R. & Maniatis, T. (1994) Cell 77, 5-8.
6. Hengartner, C. J., Thompson, C. M., Zhang, J., Chao, D. M., Liao, S. M., Koleske, A. J., Okamura, S. & Young, R. A. (1995) Genes Dev. 9, 897-910.
7. Wang, J. C. & Giaever, G. N. (1988) Science 240, 300-304.
8. Herendeen, D. R., Kassavetis, G. A., Barry, J., Alberts, B. M. & Geiduschek, E. P. (1989) Science 245, 952-958.
9. Herendeen, D. R., Williams, K. P., Kassavetis, G. A. & Geiduschek, E. P. (1990) Science 248, 573-378.
10. Brody, E. N., Kassavetis, G. A., Ouhammouch, M., Sanders G. M., Tinker, R. L. & Geiduschek, E. P. (1995) FEMS Microbiol. Lett. 128, 1-8.
11. Nossal, N. (1994) in Molecular Biology of Bacteriophage T4, ed. Karam, J. D. (Am. Soc. Microbiol., Washington, DC), pp. 43-55.
12. Kaboord, B. F. & Benkovic, S. J. (1996) Biochemistry 35, 1084-1092.
13. Young, M. C., Weitzel, S. E. & von Hippel, P. H. (1996) J. Mol. Biol. 264, 440-452.
14. Stukenberg, P. T., Studwell-Vaughan, P. S. & O'Donnell, M. (1991) J. Biol. Chem. 266, 11328-11334.
15. Kelman, Z. & O'Donnell, M. (1995) Annu. Rev. Biochem. 64, 171-200.
16. Kong, X. P., Onrust, R., O'Donnell, M. & Kuriyan, J. (1992) Cell 69, 425-437.
17. Krishna, T. S., Kong, X. P., Gary, S., Burgers, P. M. & Kuriyan, J. (1994) Cell 79, 1233-1243.
18. Tinker, R. L., Kassavetis, G. A. & Geiduschek, E. P. (1994) EMBO J. 13, 5330-5337.
19. Tinker, R. L., Williams, K. P., Kassavetis, G. A. & Geiduschek, E. P. (1994) Cell 77, 225-237.
20. Herendeen, D. R., Kassavetis, G. A. & Geiduschek, E. P. (1992) Science 256, 1298-1303.
21. Alberts, B., Bray, D., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K. & Watson, J. D., eds. (1994) Molecular Biology of the Cell (Garland, New York).
22. Barberis, A., Pearlberg, J., Simkovich, N., Farrell, S., Reinagel, P., Bamdad, C., Sigal, G. & Ptashne, M. (1995) Cell 81, 359-368.
23. Koleske, A. J. & Young, R. A. (1995) Trends Biochem. Sci. 20, 113-116.
24. Triezenberg, S. J. (1995) Curr. Opin. Genet. Dev. 5, 190-196.
25. Bartholomew, B., Tinker, R. L., Kassavetis, G. A. & Geiduschek, E. P. (1995) Methods Enzymol. 262, 476-494.
26. Feaver, W. J., Henry, N. L., Bushnell, D. A., Sayre, M. H., Brickner, J. H., Gileadi, O. & Kornberg, R. D. (1994) J. Biol. Chem. 269, 27549-27553.
27. Sayre, M. H., Tschochner, H. & Kornberg, R. D. (1992) J. Biol. Chem. 267, 23383-23387.
28. Svejstrup, J. Q., Feaver, W. J., LaPointe, J. & Kornberg, R. D. (1994) J. Biol. Chem. 269, 28044-28048.
29. Kim, Y. J., Bjorklund, S., Li, Y., Sayre, M. H. & Kornberg, R. D. (1994) Cell 77, 599-608.
30. Sayre, M. H., Tschochner, H. & Kornberg, R. D. (1992) J. Biol. Chem. 267, 23376-23382.
31. Kamakaka, R. T. & Kadonaga, J. T. (1994) Methods Cell Biol. 44, 225-235.
32. Croston, G. E., Kerrigan, L. A., Lira, L. M., Marshak, D. R. & Kadonaga, J. T. (1991) Science 251, 643-649.
33. Naktinis, V., Turner, J. & O'Donnell, M. (1996) Cell 84, 137-145.
34. Koleske, A. J. & Young, R. A. (1994) Nature (London) 368, 466-469.
35. Sawadogo, M. & Roeder, R. G. (1985) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 4394-4398.
36. Lue, N. F., Flanagan, P. M., Sugimoto, K. & Kornberg, R. D. (1989) Science 246, 661-664.
37. Sadler, J. R., Sasmor, H. & Betz, J. L. (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 6785-6789.
38. Simons, A., Tils, D., von Wilcken-Bergmann, B. & Müller-Hill, B. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 1624-1628.
39. Alberti, S., Oehler, S., von Wilcken-Bergmann, B. & Müller-Hill, B. (1993) EMBO J. 12, 3227-3236.
40. Chen, J., Alberti, S. & Matthews, K. S. (1994) J. Biol. Chem. 269, 12482-12487.
41. Gilbert, W. & Müller-Hill, B. (1966) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 56, 1891-1898.
42. Riggs, A. D. & Bourgeois, S. (1969) Biophys. J. 9, A84.
43. Fu, T.-J., Sanders, G. M., O'Donnell, M. & Geiduschek, E. P. (1996) EMBO J. 15, 4414-4422.
44. Yao. N., Turner, J., Kelman, Z., Stukenberg, P. T., Pan, Z.-Q., Hurwitz, J. & O'Donnell, M. (1996) Genes to Cells 1, 101-113.
45. Kamakaka, R. T., Tyree, C. M. & Kadonaga, J. T. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 1024-1028.
46. Sanders, G. M., Kassavetis, G. A. & Geiduschek, E. P. (1997) EMBO J., in press.
47. Croston, G. E., Laybourn, P. J., Paranjape, S. M. & Kadonaga, J. T. (1992) Genes Dev. 6, 2270-2281.
48. Laybourn, P. J. & Kadonaga, J. T. (1992) Science 257, 1682-1685.
49. Farrell, S., Simkovich, N., Wu, Y., Barberis, A. & Ptashne, M. (1996) Genes Dev. 10, 2359-2367.
50. Stargell, L. A. & Struhl, K. (1996) Trends Genet. 12, 311-315.
51. Gulbis, J. M., Kelman, Z., Hurwitz, J., O'Donnell, M. & Kuriyan, J. (1996) Cell 87, 297-306.
52. Tinker-Kulberg, R. L., Fu, T.-J., Geiduschek, E. P. & Kassavetis, G. A. (1996) EMBO J. 15, 5032-5039.
53. von Hippel, P. H. & Berg, O. C. (1989) J. Biol. Chem. 264, 675-678.
54. Ruusala, T. & Crothers, D. M. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 4903-4907.
55. Kabata, H., Kurosawa, O., Arai, I., Washizu, M., Margarson, S. A., Glass, R. E. & Shimamoto, N. (1993) Science 262, 1561-1563.
56. Surby, M. A. & Reich, N. O. (1996) Biochemistry 35, 2201-2208.
57. Kingston, R. E., Bunker, C. A. & Imbalzano, A. N. (1996) Genes Dev. 10, 905-920.
58. Imbalzano, A. N., Schnitzler, G. R. & Kingston, R. E. (1996) J. Biol. Chem. 271, 20726-20733.
59. Pazin, M. J., Bhargava, P., Geiduschek, E. P. & Kadonaga, J. T. (1997) Science 276, 809-812.
60. Wilson, C. J., Chao, D. M., Imbalzano, A. N., Schnitzler, G. R., Kingston, R. E. & Young, R. A. (1996) Cell 84, 235-244.
61. Cairns, B. R., Lorch, Y., Li, Y., Zhang, M. C., Lacomis, L., Erdjument-Bromage, H., Tempst, P., Du, J., Laurent, B. & Kornberg, R. D. (1996) Cell 87, 1249-1260.