-
1
-
-
0032980642
-
-
Goldbeck, R. A.; Thomas, Y. G.; Chen, E.; Esquerra, R. M.; Kliger, D. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999, 96, 2782-2787 10.1073/pnas.96.6.2782
-
(1999)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.96
, pp. 2782-2787
-
-
Goldbeck, R.A.1
Thomas, Y.G.2
Chen, E.3
Esquerra, R.M.4
Kliger, D.S.5
-
2
-
-
34447297323
-
-
Baldwin, R. L. J. Mol. Biol. 2007, 371, 283-301 10.1016/j.jmb.2007.05.078
-
(2007)
J. Mol. Biol.
, vol.371
, pp. 283-301
-
-
Baldwin, R.L.1
-
3
-
-
84930201934
-
-
Sborgi, L.; Verma, A.; Piana, S.; Lindorff-Larsen, K.; Cerminara, M.; Santiveri, C. M.; Shaw, D. E.; de Alba, E.; Muñoz, V. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 6506-6516 10.1021/jacs.5b02324
-
(2015)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.137
, pp. 6506-6516
-
-
Sborgi, L.1
Verma, A.2
Piana, S.3
Lindorff-Larsen, K.4
Cerminara, M.5
Santiveri, C.M.6
Shaw, D.E.7
De Alba, E.8
Muñoz, V.9
-
4
-
-
84872221774
-
-
Katritch, V.; Cherezov, V.; Stevens, R. C. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2013, 53, 531-56 10.1146/annurev-pharmtox-032112-135923
-
(2013)
Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol.
, vol.53
, pp. 531-556
-
-
Katritch, V.1
Cherezov, V.2
Stevens, R.C.3
-
5
-
-
0035853282
-
-
Katz, B. A. et al. J. Mol. Biol. 2001, 307, 1451-1486 10.1006/jmbi.2001.4516
-
(2001)
J. Mol. Biol.
, vol.307
, pp. 1451-1486
-
-
Katz, B.A.1
-
7
-
-
30944460113
-
-
Min, W.; English, B. P.; Luo, G.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Acc. Chem. Res. 2005, 38, 923-931 10.1021/ar040133f
-
(2005)
Acc. Chem. Res.
, vol.38
, pp. 923-931
-
-
Min, W.1
English, B.P.2
Luo, G.3
Cherayil, B.J.4
Kou, S.C.5
Xie, X.S.6
-
8
-
-
84879069952
-
-
Kim, E.; Lee, S.; Jeon, A.; Choi, J. M.; Lee, H.-S.; Hohng, S.; Kim, H.-S. Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 313-318 10.1038/nchembio.1213
-
(2013)
Nat. Chem. Biol.
, vol.9
, pp. 313-318
-
-
Kim, E.1
Lee, S.2
Jeon, A.3
Choi, J.M.4
Lee, H.-S.5
Hohng, S.6
Kim, H.-S.7
-
9
-
-
36348946234
-
-
Deniz, A. A.; Mukhopadhyay, S.; Lemke, E. A. J. R. Soc., Interface 2008, 5, 15-45 10.1098/rsif.2007.1021
-
(2008)
J. R. Soc., Interface
, vol.5
, pp. 15-45
-
-
Deniz, A.A.1
Mukhopadhyay, S.2
Lemke, E.A.3
-
10
-
-
84897091038
-
-
Keller, B. G.; Kobitski, A.; Jäschke, A.; Nienhaus, G. U.; Noé, F. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 4534-4543 10.1021/ja4098719
-
(2014)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.136
, pp. 4534-4543
-
-
Keller, B.G.1
Kobitski, A.2
Jäschke, A.3
Nienhaus, G.U.4
Noé, F.5
-
11
-
-
79953167530
-
-
Noé, F.; Doose, S.; Daidone, I.; Löllmann, M.; Chodera, J. D.; Sauer, M.; Smith, J. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108, 4822-4827 10.1073/pnas.1004646108
-
(2011)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.108
, pp. 4822-4827
-
-
Noé, F.1
Doose, S.2
Daidone, I.3
Löllmann, M.4
Chodera, J.D.5
Sauer, M.6
Smith, J.C.7
-
12
-
-
79958212540
-
-
Zhuang, W.; Cui, R. Z.; Silva, D.-A.; Huang, X. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 5415-5424 10.1021/jp109592b
-
(2011)
J. Phys. Chem. B
, vol.115
, pp. 5415-5424
-
-
Zhuang, W.1
Cui, R.Z.2
Silva, D.-A.3
Huang, X.4
-
13
-
-
84859527217
-
-
Keller, B.; Prinz, J.-H.; Noé, F. Chem. Phys. 2012, 396, 92-107 10.1016/j.chemphys.2011.08.021
-
(2012)
Chem. Phys.
, vol.396
, pp. 92-107
-
-
Keller, B.1
Prinz, J.-H.2
Noé, F.3
-
14
-
-
84887578598
-
-
Lindner, B.; Yi, Z.; Prinz, J.-H.; Smith, J. C.; Noé, F. J. Chem. Phys. 2013, 139.
-
(2013)
J. Chem. Phys.
, vol.139
-
-
Lindner, B.1
Yi, Z.2
Prinz, J.-H.3
Smith, J.C.4
Noé, F.5
-
15
-
-
0027441950
-
-
Amadei, A.; Linssen, A. B.; Berendsen, H. J. C. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1993, 17, 412-225 10.1002/prot.340170408
-
(1993)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.17
, pp. 412-225
-
-
Amadei, A.1
Linssen, A.B.2
Berendsen, H.J.C.3
-
17
-
-
34547297406
-
-
Altis, A.; Nguyen, P. H.; Hegger, R.; Stock, G. J. Chem. Phys. 2007, 126, 244111 10.1063/1.2746330
-
(2007)
J. Chem. Phys.
, vol.126
, pp. 244111
-
-
Altis, A.1
Nguyen, P.H.2
Hegger, R.3
Stock, G.4
-
18
-
-
84886081379
-
-
Pérez-Hernández, G.; Paul, F.; Giorgino, T.; de Fabritiis, G.; Noé, F. J. Chem. Phys. 2013, 139, 015102 10.1063/1.4811489
-
(2013)
J. Chem. Phys.
, vol.139
, pp. 015102
-
-
Pérez-Hernández, G.1
Paul, F.2
Giorgino, T.3
De Fabritiis, G.4
Noé, F.5
-
20
-
-
33846071499
-
-
Peters, B. J. Chem. Phys. 2006, 125, 241101 10.1063/1.2409924
-
(2006)
J. Chem. Phys.
, vol.125
, pp. 241101
-
-
Peters, B.1
-
21
-
-
0000573002
-
-
Schütte, C.; Fischer, A.; Huisinga, W.; Deuflhard, P. J. Comput. Phys. 1999, 151, 146-168 10.1006/jcph.1999.6231
-
(1999)
J. Comput. Phys.
, vol.151
, pp. 146-168
-
-
Schütte, C.1
Fischer, A.2
Huisinga, W.3
Deuflhard, P.4
-
22
-
-
13544256263
-
-
Dellnitz, M. Kirkland, S. Neumann, M. Schütte, C. Eds. Elsevier: New York, 2005; Vol
-
Deuflhard, P.; Weber, M. In Linear Algebra Appl.; Dellnitz, M.; Kirkland, S.; Neumann, M.; Schütte, C., Eds.; Elsevier: New York, 2005; Vol. 398C, pp 161-184.
-
Linear Algebra Appl.
, vol.398 C
, pp. 161-184
-
-
Deuflhard, P.1
Weber, M.2
-
23
-
-
84900320724
-
-
Prinz, J.-H.; Chodera, J. D.; Noé, F. Phys. Rev. X 2014, 4, 011020 10.1103/PhysRevX.4.011020
-
(2014)
Phys. Rev. X
, vol.4
, pp. 011020
-
-
Prinz, J.-H.1
Chodera, J.D.2
Noé, F.3
-
25
-
-
79958151345
-
-
Schütte, C.; Noé, F.; Lu, J.; Sarich, M.; Vanden-Eijnden, E. J. Chem. Phys. 2011, 134, 204105 10.1063/1.3590108
-
(2011)
J. Chem. Phys.
, vol.134
, pp. 204105
-
-
Schütte, C.1
Noé, F.2
Lu, J.3
Sarich, M.4
Vanden-Eijnden, E.5
-
26
-
-
2942567954
-
-
Swope, W. C.; Pitera, J. W.; Suits, F. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 6571-6581 10.1021/jp037421y
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 6571-6581
-
-
Swope, W.C.1
Pitera, J.W.2
Suits, F.3
-
28
-
-
34247339716
-
-
Noé, F.; Horenko, I.; Schütte, C.; Smith, J. C. J. Chem. Phys. 2007, 126, 155102 10.1063/1.2714539
-
(2007)
J. Chem. Phys.
, vol.126
, pp. 155102
-
-
Noé, F.1
Horenko, I.2
Schütte, C.3
Smith, J.C.4
-
29
-
-
34247338100
-
-
Chodera, J. D.; Dill, K. A.; Singhal, N.; Pande, V. S.; Swope, W. C.; Pitera, J. W. J. Chem. Phys. 2007, 126, 155101 10.1063/1.2714538
-
(2007)
J. Chem. Phys.
, vol.126
, pp. 155101
-
-
Chodera, J.D.1
Dill, K.A.2
Singhal, N.3
Pande, V.S.4
Swope, W.C.5
Pitera, J.W.6
-
30
-
-
79957488000
-
-
Prinz, J.-H.; Wu, H.; Sarich, M.; Keller, B.; Senne, M.; Held, M.; Chodera, J. D.; Schütte, C.; Noé, F. J. Chem. Phys. 2011, 134, 174105 10.1063/1.3565032
-
(2011)
J. Chem. Phys.
, vol.134
, pp. 174105
-
-
Prinz, J.-H.1
Wu, H.2
Sarich, M.3
Keller, B.4
Senne, M.5
Held, M.6
Chodera, J.D.7
Schütte, C.8
Noé, F.9
-
32
-
-
76149136021
-
-
Voelz, V. A.; Bowman, G. R.; Beauchamp, K.; Pande, V. S. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1526-1528 10.1021/ja9090353
-
(2010)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.132
, pp. 1526-1528
-
-
Voelz, V.A.1
Bowman, G.R.2
Beauchamp, K.3
Pande, V.S.4
-
33
-
-
84924386814
-
-
Bowman, G. R.; Bolin, E. R.; Hart, K. M.; Maguire, B. C.; Marqusee, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2015, 112, 2734-2739 10.1073/pnas.1417811112
-
(2015)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.112
, pp. 2734-2739
-
-
Bowman, G.R.1
Bolin, E.R.2
Hart, K.M.3
Maguire, B.C.4
Marqusee, S.5
-
34
-
-
77956841151
-
-
Sarich, M.; Noé, F.; Schütte, C. Multiscale Model. Simul. 2010, 8, 1154-1177 10.1137/090764049
-
(2010)
Multiscale Model. Simul.
, vol.8
, pp. 1154-1177
-
-
Sarich, M.1
Noé, F.2
Schütte, C.3
-
36
-
-
84898431921
-
-
Nüske, F.; Keller, B.; Pérez-Hernández, G.; Mey, A. S. J. S.; Noé, F. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 1739-1752 10.1021/ct4009156
-
(2014)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.10
, pp. 1739-1752
-
-
Nüske, F.1
Keller, B.2
Pérez-Hernández, G.3
Mey, A.S.J.S.4
Noé, F.5
-
41
-
-
84994779169
-
-
Noé, F.; Banisch, R.; Clementi, C. J. Chem. Theory Comput. 2016, 12 ( 11 ) 5620-5630
-
(2016)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.12
, Issue.11
, pp. 5620-5630
-
-
Noé, F.1
Banisch, R.2
Clementi, C.3
-
42
-
-
85006027741
-
-
submitted for publication
-
Wu, H.; Nüske, F.; Paul, F.; Klus, S.; Koltai, P.; Noé, F. ( 2016, submitted for publication.
-
(2016)
-
-
Wu, H.1
Nüske, F.2
Paul, F.3
Klus, S.4
Koltai, P.5
Noé, F.6
-
43
-
-
19644394100
-
-
Coifman, R. R.; Lafon, S.; Lee, A. B.; Maggioni, M.; Nadler, B.; Warner, F.; Zucker, S. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 7426-7431 10.1073/pnas.0500334102
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.102
, pp. 7426-7431
-
-
Coifman, R.R.1
Lafon, S.2
Lee, A.B.3
Maggioni, M.4
Nadler, B.5
Warner, F.6
Zucker, S.W.7
-
44
-
-
79953320021
-
-
Rohrdanz, M. A.; Zheng, W.; Maggioni, M.; Clementi, C. J. Chem. Phys. 2011, 134, 124116 10.1063/1.3569857
-
(2011)
J. Chem. Phys.
, vol.134
, pp. 124116
-
-
Rohrdanz, M.A.1
Zheng, W.2
Maggioni, M.3
Clementi, C.4
-
46
-
-
84863672816
-
-
Senne, M.; Trendelkamp-Schroer, B.; Mey, A. S. J. S.; Schütte, C.; Noé, F. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 2223-2238 10.1021/ct300274u
-
(2012)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.8
, pp. 2223-2238
-
-
Senne, M.1
Trendelkamp-Schroer, B.2
Mey, A.S.J.S.3
Schütte, C.4
Noé, F.5
-
47
-
-
70349631761
-
-
Bowman, G. R.; Beauchamp, K. A.; Boxer, G.; Pande, V. S. J. Chem. Phys. 2009, 131, 124101 10.1063/1.3216567
-
(2009)
J. Chem. Phys.
, vol.131
, pp. 124101
-
-
Bowman, G.R.1
Beauchamp, K.A.2
Boxer, G.3
Pande, V.S.4
-
48
-
-
33845656521
-
-
Neuweiler, H.; Löllmann, M.; Doose, S.; Sauer, M. J. Mol. Biol. 2007, 365, 856-869 10.1016/j.jmb.2006.10.021
-
(2007)
J. Mol. Biol.
, vol.365
, pp. 856-869
-
-
Neuweiler, H.1
Löllmann, M.2
Doose, S.3
Sauer, M.4
-
49
-
-
76749155787
-
-
Daidone, I.; Neuweiler, H.; Doose, S.; Sauer, M.; Smith, J. C. PLoS Comput. Biol. 2010, 6, e1000645 10.1371/journal.pcbi.1000645
-
(2010)
PLoS Comput. Biol.
, vol.6
, pp. e1000645
-
-
Daidone, I.1
Neuweiler, H.2
Doose, S.3
Sauer, M.4
Smith, J.C.5
-
50
-
-
77957937199
-
-
Shaw, D. E.; Maragakis, P.; Lindorff-Larsen, K.; Piana, S.; Dror, R.; Eastwood, M.; Bank, J.; Jumper, J.; Salmon, J.; Shan, Y.; Wriggers, W. Science 2010, 330, 341-346 10.1126/science.1187409
-
(2010)
Science
, vol.330
, pp. 341-346
-
-
Shaw, D.E.1
Maragakis, P.2
Lindorff-Larsen, K.3
Piana, S.4
Dror, R.5
Eastwood, M.6
Bank, J.7
Jumper, J.8
Salmon, J.9
Shan, Y.10
Wriggers, W.11
-
51
-
-
84903361996
-
-
Noé, F.; Wu, H.; Prinz, J.-H.; Plattner, N. J. Chem. Phys. 2013, 139, 184114 10.1063/1.4828816
-
(2013)
J. Chem. Phys.
, vol.139
, pp. 184114
-
-
Noé, F.1
Wu, H.2
Prinz, J.-H.3
Plattner, N.4
-
52
-
-
84964649164
-
-
Doerr, S.; Harvey, M. J.; Noé, F.; De Fabritiis, G. J. Chem. Theory Comput. 2016, 12, 1845-1852 10.1021/acs.jctc.6b00049
-
(2016)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.12
, pp. 1845-1852
-
-
Doerr, S.1
Harvey, M.J.2
Noé, F.3
De Fabritiis, G.4
|