Detection of Circulating Tumor DNA in Human Blood via DNA-Mediated Surface-Enhanced Raman Spectroscopy of Single-Walled Carbon Nanotubes

Analytical Chemistry

Volumn 88, Issue 9, 2016, Pages 4759-4765

  Zhou, Qifeng ^a   Zheng, Jing ^a   Qing, Zhihe ^b   Zheng, Mengjie ^a   Yang, Jinfeng ^a   Yang, Sheng ^b   Ying, Le ^a   Yang, Ronghua ^b  

^a HUNAN UNIVERSITY   (China)

^b CHANGSHA UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BLOOD; CARBON; CARBON NANOTUBES; DNA; MOLECULAR DYNAMICS; NANOTUBES; RAMAN SCATTERING; RAMAN SPECTROSCOPY; SURFACE SCATTERING; TUMORS; YARN;

MALIGNANT PROGRESSION; MOLECULAR SWITCHES; POINT-OF-CARE TESTING; RECOGNITION CAPACITY; SINGLE-WALLED CARBON NANOTUBE (SWNTS); SURFACE ENHANCED RAMAN SCATTERING (SERS); SURFACE ENHANCED RAMAN SPECTROSCOPY; ULTRASENSITIVE DETECTION;

SINGLE-WALLED CARBON NANOTUBES (SWCN);

CARBON NANOTUBE; CIRCULATING TUMOR DNA; DNA;

BLOOD; CHEMISTRY; HUMAN; RAMAN SPECTROMETRY; SURFACE PROPERTY;

CIRCULATING TUMOR DNA; DNA, NEOPLASM; HUMANS; NANOTUBES, CARBON; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN; SURFACE PROPERTIES;

EID: 84968779431     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.6b00108     Document Type: Article

References (37)

1. Sorenson, G. D.; Pribish, D. M.; Valone, F. H.; Memoli, V. A.; Bzik, D. J.; Yao, S. L. Cancer Epidemiol., Biomarkers Prev. 1994, 3, 67-71
2. Vasioukhin, V.; Anker, P.; Maurice, P.; Lyautey, J.; Lederrey, C.; Stroun, M. Br. J. Haematol. 1994, 86, 774-779 10.1111/j.1365-2141.1994.tb04828.x
3. Schwarzenbach, H.; Hoon, D.; Pantel, K. Nat. Rev. Cancer 2011, 11, 426-437 10.1038/nrc3066
4. Gormally, E.; Caboux, E.; Vineis, P.; Hainaut, P. Mutat. Res., Rev. Mutat. Res. 2007, 635, 105-117 10.1016/j.mrrev.2006.11.002
5. Diehl, F.; Schmidt, K.; Choti, M. A.; Romans, K.; Goodman, S.; Li, M.; Thornton, K.; Agrawal, N.; Sokoll, L.; Szabo, S. A. et al. Nat. Med. 2008, 14, 985-990 10.1038/nm.1789
6. Yong, E. Nature 2014, 511, 524-526 10.1038/511524a
7. Bettegowda, C.; Sausen, M.; Leary, R. J.; Kinde, I.; Wang, Y.; Agrawal, H.; Bartlett, B. R.; Wang, H.; Luber, B.; Alani, R. M. et al. Sci. Transl. Med. 2014, 6, 224ra24 10.1126/scitranslmed.3007094
8. Dawson, S. J.; Rosenfeld, N.; Caldas, C. N. Engl. J. Med. 2013, 369, 93-94 10.1056/NEJMc1306040
9. Murtaza, M.; Dawson, S. J.; Tsui, D. W.; Gale, D.; Forshew, T.; Piskorz, A. M.; Parkinson, C.; Chin, S.-F.; Kingsbury, Z.; Wong, A. S. C. et al. Nature 2013, 497, 108-112 10.1038/nature12065
10. Newman, A. M.; Bratman, S. V.; To, J.; Wynne, J. F.; Eclov, N. C.; Modlin, L. A.; Liu, C. L.; Neal, J. W.; Wakelee, H. A.; Merritt, R. E.; Shrager, J. B.; Loo, B. W., Jr; Alizadeh, A. A.; Diehn, M. Nat. Med. 2014, 20, 548-54 10.1038/nm.3519
11. Nguyen, A. H.; Sim, S. J. Biosens. Bioelectron. 2015, 67, 443-449 10.1016/j.bios.2014.09.003
12. Das, J.; Ivanov, I.; Montermini, L.; Rak, J.; Sargent, E.; Kelley, S. Nat. Chem. 2015, 7, 569-575 10.1038/nchem.2270
13. Bakker, E.; Qin, Y. Anal. Chem. 2006, 78, 3965 10.1021/ac060637m
14. Zheng, J.; Li, J.; Jiang, Y.; Jin, J.; Wang, K.; Yang, R.; Tan, W. H. Anal. Chem. 2011, 83, 6586-6592 10.1021/ac201314y
15. Zheng, J.; Jiao, A.; Yang, R.; Li, H.; Li, J.; Shi, M.; Ma, C.; Jiang, Y.; Deng, L.; Tan, W. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 19957-19960 10.1021/ja308875r
16. Yang, R. H.; Jin, J.; Chen, Y.; Shao, N.; Kang, K.; Xiao, Z.; Tang, Z.; Wu, Y.; Zhu, Z.; Tan, W. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 8351-8358 10.1021/ja800604z
17. Zheng, J.; Bai, J. H.; Zhou, Q. F.; Li, J. S.; Li, Y. H.; Yang, J. F.; Yang, R. H. Chem. Commun. 2015, 51, 6552-6555 10.1039/C5CC01003A
18. Rotaru, A.; Dutta, S.; Jentzsch, E.; Gothelf, K.; Mokhir, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5665-5667 10.1002/anie.200907256
19. Qing, Z. H.; He, X. X.; He, D. G.; Wang, K. M.; Xu, F. Z.; Qing, T. P.; Yang, X. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 9719-9722 10.1002/anie.201304631
20. Li, J. J.; Zhu, J. J.; Xu, K. TrAC, Trends Anal. Chem. 2014, 58, 90-98 10.1016/j.trac.2014.02.011
21. Zhu, Y.; Jiang, X.; Wang, H.; Wang, S.; Wang, H.; Sun, B.; Su, Y.; He, Y. Anal. Chem. 2015, 87, 6631-6638 10.1021/acs.analchem.5b00676
22. Rao, A. M.; Richter, E.; Bandow, S.; Chase, B.; Eklund, P. C.; Williams, K. A.; Fang, S.; Subbaswamy, K. R.; Menon, M.; Thess, A. et al. Science 1997, 275, 187-191 10.1126/science.275.5297.187
23. Chen, Z.; Tabakman, S. M.; Goodwin, A. P.; Kattah, M. G.; Daranciang, D.; Wang, X.; Zhang, G.; Li, X.; Liu, Z.; Utz, P. J. et al. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 1285-1292 10.1038/nbt.1501
24. Chu, H.; Wang, J.; Ding, L.; Yuan, D.; Zhang, Y.; Liu, J.; Li, Y. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 14310-14316 10.1021/ja9035972
25. Wang, X. J.; Wang, C.; Cheng, L.; Lee, S. T.; Liu, Z. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 7414-7422 10.1021/ja300140c
26. Gerasimova, Y. V.; Peck, S.; Kolpashchikov, D. M. Chem. Commun. 2009, 46, 8761-8763 10.1039/c0cc03248d
27. Rydberg, B.; Game, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 16654-16659 10.1073/pnas.262591699
28. Chen, Y.; Lee, S. H.; Mao, C. D. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 5335-5338 10.1002/anie.200460789
29. Grossmann, T. N.; Roglin, L.; Seitz, O. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 5223-5225 10.1002/anie.200700289
30. Mubeen, S.; Zhang, S. P.; Kim, N.; Lee, S.; Kramer, S.; Xu, H. X.; Moskovits, M. Nano Lett. 2012, 12, 2088-2094 10.1021/nl300351j
31. Tian, C. F.; Ding, C. H.; Liu, S. Y.; Yang, S. C.; Song, X. P.; Ding, B. J.; Li, Z. Y.; Fang, J. X. ACS Nano 2011, 5, 9442-9449 10.1021/nn203889d
32. Moskovits, M. J. Raman Spectrosc. 2005, 36, 485-496 10.1002/jrs.1362
33. Theiss, J.; Pavaskar, P.; Echternach, P. M.; Muller, R. E.; Cronin, S. B. Nano Lett. 2010, 10, 2749-2754 10.1021/nl904170g
34. De Roock, W.; Biesmans, B.; De Schutter, J.; Tejpar, S. Mol. Diagn. Ther. 2009, 13, 103-114 10.1007/BF03256319
35. Donis-Keller, H. Nucleic Acids Res. 1979, 7, 179-192 10.1093/nar/7.1.179
36. Diehl, F.; Li, M.; He, Y.; Kinzler, K.; Vogelstein, B.; Dressman, D. Nat. Methods 2006, 3, 551-559 10.1038/nmeth898
37. Knickelbein, K.; Zhang, L. Genes Dis. 2015, 2, 4-1 10.1016/j.gendis.2014.10.002