Spotting and designing promiscuous ligands for drug discovery

Chemical Communications

Volumn 52, Issue 6, 2016, Pages 1135-1138

  Schneider, P ^a,b   Rothlisberger M ^a   Reker, D ^a   Schneider, G ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b InSilicom GmbH   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CALCIUM CHANNEL L TYPE; CHEMOKINE RECEPTOR CXCR4; DILTIAZEM; G PROTEIN COUPLED RECEPTOR; LIFARIZINE; LIGAND; SIGMA OPIATE RECEPTOR;

ACCURACY; ARTICLE; ARTIFICIAL NEURAL NETWORK; BINDING SITE; CHEMICAL STRUCTURE; DRUG DEVELOPMENT; PHARMACOPHORE; PHOTON CORRELATION SPECTROSCOPY; PREDICTION; RECEPTOR BINDING ASSAY;

DRUG DISCOVERY; LIGANDS;

EID: 84953776512     PISSN: 13597345     EISSN: 1364548X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5cc07506h     Document Type: Article

References (37)

1. G. M. Rishton Drug Discovery Today 1997 2 382 384
2. M. Hann B. Hudson X. Lewell R. Lifely L. Miller N. Ramsden J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1999 39 897 902
3. W. P. Walters M. Namchuk Nat. Rev. Drug Discovery 2003 2 259 266
4. O. Roche P. Schneider J. Zuegge W. Guba M. Kansy A. Alanine K. Bleicher F. Danel E. M. Gutknecht M. Rogers-Evans W. Neidhart H. Stalder M. Dillon E. Sjögren N. Fotouhi P. Gillespie R. Goodnow W. Harris P. Jones M. Taniguchi S. Tsujii W. von der Saal G. Zimmermann G. Schneider J. Med. Chem. 2002 45 137 142
5. J. Baell M. A. Walters Nature 2014 513 481 483
6. J. W. Nissink S. Blackburn Future Med. Chem. 2014 6 1113 1126
7. J. L. Dahlin M. A. Walters Future Med. Chem. 2014 6 1265 1290
8. J. J. Irwin D. Duan H. Torosyan A. K. Doak K. T. Ziebart T. Sterling G. Tumanian B. K. Shoichet J. Med. Chem. 2015 58 7076 7087
9. G. Papadatos A. Gaulton A. Hersey J. P. Overington J. Comput.-Aided Mol. Des. 2015 29 885 889
10. G. Schneider and P. Schneider, in Chemogenomics in Drug Discovery, ed., H. Kubinyi, and, G. Müller, Wiley-VCH, Weinheim, 2004, pp. 341-376
11. J. Seidler S. L. McGovern T. N. Doman B. K. Shoichet J. Med. Chem. 2003 46 4477 4486
12. J. Sadowski H. Kubinyi J. Med. Chem. 1998 41 3325 3329
13. A. P. Bento A. Gaulton A. Hersey L. J. Bellis J. Chambers M. Davies F. A. Kruger Y. Light L. Mak S. McGlinchey M. Nowotka G. Papadatos R. Santos J. P. Overington Nucleic Acids Res. 2014 42 1083 1090
14. J. B. Baell G. A. Holloway J. Med. Chem. 2010 53 2719 2740
15. M. Reutlinger C. P. Koch D. Reker N. Todoroff P. Schneider T. Rodrigues G. Schneider Mol. Inf. 2013 32 133 138
16. G. Schneider W. Neidhart T. Giller G. Schmid Angew. Chem., Int. Ed. 1999 38 2894 2896
17. T. Kohonen Biol. Cybernetics 1982 43 59 96
18. B. W. Matthews Biochim. Biophys. Acta 1975 405 442 451
19. E. Byvatov U. Fechner J. Sadowski G. Schneider J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2003 43 1882 1889
20. 1280, Sigma-Aldrich Co., St. Louis, MO, USA
21. V. Law C. Knox Y. Djoumbou T. Jewison A. C. Guo Y. Liu A. Maciejewski D. Arndt M. Wilson V. Neveu A. Tang G. Gabriel C. Ly S. Adamjee Z. T. Dame B. Han Y. Zhou D. S. Wishart Nucleic Acids Res. 2014 42 D1091 D1097
22. Dictionary of Natural Products, Taylor & Francis Group, Boca Raton, FL, USA
23. C. Y. Chen PLoS One 2011 6 e15939
24. D. B. Kell FEBS J. 2013 280 5957 5980
25. J. M. Rollinger H. Stuppner T. Langer Prog. Drug Res. 2008 65 213 249
26. T. Miyao D. Reker P. Schneider K. Funatsu G. Schneider Planta Med. 2015 81 429 435
27. D. Reker A. M. Perna T. Rodrigues P. Schneider M. Reutlinger B. Mönch A. Koeberle C. Lamers M. Gabler H. Steinmetz R. Müller M. Schubert-Zsilavecz O. Werz G. Schneider Nat. Chem. 2014 6 1072 1078
28. A. Nath W. M. Atkins Biochemistry 2008 47 157 166
29. J. E. Fuchs S. von Grafenstein R. G. Huber M. A. Margreiter G. M. Spitzer H. G. Wallnoefer K. R. Liedl PLoS Comput. Biol. 2013 9 e1003007
30. RDKit: open-source cheminformatics, http://www.rdkit.org
31. S. D. Roughley A. M. Jordan J. Med. Chem. 2011 54 3451 3479
32. D. Reker T. Rodrigues P. Schneider G. Schneider Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2014 111 4067 4072
33. R. Horuk Expert Rev. Mol. Med. 2009 11 e1
34. C. M. Brown W. R. Rush H. A. Colquhoun CNS Drug Rev. 2006 1 149 167
35. T. Anger D. J. Madge M. Mulla D. Riddall J. Med. Chem. 2001 44 115 137
36. R. W. DeSimone K. S. Currie S. A. Mitchell J. W. Darrow D. A. Pippin Comb. Chem. High Throughput Screening 2004 7 473 494
37. M. G. Siegel M. Vieth Drug Discovery Today 2007 12 71 79