Biocatalytical Routes to Polymers

Materials Science and Technology: A Comprehensive Treatment

Volumn , Issue , 2008, Pages 549-569

  Kobayashi, Shiro ^a   Uyama, Hiroshi ^a  

^a KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

Biocatalytical routes; Biosynthetic pathways; Polypeptides; Polysaccharides; Protein synthetic machinery

Indexed keywords

CONDENSED MATTER PHYSICS; MATERIALS SCIENCE; POLYPEPTIDES; POLYSACCHARIDES;

BIOCATALYTICAL ROUTES; BIOSYNTHETIC PATHWAY;

MACHINERY;

EID: 84953741905     PISSN: None     EISSN: None     Source Type: Book    
DOI: 10.1002/9783527619313.ch16     Document Type: Chapter

References (149)

1. Abramowicz, D. A., Keese, C. R. (1989), Biotechnol. Bioeng. 33, 149.
2. Aizawa, M., Wang, L., Shinohara, H., Ikariyama, Y. (1990), J. Biotechnol. 14, 301.
3. Ajima, A., Yoshimoto, T., Takahashi, K., Tamaura, Y., Saito, Y., Inada, Y (1985), Biotechnol. Lett. 7, 303.
4. Akkara, J. A., Senecal, K. J., Kaplan, D. L. (1991), J. Polym. Sci., Polym. Chem. Ed. 29, 1561.
5. Akkara, J. A., Salapu, P., Kaplan, D. L. (1992), Ind. J. Chem. 31B, 855.
6. Akkara, J. A., Ayyagari, M. S., Bruno, F., Samuelson, L., John, V. T., Karayigitoglu, C., Tripathy, S. K., Marx, K. A., Rao, D. V. G. L. N., Kaplan, D. L. (1994a), Biomimeties 2, 331.
7. Akkara, J. A., Aranda, F. J., Rao, D. V. G. L. N., Kaplan, D. L. (1994b), in: Frontiers of Polymers and Advanced Materials: Prasad, P. N. (Ed.). New York: Plenum, p. 531.
8. Alva, K. S., Marx, K. A., Kumar, J., Tripathy, S. K. (1996), Macromol. Rapid Commun. 17, 859.
9. Alva, K. S., Marx, K. A., Kumar, J., Tripathy, S. K. (1997), Macromol. Rapid Commun. 18, 133.
10. Anderson, A. J., Dawes, E. A. (1990), Microbiol. Rev. 54, 450.
11. Anderson, G., Luisi, P. L. (1979), Helv. Chim. Acta 62, 488.
12. Arias-Marïn, E., Romero, J., Ledezma-Pérez, A., Kni-ajansky, S. (1996), Polym. Bull. 37, 581.
13. Aso, K.,Uemura,T, Shiokawa, Y. (1988), Agric. Biol. Chem. 52, 2443.
14. Athawale, V. D., Gaonkar, S. R. (1994), Biotechnol. lett. 16, 149.
15. Ayyagari, M. S., Marx, K. A., Tripathy, S. K., Akkara, J. A., Kaplan, D. L. (1995), Macromolecules 28, 5192.
16. Ayyagari, M. S., Akkara, J. A., Kaplan, D. L. (1996), Acta Polymerica 47, 193.
17. Binns, F., Roberts, S. M., Taylor, A., Williams, C. F. (1993), J. Chem. Soc. Perkin Trans. 1, 899.
18. Blinkovsky, A. M., Dordick, J. S. (1993), J. Polym. Sei., Polym. Chem. Ed. 31, 1839.
19. Blinkovsky, A. M., McEldoon, J. P., Arnold, J. M., Dordick, J. S. (1994), Appl. Biochem. Biotech. 49, 153.
20. Braunmühl, V. V., Jonas, G., Stadler, R. (1995), Macromolecules 28, 17.
21. Brazwell, E. M., Filos, D. Y., Morrow, C. J. (1995), J. Polym. Sci., Polym. Chem. Ed. 33, 89.
22. Bruno, F. F, Akkara, J. A., Ayyagari, M., Kaplan, D. L., Gross, R.. Swift, G., Dordick, J. S. (1995a), Macromolecules 28, 8881.
23. Bruno, F. F., Akkara, J. A., Kaplan, D. L., Sekher, P., Marx, K. A., Tripathy, S. K. (1995b), Ind. Eng. Chem. Res. 34, 4009.
24. Bruno, F. F., Akkara, J. A., Samuelson, L. A., Kaplan, D. L., Mandel, B. K., Marx, K. A., Kumar, J., Tripathy, S. K. (1995c), Langmuir 11, 889.
25. Cantor, E. J., Creel, H. S., Deguchi, Y., Dougherty, M. J., Kothakota, S., Krejchi, M. T., Matsuki, K., McGrath, K. P., Parkhe, A. D., Atkins, E. D. T., Fournier, M. J., Mason, T. L., Tirrell, D. A. (1994), ACS Symp. Ser. 55, 98.
26. Chaudhary, A. K., Beckman, E. J., Russell, A. J. (1995), J. Am. Chem. Soc. 117, 3728.
27. Cori, G. T., Cori, C. F. (1940), J. Biol. Chem. 135, 733.
28. Deguchi, Y., Fournier, M. J., Mason, T. L., Tirrell, D. A. (1994), J Macromol. Sci. - Pure Appl. Chem. A31, 1691.
29. Doi, Y. (1995), Macromol. Symp. 98, 585.
30. Doi, Y., Tamaki, A., Kunioka, M., Soga, K. (1987a), J. Chem. Soc., Chem. Commun., 1935.
31. Doi, Y., Tamaki, A., Kunioka, M., Soga, K. (1987b), Makromol. Chem., Rapid Commun. 8, 631.
32. Dordick, J. S., Marletta, M. A., Klibanov, A. M. (1987), Biotechnol. Bioeng. 30, 31.
33. Freudenberg, K. (1965), Science 148, 595.
34. Geresh, S., Gilboa, Y. (1990), Biotechnol. Bioeng. 36, 270.
35. Geresh, S., Gilboa, Y. (1991), Biotechnol. Bioeng. 37, 883.
36. Geresh, S., Gilboa, Y., Abrahami, S., Abrahami, A. (1993), Polym. Eng. Sci. 33, 311.
37. Heinrich, C. P., Fruton, J. S. (1968), Biochemistry 7, 3556.
38. Henderson, L. A., Svirkin, Y. Y., Gross, R. A., Kaplan, D. L., Swift, G. (1996), Macromolecules 29, 7759.
39. Hohsaka, T., Sato, K., Sisido, M., Takai, K., Yokoya-ma, S. (1993), FEBS Lett. 335, 47.
40. Hohsaka, T., Sato, K., Sisido, M., Takai, K., Yokoya-ma, S. (1994a), FEBS Lett. 344, 171.
41. Hohsaka, T., Kawashima, K., Sisido, M. (1994b), J. Am. Chem. Soc. 116, 413.
42. Hohsaka, T., Ashizuka, Y., Murakami, H., Sisido, M. (1996), J. Am. Chem. Soc. 118, 9778.
43. Holmes, P. A. (1985), Phys. Technol. 16, 32.
44. Holmes, P. A., Wright, L. F., Collins, S. H. (1981), Eur. Patent Appl. 0052459.
45. Hüttermann, A., Herche, C., Haars, A. (1980), Holzforschung 34, 64.
46. Ikeda, R., Sugihara, J., Uyama, H., Kobayashi, S. (1996a), Macromolecules 29, 8072.
47. Ikeda, R., Uyama, H., Kobayashi, S. (1996b), Macromolecules 29, 3053.
48. Jones, J. B. (1986), Tetrahedron 42, 3351.
49. Jost, R., Brambilla, E., Monti, J. C., Luisi, P. L. (1980), Helv. Chim. Acta 63, 375.
50. Kitahata, S., Yoshimura, Y., Okada, S. (1987), Carbo-hydr. Res. 159, 303.
51. Kitazume, T., Sato, T., Kobayashi, T. (1988), Chem. Express 3, 1354.
52. Klibanov, A. M. (1990), Acc. Chem. Res. 23, 114.
53. Knani, D., Kohn, D. H. (1993), J. Polym. Sci., Polym. Chem. Ed. 31, 2887.
54. Knani, D., Gutman, A. L., Kohn, D. H. (1993), J. Polym. Sci., Polym. Chem. Ed. 31, 1221.
55. Kobayashi, S., Shoda, S. (1995), Int. J. Biol. Macromol. 17, 373.
56. Kobayashi, S., Uyama, H. (1993), Makromol. Chem., Rapid Commun. 14, 841.
57. Kobayashi, S., Kashiwa, K., Kawasaki, T., Shoda, S. (1991), J. Am. Chem. Soc. 113, 3079.
58. Kobayashi, S., Kashiwa, K., Shimada, J., Kawasaki, T., Shoda, S. (1992a), Makromol. Chem., Macromol. Symp. 54/55, 509.
59. Kobayashi, S., Shimada, J., Kashiwa, K., Shoda, S. (1992b), Macromolecules 25, 3237.
60. Kobayashi, S., Kaneko, I., Uyama, H. (1992c), Chem. Lett., 393.
61. Kobayashi, S., Shoda, S., Kashiwa, K. (1993), in: Cel-lulosics: Chemical, Biochemical and Material Aspects: Kennedy, J. E, Phillips, G. O., Williams, P. A. (Eds.). New York: Ellis Horwood, p. 23.
62. Kobayashi, S., Shoda, S., Uyama, H. (1994a), J. Syn. Org. Chem., Jpn. 52, 754.
63. Kobayashi, S., Shoda, S., Lee, J. H., Okuda, K., Brown, Jr., R. M., Kuga, S. (1994b), Macromol. Chem. Phys. 195, 1319.
64. Kobayashi, S., Shoda, S., Uyama, H. (1995), Adv. Polym. Sci. 121, 1.
65. Kobayashi, S., Okamoto, E., Wen, X., Shoda, S. (1996a), J. Macromol. Sci. -PureAppl. Chem. A33, 1375.
66. Kobayashi, S., Wen, X., Shoda, S. (1996b), Macromolecules 29, 2698.
67. Kobayashi, S., Kiyosada, T., Shoda, S. (1996c), J. Am. Chem. Soc. 118, 13113.
68. Kobayashi, S., Kurioka, H., Uyama, H. (1996 d), Macromol. Rapid Commun. 17, 503.
69. Kobayashi, K., Kamiya, S., Enomoto, N. (1996e), Macromolecules 29, 8670.
70. Kobayashi, S., Uyama, H., Suda, S., Namekawa, S. (1997a), Chem. Lett., 105.
71. Kobayashi, S., Kikuchi, H., Uyama, H. (1997b), Macromol. Rapid Commun. 18, 575.
72. Komatsu, I., Uyama, H., Kobayashi, S. (1995), Polym. Prepr., Jpn. 44, 246.
73. Krejchi, M. T., Atkins, E. D. T., Waddon, A. J., Fournier, M. J., Mason, T. L., Tirrell, D. A. (1994), Science 265, 1427.
74. Kurioka, H., Komatsu, I., Uyama, H., Kobayashi, S. (1994), Macromol. Rapid Commun. 15, 507.
75. Kurioka, H., Uyama, H., Kobayashi, S. (1996), Polym. Prepr., Jpn. 45, 218.
76. Lee, J. H., Brown, Jr., R. M., Kuga, S., Shoda, S., Kobayashi, S. (1994), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 7425.
77. Lee, S. Y. (1996), Biotechnol. Bioeng. 49, 1.
78. Linko, Y.-Y., Wang, Z.-L., Seppälä, J. (1994), Bio-catalysis 8, 269.
79. Linko, Y.-Y., Wang, Z.-L., Seppälä, J. (1995), Enzyme Microbiol. Technol. 17, 506.
80. MacDonald, R. T., Pulapura, S. K., Svirkin, Y. Y., Gross, R. A., Kaplan, D. L., Akkara, J. A., Swift, G., Wolf, S. (1995), Macromolecules 28, 73.
81. Margolin. A. L., Crenne. J.-Y., Klibanov, A. M. (1987), Tetrahedron Lett. 28, 1607.
82. Matsumura, S., Takahashi. J. (1986). Makromol. Chem., Rapid Commun. 7, 369.
83. Matsumura, S., Beppu. H., Nakamura, K., Osanai, S., Toshima, K. (1996). Chem. Lett., 795.
84. Mezoul, G., Lalot. T., Brigodiot. M., Maréchal, E. (1995a), J. Polym. Sei., Polym. Chem. Ed. 33, 2691.
85. Mezoul, G.. Lalot. T. Brigodiot, M., Maréchal. E. (1995b), Macromol. Rapid Commun. 16, 613.
86. Mezoul, G.. Lalot. T. Brigodiot, M.. Maréchal, E. (1996a), Macromol. Chem. Phys. 197, 3581.
87. Mezoul, G., Lalot, T., Brigodiot, M., Maréchal, E., (1996b), Polym. Bull. 36. 541.
88. Moreau, V., Driguez. H. (1996). J. Chem. Soc., Per-kin Trans. 1, 525.
89. Namekawa. S., Uyama. H., Kobayashi, S. (1996). Polym. J. 28, 730.
90. Nitta, I., Ueda. T., Watanabe. K. (1994). J. Biochem. 115, 803.
91. Nobes, G. A. R.. Kazlauskas, R. J., Marchessault. R. H. (1996), Macromolecules 29, 4829.
92. Noll, O., Ritter, H. (1996). Macromol. Rapid Commun. 17, 553.
93. Noll. O., Ritter. H. (1997). Macromol. Rapid Commun. 18, 53.
94. O'Hagan, D., Zaidi, N. A. (1993). J. Chem. Soc., Per-kin Trans 1, 2389.
95. O'Hagan. D., Zaidi. N. A. (1994). Polymer 35, 3576.
96. Ohya. Y., Sugitou, T., Ouchi. T. (1995). J. Macromol. Sei. - Pure Appl. Chem. A32, 179.
97. Okamoto, E., Kiyosada. T., Shoda, S., Kobayashi, S. (1997), Cellulose 4, 161.
98. Osada, S., Okamoto. E., Shoda. S.. Kobayashi, S. (1995), Polym. Prepr., Jpn. 44, 2468.
99. Panitch, A., Matsuki, K., Cantor, E. J., Cooper, S. J., Atkins, E. D. T., Fournier. M. J., Mason. T. L., Tir-rell, D. A. (1997). Macromolecules 30, 42.
100. Park, H. G.. Chang, H. N. Dordick. J. S. (1994), Biocatalysis 11, 263.
101. Patil, D. R., Rethwisch. D. G., Dordick, J. S. (1991). Biotechnol. Bioeng. 37, 639.
102. Payne, G. F., Chaubal, M. V., Barbari, T. A. (1996). Polymer 37. 4643.
103. Popp, J. L., Kirk. T. K., Dordick, J. S. (1991), Enzyme Microbiol. Technol. 13. 964.
104. Premachandran, R. S., Banerjee, S., Wu. X.-K., John. V. T., McPherson, G. L., Akkara. J., Ayyagari, M., Kapan, D. (1996), Macromolecules 29. 6452.
105. Rao, A. M., John. V. T., Gonzalez, R. D., Akkara, J. A., Kaplan, D. L. (1993). Biotechnol. Bioeng. 41, 531.
106. Ravet. C. Thomas. D., Legoy. M. D. (1993), Biotechnol. Bioeng. 42, 303.
107. Ritter. H. (1993), Trends Polym. Sci. 1, 171.
108. Santaniello, E., Ferraboschi, P., Grisenti, P., Manzoc-chi, A. (1992), Chem. Rev. 92, 1071.
109. Shoda, S., Kobayashi, S. (1995), Macromol. Symp. 99, 179.
110. Shoda, S., Okamoto, E., Kiyosada, T., Kobayashi, S. (1994), Macromol. Rapid Commun. 15, 751.
111. Sluyterman, L. A. E., Wijdenes, J. (1972), Biochim. Biophys. Acta 289, 194.
112. Spirin, A. S., Baranov, V. L, Ryabova, L. A., Ovodov, S. Y. Alakhov, Y. B. (1988), Science 242, 1162.
113. Steinbüchel, A., Schlegel, H. G. (1991), Mol. Microbiol. 5, 535.
114. Steinbüchel, A., Valentin, H. E. (1995), FEMS Microbiol. Lett. 128, 219.
115. Svirkin, Y. Y., Xu, J., Gross, R. A., Kaplan, D. L., Swift, G. (1996), Macromolecules 29, 4591.
116. Tanahashi, M., Higuchi, T. (1981), Wood. Res. 67, 29.
117. Terada. M., Oyabu, H., Aso, Y. (1994), J. Jpn. Soc. Colour Mater. 66, 681.
118. Treder, W., Thiem, J., Schlingmann, M. (1986), Tetrahedron Lett. 27, 5605.
119. Usui. T., Matsui, H., Isobe, K. (1990), Carbohydr. Res. 203, 65.
120. Uyama, H., Kobayashi, S. (1993), Chem. Lett., 1149.
121. Uyama, H., Kobayashi, S. (1994), Chem. Lett., 1687.
122. Uyama, H., Kobayashi, S. (1996), in: Biomedical Functions and Biotechnology of Natural and Artificial Polymers: Yalpani, M. (Ed.). Schrewsbury: ATL Press, p. 5.
123. Uyama, H., Takeya, K., Kobayashi, S. (1993), Proc. Acad. Jpn. 69B, 203.
124. Uyama, H., Kurioka, H., Kaneko, I., Kobayashi, S. (1994a), Chem. Lett., 423.
125. Uyama. H., Kurioka, H., Kaneko, I., Kobayashi, S. (1994b), Macromol. Rep. A31, 421.
126. Uyama, H., Takeya, K., Kobayashi, S. (1995a), Bull. Chem. Soc. Jpn. 68, 56.
127. Uyama, H., Takeya, K., Hoshi, N., Kobayashi, S. (1995b), Macromolecules 28, 7046.
128. Uyama, H., Kikuchi, H., Kobayashi, S. (1995 c), Chem. Lett., 1047.
129. Uyama, H., Kurioka, H., Komatsu, I., Sugihara, J., Kobayashi, S. (1995d), Macromol. Rep. A32, 649.
130. Uyama. H., Kurioka, H., Sugihara, J., Komatsu, I., Kobayashi, S. (1995 e), Bull. Chem. Soc. Jpn. 68. 3209.
131. Uyama, H., Kurioka, H., Kobayashi, S. (1995f), Chem. Lett., 795.
132. Uyama, H., Kikuchi, H., Takeya, K., Kobayashi, S. (1996a), Acta Polymerica 47, 357.
133. Uyama, H., Kikuchi, H., Takeya, K., Hoshi, N. Kobayashi. S. (1996b), Chem. Lett., 107.
134. Uyama, H., Kurioka, H., Sugihara, J., Kobayashi, S. (1996c), Bull. Chem. Soc. Jpn. 69, 189.
135. Uyama, H., Namekawa, S., Kobayashi, S. (1997a), Polym. J. 29, 299.
136. Uyama, H., Kurioka, H., Sugihara, J., Komatsu, I., Kobayashi, S. (1997b), J. Polym. Sci., Polym. Chem. Ed. 35, 1453.
137. Uyama, H., Kurioka, H., Kobayashi, S. (1997 c), Polym. J. 27, 190.
138. Wallace, J. S., Morrow, C. J. (1989a), J. Polym. Sei, Polym. Chem. Ed. 27, 3271.
139. Wallace, J. S., Morrow, C. J. (1989b), J. Polym. Sci., Polym. Chem. Ed. 27, 2553.
140. Wang, L., Kobatake, E., Ikariyama, Y., Aizawa, M. (1993), J. Polym. Sci., Polym. Chem. Ed. 31, 2855.
141. Wang, P., Martin, D., Parida, S., Rethwisch, D. G., Dordick, J. S. (1995), J. Am. Chem. Soc. 117, 12885.
142. Wang, Z.-L., Hiltunen, K., Orava, P., Seppälä, J., Linko, Y.-Y. (1996), J. Macromol. Sci. - Pure Appl. Chem. A33, 599.
143. Watson, J. D., Hopkins, N. H., Roberts, J. W., Steitz, J. A., Weiner, A. M. (1987), Molecular Biology of the Gene, 4th ed. Menlo Park: Benjamin/Cumming.
144. Whitesides, G. M., Wong, C.-H. (1985), Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 24, 617.
145. Wong, C.-H., Chen, S.-T., Hennen, W. J., Bibbs, J. A., Wang, Y.-E., Liu, J. L.-C, Pantoliano, M. W., Whitlow, M., Bryan, P. N. (1990), J. Am. Chem. Soc.112, 945.
146. Yoshikawa, E., Mason, T. L., Fournier, M. J., Tirrell, D. A. (1994), Macromolecules 27, 5471.
147. Yoshimura, Y., Kitahata, S., Okada, S. (1987), Carbo-hydr. Res. 168, 285.
148. Zhong, Z., Liu, J. L.-C, Dinterman, L. M., Finkelman, M. A. J., Mueller, W. T., Rollence, M. L., Whitlow, M., Wong, C.-H. (1991), J. Am. Chem. Soc. 113, 683.
149. Ziegast, G., Pfannemüller, B. (1987), Carbohydr. Res. 160, 185.