Discovery of trace amine-associated receptor 1 ligands by molecular docking screening against a homology model

MedChemComm

Volumn 6, Issue 12, 2015, Pages 2216-2223

  Lam, V M ^a   Rodriguez D ^b   Zhang, T ^a   Koh, E J ^a   Carlsson, J ^c   Salahpour, A ^a  

^a UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

^b STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

^c UPPSALA UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AGENTS INTERACTING WITH TRANSMITTER, HORMONE OR DRUG RECEPTORS; BETA PHENYLETHYLIMINE; G PROTEIN COUPLED RECEPTOR; GUANABENZ; IMINE; LIGAND; MOLECULAR SCAFFOLD; MONOAMINE; NEUROTRANSMITTER; RECEPTOR BLOCKING AGENT; RO 5073012; RO 516617; RO 5203648; RO 5212773; RO 5256390; RO 526397; TRACE AMINE; TRACE AMINE ASSOCIATED RECEPTOR 1; TRACE AMINE ASSOCIATED RECEPTOR 1 AGONIST; TRACE AMINE ASSOCIATED RECEPTOR 1 ANTAGONIST; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; CONTROLLED STUDY; DOPAMINERGIC TRANSMISSION; DRUG SCREENING; DRUG STRUCTURE; EC50; HOMOLOGY MODEL; MODEL; MOLECULAR DOCKING; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN FAMILY; RECEPTOR AFFINITY;

EID: 84948756563     PISSN: 20402503     EISSN: 20402511     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5md00400d     Document Type: Article

References (43)

1. B. Borowsky N. Adham K. A. Jones R. Raddatz R. Artymyshyn K. L. Ogozalek M. M. Durkin P. P. Lakhlani J. A. Bonini S. Pathirana N. Boyle X. Pu E. Kouranova H. Lichtblau F. Y. Ochoa T. A. Branchek C. Gerald Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 8966 8971
2. D. K. Grandy Pharmacol. Ther. 2007 116 355 390
3. T. D. Sotnikova M. G. Caron R. R. Gainetdinov Mol. Pharmacol. 2009 76 229 235
4. L. S. Barak A. Salahpour X. Zhang B. Masri T. D. Sotnikova A. J. Ramsey J. D. Violin R. J. Lefkowitz M. G. Caron R. R. Gainetdinov Mol. Pharmacol. 2008 74 585 594
5. S. Espinoza A. Salahpour B. Masri T. D. Sotnikova M. Messa L. S. Barak M. G. Caron R. R. Gainetdinov Mol. Pharmacol. 2011 80 416 425
6. V. M. Lam S. Espinoza A. S. Gerasimov R. R. Gainetdinov A. Salahpour Eur. J. Pharmacol. 2015 763 136 142
7. D. Leo L. Mus S. Espinoza M. C. Hoener T. D. Sotnikova R. R. Gainetdinov Neuropharmacology 2014 81 283 291
8. A. Gaulton L. J. Bellis A. P. Bento J. Chambers M. Davies A. Hersey Y. Light S. McGlinchey D. Michalovich B. Al-Lazikani J. P. Overington Nucleic Acids Res. 2012 40 D1100 D1107
9. J. Carlsson R. G. Coleman V. Setola J. J. Irwin H. Fan A. Schlessinger A. Sali B. L. Roth B. K. Shoichet Nat. Chem. Biol. 2011 7 769 778
10. C. de Graaf A. J. Kooistra H. F. Vischer V. Katritch M. Kuijer M. Shiroishi S. Iwata T. Shimamura R. C. Stevens I. J. P. de Esch R. Leurs J. Med. Chem. 2011 54 8195 8206
11. A. C. Kruse D. R. Weiss M. Rossi J. Hu K. Hu K. Eitel P. Gmeiner J. Wess B. K. Kobilka B. K. Shoichet Mol. Pharmacol. 2013 84 528 540
12. D. Rodríguez J. Brea M. I. Loza J. Carlsson Structure 2014 22 1140 1151
13. D. Rodríguez A. Ranganathan J. Carlsson J. Chem. Inf. Model. 2014 54 2004 2021
14. I. Kufareva V. Katritch Participants of GPCR Dock 2013 R. C. Stevens R. Abagyan Structure 2014 22 1120 1139
15. I. Kufareva M. Rueda V. Katritch Participants of GPCR Dock 2010 R. C. Stevens R. Abagyan Structure 2011 19 1108 1126
16. P. Kolb D. M. Rosenbaum J. J. Irwin J. J. Fung B. K. Kobilka B. K. Shoichet Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 6843 6848
17. M. Vass É. Schmidt F. Horti G. M. Keser Eur. J. Med. Chem. 2014 77 38 46
18. E. P. Istyastono A. J. Kooistra H. F. Vischer M. Kuijer L. Roumen S. Nijmeijer R. A. Smits I. J. P. de Esch R. Leurs C. de Graaf Med. Chem. Commun. 2015 6 1003 1017
19. D. Rodriguez A. Ranganathan J. Carlsson Curr. Top. Med. Chem. 2015 15 2484 2504
20. V. Cherezov D. M. Rosenbaum M. A. Hanson S. G. F. Rasmussen F. S. Thian T. S. Kobilka H.-J. Choi P. Kuhn W. I. Weis B. K. Kobilka R. C. Stevens Science 2007 318 1258 1265
21. J. J. Irwin B. K. Shoichet M. M. Mysinger N. Huang F. Colizzi P. Wassam Y. Cao J. Med. Chem. 2009 52 5712 5720
22. D. M. Lorber B. K. Shoichet Curr. Top. Med. Chem. 2005 5 739 749
23. M. M. Mysinger B. K. Shoichet J. Chem. Inf. Model. 2010 50 1561 1573
24. C. de Graaf N. Foata O. Engkvist D. Rognan Proteins 2008 71 599 620
25. J. A. Ballesteros and H. Weinstein, in Methods in Neurosciences, Elsevier, 1995, vol. 25, pp. 366-428
26. E. Cichero S. Espinoza R. R. Gainetdinov L. Brasili P. Fossa Chem. Biol. Drug Des. 2013 81 509 516
27. D. M. Rosenbaum C. Zhang J. A. Lyons R. Holl D. Aragao D. H. Arlow S. G. F. Rasmussen H.-J. Choi B. T. Devree R. K. Sunahara P. S. Chae S. H. Gellman R. O. Dror D. E. Shaw W. I. Weis M. Caffrey P. Gmeiner B. K. Kobilka Nature 2011 469 236 240
28. J. J. Irwin T. Sterling M. M. Mysinger E. S. Bolstad R. G. Coleman J. Chem. Inf. Model. 2012 52 1757 1768
29. S. G. F. Rasmussen H.-J. Choi D. M. Rosenbaum T. S. Kobilka F. S. Thian P. C. Edwards M. Burghammer V. R. P. Ratnala R. Sanishvili R. F. Fischetti G. F. X. Schertler W. I. Weis B. K. Kobilka Nature 2007 450 383 387
30. S. G. F. Rasmussen H.-J. Choi J. J. Fung E. Pardon P. Casarosa P. S. Chae B. T. Devree D. M. Rosenbaum F. S. Thian T. S. Kobilka A. Schnapp I. Konetzki R. K. Sunahara S. H. Gellman A. Pautsch J. Steyaert W. I. Weis B. K. Kobilka Nature 2011 469 175 180
31. E. Cichero S. Espinoza S. Franchini S. Guariento L. Brasili R. R. Gainetdinov P. Fossa Chem. Biol. Drug Des. 2014 84 712 720
32. D. R. Weiss S. Ahn M. F. Sassano A. Kleist X. Zhu R. Strachan B. L. Roth R. J. Lefkowitz B. K. Shoichet ACS Chem. Biol. 2013 8 1018 1026
33. M. Wawer J. Bajorath J. Chem. Inf. Model. 2010 50 1395 1409
34. Y. Wang J. Xiao T. O. Suzek J. Zhang J. Wang Z. Zhou L. Han K. Karapetyan S. Dracheva B. A. Shoemaker E. Bolton A. Gindulyte S. H. Bryant Nucleic Acids Res. 2012 40 D400 D412
35. L. A. Hu T. Zhou J. Ahn S. Wang J. Zhou Y. Hu Q. Liu Biochem. J. 2009 424 39 45
36. F. G. Revel J. L. Moreau R. R. Gainetdinov A. Ferragud C. Velázquez-Sánchez T. D. Sotnikova S. R. Morairty A. Harmeier K. Groebke Zbinden R. D. Norcross A. Bradaia T. S. Kilduff B. Biemans B. Pouzet M. G. Caron J. J. Canales T. L. Wallace J. G. Wettstein M. C. Hoener Biol. Psychiatry 2012 72 934 942
37. F. G. Revel J.-L. Moreau B. Pouzet R. Mory A. Bradaia D. Buchy V. Metzler S. Chaboz K. Groebke Zbinden G. Galley R. D. Norcross D. Tuerck A. Bruns S. R. Morairty T. S. Kilduff T. L. Wallace C. Risterucci J. G. Wettstein M. C. Hoener Mol. Psychiatry 2012 18 543 556
38. P. I. Dosa E. A. Amin J. Med. Chem. 2015 10.1021/acs.jmedchem.5b00982
39. E. A. Reese Y. Norimatsu M. S. Grandy K. L. Suchland J. R. Bunzow D. K. Grandy J. Med. Chem. 2014 57 378 390
40. D. M. Ferrero D. Wacker M. A. Roque M. W. Baldwin R. C. Stevens S. D. Liberles ACS Chem. Biol. 2012 7 1184 1189
41. S. G. F. Rasmussen B. T. DeVree Y. Zou A. C. Kruse K. Y. Chung T. S. Kobilka F. S. Thian P. S. Chae E. Pardon D. Calinski J. M. Mathiesen S. T. A. Shah J. A. Lyons M. Caffrey S. H. Gellman J. Steyaert G. Skiniotis W. I. Weis R. K. Sunahara B. K. Kobilka Nature 2011 477 549 555
42. F. G. Revel J.-L. Moreau R. R. Gainetdinov A. Bradaia T. D. Sotnikova R. Mory S. Durkin K. G. Zbinden R. Norcross C. A. Meyer V. Metzler S. Chaboz L. Ozmen G. Trube B. Pouzet B. Bettler M. G. Caron J. G. Wettstein M. C. Hoener Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 8485 8490
43. F. G. Revel C. A. Meyer A. Bradaia K. Jeanneau E. Calcagno C. B. André M. Haenggi M.-T. Miss G. Galley R. D. Norcross R. W. Invernizzi J. G. Wettstein J.-L. Moreau M. C. Hoener Neuropsychopharmacology 2012 37 2580 2592