DNA-Directed Antibody Immobilization for Enhanced Detection of Single Viral Pathogens

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 20, 2015, Pages 10505-10512

  Seymour, Elif ^a   Daaboul, George G ^a   Zhang, Xirui ^a   Scherr, Steven M ^a   Ünlü, Nese Lortlar ^a,c   Connor, John H ^b   Ünlü, M Selim ^a  

^a Boston University   (United States)

^b BOSTON UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

^c BAHCESEHIR UNIVERSITY   (Turkey)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHEMICAL DETECTION; DNA; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE MICROSCOPY; POLYMERS; PRINTING; VIRUSES;

ANTIBODY IMMOBILIZATION; DIRECTED IMMOBILIZATION; IMMOBILIZED ANTIBODIES; INDIVIDUAL NANOPARTICLES; POINT OF CARE DIAGNOSTIC; SPECTRAL SELF-INTERFERENCE FLUORESCENCE MICROSCOPIES; THREEDIMENSIONAL (3-D); VESICULAR STOMATITIS VIRUS;

ANTIBODIES;

DNA; DNA PROBE; IMMOBILIZED ANTIBODY;

CHEMISTRY; DEVICES; DNA PROBE; FLUORESCENCE MICROSCOPY; GENETIC PROCEDURES; ISOLATION AND PURIFICATION; PATHOGENICITY; VESICULOVIRUS;

ANTIBODIES, IMMOBILIZED; BIOSENSING TECHNIQUES; DNA; DNA PROBES; MICROSCOPY, FLUORESCENCE; VESICULOVIRUS;

EID: 84945313169     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.5b02702     Document Type: Article

References (43)

1. MacBeath, G.; Schreiber, S. L. Science 2000, 289, 1760-1763
2. Sun, H.; Chen, G. Y. J.; Yao, S. Q. Chem. Biol. 2013, 20, 685-699 10.1016/j.chembiol.2013.04.009
3. Schwenk, J. M.; Lindberg, J.; Sundberg, M.; Uhlén, M.; Nilsson, P. Mol. Cell. Proteomics 2007, 6, 125-132 10.1074/mcp.T600035-MCP200
4. Peluso, P.; Wilson, D. S.; Do, D.; Tran, H.; Venkatasubbaiah, M.; Quincy, D.; Heidecker, B.; Poindexter, K.; Tolani, N.; Phelan, M.; Witte, K.; Jung, L. S.; Wagner, P.; Nock, S. Anal. Biochem. 2003, 312, 113-124 10.1016/S0003-2697(02)00442-6
5. Nielsen, U. B.; Geierstanger, B. H. J. Immunol. Methods 2004, 290, 107-120 10.1016/j.jim.2004.04.012
6. Seurynck-Servoss, S. L.; White, A. M.; Baird, C. L.; Rodland, K. D.; Zangar, R. C. Anal. Biochem. 2007, 371, 105-115 10.1016/j.ab.2007.07.010
7. Deng, Y.; Zhu, X. Y.; Kienlen, T.; Guo, A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 2768-2769 10.1021/ja057669w
8. Mace, C. R.; Yadav, A. R.; Miller, B. L. Langmuir 2008, 24, 12754-12757 10.1021/la801712m
9. Romanov, V.; Davidoff, S. N.; Miles, A. R.; Grainger, D. W.; Gale, B. K.; Brooks, B. D. Analyst 2014, 139, 1303-1326 10.1039/c3an01577g
10. Niemeyer, C. M.; Boldt, L.; Ceyhan, B.; Blohm, D. Anal. Biochem. 1999, 268, 54-63 10.1006/abio.1998.3017
11. Ladd, J.; Boozer, C.; Yu, Q.; Chen, S.; Homola, J.; Jiang, S. Langmuir 2004, 20, 8090-8095 10.1021/la049867r
12. Wacker, R.; Niemeyer, C. M. ChemBioChem 2004, 5, 453-459 10.1002/cbic.200300788
13. Boozer, C.; Ladd, J.; Chen, S.; Jiang, S. Anal. Chem. 2006, 78, 1515-1519 10.1021/ac051923l
14. Bailey, R. C.; Kwong, G. A.; Radu, C. G.; Witte, O. N.; Heath, J. R. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1959-1967 10.1021/ja065930i
15. Fan, R.; Vermesh, O.; Srivastava, A.; Yen, B. K. H.; Qin, L.; Ahmad, H.; Kwong, G. A.; Liu, C.-C.; Gould, J.; Hood, L.; Heath, J. R. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 1373-1378 10.1038/nbt.1507
16. Bano, F.; Fruk, L.; Sanavio, B.; Glettenberg, M.; Casalis, L.; Niemeyer, C. M.; Scoles, G. Nano Lett. 2009, 9, 2614-2618 10.1021/nl9008869
17. Fruk, L.; Kuhlmann, J.; Niemeyer, C. M. Chem. Commun. (Cambridge, U. K.) 2009, 230-232 10.1039/B817206D
18. Schroeder, H.; Adler, M.; Gerigk, K.; Müller-Chorus, B.; Götz, F.; Niemeyer, C. M. Anal. Chem. 2009, 81, 1275-1279 10.1021/ac802228k
19. Washburn, A. L.; Gomez, J.; Bailey, R. C. Anal. Chem. 2011, 83, 3572-3580 10.1021/ac200317z
20. Wacker, R.; Schröder, H.; Niemeyer, C. M. Anal. Biochem. 2004, 330, 281-287 10.1016/j.ab.2004.03.017
21. Daaboul, G. G.; Yurt, A.; Zhang, X.; Hwang, G. M.; Goldberg, B. B.; Ünlü, M. S. Nano Lett. 2010, 10, 4727-4731 10.1021/nl103210p
22. Yurt, A.; Daaboul, G. G.; Connor, J. H.; Goldberg, B. B.; Ünlü, M. S. Nanoscale 2012, 4, 715-726 10.1039/c2nr11562j
23. Daaboul, G. G.; Lopez, C. A.; Yurt, A.; Goldberg, B. B.; Connor, J. H.; Ünlü, M. S. IEEE J. Sel. Top. Quantum Electron. 2012, 18, 1422-1433 10.1109/JSTQE.2011.2180516
24. Daaboul, G. G.; Lopez, C. A.; Chinnala, J.; Goldberg, B. B.; Connor, J. H.; Ünlü, M. S. ACS Nano 2014, 8, 6047-6055 10.1021/nn501312q
25. Boozer, C.; Ladd, J.; Chen, S.; Yu, Q.; Homola, J.; Jiang, S. Anal. Chem. 2004, 76, 6967-6972 10.1021/ac048908l
26. Cha, T.; Guo, A.; Zhu, X. Y. Proteomics 2005, 5, 416-419 10.1002/pmic.200400948
27. Guilleaume, B.; Buneß, A.; Schmidt, C.; Klimek, F.; Moldenhauer, G.; Huber, W.; Arlt, D.; Korf, U.; Wiemann, S.; Poustka, A. Proteomics 2005, 5, 4705-4712 10.1002/pmic.200401324
28. Steel, a B.; Levicky, R. L.; Herne, T. M.; Tarlov, M. J. Biophys. J. 2000, 79, 975-981 10.1016/S0006-3495(00)76351-X
29. Ozkumur, E.; Yalçin, A.; Cretich, M.; Lopez, C. a; Bergstein, D. a; Goldberg, B. B.; Chiari, M.; Unlü, M. S. Biosens. Bioelectron. 2009, 25, 167-172 10.1016/j.bios.2009.06.033
30. Scherr, S. M.; Daaboul, G. G.; Trueb, J. T.; Sevenler, D.; Fawcett, H. E.; Fawcett, B. B.; Connor, J. H.; Unlu, M. S. (2015, submitted for publication.
31. Wilson, J. A.; Hevey, M.; Bakken, R.; Guest, S.; Bray, M.; Schmaljohn, A. L.; Hart, M. K. Science 2000, 287, 1664-1666 10.1126/science.287.5458.1664
32. Zeitlin, L.; Pettitt, J.; Scully, C.; Bohorova, N.; Kim, D.; Pauly, M.; Hiatt, a.; Ngo, L.; Steinkellner, H.; Whaley, K. J.; Olinger, G. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108, 20690-20694 10.1073/pnas.1108360108
33. Olinger, G. G.; Pettitt, J.; Kim, D.; Working, C.; Bohorov, O.; Bratcher, B.; Hiatt, E.; Hume, S. D.; Johnson, a. K.; Morton, J.; Pauly, M.; Whaley, K. J.; Lear, C. M.; Biggins, J. E.; Scully, C.; Hensley, L.; Zeitlin, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 18030-18035 10.1073/pnas.1213709109
34. Mire, C. E.; Geisbert, J. B.; Versteeg, K. M.; Mamaeva, N.; Agans, K. N.; Geisbert, T. W.; Connor, J. H. J. Infect. Dis. 2015, 212, S384-S388 10.1093/infdis/jiv126
35. Cretich, M.; Pirri, G.; Damin, F.; Solinas, I.; Chiari, M. Anal. Biochem. 2004, 332, 67-74 10.1016/j.ab.2004.05.041
36. Daaboul, G. G.; Vedula, R. S.; Ahn, S.; Lopez, C. A.; Reddington, A.; Ozkumur, E.; Ünlü, M. S. Biosens. Bioelectron. 2011, 26, 2221-2227 10.1016/j.bios.2010.09.038
37. Lopez, C. A.; Daaboul, G. G.; Vedula, R. S.; Özkumur, E.; Bergstein, D. A.; Geisbert, T. W.; Fawcett, H. E.; Goldberg, B. B.; Connor, J. H.; Ünlü, M. S. Biosens. Bioelectron. 2011, 26, 3432-3437 10.1016/j.bios.2011.01.019
38. Ozkumur, E.; Needham, J. W.; Bergstein, D. a; Gonzalez, R.; Cabodi, M.; Gershoni, J. M.; Goldberg, B. B.; Unlü, M. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105, 7988-7992 10.1073/pnas.0711421105
39. Moiseev, L.; Cantor, C. R.; Aksun, M. I.; Dogan, M.; Goldberg, B. B.; Swan, a. K.; Ünlü, M. S. J. Appl. Phys. 2004, 96, 5311 10.1063/1.1786665
40. Moiseev, L.; Unlü, M. S.; Swan, A. K.; Goldberg, B. B.; Cantor, C. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 2623-2628 10.1073/pnas.0511214103
41. Zhang, X.; Daaboul, G. G.; Spuhler, P. S.; Freedman, D. S.; Yurt, A.; Ahn, S.; Avci, O.; Ünlü, M. S. Analyst 2014, 139, 6440-6449 10.1039/C4AN01425A
42. Hill, H. D.; Mirkin, C. a. Nat. Protoc. 2006, 1, 324-336 10.1038/nprot.2006.51
43. Singh-Zocchi, M.; Dixit, S.; Ivanov, V.; Zocchi, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 7605-7610 10.1073/pnas.1337215100