Binding interaction of an anionic amino acid surfactant with bovine serum albumin: physicochemical and spectroscopic investigations combined with molecular docking study

RSC Advances

Volumn 5, Issue 96, 2015, Pages 79107-79118

  Dasmandal, Somnath ^a   Kundu, Arjama ^a   Rudra, Suparna ^a   Mahapatra, Ambikesh ^a  

^a JADAVPUR UNIVERSITY   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; ATOMIC ABSORPTION SPECTROMETRY; BINDING ENERGY; BODY FLUIDS; DICHROISM; MAMMALS; MOLECULAR MODELING; PH; PHYSIOLOGICAL MODELS; PROTEINS; QUANTUM THEORY; SURFACE ACTIVE AGENTS; SURFACE PLASMON RESONANCE;

POTENTIAL MEASUREMENTS; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; QUANTUM-MECHANICAL CALCULATION; SPECTROSCOPIC INVESTIGATIONS; SPECTROSCOPIC TECHNIQUE; STEADY STATE FLUORESCENCES; THERMODYNAMIC PARAMETER; TIME RESOLVED MEASUREMENT;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 84942155606     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5ra17254c     Document Type: Article

References (76)

1. F. L. Cui J. Fan J. P. Li Z. D. Hu Bioorg. Med. Chem. 2004 12 151 157
2. T. Peters, All About Albumin: Biochemistry, Genetics, and Medical Applications, Academic, San Diego, 1996
3. A. Sulkowska B. Bojko J. Rownicka W. Sulkowski J. Mol. Struct. 2003 651 237 243
4. J. W. Smalley P. Charalabou C. A. Hart J. Silver Microbiology 2003 149 843 853
5. E. D. Goddard and K. P. Ananthapadmanabhan, Interactions of surfactants with polymers and proteins, CRC Press Inc., London, 1992
6. M. Wilcox, in Poucher's perfumes, cosmetics and soaps, ed., H. Butler,. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, The Netherlands, 10th edn., 2000, pp. 453-465
7. M. N. Jones Chem. Soc. Rev. 1992 21 127 136
8. D. J. McClements, Food Emulsions: Principles, Practice, and Techniques, CRC Press, Boca Raton, FL, 2004
9. G. Prieto J. Sabín J. M. Ruso A. González-Pérez F. Sarmiento Colloids Surf., A 2004 249 51 55
10. C. Giancola C. D. Sena D. Fessas G. Graziano G. Barone Int. J. Biol. Macromol. 1997 20 193 204
11. B. X. Huang H. Y. Kim C. Dass J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2004 15 1237 1247
12. P. Hazra D. Chakrabarty A. Chakraborty N. Sarkar Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 314 543 549
13. Y. Moriyama K. Takeda Langmuir 1999 15 2003 2008
14. Y. Moriyama K. Takeda Langmuir 2005 21 5524 5528
15. Y. Moriyama E. Watanabe K. Kobayashi H. Harano E. Inui K. Takeda J. Phys. Chem. B 2008 112 16585 16589
16. Y. Moriyama Y. Sato K. Takeda J. Colloid Interface Sci. 1993 156 420 424
17. M. A. Mir M. Gull J. M. Khan R. H. Khan A. A. Dar G. M. Rather J. Phys. Chem. B 2010 114 3197 3210
18. K. Sahu S. K. Mondal D. Roy R. Karmakar K. Bhattacharyya Chem. Phys. Lett. 2005 413 484 489
19. S. S. Krishnakumar D. Panda Biochemistry 2002 41 7443 7452
20. M. D. Charbonneau H. A. T. Richie J. Phys. Chem. B 2010 114 1148 1155
21. E. L. Gelamo R. Itri A. Alonso J. V. da Silva M. Tabak J. Colloid Interface Sci. 2004 277 471 482
22. D. Kelley D. J. McClements Food Hydrocolloids 2003 17 73 85
23. D. Wu G. Xu Y. Sun H. Zhang H. Mao Y. Feng Biomacromolecules 2007 8 708 712
24. V. I. Martin A. Rodriguez A. Maestre M. L. Moya Langmuir 2013 29 7629 7641
25. D. E. Otzen Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2011 1814 562 591
26. A. Stenstam A. Khan H. Wennerstrom Langmuir 2002 17 7513 7520
27. C. M. Dobson Trends Biochem. Sci. 1999 24 329
28. N. P. Moore S. Puvvada D. Blankschtein Langmuir 2003 19 1009 1016
29. S. Shingawa M. Sato K. Kameyama T. Takagi Langmuir 1994 10 1690 1694
30. X. H. Guo N. M. Zhao S. H. Chen J. Teixeira Biopolymers 1990 29 335 346
31. st edn, 1993, p. 319
32. U. Anand S. Mukherjee Phys. Chem. Chem. Phys. 2013 15 9375 9383
33. R. Kaur R. K. Mahajan RSC Adv. 2014 4 29450 29462
34. M. R. Infante A. Pinazo J. Seguer Colloids Surf., A 1997 123-124 49 70
35. T. Peters, The Plasma Proteins, ed., F. W. Putman, Academic Press, 1975. pp. 133-181
36. S. Miyagishi M. Nishida J. Colloid Interface Sci. 1978 65 380 386
37. A. Kundu S. Dasmandal T. Majumdar A. Mahapatra Colloids Surf., A 2013 419 216 222
38. J. R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy, Springer, USA, 3rd edn, 2006
39. A. Dan I. Chakraborty S. Ghosh S. P. Moulik Langmuir 2007 23 7531 7538
40. M. van de Weert L. Stella J. Mol. Struct. 2011 998 144 150
41. W. Zong R. Liu F. Sun Y. Teng X. Fang J. Chai J. Fluoresc. 2011 21 1249 1254
42. L. Stella A. L. Capodilupo M. Bietti Chem. Commun. 2008 4744 4746
43. H. M. Berman J. Westbrook Z. Feng G. Gilliland T. N. Bhat H. Weissig I. N. Shindyalov P. E. Bourne Nucleic Acids Res. 2000 28 235 242
44. W. Khon L. J. Sham Phys. Rev. 1965 140 A1133
45. G. M. Morris D. S. Goodsell R. S. Halliday R. Huey W. E. Hart R. K. Belew A. J. Olson J. Comput. Chem. 1998 19 1639 1662
46. W. L. De Lano, The PyMOL Molecular Graphics System, De Lano Scientific, San Carlos, CA, USA, 2004
47. S. F. Santos D. Zanette H. Fischer R. Itri J. Colloid Interface Sci. 2003 262 400 408
48. C. Das T. Chakraborty S. Ghosh B. Das Colloid Polym. Sci. 2008 286 1143 1155
49. T. Chakraborty I. Chakraborty S. P. Moulik S. Ghosh Langmuir 2009 25 3062 3074
50. S. Miyagishi M. Takagi S. Kadono A. Ohta T. Asakawa J. Colloid Interface Sci. 2003 261 191 196
51. J. Sabin G. Prieto A. Gonzalez-Perez J. M. Ruso F. Sarmiento Biomacromolecules 2006 7 176 182
52. N. Miyake T. Sato Y. Maki Bull. Tokyo Dent. Coll. 2013 54 97 101
53. E. L. Gelamo C. H. Silva H. Imasato M. Tabak Biochim. Biophys. Acta 2002 1594 84 99
54. W. G. Liu K. D. Yao G. C. Wang H. X. Li Polymer 2000 41 7589 7592
55. Y. Shu M. Liu S. Chen X.-W. Chen J.-H. Wang J. Phys. Chem. B 2011 115 12306 12314
56. S. Koutsopoulos A. Tjeerdsma J. F. T. Lieshout J. van der Oost W. Norde Biomacromolecules 2005 6 1176 1184
57. Y. J. Hu Y. Liu R. M. Zhao J. X. Dong S. S. Qu J. Photochem. Photobiol., A 2006 179 324 329
58. U. Anand C. Jash S. Mukherjee J. Phys. Chem. B 2010 114 15839 15845
59. G. Ercolani J. Am. Chem. Soc. 2003 25 16097 16103
60. F. Karush M. Sonenberg J. Am. Chem. Soc. 1949 71 1369 1376
61. P. D. Ross S. Subramanian Biochemistry 1981 20 3096 3102
62. J. A. Lefstin K. R. Yamamoto Nature 1998 392 885 888
63. S. Matzinger D. M. Hussey M. D. Fayer J. Phys. Chem. B 1998 102 7216 7224
64. P. F. Spahr J. T. Edsall J. Biol. Chem. 1964 239 850 854
65. Y. Chen M. D. Barkley Biochemistry 1998 37 9976 9982
66. A. Grinvald I. Z. Steinberg Biochim. Biophys. Acta 1976 427 663 668
67. J. Tiana Y. Zhaob X. Liua S. Zhaoa Luminescence 2009 24 386 393
68. S. De A. Girigoswami S. Das J. Colloid Interface Sci. 2005 285 562 573
69. M. Li A. E. Hagerman J. Agric. Food Chem. 2014 62 3768 3775
70. K. Takeda K. Yamamoto J. Protein Chem. 1990 9 17 22
71. N. Sreerama R. W. Woody Anal. Biochem. 2000 287 252 260
72. P. Yang and F. Gao, The Principle of Bioinorganic Chemistry, Science Press, Beijing, China, 2002, p. 349
73. P. Bharmoria K. S. Rao T. J. Trivedi A. Kumar J. Phys. Chem. B 2014 118 115 124
74. S. Dasmandal H. K. Mandal S. Rudra A. Kundu T. Majumdar A. Mahapatra RSC Adv. 2015 5 38503 38512
75. Y. S. Ge S. X. Tai Z. Q. Xu L. Lai F. F. Tian D. W. Li F. L. Jiang Y. Liu Z. N. Gao Langmuir 2012 28 5913 5920
76. A. S. Sharma S. Anandakumar M. Ilanchelian J. Lumin. 2014 151 206 218