LoMA-B: A simple and versatile lab-on-a-chip system based on single-channel bisulfite conversion for DNA methylation analysis

Lab on a Chip

Volumn 15, Issue 17, 2015, Pages 3530-3539

  Yoon, Jaeyun ^a,b   Park, Mi Kyoung ^a   Lee, Tae Yoon ^a   Yoon, Yong Jin ^b   Shin, Yong ^a  

^a INSTITUTE OF MICROELECTRONICS   (Singapore)

^b NANYANG TECHNOLOGICAL UNIVERSITY   (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BISULFITE; GENOMIC DNA; DNA; HYDROGEN SULFITE; RETINOIC ACID RECEPTOR; SULFITE;

ARTICLE; CONTROLLED STUDY; DNA METHYLATION; EPIGENETICS; GENE; GENE AMPLIFICATION; HUMAN; HUMAN CELL; LAB ON A CHIP; MCF 7 CELL LINE; METHYLATION SPECIFIC POLYMERASE CHAIN REACTION; NEXT GENERATION SEQUENCING; NUCLEIC ACID ANALYSIS; POLYMERASE CHAIN REACTION; PRIORITY JOURNAL; RARBETA GENE; CHEMISTRY; DEVICES; EQUIPMENT DESIGN; GENETICS; MICROFLUIDIC ANALYSIS; PROCEDURES;

DNA; DNA METHYLATION; EQUIPMENT DESIGN; HUMANS; LAB-ON-A-CHIP DEVICES; MCF-7 CELLS; MICROFLUIDIC ANALYTICAL TECHNIQUES; RECEPTORS, RETINOIC ACID; SULFITES;

EID: 84939179745     PISSN: 14730197     EISSN: 14730189     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5lc00458f     Document Type: Article

References (47)

1. G. M. Whitesides Nature 2006 442 368 373
2. J. W. Hong S. R. Quake Nat. Biotechnol. 2003 21 1179 1183
3. Z. Zhang S. Nagrath Biomed. Microdevices 2013 15 595 609
4. J.-I. Hahm C. M. Lieber Nano Lett. 2004 4 51 54
5. M. T. Martínez Y.-C. Tseng N. Ormategui I. Loinaz R. Eritja J. Bokor Nano Lett. 2009 9 530 536
6. Y. Shin A. P. Perera M. K. Park Sens. Actuators, B 2013 178 200 206
7. A. L. Washburn M. S. Luchansky A. L. Bowman R. C. Bailey Anal. Chem. 2010 82 69 72
8. F. Lisdat D. Schäfer Anal. Bioanal. Chem. 2008 391 1555 1567
9. T. Jain R. J. S. Guerrero C. A. Aguilar R. Karnik Anal. Chem. 2013 85 3871 3878
10. Y. Wang D. Zheng Q. Tan M. X. Wang L.-Q. Gu Nat. Nanotechnol. 2011 6 1 7
11. T. Matsuoka B. C. Kim C. Moraes M. Han S. Takayama Biomicrofluidics 2013 7 041301 041313
12. A. P. Feinberg B. Tycko Nat. Rev. Cancer 2004 4 143 153
13. P. A. Jones S. B. Baylin Cell 2007 128 683 692
14. A. Kundaje W. Meuleman J. Ernst M. Bilenky A. Yen A. Heravi-Moussavi P. Kheradpour Z. Zhang J. Wang M. J. Ziller et al. Nature 2015 518 317 330
15. M. Esteller Carcinogenesis 2006 27 1121 1125
16. M. Frommer L. E. McDonald D. S. Millar C. M. Collis F. Watt G. W. Grigg P. L. Molloy C. L. Paul Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992 89 1827 1831
17. J. G. Herman J. R. Graff S. Myohanen B. D. Nelkin S. B. Baylin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93 9821 9826
18. K. Munson J. Clark K. Lamparska-Kupsik S. S. Smith Nucleic Acids Res. 2007 35 2893 2903
19. T. V. Kanel D. Gerber A. Shaller A. Baumer E. Wey C. B. Jackson F. M. Gisler K. Heinimann S. Gallati Clin. Chem. 2010 56 1098 1106
20. M. Ronen D. Avrahami D. Gerber Lab Chip 2014 14 2354 2362
21. C.-H. Wang H.-C. Lai T.-M. Liou K.-F. Hsu C.-Y. Chou G.-B. Lee Microfluid. Nanofluid. 2013 15 575 585
22. M. Kantlehner R. Kirchner P. Hartmann J. W. Ellwart M. Alunni-Fabbroni A. Schumacher Nucleic Acids Res. 2011 39 e44
23. T. Y. Lee Y. Shin M. K. Park Lab Chip 2014 14 4220 4229
24. P. Hou M. Ji C. Ge J. Shen S. Li N. He Z. Lu Nucleic Acids Res. 2003 31 e92
25. S. F. Lim A. Karpusenko J. J. Sakon J. A. Hook T. A. Lamar R. Riehn Biomicrofluidics 2011 5 034106 034114
26. A. De W. Sparreboom A. Berg E. T. Carlen Biomicrofluidics 2014 8 054119
27. W. C. Maki N. N. Mishra E. G. Cameron B. Filanoski S. K. Rastogi G. K. Maki Biosens. Bioelectron. 2008 23 780 787
28. J. Shim G. I. Humphreys B. M. Venkatesan J. M. Munz X. Zou C. Sathe K. Schulten F. Kosari A. M. Nardulli G. Vasmatzis R. Bashir Sci. Rep. 2013 3 1 8
29. K. Goto D. Kato N. Sekioka A. Ueda S. Hirono O. Niwa Anal. Biochem. 2010 405 59 66
30. P. W. Laird Nat. Rev. Genet. 2010 11 191 203
31. F. J. Steemers K. L. Gunderson Biotechnol. J. 2007 2 41 49
32. T. K. Wojdacz A. Dobrovic Nucleic Acids Res. 2007 35 e41
33. T. K. Wojdacz T. H. Moller B. B. Thestrup L. S. Kristensen L. L. Hansen Expert Rev. Mol. Diagn. 2010 10 575 580
34. C. A. Eads K. D. Danenberg K. Kawakami L. B. Saltz C. Blake D. Shibata P. V. Danenberg P. W. Laird Nucleic Acids Res. 2000 28 e32
35. H. G. Hernandez M. Y. Tse S. C. Pang H. Arboleda D. A. Forero BioTechniques 2013 55 181 197
36. H. K. Komori S. A. LaMere A. Torkamani G. T. Hart S. Kotsopoulos J. Warner M. L. Samuels J. Olson S. R. Head P. Ordoukhanian P. L. Lee D. R. Link D. R. Salomon Genome Res. 2011 21 1738 1745
37. Y. Zhang V. Bailey C. M. Puleo H. Easwaran E. Griffiths J. G. Herman S. B. Baylin T.-H. Wang Lab Chip 2009 9 1059 1064
38. M. Kalofonou C. Toumazou Sens. Actuators, B 2013 178 572 580
39. J. Kim Y. Shin S. Song J. Lee J. Kim Sens. Actuators, B 2014 202 60 66
40. Y. Shin A. P. Perera K. W. Kim M. K. Park Lab Chip 2013 13 2106 2109
41. Y. Shin R. A. Soo J. Yoon A. P. Perera Y. J. Yoon M. K. Park Biosens. Bioelectron. 2015 68 107 114
42. Y. Shin A. P. Perera W. Y. Tang D. L. Fu Q. Liu J. K. Sheng Z. Gu T. Y. Lee T. Barkham M. K. Park Biosens. Bioelectron. 2015 68 390 396
43. R. Rouzier C. M. Perou W. F. Symmans N. Ibrahim M. Cristofanilli K. Anderson K. R. Hess J. Stec M. Ayers P. Wagner P. Morandi C. Fan I. Rabiul J. S. Ross G. N. Hortobagyi L. Pusztai Clin. Cancer Res. 2005 11 5678 5685
44. M. K. Park J. S. Kee J. Y. Quah V. Netto J. Song Q. Fang E. M. La Fosse G.-Q. Lo Sens. Actuators, B 2013 176 552 559
45. Y. Shin A. P. Perera J. S. Kee J. Song Q. Fang G.-Q. Lo M. K. Park Sens. Actuators, B 2013 177 404 411
46. R. H. Liu M. A. Stremler K. V. Sharp M. G. Olsen J. G. Santiago R. J. Adrian H. Aref D. J. Beebe J. Microelectromech. Syst. 2000 9 190 197
47. M. Shiraishi H. Hayatsu DNA Res. 2004 11 409 415