Why Quantum Coherence Is Not Important in the Fenna-Matthews-Olsen Complex

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 11, Issue 7, 2015, Pages 3411-3419

  Wilkins, David M ^a   Dattani, Nikesh S ^b,c  

^a UNIVERSITY OF OXFORD   (United Kingdom)

^b KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

^c NANYANG TECHNOLOGICAL UNIVERSITY   (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84939169308     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct501066k     Document Type: Article

References (103)

1. Engel, G. S.; Calhoun, T. R.; Read, E. L.; Ahn, T.-K.; Mančal, T.; Cheng, Y.-C.; Blankenship, R. E.; Fleming, G. R. Nature 2007, 446, 782-786
2. Ishizaki, A.; Fleming, G. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 17255-17260
3. Panitchayangkoon, G.; Hayes, D.; Fransted, K. A.; Caram, J. R.; Harel, E.; Wen, J.; Blankenship, R. E.; Engel, G. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 12766-12770
4. Ishizaki, A.; Calhoun, T. R.; Schlau-Cohen, G. S.; Fleming, G. R. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 7319-7337
5. Collini, E.; Wong, C. Y.; Wilk, K. E.; Curmi, P. M. G.; Brumer, P.; Scholes, G. D. Nature 2010, 463, 644-647
6. Nalbach, P.; Eckel, J.; Thorwart, M. New J. Phys. 2010, 12, 065043
7. Huo, P.; Coker, D. F. J. Chem. Phys. 2010, 133, 184108
8. Scholes, G. D.; Fleming, G. R.; Olaya-Castro, A.; van Grondelle, R. Nat. Chem. 2011, 3, 763-774
9. Yuen-Zhou, J.; Krich, J. J.; Aspuru-Guzik, A. J. Chem. Phys. 2012, 136, 234501
10. Butkus, V.; Valkunas, L.; Abramavicius, D. J. Chem. Phys. 2012, 137, 044513
11. Mančal, T.; Christensson, N.; Lukeš, V.; Milota, F.; Bixner, O.; Kauffmann, H. F.; Hauer, J. J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 1497-1502
12. Strümpfer, J.; Sener, M.; Schulten, K. J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 536-542
13. Christensson, N.; Kauffmann, H. F.; Pullerits, T.; Mančal, T. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 7449-7454
14. Kassal, I.; Yuen-Zhou, J.; Rahimi-Keshari, S. J. Phys. Chem. Lett. 2013, 4, 362-367
15. del Rey, M.; Chin, A. W.; Huelga, S. F.; Plenio, M. B. J. Phys. Chem. Lett. 2013, 4, 903-907
16. Mančal, T. J. Phys. Chem. B 2013, 117, 11282-11291
17. Plenio, M. B.; Almeida, J.; Huelga, S. F. J. Chem. Phys. 2013, 139, 235102
18. Fokas, A. S.; Cole, D. J.; Chin, A. W. Photosynth. Res. 2014, 122, 275-292
19. Sato, Y.; Doolittle, B. J. Chem. Phys. 2014, 141, 185102
20. Tempelaar, R.; Jansen, T. L. C.; Knoester, J. J. Phys. Chem. B 2014, 118, 12865-12872
21. Aghtar, M.; Strümpfer, J.; Olbrich, C.; Schulten, K.; Kleinekathöfer, U. J. Phys. Chem. Lett. 2014, 5, 3131-3137
22. Shabani, A.; Mohseni, M.; Rabitz, H.; Lloyd, S. Phys. Rev. E 2014, 89, 042706
23. Pelzer, K. M.; Can, T.; Gray, S. K.; Morr, D. K.; Engel, G. S. J. Phys. Chem. B 2014, 118, 2693-2702
24. Buchleitner, A.; Burghardt, I.; Cheng, Y.; Scholes, G. D.; Schwartz, U. T.; Weber-Bargioni, A.; Wellens, T. New J. Phys. 2014, 16, 105021
25. Mourokh, L. G.; Nori, F. (2014, arXiv:1402.7031, arXiv.org ePrint archive, http://arxiv.org/pdf/1402.7031v1.pdf, accessed Feb 10, 2015.
26. Rivera, E.; Montemayor, D.; Masia, M.; Coker, D. F. J. Phys. Chem. B 2013, 117, 5510-5521
27. Chin, A. W.; Prior, J.; Rosenbach, R.; Caycedo-Soler, F.; Huelga, S. F.; Plenio, M. B. Nat. Phys. 2013, 9, 113-118
28. Jang, S.; Cheng, Y.; Reichmann, D. R.; Eaves, J. D. J. Chem. Phys. 2008, 129, 101104
29. Moix, J.; Wu, J.; Huo, P.; Coker, D.; Cao, J. J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 3045-3052
30. Wu, J. L.; Liu, F.; Ma, J.; Silbey, R. J.; Cao, J. S. J. Chem. Phys. 2012, 137, 174111
31. Lloyd, S. J. Phys.: Conf. Ser. 2011, 301, 012037
32. Fenna, R. E.; Matthews, B.; Olson, J.; Shaw, E. J. Mol. Biol. 1974, 84, 231-240
33. Fenna, R. E.; Matthews, B. Nature 1975, 258, 573-577
34. Tronrud, D. E.; Wen, J.; Gay, L.; Blankenship, R. E. Photosynth. Res. 2009, 100, 79-87
35. Schmidt am Busch, M.; Muh, F.; El-Amine Madjet, M.; Renger, T. J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 93-98
36. Schröter, M.; Ivanov, S. D.; Schulze, J.; Polyutov, S. P.; Yan, Y.; Pullerits, T.; Kühn, O. Phys. Rep. 2015, DOI: 10.1016/j.physrep.2014.12.001.
37. Doolittle, B. Honor's Thesis; Physics and Astronomy Department, Colby College, 2014.
38. Pachón, L. A.; Brumer, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 10094-10108
39. Lambert, N.; Chen, Y.; Cheng, Y.; Li, C.; Chen, G.; Nori, F. Nat. Phys. 2013, 9, 10-18
40. Zimanyi, E. N.; Silbey, R. J. J. Chem. Phys. 2010, 133, 144107
41. Briggs, J. S.; Eisfeld, A. Phys. Rev. E 2011, 83, 051911
42. Eisfeld, A.; Briggs, J. S. Phys. Rev. E 2012, 85, 046118
43. Miller, W. H. J. Chem. Phys. 2012, 136, 210901
44. León-Montiel, R. de J.; Torres, J. P. Phys. Rev. Lett. 2013, 110, 218101
45. Mančal, T. J. Phys. Chem. B 2013, 117, 11282-11291
46. van Grondelle, R.; Dekker, J. P.; Gillbro, T.; Sundstrom, V. Biochem. Biophys. Acta 1994, 1187, 1-65
47. Scholes, G. D. Annu. Rev. Phys. Chem. 2003, 54, 57-87
48. Renger, T. Photosynth. Res. 2009, 102, 471-485
49. Cheng, Y.-C.; Fleming, G. R. Annu. Rev. Phys. Chem. 2009, 60, 241-262
50. Ishizaki, A.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2009, 130, 234111
51. Tao, G.; Miller, W. H. J. Phys. Chem. Lett. 2010, 1, 891-894
52. Ritschel, G.; Roden, J.; Strunz, W. T.; Aspuru-Guzik, A.; Eisfeld, A. J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 2912-2917
53. Huo, P.; Coker, D. F. J. Chem. Phys. 2011, 135, 201101
54. Zhu, J.; Kais, S.; Rebentrost, P.; Aspuru-Guzik, A. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 1531-1537
55. Shabani, A.; Mohseni, M.; Rabitz, H.; Lloyd, S. Phys. Rev. E 2012, 86, 011915
56. Berkelbach, T.; Markland, T.; Reichman, D. J. Chem. Phys. 2012, 136, 084104
57. Seuss, D.; Eisfeld, A.; Strunz, W. Phys. Rev. Lett. 2014, 113, 150403
58. Imai, H.; Ohtsuki, Y.; Kono, H. Chem. Phys. 2015, 446, 134-141
59. Hwang-Fu, Y.; Chen, W.; Cheng, Y. Chem. Phys. 2015, 447, 46-53
60. Louwe, R. J. W.; Aartsma, T. J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7221-7226
61. Plenio, M. B.; Huelga, S. F. New J. Phys. 2008, 10, 113019
62. Hu, J.; Xu, R.-X.; Yan, Y. J. Chem. Phys. 2010, 133, 101106
63. Hu, J.; Luo, M.; Jiang, F.; Xu, R.-X.; Yan, Y. J. Chem. Phys. 2011, 134, 244106
64. Tanimura, Y. J. Chem. Phys. 2014, 141, 044144
65. Tanimura, Y.; Kubo, R. J. Phys. Soc. Jpn. 1989, 58, 101-114
66. Tanimura, Y. Phys. Rev. A 1990, 41, 6676-6687
67. Tanimura, Y.; Wolynes, P. Phys. Rev. A 1991, 43, 4131
68. Kato, T.; Tanimura, Y. J. Chem. Phys. 2002, 117, 6221
69. Kato, T.; Tanimura, Y. J. Chem. Phys. 2004, 120, 260
70. Tanimura, Y.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 1994, 101, 3049
71. Ishizaki, A.; Tanimura, Y. J. Chem. Phys. 2005, 123, 014503
72. Ishizaki, A.; Tanimura, Y. J. Chem. Phys. 2006, 125, 084501
73. Jin, J.; Welack, S.; Luo, J.; Li, X.-Q.; Cui, P.; Xu, R.-X.; Yan, Y. J. Chem. Phys. 2007, 126, 134113
74. Hein, B.; Kreisbeck, C.; Kramer, T.; Rodríguez, M. New J. Phys. 2012, 14, 023018
75. Han, P.; Xu, R.-X.; Li, B.; Xu, J.; Cui, P.; Mo, Y.; Yan, Y. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 11438
76. Schröder, M.; Schreiber, M.; Kleinekathöfer, U. J. Chem. Phys. 2007, 126, 114102
77. Ishizaki, A.; Tanimura, Y. J. Phys. Soc. Jpn. 2005, 74, 3131-3134
78. Ishizaki, A.; Tanimura, Y. J. Chem. Phys. 2006, 125, 084501
79. Yan, Y.-A.; Yang, F.; Liu, Y.; Shao, J. Chem. Phys. Lett. 2004, 395, 216
80. Xu, R.-X.; Cui, P.; Li, X.-Q.; Mo, Y.; Yan, Y. J. Chem. Phys. 2005, 122, 41103
81. Kleinekathöfer, U.; Barvík, I.; Heřman, P.; Kondov, I.; Schreiber, M. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 14094
82. Kleinekathöfer, U. J. Chem. Phys. 2004, 121, 2505
83. Yan, Y.; Xu, R. Annu. Rev. Phys. Chem. 2005, 56, 187
84. Jin, J.; Welack, S.; Luo, J.; Li, X.-Q.; Cui, P.; Xu, R.-X.; Yan, Y. J. Chem. Phys. 2007, 126, 134113
85. Dattani, N. S.; Pollock, F. A.; Wilkins, D. M. Quant. Phys. Lett. 2012, 1, 35; http://arxiv.org/abs/1203.4551.
86. Dattani, N. S.; Wilkins, D. M.; Pollock, F. A. arXiv:1205.4651, 2012; arXiv.org ePrint archive, http://arxiv.org/pdf/1205.4651v2.pdf, accessed May 19, 2015.
87. Kreisbeck, C.; Kramer, T.; Rodriguez, M.; Hein, B. J. Chem. Theor. Comput. 2011, 7, 2166
88. Hou, D.; Wang, S.; Wang, R.; Ye, L.-Z.; Xu, R.-X.; Zheng, X.; Yan, Y. J. Chem. Phys. 2015, 142, 104112
89. Förster, T. Ann. Phys. 1948, 437, 55-75
90. Yang, M.; Fleming, G. R. Chem. Phys. 2002, 282, 163-180
91. Palmieri, B.; Abramavicius, D.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 2009, 130, 204512
92. Roden, J.; Eisfeld, A.; Wolff, W.; Strunz, W. T. Phys. Rev. E 2009, 103, 058301
93. Rebentrost, P.; Mohseni, M.; Aspuru-Guzik, A. J. Chem. Phys. B 2009, 113, 9942-9947
94. Alicki, R.; Miklaszewski, W. J. Chem. Phys. 2012, 136, 134103
95. Kreisbeck, C.; Kramer, T. J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 2828-2833
96. Kramer, T.; Kreisbeck, C. AIP Conf. Proc. 2014, 1575, 111
97. Adolphs, J.; Renger, T. Biophys. J. 2006, 91, 2778-2797
98. Nalbach, P.; Braun, D.; Thorwart, M. Phys. Rev. E 2011, 84, 041926
99. Olbrich, C.; Strümpfer, J.; Schulten, K.; Kleinekathöfer, U. J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 1771-1776
100. Read, E. L.; Schlau-Cohen, G. S.; Engel, G. S.; Wen, J.; Blankenship, R. E.; Fleming, G. R. Biophys. J. 2008, 95, 847-856
101. Zigmantas, D.; Read, E. L.; Mančal, T.; Brixner, T.; Gardiner, A. T.; Cogdell, R. J.; Fleming, G. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 12672-12677
102. Read, E. L.; Engel, G. S.; Calhoun, T. R.; Mančal, T.; Ahn, T. K.; Blankenship, R. E.; Fleming, G. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 14203-14208
103. Ritschel, G.; Roden, J.; Strunz, W. T.; Eisfeld, A. New J. Phys. 2011, 13, 113034