Stretching of BDT-gold molecular junctions: Thiol or thiolate termination?

Nanoscale

Volumn 6, Issue 23, 2014, Pages 14495-14507

  Souza, Amaury De Melo ^a   Rungger, Ivan ^a   Pontes, Renato Borges ^b   Rocha, Alexandre Reily ^c   Da Silva, Antônio José Roque ^d,e   Schwingenschlöegl, Udo ^f   Sanvito, Stefano ^a  

^a TRINITY COLLEGE DUBLIN   (Ireland)

^b FEDERAL UNIVERSITY OF GOIÁS   (Brazil)

^c SÃO PAULO STATE UNIVERSITY UNESP   (Brazil)

^d UNIVERSITY OF SÃO PAULO   (Brazil)

^e LABORATÓRIO NACIONAL DE LUZ SÍNCROTRON   (Brazil)

^f KING ABDULLAH UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY   (Saudi Arabia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMS; BENZENE; ELECTRODES; ELECTRON ENERGY LEVELS; GOLD; MOLECULAR ORBITALS; MOLECULES; PHOTODISSOCIATION; TRANSPORT PROPERTIES;

ACTIVATION BARRIERS; DISSOCIATIVE ADSORPTION; ELECTRODE GEOMETRIES; ELECTRODE SEPARATION; HIGHEST OCCUPIED MOLECULAR ORBITAL; IMAGE-CHARGE EFFECTS; LOWEST UNOCCUPIED MOLECULAR ORBITAL; ORDERS OF MAGNITUDE;

LOCAL DENSITY APPROXIMATION;

EID: 84908880959     PISSN: 20403364     EISSN: 20403372     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4nr04081c     Document Type: Article

References (89)

1. M. A. Reed, C. Zhou, C. J. Muller, T. P. Burgin and J. M. Tour, Science, 1997, 278, 252-254.
2. M. Tsutsui, Y. Teramae, S. Kurokawa and A. Sakai, Appl. Phys. Lett., 2006, 89, 163111-163113.
3. M. Tsutsui, M. Taniguchi, K. Shoji, K. Yokota and T. Kawai, Nanoscale, 2009, 1, 164-170.
4. J.-H. Tian, Y. Yang, X.-S. Zhou, B. Schöllhorn, E. Maisonhaute, Z.-B. Chen, F.-Z. Yang, Y. Chen, C. Amatore, B.-W. Mao and Z.-Q. Tian, ChemPhysChem, 2010, 11, 2745-2755.
5. X. Xiao, B. Xu and N. J. Tao, Nano Lett., 2004, 4, 267-271.
6. M. Taniguchi, M. Tsutsui, K. Yokota and T. Kawai, Chem. Sci., 2010, 1, 247-253.
7. K. Baheti, J. A. Malen, P. Doak, P. Reddy, S.-Y. Jang, T. D. Tilley, A. Majumdar and R. A. Segalman, Nano Lett., 2008, 8, 715-719.
8. E. Lörtscher, H. B. Weber and H. Riel, Phys. Rev. Lett., 2007, 98, 176807-176811.
9. Y. Kim, T. Pietsch, A. Erbe, W. Belzig and E. Scheer, Nano Lett., 2011, 11, 3734-3738.
10. F. Demir and G. Kirczenow, J. Chem. Phys., 2012, 137, 094703-094713.
11. R. B. Pontes, F. D. Novaes, A. Fazzio and A. J. R. Silva, J. Am. Chem. Soc., 2006, 128, 8996-8997.
12. R. B. Pontes, A. R. Rocha, S. Sanvito, A. Fazzio and A. J. R. Da Silva, ACS Nano, 2011, 5, 795-804.
13. C. Toher and S. Sanvito, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2008, 77, 155402-155414.
14. M. Strange and K. S. Thygesen, 2011, arXiv:cond-mat/1108- 3687v1.
15. W. R. French, C. R. Iacovella, I. Rungger, A. M. Souza, S. Sanvito and P. T. Cummings, J. Phys. Chem. Lett., 2013, 4, 887-891.
16. W. R. French, C. R. Iacovella, I. Rungger, A. M. Souza, S. Sanvito and P. T. Cummings, Nanoscale, 2013, 5, 3654-3663.
17. M. T. Gonzalez, S. Wu, R. Huber, S. J. van der Molen, C. Schönenberger and M. Calame, Nano Lett., 2006, 6, 2238-2242.
18. J.-H. Tian, B. Liu, X. Li, Z.-L. Yang, B. Ren, S.-T. Wu, N. Tao and Z.-Q. Tian, J. Am. Chem. Soc., 2006, 128, 14748-14749.
19. M. Tsutsui, M. Taniguchi and T. Kawai, Nano Lett., 2009, 9, 2433-2439.
20. S. Y. Quek, M. Kamenetska, M. L. Steigerwald, H. J. Choi, S. G. Louie, M. S. Hybertsen, J. B. Neaton and L. Venkataraman, Nat. Nanotechnol., 2009, 4, 230-234.
21. C. R. Arroyo, E. Leary, A. Castellanos-Gómez, G. Rubio-Bollinger, M. T. González and N. Agraït, J. Am. Chem. Soc., 2011, 133, 14313-14319.
22. C. Bruot, J. Hihath and N. Tao, Nat. Nanotechnol., 2012, 7, 35-40.
23. V. Fatemi, M. Kamenetska, J. B. Neaton and L. Venkataraman, Nano Lett., 2011, 11, 1988-1992.
24. M. Kiguchi, H. Nakamura, Y. Takahashi, T. Takahashi and T. Ohto, J. Phys. Chem. C, 2010, 114, 22254-22261.
25. P. Reddy, S.-Y. Jang, R. A. Segalman and A. Majumdar, Science, 2007, 315, 1568-1571.
26. H. Vazquez, R. Skouta, S. Schneebeli, M. Kamenetska, R. Breslow, L. Venkataraman and M. S. Hybertsen, Nat. Nanotechnol., 2012, 7, 663-667.
27. L. Venkataraman, J. E. Klare, I. W. Tam, C. Nuckolls, M. S. Hybertsen and M. L. Steigerwald, Nano Lett., 2006, 6, 458-462.
28. D. J. Wold, R. Haag, M. A. Rampi and C. D. Frisbie, J. Phys. Chem. B, 2002, 106, 2813-2816.
29. B. Xu and N. J. Tao, Science, 2003, 301, 1221-1223.
30. J. Tomfohr and O. F. Sankey, J. Chem. Phys., 2004, 120, 1542-1554.
31. K. Stokbro, J. Taylor, M. Brandbyge, J.-L. Mozos and P. Ordejón, Comput. Mater. Sci., 2003, 27, 151-160.
32. P. Maksymovych and J. T. Yates, J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 7518-7519.
33. W. Andreoni, A. Curioni and H. Grönbeck, Int. J. Quantum. Chem., 2000, 80, 598-608.
34. Q. Pu, Y. Leng, X. Zhao and P. T. Cummings, J. Phys. Chem. C, 2010, 114, 10365-10372.
35. M. Strange, C. Rostgaard, H. Häkkinen and K. S. Thygesen, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2011, 83, 115108-115120.
36. H. Grönbeck, A. Curioni and W. Andreoni, J. Am. Chem. Soc., 2000, 122, 3839-3842.
37. J. Nara, S. Higai, Y. Morikawa and T. Ohno, J. Chem. Phys., 2004, 120, 6705-6711.
38. Z. Ning, W. Ji and H. Guo, 2010, arXiv:cond-mat/09074674v2.
39. J. P. Perdew and M. Levy, Phys. Rev. Lett., 1983, 51, 1884-1887.
40. J. P. Perdew, R. G. Parr, M. Levy and J. L. Balduz, Phys. Rev. Lett., 1982, 49, 1691-1694.
41. J. F. Janak, Phys. Rev. B: Solid State, 1978, 18, 7165-7168.
42. R. Hesper, L. H. Tjeng and G. A. Sawatzky, Europhys. Lett., 1997, 40, 177-182.
43. J. Repp, G. Meyer, S. Stojković, A. Gourdon and C. Joachim, Phys. Rev. Lett., 2005, 94, 026803-026807.
44. X. Lu, M. Grobis, K. H. Khoo, S. G. Louie and M. F. Crommie, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2004, 70, 115418-115426.
45. M. T. Greiner, M. G. Helander, W.-M. Tang, Z.-B. Wang, J. Qiu and Z.-H. Lu, Nat. Mater., 2011, 11, 76-81.
46. M. L. Perrin, C. J. O. Verzijl, C. A. Martin, A. J. Shaikh, R. Eelkema, J. H. van Esch, J. M. van Ruitenbeek, J. M. Thijssen, H. S. J. van der Zant and D. Dulić, Nat. Nanotechnol., 2013, 8, 282-287.
47. S. Kümmel and L. Kronik, Rev. Mod. Phys., 2008, 80, 3-60.
48. F. Flores, J. Ortega and H. Vázquez, Phys. Chem. Chem. Phys., 2009, 11, 8658-8675.
49. J. C. Inkson, J. Phys. C: Solid State Phys., 1973, 6, 1350-1362.
50. M. S. Hybertsen and S. G. Louie, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 1986, 34, 5390-5413.
51. G. Onida, L. Reining and A. Rubio, Rev. Mod. Phys., 2002, 74, 601-659.
52. J. B. Neaton, M. S. Hybertsen and S. G. Louie, Phys. Rev. Lett., 2006, 97, 216405-216409.
53. J. M. Garcia-Lastra and K. S. Thygesen, Phys. Rev. Lett., 2011, 106, 187402-187406.
54. J. M. Garcia-Lastra, C. Rostgaard, A. Rubio and K. S. Thygesen, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2009, 80, 245427-245434.
55. I. Tamblyn, P. Darancet, S. Y. Quek, S. A. Bonev and J. B. Neaton, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2011, 84, 201402-201406.
56. G.-M. Rignanese, X. Blase and S. G. Louie, Phys. Rev. Lett., 2001, 86, 2110-2113.
57. M. Strange and K. S. Thygesen, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2012, 86, 195121-195127.
58. C. D. Pemmaraju, T. Archer, D. Sánchez-Portal and S. Sanvito, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2007, 75, 045101-045116.
59. S. Y. Quek, L. Venkataraman, H. J. Choi, S. G. Louie, M. S. Hybertsen and J. B. Neaton, Nano Lett., 2007, 7, 3477-3482.
60. V. M. García-Suárez and C. J. Lambert, New J. Phys., 2011, 13, 053026-005342.
61. A. M. Souza, I. Rungger, C. D. Pemmaraju, U. Schwingenschloegl and S. Sanvito, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2013, 88, 165112-165121.
62. J. M. Soler, E. Artacho, J. D. Gale, A. García, J. Junquera, P. Ordejón and D. Sánchez-Portal, J. Phys.: Condens. Matter, 2002, 14, 2745-2779.
63. G. Kresse and J. Furthmüller, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 1996, 54, 11169-11186.
64. J. P. Perdew, K. Burke and M. Ernzerhof, Phys. Rev. Lett., 1996, 77, 3865-3868.
65. N. Troullier and J. L. Martins, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 1991, 15, 43-57.
66. C. Rostgaard, 2009, arXiv:cond-mat/09101921v2.
67. I. Rungger and S. Sanvito, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2008, 78, 035407-035420.
68. A. R. Rocha, V. M. García-Suárez, S. Bailey, C. J. Lambert, J. Ferrer and S. Sanvito, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2006, 73, 085414-085435.
69. A. Filippetti, C. D. Pemmaraju, S. Sanvito, P. Delugas, D. Puggioni and V. Fiorentini, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2011, 84, 195127-195149.
70. C. Toher, A. Filippetti, S. Sanvito and K. Burke, Phys. Rev. Lett., 2005, 95, 146402-146406.
71. N. D. Lang and W. Kohn, Phys. Rev. B: Solid State, 1973, 7, 3541-3551.
72. A. Ferretti, A. Calzolari, R. Di Felice and F. Manghi, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2005, 72, 125114-125127.
73. S. Y. Quek, H. J. Choi, S. G. Louie and J. B. Neaton, ACS Nano, 2011, 5, 551-557.
74. D. J. Mowbray, G. Jones and K. S. Thygesen, J. Chem. Phys., 2008, 128, 111103-111108.
75. E. Abad, J. Ortega, Y. J. Dappe and F. Flores, Appl. Phys. A, 2008, 95, 119-124.
76. J.-G. Zhou and F. Hagelberg, Phys. Rev. Lett., 2006, 97, 045505-045509.
77. I. I. Rzeźnicka, J. Lee, P. Maksymovych and J. T. Yates, J. Phys. Chem. B, 2005, 109, 15992-15996.
78. R. G. Nuzzo, B. R. Zegarski and L. H. Dubois, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 733-740.
79. G. Henkelman, B. P. Uberuaga and H. Jónsson, J. Chem. Phys., 2000, 113, 9901-9904.
80. G. Henkelman and H. Jónsson, J. Chem. Phys., 2000, 113, 9978-9985.
81. G. Henkelman and H. Jónsson, J. Chem. Phys., 2000, 111, 7010-7022.
82. M. Frei, S. V. Aradhya, M. S. Hybertsen and L. Venkataraman, J. Am. Chem. Soc., 2012, 134, 4003-4006.
83. S. V. Aradhya, M. Frei, M. S. Hybertsen and L. Venkataraman, Nat. Mater., 2012, 11, 872-878.
84. Z. Huang, B. Xu, Y. Chen, M. Di Ventra and N. Tao, Nano Lett., 2006, 6, 1240-1244.
85. X. Li, J. He, J. Hihath, B. Xu, S. M. Lindsay and N. Tao, J. Am. Chem. Soc., 2006, 128, 2135-2141.
86. M. Strange, O. Lopez-Acevedo and H. Häkkinen, J. Phys. Chem. Lett., 2010, 1, 1528-1532.
87. L. Romaner, G. Heimel, M. Gruber, J.-L. Brédas and E. Zojer, Small, 2006, 2, 1468-1475.
88. N. Sergueev, L. Tsetseris, K. Varga and S. Pantelides, Phys. Rev. B: Condens. Matter, 2010, 82, 073106-073110.
89. Y. Qi, J. Qin, G. Zhang and T. Zhang, J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 16418-16422.