DNA sequencing by synthesis using 3′-O-azidomethyl nucleotide reversible terminators and surface-enhanced Raman spectroscopic detection

RSC Advances

Volumn 4, Issue 90, 2014, Pages 49342-49346

  Palla, Mirkó ^a,b   Guo, Wenjing ^a,b   Shi, Shundi ^a,b   Li, Zengmin ^a,b   Wu, Jian ^a   Jockusch, Steffen ^a   Guo, Cheng ^a,b   Russo, James J ^a,b   Turro, Nicholas J ^a   Ju, Jingyue ^a,b,c  

^a Och Spine at New York Presbyterian Hospitals   (United States)

^b Department of Mechanical Engineering Columbia University ^*  (United States)

^c Department of Chemical Engineering Columbia University ^*  (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA SEQUENCING; SURFACE-ENHANCED RAMAN;

EID: 84907963079     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4ra08398a     Document Type: Article

References (22)

1. E. D. Hyman Anal. Biochem. 1988 174 423 436
2. M. Ronaghi M. Uhlén P. Nyrén Science 1998 281 363 365
3. J. Ju, Z. Li, J. R. Edwards and Y. Itagaki, US Pat., 6 664 079, 2003
4. Z. Li X. Bai H. Ruparel S. Kim N. J. Turro J. Ju Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 414 419
5. I. Braslavsky B. Hebert E. Kartalov S. R. Quake Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 3960 3964
6. H. Ruparel L. Bi Z. Li X. Bai D. H. Kim N. J. Turro J. Ju Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 5932 5937
7. M. Margulies M. Egholm W. E. Altman S. Attiya J. S. Bader L. A. Bemben J. Berka M. S. Braverman Y.-J. Chen et al. Nature 2005 437 376 380
8. J. Ju D. H. Kim L. Bi Q. Meng X. Bai Z. Li X. Li M. S. Marma S. Shi J. Wu J. R. Edwards A. Romu N. J. Turro Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 19635 19640
9. J. Wu S. Zhang Q. Meng H. Cao Z. Li X. Li S. Shi D. H. Kim L. Bi N. J. Turro J. Ju Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 16462 16467
10. J. Guo N. Xu Z. Li S. Zhang J. Wu D. H. Kim S. M. Marma Q. Meng H. Cao X. Li S. Shi L. Yu S. Kalachikov J. J. Russo N. J. Turro J. Ju Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 9145 9150
11. D. R. Bentley S. Balasubramanian H. P. Swerdlow G. P. Smith J. Milton C. G. Brown K. P. Hall D. J. Evers C. L. Barnes H. R. Bignell et al. Nature 2008 456 53 59
12. T. D. Harris P. R. Buzby H. Babcock E. Beer J. Bowers I. Braslavsky M. Causey J. Colonell J. Dimeo J. W. Efcavitch et al. Science 2008 320 106 109
13. J. Eid A. Fehr J. Gray K. Luong J. Lyle G. Otto P. Peluso D. Rank P. Baybayan B. Bettman et al. Science 2009 323 133 138
14. J. M. Rothberg W. Hinz T. M. Rearick J. Schultz W. Mileski M. Davey J. H. Leamon K. Johnson M. J. Milgrew M. Edwards et al. Nature 2011 475 348 352
15. S. L. Kleinman E. Ringe N. Valley K. L. Wustholz E. Phillips K. A. Scheidt G. C. Schatz R. P. Van Duyne J. Am. Chem. Soc. 2011 133 4115 4122
16. W. D. Li F. Ding J. Hu S. Y. Chou Opt. Express 2011 19 3925 3936
17. M. S. Schmidt J. Hübner A. Boisen Adv. Mater. 2012 24 OP11 OP18
18. H. Yamakoshi K. Dodo A. Palonpon J. Ando K. Fujita S. Kawata M. Sodeoka J. Am. Chem. Soc. 2012 134 20681 20689
19. L. Lin X. Tian S. Hong P. Dai Q. You R. Wang L. Feng C. Xie Z. Q. Tian X. Chen Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 7266 7271
20. K. Kneipp H. Kneipp V. B. Kartha R. Manoharan G. Deinum I. Itzkan R. R. Dasari M. S. Feld Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 1998 57 R6281 R6284
21. T. Vo-Dinh D. L. Stokes G. D. Griffin M. Volkan U. J. Kim M. I. Simon J. Raman Spectrosc. 1999 30 785 793
22. D. Zhang D. Ben-Amotz Appl. Spectrosc. 2000 54 1379 1383