ILQINS hexapeptide, identified in lysozyme left-handed helical ribbons and nanotubes, forms right-handed helical ribbons and crystals

Journal of the American Chemical Society

Volumn 136, Issue 12, 2014, Pages 4732-4739

  Lara, Cecile ^a   Reynolds, Nicholas P ^b   Berryman, Joshua T ^c   Xu, Anqiu ^d   Zhang, Afang ^d   Mezzenga, Raffaele ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b CSIRO   (Australia)

^c UNIVERSITY OF LUXEMBOURG   (Luxembourg)

^d SHANGHAI UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; ENZYMES; GLYCOPROTEINS; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR DYNAMICS; NANOTUBES;

FIBRILLAR STRUCTURES; HEN EGG WHITE LYSOZYME; MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION MASS SPECTROMETRY; META-STABLE STATE; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; SMALL- AND WIDE-ANGLE X-RAY SCATTERINGS; SOLID PHASE PEPTIDE SYNTHESIS; STRUCTURAL AND PHYSICAL PROPERTIES;

NANOTECHNOLOGY;

AMYLOID; EGG WHITE; HEXAPEPTIDE; LYSOZYME; NANOTUBE; WATER; OLIGOPEPTIDE; PEPTIDE FRAGMENT;

ANIMAL MODEL; ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CHEMICAL STRUCTURE; CHIRALITY; CIRCULAR DICHROISM; CRYSTAL; DISEASE ASSOCIATION; HEN; LEFT HANDED HELICAL RIBBON; LEFT HANDEDNESS; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR DYNAMICS; NANOTECHNOLOGY; NONHUMAN; PEPTIDE SYNTHESIS; PH; PROTEIN MODIFICATION; PROTEIN STRUCTURE; RADIATION SCATTERING; RIGHT HANDED HELICAL RIBBON; STRESS; STRUCTURE ANALYSIS; AMINO ACID SEQUENCE; CHEMISTRY; KINETICS; PROTEIN MULTIMERIZATION; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; TEMPERATURE;

AMINO ACID SEQUENCE; KINETICS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; MURAMIDASE; NANOTUBES; OLIGOPEPTIDES; PEPTIDE FRAGMENTS; PROTEIN MULTIMERIZATION; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; TEMPERATURE;

EID: 84897093151     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja500445z     Document Type: Article

References (64)

1. Chiti, F.; Dobson, C. M. Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 333-366
2. Luheshi, L. M.; Crowther, D. C.; Dobson, C. M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2008, 12, 25-31
3. Kayed, R.; Head, E.; Thompson, J. L.; McIntire, T. M.; Milton, S. C.; Cotman, C. W.; Glabe, C. G. Science 2003, 300, 486-489
4. Conway, K. A.; Lee, S. J.; Rochet, J. C.; Ding, T. T.; Williamson, R. E.; Lansbury, P. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 571-576
5. Winner, B.; Jappelli, R.; Maji, S. K.; Desplats, P. A.; Boyer, L.; Aigner, S.; Hetzer, C.; Loher, T.; Vilar, M.; Campionic, S.; Tzitzilonis, C.; Soragni, A.; Jessberger, S.; Mira, H.; Consiglio, A.; Pham, E.; Masliah, E.; Gage, F. H.; Riek, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 4194-4199
6. Reynolds, N. P.; Soragni, A.; Rabe, M.; Verdes, D.; Liverani, E.; Handschin, S.; Riek, R.; Seeger, S. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 19366-19375
7. Bellotti, V.; Mangione, P.; Merlini, G. J. Struct. Biol. 2000, 130, 280-289
8. Brandner, S.; Isenmann, S.; Raeber, A.; Fischer, M.; Sailer, A.; Kobayashi, Y.; Marino, S.; Weissmann, C.; Aguzzi, A. Nature 1996, 379, 339-343
9. Fowler, D. M.; Koulov, A. V.; Alory-Jost, C.; Marks, M. S.; Balch, W. E.; Kelly, J. W. PLoS Biol. 2006, 4, 100-107
10. Maji, S. K.; Perrin, M. H.; Sawaya, M. R.; Jessberger, S.; Vadodaria, K.; Rissman, R. A.; Singru, P. S.; Nilsson, K. P. R.; Simon, R.; Schubert, D.; Eisenberg, D.; Rivier, J.; Sawchenko, P.; Vale, W.; Riek, R. Science 2009, 325, 328-332
11. Greenwald, J.; Riek, R. Structure 2010, 18, 1244-1260
12. Knowles, T. P. J.; Buehler, M. J. Nat. Nanotechnol. 2011, 6, 469-479
13. Adamcik, J.; Lara, C.; Usov, I.; Jeong, J. S.; Ruggeri, F. S.; Dietler, G.; Lashuel, H. A.; Hamley, I. W.; Mezzenga, R. Nanoscale 2012, 4, 4426-4429
14. Reynolds, N. P.; Styan, K. E.; Easton, C. D.; Li, Y.; Waddington, L.; Lara, C.; Forsythe, J. S.; Mezzenga, R.; Hartley, P. G.; Muir, B. W. Biomacromolecules 2013, 14, 2305-2316
15. Bongiovanni, M. N.; Scanlon, D. B.; Gras, S. L. Biomaterials 2011, 32, 6099-6110
16. Cherny, I.; Gazit, E. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 4062-4069
17. Li, C.; Adamcik, J.; Mezzenga, R. Nat. Nanotechnol. 2012, 7, 421-427
18. Geddes, A. J.; Parker, K. D.; Atkins, E. D. T.; Beighton, E. J. Mol. Biol. 1968, 32, 343-344
19. Sunde, M.; Serpell, L. C.; Bartlam, M.; Fraser, P. E.; Pepys, M. B.; Blake, C. C. F. J. Mol. Biol. 1997, 273, 729-739
20. Guijarro, J. I.; Sunde, M.; Jones, J. A.; Campbell, I. D.; Dobson, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 4224-4228
21. Dobson, C. M. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 329-332
22. Cheng, P.-N.; Pham, J. D.; Nowick, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 5477-5492
23. Sawaya, M. R.; Sambashivan, S.; Nelson, R.; Ivanova, M. I.; Sievers, S. A.; Apostol, M. I.; Thompson, M. J.; Balbirnie, M.; Wiltzius, J. J. W.; McFarlane, H. T.; Madsen, A. O.; Riekel, C.; Eisenberg, D. Nature 2007, 447, 453-457
24. Marshall, K. E.; Serpell, L. C. Soft Matter 2010, 6, 2110-2114
25. Wiltzius, J. J. W.; Landau, M.; Nelson, R.; Sawaya, M. R.; Apostol, M. I.; Goldschmidt, L.; Soriaga, A. B.; Cascio, D.; Rajashankar, K.; Eisenberg, D. Nat. Struct. Mol. Biol. 2009, 16, 973-U98
26. Liu, L.; Busuttil, K.; Zhang, S.; Yang, Y.; Wang, C.; Besenbacher, F.; Dong, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 17435-17444
27. Scanlon, S.; Aggeli, A. Nano Today 2008, 3, 22-30
28. Silva, G. A.; Czeisler, C.; Niece, K. L.; Beniash, E.; Harrington, D. A.; Kessler, J. A.; Stupp, S. I. Science 2004, 303, 1352-1355
29. Arnaudov, L. N.; de Vries, R. Biophys. J. 2005, 88, 515-526
30. Frare, E.; de Laureto, P. P.; Zurdo, J.; Dobson, C. M.; Fontana, A. J. Mol. Biol. 2004, 340, 1153-1165
31. Tartaglia, G. G.; Pawar, A. P.; Campioni, S.; Dobson, C. M.; Chiti, F.; Vendruscolo, M. J. Mol. Biol. 2008, 380, 425-436
32. Frare, E.; Mossuto, M. F.; de Laureto, P. P.; Dumoulin, M.; Dobson, C. M.; Fontana, A. J. Mol. Biol. 2006, 361, 551-561
33. Lara, C.; Adamcik, J.; Jordens, S.; Mezzenga, R. Biomacromolecules 2011, 12, 1868-1875
34. Krebs, M. R. H.; Wilkins, D. K.; Chung, E. W.; Pitkeathly, M. C.; Chamberlain, A. K.; Zurdo, J.; Robinson, C. V.; Dobson, C. M. J. Mol. Biol. 2000, 300, 541-549
35. Thompson, M. J.; Sievers, S. A.; Karanicolas, J.; Ivanova, M. I.; Baker, D.; Eisenberg, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 4074-4078
36. Lara, C.; Handschin, S.; Mezzenga, R. Nanoscale 2013, 5, 7197-7201
37. Cenker, C. C.; Bucak, S.; Olsson, U. Soft Matter 2011, 7, 4868-4875
38. Ribo, J. M.; Crusats, J.; Sagues, F.; Claret, J.; Rubires, R. Science 2001, 292, 2063-2066
39. Volpatti, L. R.; Vendruscolo, M.; Dobson, C. M.; Knowles, T. P. J. ACS Nano 2013, 7, 10443-10448
40. Harper, J. D.; Lieber, C. M.; Lansbury, P. T. Chem. Biol. 1997, 4, 951-959
41. Koga, T.; Matsuoka, M.; Higashi, N. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17596-17597
42. Rubin, N.; Perugia, E.; Goldschmidt, M.; Fridkin, M.; Addadi, L. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4602-4603
43. Kurouski, D.; Dukor, R. K.; Lu, X.; Nafie, L. A.; Lednev, I. K. Biophys. J. 2012, 103, 522-531
44. Usov, I.; Adamcik, J.; Mezzenga, R. ACS Nano 2013, 7, 10465-10474
45. Kurouski, D.; Dukor, R. K.; Lu, X. F.; Nafie, L. A.; Lednev, I. K. Chem. Commun. 2012, 48, 2837-2839
46. Chung, D. S.; Benedek, G. B.; Konikoff, F. M.; Donovan, J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 11341-11345
47. Marshall, K. E.; Hicks, M. R.; Williams, T. L.; Hoffmann, S. V.; Rodger, A.; Dafforn, T. R.; Serpell, L. C. Biophys. J. 2010, 98, 330-338
48. Lewandowski, J. R.; van der Wel, P. C. A.; Rigney, M.; Grigorieff, N.; Griffin, R. G. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 14686-14698
49. Adamcik, J.; Jung, J.-M.; Flakowski, J.; De Los Rios, P.; Dietler, G.; Mezzenga, R. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 423-428
50. Najbar, L. V.; Craik, D. J.; Wade, J. D.; Salvatore, D.; McLeish, M. J. Biochemistry 1997, 36, 11525-11533
51. Yang, J. J.; Pitkeathly, M.; Radford, S. E. Biochemistry 1994, 33, 7345-7353
52. Manning, M. C.; Illangasekare, M.; Woody, R. W. Biophys. Chem. 1988, 31, 77-86
53. Glatter, O. Neutrons, X-rays and Light: Scattering Methods Applied to Soft Condensed Matter, 1 st ed.; Elsevier: Amsterdam, The Netherlands, 2002, pp 73-103.
54. Borsali, R.; Pecora, R. Soft Matter Characterization; Springer Science: New York, 2008, pp 57-68.
55. Pronchik, J.; He, X.; Giurleo, J. T.; Talaga, D. S. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 9797-9803
56. Rabe, M.; Soragni, A.; Reynolds, N. P.; Verdes, D.; Liverani, E.; Riek, R.; Seeger, S. ACS Chem. Neurosci. 2013, 4, 408-417
57. Gillam, J. E.; MacPhee, C. E. J. Phys.: Condens. Matter 2013, 25, 373101
58. Knowles, T. P. J.; Oppenheim, T. W.; Buell, A. K.; Chirgadze, D. Y.; Welland, M. E. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 204-207
59. Soininen, A. J.; Kasemi, E.; Schlueter, A. D.; Ikkala, O.; Ruokolainen, J.; Mezzenga, R. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 10882-10890
60. Mezzenga, R.; Fischer, P. Rep. Prog. Phys. 2013, 76, 046601
61. Nelson, R.; Sawaya, M. R.; Balbirnie, M.; Madsen, A. O.; Riekel, C.; Grothe, R.; Eisenberg, D. Nature 2005, 435, 773-778
62. Berryman, J. T.; Radford, S. E.; Harris, S. A. Biophys. J. 2009, 97, 1-11
63. Berryman, J. T.; Radford, S. E.; Harris, S. A. Biophys. J. 2011, 100, 2234-2242
64. Hoyer, W.; Antony, T.; Cherny, D.; Heim, G.; Jovin, T. M.; Subramaniam, V. J. Mol. Biol. 2002, 322, 383-393