193 nm ultraviolet photodissociation mass spectrometry for the structural elucidation of lipid a compounds in complex mixtures

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 4, 2014, Pages 2138-2145

  O'Brien, John P ^a   Needham, Brittany D ^b   Henderson, Jeremy C ^b   Nowicki, Emily M ^b   Trent, M Stephen ^b   Brodbelt, Jennifer S ^a  

^a University of Texas at Austin   (United States)

^b UNIVERSITY OF TEXAS AT AUSTIN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

LIPID A;

ARTICLE; CHEMISTRY; CONFORMATION; DRUG MIXTURE; MASS SPECTROMETRY; METHODOLOGY; X RAY PHOTOELECTRON SPECTROSCOPY;

COMPLEX MIXTURES; LIPID A; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR CONFORMATION; PHOTOELECTRON SPECTROSCOPY;

EID: 84894263140     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac403796n     Document Type: Article

References (61)

1. Raetz, C. R. H.; Whitfield, C. Annu. Rev. Biochem. 2002, 71, 635-700
2. Trent, M. S.; Stead, C. M.; Tran, A. X.; Hankins, J. V. J. Endotoxin Res. 2006, 12, 205-223
3. Raetz, C. R. H.; Reynolds, C. M.; Trent, M. S.; Bishop, R. E. Annu. Rev. Biochem. 2007, 76, 295-329
4. Casella, C. R.; Mitchell, T. C. Cell. Mol. Life Sci. 2008, 65, 3231-3240
5. Needham, B. D.; Carroll, S. M.; Giles, D. K.; Georgiou, G.; Whiteley, M.; Trent, M. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 1464-1469
6. Kilár, A.; Dörnyei, á.; Kocsis, B. Mass Spectrom. Rev. 2013, 32, 90-117
7. Banoub, J. H.; Aneed, A. E.; Cohen, A. M.; Joly, N. Mass Spectrom. Rev. 2010, 29, 606-650
8. Caroff, M.; Deprun, C.; Karibian, D. J. Biol. Chem. 1993, 268, 12321-12324
9. Deprun, C.; Karibian, D.; Caroff, M. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1993, 126, 187-190
10. Karibian, D.; Brunelle, A.; Aussel, L.; Caroff, M. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1999, 13, 2252-2259
11. Seid, R. C., Jr.; Bone, W. M.; Phillips, L. R. Anal. Biochem. 1986, 155, 168-176
12. Johnson, R. S.; Her, G. R.; Grabarek, J.; Hawiger, J.; Reinhold, V. N. J. Biol. Chem. 1990, 265, 8108-8116
13. Cole, R. B.; Harrata, A. K. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1992, 6, 536-539
14. Li, J.; Purves, R. W.; Richards, J. C. Anal. Chem. 2004, 76, 4676-4683
15. Casabuono, A. C.; van der Ploeg, C. A.; Rogé, A. D.; Bruno, S. B.; Couto, A. S. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2012, 26, 2011-2020
16. Ummarino, S.; Corsaro, M. M.; Lanzetta, R.; Parrilli, M.; Peter-Katalini, J. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2003, 17, 2226-2232
17. Cullen, T. W.; O'Brien, J. P.; Hendrixson, D. R.; Giles, D. K.; Hobb, R. I.; Thompson, S. A.; Brodbelt, J. S.; Trent, M. S. Infect. Immun. 2013, 81, 430-440
18. Silipo, A.; De Castro, C.; Lanzetta, R.; Molinaro, A.; Parrilli, M.; Vago, G.; Sturiale, L.; Messina, A.; Garozzo, D. J. Mass Spectrom. 2008, 43, 478-484
19. Jones, J. W.; Shaffer, S. A.; Ernst, R. K.; Goodlett, D. R.; Tureček, F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 12742-12747
20. Jones, J. W.; Cohen, I. E.; Turecîek, F.; Goodlett, D. R.; Ernst, R. K. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2010, 21, 785-799
21. Lukasiewicz, J.; Jachymek, W.; Niedziela, T.; Kenne, L.; Lugowski, C. J. Lipid Res. 2010, 51, 564-574
22. Ting, Y. S.; Shaffer, S. A.; Jones, J. W.; Ng, W. V.; Ernst, R. K.; Goodlett, D. R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 856-866
23. Schilling, B.; McLendon, M. K.; Phillips, N. J.; Apicella, M. A.; Gibson, B. W. Anal. Chem. 2007, 79, 1034-1042
24. Mikhail, I.; Yildirim, H. H.; Lindahl, E. C. H.; Schweda, E. K. H. Anal. Biochem. 2005, 340, 303-316
25. Shaffer, S. A.; Harvey, M. D.; Goodlett, D. R.; Ernst, R. K. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1080-1092
26. Kilár, A.; Dörnyei, á.; Bui, A.; Szabó, Z.; Kocsis, B.; Kilár, F. J. Mass Spectrom. 2011, 46, 61-70
27. El-Aneed, A.; Banoub, J. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2005, 19, 1683-1695
28. Madalinski, G.; Fournier, F.; Wind, F.-L.; Afonso, C.; Tabet, J.-C. Int. J. Mass Spectrom. 2006, 249-250, 77-92
29. Boué, S. M.; Cole, R. B. J. Mass Spectrom. 2000, 35, 361-368
30. Kussak, A.; Weintraub, A. Anal. Biochem. 2002, 307, 131-137
31. Chan, S.; Reinhold, V. N. Anal. Biochem. 1994, 218, 63-73
32. Yoon, S. H.; Huang, Y.; Edgar, J. S.; Ting, Y. S.; Heron, S. R.; Kao, Y.; Li, Y.; Masselon, C. D.; Ernst, R. K.; Goodlett, D. R. Anal. Chem. 2012, 84, 6530-6537
33. Madsen, J. A.; Cullen, T. W.; Trent, M. S.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2011, 83, 5107-5113
34. Hankins, J. V.; Madsen, J. A.; Giles, D. K.; Brodbelt, J. S.; Trent, M. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 8722-8727
35. Hankins, J. V.; Madsen, J. A.; Needham, B. D.; Brodbelt, J. S.; Trent, M. S. In Bacterial Cell Surfaces; Delcour, A. H., Ed.; Humana Press: Totowa, NJ, 2013; Vol. 966, pp 239-258.
36. Hankins, J. V.; Madsen, J. A.; Giles, D. K.; Childers, B. M.; Klose, K. E.; Brodbelt, J. S.; Trent, M. S. Mol. Microbiol. 2011, 81, 1313-1329
37. Henderson, J. C.; O'Brien, J. P.; Brodbelt, J. S.; Trent, M. S. J. Vis. Exp. 2013, 79, e50623
38. Reilly, J. P. Mass Spectrom. Rev. 2009, 28, 425-447
39. Brodbelt, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 197-206
40. Smith, S. I.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2010, 83, 303-310
41. Smith, S. I.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2010, 82, 7218-7226
42. Gabelica, V.; Rosu, F.; Pauw, E.; Antoine, R.; Tabarin, T.; Broyer, M.; Dugourd, P. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1990-2000
43. Rosu, F.; Gabelica, V.; De Pauw, E.; Antoine, R.; Broyer, M.; Dugourd, P. J. Phys. Chem. 2012, 116, 5383-5391
44. Ly, T.; Julian, R. R. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 7130-7137
45. Yoon, S. H.; Moon, J. H.; Kim, M. S. J. Mass Spectrom. 2010, 45, 806-814
46. Morgan, J. W.; Russell, D. H. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006, 17, 721-729
47. Guan, Z.; Kelleher, N. L.; O'Connor, P. B.; Aaserud, D. J.; Little, D. P.; McLafferty, F. W. Int. J. Mass Spectrom. Ion Process. 1996, 157-158, 357-364
48. Cotham, V. C.; Wine, Y.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2013, 85, 5577-5585
49. Shaw, J. B.; Li, W.; Holden, D. D.; Zhang, Y.; Griep-Raming, J.; Fellers, R. T.; Early, B. P.; Thomas, P. M.; Kelleher, N. L.; Brodbelt, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 12646-12651
50. O'Brien, J. P.; Pruet, J. M.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2013, 85, 7391-7397
51. Enjalbert, Q.; Girod, M.; Simon, R.; Jeudy, J.; Chirot, F.; Salvador, A.; Antoine, R.; Dugourd, P.; Lemoine, J. Anal. Bioanal. Chem. 2013, 405, 2321-2331
52. Diedrich, J. K.; Julian, R. R. Anal. Chem. 2010, 82, 4006-4014
53. Ko, B. J.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2011, 83, 8192-8200
54. Racaud, A.; Antoine, R.; Dugourd, P.; Lemoine, J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2010, 21, 2077-2084
55. Pham, H. T.; Ly, T.; Trevitt, A. J.; Mitchell, T. W.; Blanksby, S. J. Anal. Chem. 2012, 84, 7525-7532
56. Pham, H. T.; Trevitt, A. J.; Mitchell, T. W.; Blanksby, S. J. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2013, 27, 805-815
57. Devakumar, A.; O'Dell, D. K.; Walker, J. M.; Reilly, J. P. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 14-26
58. O'Brien, J. P.; Brodbelt, J. S. Anal. Chem. 2013, 85, 10399-10407
59. Palmer, K. L.; Aye, L. M.; Whiteley, M. J. Bacteriol. 2007, 189, 8079-8087
60. Park, B. S.; Song, D. H.; Kim, H. M.; Choi, B.-S.; Lee, H.; Lee, J.-O. Nature 2009, 458, 1191-1195
61. Ernst, R. K.; Hajjar, A. M.; Tsai, J. H.; Moskowitz, S. M.; Wilson, C. B.; Miller, S. I. J. Endotoxin Res. 2003, 9, 395-400