A highly sensitive targeted mass spectrometric assay for quantification of AGR2 protein in human urine and serum

Journal of Proteome Research

Volumn 13, Issue 2, 2014, Pages 875-882

  Shi, Tujin ^a   Gao, Yuqian ^a   Quek, Sue Ing ^c   Fillmore, Thomas L ^b   Nicora, Carrie D ^a   Su, Dian ^a   Zhao, Rui ^b   Kagan, Jacob ^d   Srivastava, Sudhir ^d   Rodland, Karin D ^a   Liu, Tao ^a   Smith, Richard D ^a   Chan, Daniel W ^e   Camp, David G ^a   Liu, Alvin Y ^c   Qian, Wei Jun ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

^b PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

^c UNIVERSITY OF WASHINGTON SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

^d NATIONAL CANCER INSTITUTE   (United States)

^e JOHNS HOPKINS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

AGR2; human serum; human urine; PRISM SRM; prostate cancer; PSA

Indexed keywords

AMINO ACID SEQUENCE; CALIBRATION; CHROMATOGRAPHY, REVERSE-PHASE; HUMANS; HYDROGEN-ION CONCENTRATION; LIMIT OF DETECTION; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEINS;

EID: 84893829147     PISSN: 15353893     EISSN: 15353907     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr400912c     Document Type: Article

References (37)

1. Siegel, R.; Naishadham, D.; Jemal, A. CA Cancer J. Clin. 2012, 62, 10
2. Cancer Facts & Figures 2012; American Cancer Society: Atlanta, GA, 2012.
3. Placer, J.; Morote, J. Arch. Esp. Urol. 2011, 64, 659
4. Tomlins, S. A. Eur. Urol. 2012, 10.1016/j.eururo.2012.11.014
5. Vlaeminck-Guillem, V.; Ruffion, A.; Andre, J. Prog. Urol. 2008, 18, 259
6. Tomlins, S. A.; Aubin, S. M.; Siddiqui, J.; Lonigro, R. J.; Sefton-Miller, L.; Miick, S.; Williamsen, S.; Hodge, P.; Meinke, J.; Blase, A.; Penabella, Y.; Day, J. R.; Varambally, R.; Han, B.; Wood, D.; Wang, L.; Sanda, M. G.; Rubin, M. A.; Rhodes, D. R.; Hollenbeck, B.; Sakamoto, K.; Silberstein, J. L.; Fradet, Y.; Amberson, J. B.; Meyers, S.; Palanisamy, N.; Rittenhouse, H.; Wei, J. T.; Groskopf, J.; Chinnaiyan, A. M. Sci. Transl. Med. 2011, 3, 94ra72
7. Maresh, E. L.; Mah, V.; Alavi, M.; Horvath, S.; Bagryanova, L.; Liebeskind, E. S.; Knutzen, L. A.; Zhou, Y.; Chia, D.; Liu, A. Y.; Goodglick, L. BMC Cancer 2010, 10, 680
8. Bu, H.; Bormann, S.; Schafer, G.; Horninger, W.; Massoner, P.; Neeb, A.; Lakshmanan, V. K.; Maddalo, D.; Nestl, A.; Sultmann, H.; Cato, A. C.; Klocker, H. Prostate 2011, 71, 575
9. Wayner, E. A.; Quek, S. I.; Ahmad, R.; Ho, M. E.; Loprieno, M. A.; Zhou, Y.; Ellis, W. J.; True, L. D.; Liu, A. Y. Prostate 2012, 72, 1023
10. Chevet, E.; Fessart, D.; Delom, F.; Mulot, A.; Vojtesek, B.; Hrstka, R.; Murray, E.; Gray, T.; Hupp, T. Oncogene 2012, 32, 2499-2509
11. Brychtova, V.; Vojtesek, B.; Hrstka, R. Cancer Lett. 2011, 304, 1
12. Barraclough, D. L.; Platt-Higgins, A.; de Silva Rudland, S.; Barraclough, R.; Winstanley, J.; West, C. R.; Rudland, P. S. Am. J. Pathol. 2009, 175, 1848
13. Hrstka, R.; Nenutil, R.; Fourtouna, A.; Maslon, M. M.; Naughton, C.; Langdon, S.; Murray, E.; Larionov, A.; Petrakova, K.; Muller, P.; Dixon, M. J.; Hupp, T. R.; Vojtesek, B. Oncogene 2010, 29, 4838
14. Pizzi, M.; Fassan, M.; Balistreri, M.; Galligioni, A.; Rea, F.; Rugge, M. Appl. Immunohistochem. Mol. Morphol. 2012, 20, 31
15. Fritzsche, F. R.; Dahl, E.; Dankof, A.; Burkhardt, M.; Pahl, S.; Petersen, I.; Dietel, M.; Kristiansen, G. Histol. Histopathol. 2007, 22, 703
16. Valladares-Ayerbes, M.; Blanco-Calvo, M.; Reboredo, M.; Lorenzo-Patino, M. J.; Iglesias-Diaz, P.; Haz, M.; Diaz-Prado, S.; Medina, V.; Santamarina, I.; Pertega, S.; Figueroa, A.; Anton-Aparicio, L. M. Int. J. Mol. Sci. 2012, 13, 4367
17. Rice, G. E.; Edgell, T. A.; Autelitano, D. J. J. Exp. Clin. Cancer Res. 2010, 29, 62
18. Edgell, T. A.; Barraclough, D. L.; Rajic, A.; Dhulia, J.; Lewis, K. J.; Armes, J. E.; Barraclough, R.; Rudland, P. S.; Rice, G. E.; Autelitano, D. J. Clin. Sci. (London) 2010, 118, 717
19. Vivekanandan, P.; Micchelli, S. T.; Torbenson, M. Hum. Pathol. 2009, 40, 293
20. Chen, R.; Pan, S.; Duan, X.; Nelson, B. H.; Sahota, R. A.; de Rham, S.; Kozarek, R. A.; McIntosh, M.; Brentnall, T. A. Mol. Cancer 2010, 9, 149
21. Dumartin, L.; Whiteman, H. J.; Weeks, M. E.; Hariharan, D.; Dmitrovic, B.; Iacobuzio-Donahue, C. A.; Brentnall, T. A.; Bronner, M. P.; Feakins, R. M.; Timms, J. F.; Brennan, C.; Lemoine, N. R.; Crnogorac-Jurcevic, T. Cancer Res. 2011, 71, 7091
22. Shi, T.; Su, D.; Liu, T.; Tang, K.; Camp, D. G., 2nd; Qian, W. J.; Smith, R. D. Proteomics 2012, 12, 1074
23. Picotti, P.; Aebersold, R. Nat. Methods 2012, 9, 555
24. Keshishian, H.; Addona, T.; Burgess, M.; Kuhn, E.; Carr, S. A. Mol. Cell. Proteomics 2007, 6, 2212
25. Hoofnagle, A. N.; Becker, J. O.; Wener, M. H.; Heinecke, J. W. Clin. Chem. 2008, 54, 1796
26. Whiteaker, J. R.; Zhao, L.; Abbatiello, S. E.; Burgess, M.; Kuhn, E.; Lin, C.; Pope, M. E.; Razavi, M.; Anderson, N. L.; Pearson, T. W.; Carr, S. A.; Paulovich, A. G. Mol. Cell. Proteomics 2011, 10 M110.005645
27. Shi, T.; Fillmore, T. L.; Sun, X.; Zhao, R.; Schepmoes, A. A.; Hossain, M.; Xie, F.; Wu, S.; Kim, J. S.; Jones, N.; Moore, R. J.; Pasa-Tolic, L.; Kagan, J.; Rodland, K. D.; Liu, T.; Tang, K.; Camp, D. G., 2nd; Smith, R. D.; Qian, W. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 15395
28. True, L. D.; Zhang, H.; Ye, M.; Huang, C. Y.; Nelson, P. S.; von Haller, P. D.; Tjoelker, L. W.; Kim, J. S.; Qian, W. J.; Smith, R. D.; Ellis, W. J.; Liebeskind, E. S.; Liu, A. Y. Mod. Pathol. 2010, 23, 1346-1356
29. Qian, W. J.; Kaleta, D. T.; Petritis, B. O.; Jiang, H.; Liu, T.; Zhang, X.; Mottaz, H. M.; Varnum, S. M.; Camp, D. G., 2nd; Huang, L.; Fang, X.; Zhang, W. W.; Smith, R. D. Mol. Cell. Proteomics 2008, 7, 1963
30. Fusaro, V. A.; Mani, D. R.; Mesirov, J. P.; Carr, S. A. Nat. Biotechnol. 2009, 27, 190
31. Eyers, C. E.; Lawless, C.; Wedge, D. C.; Lau, K. W.; Gaskell, S. J.; Hubbard, S. J. Mol. Cell. Proteomics 2011, 10 M110.003384
32. MacLean, B.; Tomazela, D. M.; Shulman, N.; Chambers, M.; Finney, G. L.; Frewen, B.; Kern, R.; Tabb, D. L.; Liebler, D. C.; MacCoss, M. J. Bioinformatics 2010, 26, 966
33. Marks, L. S.; Bostwick, D. G. Rev. Urol. 2008, 10, 175
34. Liu, T.; Hossain, M.; Schepmoes, A. A.; Fillmore, T. L.; Sokoll, L. J.; Kronewitter, S. R.; Izmirlian, G.; Shi, T.; Qian, W.-J.; Leach, R. J.; Tompson, I. M.; Chan, D. W.; Smith, R. D.; Kagan, J.; Srivastava, S.; Rodland, K. D.; Camp, D. G. J. Proteomics 2012, 75, 4747-4757
35. Shi, T.; Sun, X.; Gao, Y.; Fillmore, T. L.; Schepmoes, A. A.; Zhao, R.; He, J.; Moore, R. J.; Kagan, J.; Rodland, K. D.; Liu, T.; Liu, A. Y.; Smith, R. D.; Tang, K.; Camp, D. G., 2nd; Qian, W. J. J. Proteome Res. 2013, 12, 3353
36. Zhang, J. S.; Gong, A.; Cheville, J. C.; Smith, D. I.; Young, C. Y. Genes Chromosomes Cancer 2005, 43, 249
37. Kani, K.; Malihi, P. D.; Jiang, Y.; Wang, H.; Wang, Y.; Ruderman, D. L.; Agus, D. B.; Mallick, P.; Gross, M. E. Prostate 2012, 73, 306-315