A microfluidic device for multiplex single-nucleotide polymorphism genotyping

RSC Advances

Volumn 4, Issue 9, 2014, Pages 4269-4277

  Zhu, Jing ^a   Qiu, Chunmei ^b   Palla, Mirkó ^a,b   Nguyen, Thaihuu ^a   Russo, James J ^b   Ju, Jingyue ^b   Lin, Qiao ^a  

^a Och Spine at New York Presbyterian Hospitals   (United States)

^b NONE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AUTOMATED OPERATIONS; DIAGNOSIS AND PROGNOSIS; HIGH-THROUGHPUT ASSAYS; MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION/IONIZATION-TIME-OF-FLIGHT MASS SPECTROMETRY; MICRO-FLUIDIC DEVICES; SIMULTANEOUS DETECTION; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS; SINGLE-BASE EXTENSIONS;

DNA SEQUENCES; FLUIDIC DEVICES; MASS SPECTROMETRY; MICROFLUIDICS; MULTIPLEXING;

DIAGNOSIS;

EID: 84891478280     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3ra44091e     Document Type: Article

References (30)

1. R. Sachidanandam D. Weissman S. C. Schmidt J. M. Kakol L. D. Stein G. Marth S. Sherry J. C. Mullikin B. J. Mortimore D. L. Willey S. E. Hunt C. G. Cole P. C. Coggill C. M. Rice Z. Ning J. Rogers D. R. Bentley P. Y. Kwok E. R. Mardis R. T. Yeh B. Schultz L. Cook R. Davenport M. Dante L. Fulton L. Hillier R. H. Waterston J. D. McPherson B. Gilman S. Schaffner W. J. Van Etten D. Reich J. Higgins M. J. Daly B. Blumenstiel J. Baldwin N. Stange-Thomann M. C. Zody L. Linton E. S. Lander D. Altshuler Nature 2001 409 928 933
2. G. Bollag P. Hirth J. Tsai J. Zhang P. N. Ibrahim H. Cho W. Spevak C. Zhang Y. Zhang G. Habets E. A. Burton B. Wong G. Tsang B. L. West B. Powell R. Shellooe A. Marimuthu H. Nguyen K. Y. Zhang D. R. Artis J. Schlessinger F. Su B. Higgins R. Iyer K. D'Andrea A. Koehler M. Stumm P. S. Lin R. J. Lee J. Grippo I. Puzanov K. B. Kim A. Ribas G. A. McArthur J. A. Sosman P. B. Chapman K. T. Flaherty X. Xu K. L. Nathanson K. Nolop Nature 2010 467 596 599
3. P. T. C. Wan M. J. Garnett S. M. Roe S. Lee D. Niculescu-Duvaz V. M. Good C. G. Project C. M. Jones C. J. Marshall C. J. Springer D. Barford R. Marais Cell 2004 116 855 867
4. R. Kudchadkar K. H. Paraiso K. S. Smalley Cancer J. 2012 18 124 131
5. M. Ota H. Fukushima J. K. Kulski H. Inoko Nat. Protoc. 2007 2 2857 2864
6. G. H. McGall F. C. Christians Adv. Biochem. Eng./Biotechnol. 2002 77 21 42
7. D. Schleinitz J. K. Distefano P. Kovacs Methods Mol. Biol. 2011 700 77 87
8. U. Landegren R. Kaiser J. Sanders L. Hood Science 1988 241 1077 1080
9. R. Palacios D. Comas J. Elorza P. Villoslada J. Neuroimmunol. 2008 203 108 115
10. Y. Zhang P. Ozdemir Anal. Chim. Acta 2009 638 115 125
11. N. Beyor L. Yi T. S. Seo R. A. Mathies Anal. Chem. 2009 81 3523 3528
12. R. H. Liu M. J. Lodes T. Nguyen T. Siuda M. Slota H. S. Fuji A. McShea Anal. Chem. 2006 78 4184 4193
13. J. K. K. Ng H. H. Feng W. T. Liu Anal. Chim. Acta 2007 582 295 303
14. R. D. Sochol B. P. Casavant M. E. Dueck L. P. Lee L. Lin J. Micromech. Microeng. 2011 21 054019
15. J. Chowdhury G. V. Kagiala S. Pushpakom J. Lauzon A. Makin A. Atrazhev A. Stickel W. G. Newman C. J. Backhouse L. M. Pilarski J. Mol. Diagn. 2007 9 521 529
16. J. Wang M. Lin A. Crenshaw A. Hutchinson B. Hicks M. Yeager S. Berndt W. Y. Huang R. B. Hayes S. J. Chanock R. C. Jones R. Ramakrishnan BMC Genomics 2009 10 561
17. M. Chan M. W. Chan T. W. Loh H. Y. Law C. S. Yoon S. S. Than J. M. Chua C. Y. Wong W. S. Yong Y. S. Yap G. H. Ho P. Ang A. S. Lee J. Mol. Diagn. 2011 13 305 312
18. Y. He J. Wu D. C. Dressman C. Iacobuzio-Donahue S. D. Markowitz V. E. Velculescu L. A. Diaz, Jr. K. W. Kinzler B. Vogelstein N. Papadopoulos Nature 2010 464 610 614
19. M. Gundry J. Vijg Mutat. Res. 2012 729 1 15
20. S. Gabriel, L. Ziaugra and D. Tabbaa, Curr Protoc Hum Genet, 2009, ch. 2, unit 2 12
21. S. Kim H. D. Ruparel T. C. Gilliam J. Ju Nat. Rev. Genet. 2003 4 1001 1008
22. J. Zhu M. Palla S. Ronca R. Wapner J. Ju Q. Lin Sens. Actuators, A 2013 195 175 182
23. Y. S. Shin K. Cho S. H. Lim S. Chung S. J. Park C. Chung D. C. Han J. K. Chang J. Micromech. Microeng. 2003 13 768 774
24. C. Qiu S. Kumar J. Guo L. Yu W. Guo S. Shi J. J. Russo J. Ju Anal. Biochem. 2012 427 193 201
25. M. A. Unger H. P. Chou T. Thorsen A. Scherer S. R. Quake Science 2000 288 113 116
26. C. Qiu S. Kumar J. Guo J. Lu S. Shi S. M. Kalachikov J. J. Russo A. B. Naini E. A. Schon J. Ju Anal. Biochem. 2012 427 202 210
27. M. G. Pluskal Nat. Biotechnol. 2000 18 104 105
28. C. E. C. A. Hop R. Bakhtiar Biospectroscopy 1997 3 259 280
29. J. White Model. Simulat. Eng 2012 2012 651434
30. T. Nguyen R. Pei M. Stojanovic Q. Lin Microfluid. Nanofluid. 2009 6 479 487