Multistep DNA-templated synthesis using a universal template

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 47, 2013, Pages 17727-17730

  Li, Yizhou ^a   Zhao, Peng ^a   Zhang, Mingda ^a   Zhao, Xianyuan ^a   Li, Xiaoyu ^a  

^a PEKING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BASE-PAIRING; DEOXYINOSINE; DESIGN FEATURES; DIRECT ENCODING; DNA-TEMPLATE; DNA-TEMPLATED SYNTHESIS; MULTI-STEP; TARGET SELECTION;

CHEMISTRY; SYNTHESIS (CHEMICAL);

DNA;

DEOXYINOSINE; DNA;

ARTICLE; CHEMICAL REACTION; CHEMICAL STRUCTURE; DNA CLEAVAGE; DNA LIBRARY; DNA SEQUENCE; DNA TEMPLATE; SYNTHESIS;

BASE PAIRING; BASE SEQUENCE; DNA; GENE LIBRARY; MOLECULAR SEQUENCE DATA;

EID: 84889241150     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja409936r     Document Type: Article

References (41)

1. Brenner, S.; Lerner, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 5381-5383
2. Nielsen, J.; Brenner, S.; Janda, K. D.. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9812-9813
3. Needels, M. C.; Jones, D. G.; Tate, E. H.; Heinkel, G. L.; Kochersperger, L. M.; Dower, W. J.; Barrett, R. W.; Gallop, M. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 10700-10704
4. Halpin, D. R.; Harbury, P. B. PLoS Biol. 2004, 2, 1015-1021
5. Scheuermann, J.; Dumelin, C. E.; Melkko, S.; Neri, D. J. Biotechnol. 2006, 126, 568-581
6. Melkko, S.; Dumelin, C. E.; Scheuermann, J.; Neri, D. Drug Discovery Today 2007, 12, 465-471
7. Silverman, S. K. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 7180-7201
8. Clark, M. A. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 396-403
9. Kleiner, R. E.; Dumelin, C. E.; Liu, D. R. Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 5707-5717
10. Mannocci, L.; Leimbacher, M.; Wichert, M.; Scheuermann, J.; Neri, D. Chem. Commun. 2011, 47, 12747-12753
11. Daguer, J. P.; Ciobanu, C.; Alvarez, S.; Barluenga, S.; Winssinger, N. Chem. Sci. 2011, 2, 625-632
12. Clark, M. A.; Acharya, R. A.; Arico-Muendel, C. C.; Belyanskaya, S. L.; Benjamin, D. R.; Carlson, N. R.; Centrella, P. A.; Chiu, C. H.; Creaser, S. P.; Cuozzo, J. W.; Davie, C. P.; Ding, Y.; Franklin, G. J.; Franzen, K. D.; Gefter, M. L.; Hale, S. P.; Hansen, N. J. V.; Israel, D. I.; Jiang, J. W.; Kavarana, M. J.; Kelley, M. S.; Kollmann, C. S.; Li, F.; Lind, K.; Mataruse, S.; Medeiros, P. F.; Messer, J. A.; Myers, P.; O'Keefe, H.; Oliff, M. C.; Rise, C. E.; Satz, A. L.; Skinner, S. R.; Svendsen, J. L.; Tang, L. J.; van Vloten, K.; Wagner, R. W.; Yao, G.; Zhao, B. G.; Morgan, B. A. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 647-654
13. Mannocci, L.; Zhang, Y. X.; Scheuermann, J.; Leimbacher, M.; De Bellis, G.; Rizzi, E.; Dumelin, C.; Melkko, S.; Neri, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 17670-17675
14. Buller, F.; Mannocci, L.; Zhang, Y.; Dumelin, C. E.; Scheuermann, J.; Neri, D. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 5926-5931
15. Buller, F.; Zhang, Y.; Scheuermann, J.; Schafer, J.; Buhlmann, P.; Neri, D. Chem. Biol. 2009, 16, 1075-1086
16. Kleiner, R. E.; Dumelin, C. E.; Tiu, G. C.; Sakurai, K.; Liu, D. R. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 11779-11791
17. Buller, F.; Steiner, M.; Frey, K.; Mircsof, D.; Scheuermann, J.; Kalisch, M.; Buhlmann, P.; Supuran, C. T.; Neri, D. ACS Chem. Biol. 2011, 6, 336-344
18. Gartner, Z. J.; Liu, D. R. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 6961-6963
19. Gartner, Z. J.; Tse, B. N.; Grubina, R.; Doyon, J. B.; Snyder, T. M.; Liu, D. R. Science 2004, 305, 1601-1605
20. Tse, B. N.; Snyder, T. M.; Shen, Y. H.; Liu, D. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 15611-15626
21. Summerer, D.; Marx, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 89-90
22. Silverman, A. P.; Kool, E. T. Chem. Rev. 2006, 106, 3775-3789
23. Gorska, K.; Huang, K. T.; Chaloin, O.; Winssinger, N. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 7695-7700
24. Boersma, A. J.; Megens, R. P.; Feringa, B. L.; Roelfes, G. Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 2083-2092
25. Xu, L.; Liu, D. Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 150-155
26. Diezmann, F.; Seitz, O. Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 5789-5801
27. Englund, E. A.; Wang, D.; Fujigaki, H.; Sakai, H.; Micklitsch, C. M.; Ghirlando, R.; Martin-Manso, G.; Pendrak, M. L.; Roberts, D. D.; Durell, S. R.; Appella, D. H. Nat. Commun. 2012, 3, 614
28. Gorska, K.; Winssinger, N. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 6820-6843
29. Furka, A.; Sebestyen, F.; Asgedom, M.; Dibo, G. Int. J. Pept. Protein Res. 1991, 37, 487-493
30. Snyder, T. M.; Tse, B. N.; Liu, D. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 1392-1401
31. Melkko, S.; Scheuermann, J.; Dumelin, C. E.; Neri, D. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 568-574
32. Hansen, M. H.; Blakskjaer, P.; Petersen, L. K.; Hansen, T. H.; Hojfeldt, J. W.; Gothelf, K. V.; Hansen, N. J. V. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1322-1327
33. Martin, F. H.; Castro, M. M.; Aboul-ela, F.; Tinoco, I., Jr. Nucleic Acids Res. 1985, 13, 8927-8938
34. Loakes, D. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 2437-2447
35. Gartner, Z. J.; Grubina, R.; Calderone, C. T.; Liu, D. R. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 1370-1375
36. Ordoukhanian, P.; Taylor, J. S. Bioconjugate Chem. 2000, 11, 94-103
37. Ordoukhanian, P.; Taylor, J. S. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9570-9571
38. Li, Y.; Zhang, M.; Zhang, C.; Li, X. Chem. Commun. 2012, 48, 9513-9515
39. Gartner, Z. J.; Kanan, M. W.; Liu, D. R. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10304-10306
40. Hojfeldt, J. W.; Blakskjaer, P.; Gothelf, K. V. J. Org. Chem. 2006, 71, 9556-9559
41. Mincione, F.; Starnotti, M.; Menabuoni, L.; Scozzafava, A.; Casini, A.; Supuran, C. T. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2001, 11, 1787-1791