Targeted disruption of transcriptional regulators in chaetomium globosum activates biosynthetic pathways and reveals transcriptional regulator-like behavior of aureonitol

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 36, 2013, Pages 13446-13455

  Nakazawa, Takehito ^a   Ishiuchi, Kan'Ichiro ^a,c   Sato, Michio ^a   Tsunematsu, Yuta ^a   Sugimoto, Satoru ^a   Gotanda, Yasutaka ^a   Noguchi, Hiroshi ^a   Hotta, Kinya ^b   Watanabe, Kenji ^a  

^a UNIVERSITY OF SHIZUOKA   (Japan)

^b UNIVERSITY OF NOTTINGHAM MALAYSIA CAMPUS   (Malaysia)

^c NIHON UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL FUNCTIONS; BIOSYNTHETIC PATHWAY; EPIGENETIC SILENCING; GENETIC MANIPULATIONS; HOMOLOGOUS RECOMBINATION; POST-GENOMIC ANALYSIS; SECONDARY METABOLITES; TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

BIOCHEMISTRY; BIOSYNTHESIS; FUNGI; GENES; MICROORGANISMS; MOLECULAR BIOLOGY;

METABOLITES;

ARTICLE; BIOSYNTHESIS; CHAETOMIUM; CONTROLLED STUDY; GENE CLUSTER; GENE DISRUPTION; GENE ISOLATION; GENE SILENCING; GENETIC MANIPULATION; HOMOLOGOUS RECOMBINATION; MOLECULAR GENETICS; NONHUMAN;

BIOSYNTHETIC PATHWAYS; CHAETOMIUM; FURANS; TRANSCRIPTION FACTORS;

EID: 84884181693     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja405128k     Document Type: Article

References (65)

1. Bergmann, S.; Schümann, J.; Scherlach, K.; Lange, C.; Brakhage, A. A.; Hertweck, C. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 213
2. Bok, J. W.; Chiang, Y. M.; Szewczyk, E.; Reyes-Dominguez, Y.; Davidson, A. D.; Sanchez, J. F.; Lo, H. C.; Watanabe, K.; Strauss, J.; Oakley, B. R.; Wang, C. C.; Keller, N. P. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 462
3. Nützmann, H. W.; Reyes-Dominguez, Y.; Scherlach, K.; Schroeckh, V.; Horn, F.; Gacek, A.; Schümann, J.; Hertweck, C.; Strauss, J.; Brakhage, A. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 14282
4. Asai, T.; Yamamoto, T.; Oshima, Y. Org. Lett. 2012, 14, 2006
5. Ishiuchi, K.; Nakazawa, T.; Ookuma, T.; Sugimoto, S.; Sato, M.; Tsunematsu, Y.; Ishikawa, N.; Noguchi, H.; Hotta, K.; Moriya, H.; Watanabe, K. ChemBioChem 2012, 13, 846
6. Nakazawa, T.; Ishiuchi, K.; Praseuth, A.; Noguchi, H.; Hotta, K.; Watanabe, K. ChemBioChem 2012, 13, 855
7. Bode, H. B.; Müller, R. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 6828
8. Stewart, E. J. J. Bacteriol. 2012, 194, 4151
9. Wenzel, S. C.; Müller, R. Curr. Opin. Biotechnol. 2005, 16, 594
10. Brakhage, A. A.; Schroeckh, V. Fungal Genet. Biol. 2011, 48, 15
11. Hansen, B. G.; Salomonsen, B.; Nielsen, M. T.; Nielsen, J. B.; Hansen, N. B.; Nielsen, K. F.; Regueira, T. B.; Nielsen, J.; Patil, K. R.; Mortensen, U. H. Appl. Environ. Microbiol. 2011, 77, 3044
12. Qiao, K.; Chooi, Y. H.; Tang, Y. Metab. Eng. 2011, 13, 723
13. An, Z.; Mei, B.; Yuan, W. M.; Leong, S. A. EMBO J. 1997, 16, 1742
14. Cichewicz, R. H. Nat. Prod. Rep. 2010, 27, 11
15. Bayram, Ö.; Braus, G. H. FEMS Microbiol. Rev. 2012, 36, 1
16. Eriksson, P. R.; Ganguli, D.; Clark, D. J. Mol. Cell. Biol. 2011, 31, 557
17. Shwab, E. K.; Bok, J. W.; Tribus, M.; Galehr, J.; Graessle, S.; Keller, N. P. Eukaryotic Cell 2007, 6, 1656
18. Binninger, D. M.; Skrzynia, C.; Pukkila, P. J.; Casselton, L. A. EMBO J. 1987, 6, 835
19. Ishibashi, K.; Suzuki, K.; Ando, Y.; Takakura, C.; Inoue, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 14871
20. Mizutani, O.; Kudo, Y.; Saito, A.; Matsuura, T.; Inoue, H.; Abe, K.; Gomi, K. Fungal Genet. Biol. 2008, 45, 878
21. Johnson, M.; Zaretskaya, I.; Raytselis, Y.; Merezhuk, Y.; McGinnis, S.; Madden, T. L. Nucleic Acids Res. 2008, 36, W5
22. Cummings, W. J.; Celerin, M.; Crodian, J.; Brunick, L. K.; Zolan, M. E. Curr. Genet. 1999, 36, 371
23. Calvo, A. M.; Wilson, R. A.; Bok, J. W.; Keller, N. P. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2002, 66, 447
24. Yu, J. H.; Keller, N. Annu. Rev. Phytopathol. 2005, 43, 437
25. Bayram, O.; Krappmann, S.; Ni, M.; Bok, J. W.; Helmstaedt, K.; Valerius, O.; Braus-Stromeyer, S.; Kwon, N. J.; Keller, N. P.; Yu, J. H.; Braus, G. H. Science 2008, 320, 1504
26. Calvo, A. M.; Bok, J.; Brooks, W.; Keller, N. P. Appl. Environ. Microbiol. 2004, 70, 4733
27. Bok, J. W.; Keller, N. P. Eukaryotic Cell 2004, 3, 527
28. Takahashi, M.; Koyama, K.; Natori, S. Chem. Pharm. Bull. (Tokyo) 1990, 38, 625
29. Borges, W. S.; Mancilla, G.; Guimarães, D. O.; Durán- Patrón, R.; Collado, I. G.; Pupo, M. T. J. Nat. Prod. 2011, 74, 1182
30. Jiao, W.; Feng, Y.; Blunt, J. W.; Cole, A. L.; Munro, M. H. J. Nat. Prod. 2004, 67, 1722
31. Zhang, J.; Ge, H. M.; Jiao, R. H.; Li, J.; Peng, H.; Wang, Y. R.; Wu, J. H.; Song, Y. C.; Tan, R. X. Planta Med. 2010, 76, 1910
32. Winter, J. M.; Sato, M.; Sugimoto, S.; Chiou, G.; Garg, N. K.; Tang, Y.; Watanabe, K. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 17900
33. Käfer, E. Genetics 1965, 52, 217
34. Wiemann, P.; Brown, D. W.; Kleigrewe, K.; Bok, J. W.; Keller, N. P.; Humpf, H. U.; Tudzynski, B. Mol. Microbiol. 2010, 77, 972
35. Bok, J. W.; Noordermeer, D.; Kale, S. P.; Keller, N. P. Mol. Microbiol. 2006, 61, 1636
36. Perrin, R. M.; Fedorova, N. D.; Bok, J. W.; Cramer, R. A.; Wortman, J. R.; Kim, H. S.; Nierman, W. C.; Keller, N. P. PLoS Pathog. 2007, 3 e50
37. Weidner, G.; d'Enfert, C.; Koch, A.; Mol, P. C.; Brakhage, A. A. Curr. Genet. 1998, 33, 378
38. Jerram, W. A.; McInnes, A. G.; Maass, W. S. G.; Smith, D. G.; Taylor, A.; Walter, J. A. Can. J. Chem. 1975, 53, 727
39. McMullin, D. R.; Sumarah, M. W.; Blackwell, B. A.; Miller, J. D. Tetrahedron Lett. 2013, 54, 568
40. Balibar, C. J.; Howard-Jones, A. R.; Walsh, C. T. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 584
41. Arai, N.; Shiomi, K.; Tomoda, H.; Tabata, N.; Yang, D. J.; Masuma, R.; Kawakubo, T.; Omura, S. J. Antibiot. (Tokyo) 1995, 48, 696
42. Ge, H. M.; Zhang, Q.; Xu, S. H.; Guo, Z. K.; Song, Y. C.; Huang, W. Y.; Tan, R. X. Planta Med. 2011, 77, 277
43. Marwah, R. G.; Fatope, M. O.; Deadman, M. L.; Al-Maqbali, Y. M.; Husband, J. Tetrahedron 2007, 63, 8174
44. Burrows, B. F.; Turner, W. B.; Walker, E. R. H. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1 1975, 999
45. Saito, M.; Seto, H.; Yonehara, H. Agric. Biol. Chem. 1983, 47, 2935
46. Abraham, W.-R.; Arfmann, H.-A. Phytochemistry 1992, 31, 2405
47. Sekita, S.; Yoshihira, K.; Natori, S.; Kuwano, H. Chem. Pharm. Bull. (Tokyo) 1982, 30, 1629
48. Phonkerd, N.; Kanokmedhakul, S.; Kanokmedhakul, K.; Soytong, K.; Prabpai, S.; Kongsearee, P. Tetrahedron 2008, 64, 9636
49. Ge, H. M.; Zhang, W. Y.; Ding, G.; Saparpakorn, P.; Song, Y. C.; Hannongbua, S.; Tan, R. X. Chem. Commun. 2008, 5978
50. Ishiuchi, K.; Nakazawa, T.; Yagishita, F.; Mino, T.; Noguchi, H.; Hotta, K.; Watanabe, K. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 7371
51. Reyes-Dominguez, Y.; Bok, J. W.; Berger, H.; Shwab, E. K.; Basheer, A.; Gallmetzer, A.; Scazzocchio, C.; Keller, N.; Strauss, J. Mol. Microbiol. 2010, 76, 1376
52. Chang, J. S.; Winston, F. Eukaryotic Cell 2011, 10, 118
53. Asai, T.; Morita, S.; Shirata, N.; Taniguchi, T.; Monde, K.; Sakurai, H.; Ozeki, T.; Oshima, Y. Org. Lett. 2012, 14, 5456
54. Wei, W. G.; Yao, Z. J. J. Org. Chem. 2005, 70, 4585
55. Davison, J.; al Fahad, A.; Cai, M.; Song, Z.; Yehia, S. Y.; Lazarus, C. M.; Bailey, A. M.; Simpson, T. J.; Cox, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 7642
56. Garvey, G. S.; McCormick, S. P.; Alexander, N. J.; Rayment, I. Protein Sci. 2009, 18, 747
57. Niemetz, R.; Gross, G. G. Phytochemistry 2003, 64, 1197
58. Seto, H.; Shibamiya, M.; Yonehara, H. J. Antibiot. (Tokyo) 1978, 31, 926
59. Komatsu, M.; Uchiyama, T.; Omura, S.; Cane, D. E.; Ikeda, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 2646
60. Ng, W. L.; Bassler, B. L. Annu. Rev. Genet. 2009, 43, 197
61. Horinouchi, S. Biosci., Biotechnol., Biochem. 2007, 71, 283
62. Höfer, I.; Crüsemann, M.; Radzom, M.; Geers, B.; Flachshaar, D.; Cai, X.; Zeeck, A.; Piel, J. Chem. Biol. 2011, 18, 381
63. van Rij, E. T.; Girard, G.; Lugtenberg, B. J.; Bloemberg, G. V. Microbiology 2005, 151, 2805
64. Martín, J.; García-Estrada, C.; Kosalková, K.; Ullán, R. V.; Albillos, S. M.; Martín, J. F. Fungal Genet. Biol. 2012, 49, 1004
65. Inaoka, T.; Ochi, K. J. Bacteriol. 2007, 189, 65