SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 10, 2013, Pages 2530-2540

In silico modeling and evaluation of Gordonia alkanivorans for biodesulfurization

(3) Aggarwal, Shilpi a Karimi, I A a Reinaldi Ivan, Gregorius a

a NATIONAL UNIVERSITY OF SINGAPORE (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACID; CARBON; GLUCOSE; SULFUR DERIVATIVE; VITAMIN; CULTURE MEDIUM;

ARTICLE; BIOLOGICAL MODEL; BIOTRANSFORMATION; COMPUTER SIMULATION; CULTURE MEDIUM; GENETIC ASSOCIATION; GENETICS; GORDONIA; GROWTH, DEVELOPMENT AND AGING; METABOLISM; REPRODUCIBILITY;

AMINO ACIDS; BIOTRANSFORMATION; CARBON; COMPUTER SIMULATION; CULTURE MEDIA; GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY; GLUCOSE; GORDONIA BACTERIUM; MODELS, BIOLOGICAL; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SULFUR COMPOUNDS; VITAMINS;

EID: 84883414986 PISSN: 1742206X EISSN: 17422051 Source Type: Journal
DOI: 10.1039/c3mb70132h Document Type: Article

Times cited : (42)

References (47)

1
- 34648819846
- M. Soleimani A. Bassi A. Margaritis Biotechnol. Adv. 2007 25 570 596
- (2007) Biotechnol. Adv. , vol.25 , pp. 570-596
- Soleimani, M.¹ Bassi, A.² Margaritis, A.³

2
- 0141988541
- C. Song Catal. Today 2003 86 211 263
- (2003) Catal. Today , vol.86 , pp. 211-263
- Song, C.¹

3
- 0026953962
- J. J. Kilbane II K. Jackowski Biotechnol. Bioeng. 1992 40 1107 1114
- (1992) Biotechnol. Bioeng. , vol.40 , pp. 1107-1114
- Kilbane II, J.J.¹ Jackowski, K.²

4
- 0036384908
- K. J. Kayser L. Cleveland H. S. Park J. H. Kwak A. Kolhatkar J. J. Kilbane II Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002 59 737 745
- (2002) Appl. Microbiol. Biotechnol. , vol.59 , pp. 737-745
- Kayser, K.J.¹ Cleveland, L.² Park, H.S.³ Kwak, J.H.⁴ Kolhatkar, A.⁵ Kilbane II, J.J.⁶

5
- 19944415310
- L. Alves R. Salgueiro C. Rodrigues E. Mesquita J. Matos F. M. Gírio Appl. Biochem. Biotechnol. 2005 120 199 208
- (2005) Appl. Biochem. Biotechnol. , vol.120 , pp. 199-208
- Alves, L.¹ Salgueiro, R.² Rodrigues, C.³ Mesquita, E.⁴ Matos, J.⁵ Gírio, F.M.⁶

6
- 2942595803
- M. Arenskötter D. Bröker A. Steinbüchel Appl. Environ. Microbiol. 2004 70 3195 3204
- (2004) Appl. Environ. Microbiol. , vol.70 , pp. 3195-3204
- Arenskötter, M.¹ Bröker, D.² Steinbüchel, A.³

7
- 33947583840
- L. Alves M. Melo D. Mendonça F. Simões J. Matos R. Tenreiro F. M. Gírio Enzyme Microb. Technol. 2007 40 1598 1603
- (2007) Enzyme Microb. Technol. , vol.40 , pp. 1598-1603
- Alves, L.¹ Melo, M.² Mendonça, D.³ Simões, F.⁴ Matos, J.⁵ Tenreiro, R.⁶ Gírio, F.M.⁷

8
- 34547403662
- J. J. Kilbane II J. Robbins Appl. Microbiol. Biotechnol. 2007 75 843 851
- (2007) Appl. Microbiol. Biotechnol. , vol.75 , pp. 843-851
- Kilbane II, J.J.¹ Robbins, J.²

9
- 33745504739
- S. C. C. Santos D. S. Alviano C. S. Alviano M. Pádula A. C. Leitão O. B. Martins C. M. S. Ribeiro M. Y. M. Sassaki C. P. S. Matta J. Bevilaqua G. V. Sebastián L. Seldin Appl. Microbiol. Biotechnol. 2006 71 355 362
- (2006) Appl. Microbiol. Biotechnol. , vol.71 , pp. 355-362
- Santos, S.C.C.¹ Alviano, D.S.² Alviano, C.S.³ Pádula, M.⁴ Leitão, A.C.⁵ Martins, O.B.⁶ Ribeiro, C.M.S.⁷ Sassaki, M.Y.M.⁸ Matta, C.P.S.⁹ Bevilaqua, J.¹⁰ Sebastián, G.V.¹¹ Seldin, L.¹²

10
- 50249172792
- G. Q. Li S. S. Li S. W. Qu Q. K. Liu T. Ma L. Zhu F. L. Liang R. L. Liu Biotechnol. Lett. 2008 30 1759 1764
- (2008) Biotechnol. Lett. , vol.30 , pp. 1759-1764
- Li, G.Q.¹ Li, S.S.² Qu, S.W.³ Liu, Q.K.⁴ Ma, T.⁵ Zhu, L.⁶ Liang, F.L.⁷ Liu, R.L.⁸

11
- 0344972732
- S. K. Rhee J. H. Chang Y. K. Chang H. N. Chang Appl. Environ. Microbiol. 1998 64 2327 2331
- (1998) Appl. Environ. Microbiol. , vol.64 , pp. 2327-2331
- Rhee, S.K.¹ Chang, J.H.² Chang, Y.K.³ Chang, H.N.⁴

12
- 51349091821
- M. Shavandi M. Sadeghizadeh A. Zomorodipour K. Khajeh Bioresour. Technol. 2008 100 475 479
- (2008) Bioresour. Technol. , vol.100 , pp. 475-479
- Shavandi, M.¹ Sadeghizadeh, M.² Zomorodipour, A.³ Khajeh, K.⁴

13
- 80052387208
- L. Alves S. M. Paixão Bioresour. Technol. 2011 102 9162 9166
- (2011) Bioresour. Technol. , vol.102 , pp. 9162-9166
- Alves, L.¹ Paixão, S.M.²

14
- 0029829688
- K. A. Gray O. S. Pogrebinsky G. T. Mrachko L. Xi D. J. Monticello C. H. Squires Nat. Biotechnol. 1996 14 1705 1708
- (1996) Nat. Biotechnol. , vol.14 , pp. 1705-1708
- Gray, K.A.¹ Pogrebinsky, O.S.² Mrachko, G.T.³ Xi, L.⁴ Monticello, D.J.⁵ Squires, C.H.⁶

15
- 33847289637
- G. Mohebali A. S. Ball B. Rasekh A. Kaytash Enzyme Microb. Technol. 2007 40 578 584
- (2007) Enzyme Microb. Technol. , vol.40 , pp. 578-584
- Mohebali, G.¹ Ball, A.S.² Rasekh, B.³ Kaytash, A.⁴

16
- 57549102595
- M. Durot P. Y. Bourguignon V. Schachter FEMS Microbiol. Rev. 2009 33 164 190
- (2009) FEMS Microbiol. Rev. , vol.33 , pp. 164-190
- Durot, M.¹ Bourguignon, P.Y.² Schachter, V.³

17
- 34347332311
- A. M. Feist C. S. Henry J. L. Reed M. Krummenacker A. R. Joyce P. D. Karp L. J. Broadbelt V. Hatzimanikatis B. Ø. Palsson Mol. Syst. Biol. 2007 3 121
- (2007) Mol. Syst. Biol. , vol.3 , pp. 121
- Feist, A.M.¹ Henry, C.S.² Reed, J.L.³ Krummenacker, M.⁴ Joyce, A.R.⁵ Karp, P.D.⁶ Broadbelt, L.J.⁷ Hatzimanikatis, V.⁸ Palsson B.Ø⁹

18
- 0034625143
- J. S. Edwards B. O. Palsson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 5528 5533
- (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.97 , pp. 5528-5533
- Edwards, J.S.¹ Palsson, B.O.²

19
- 78651462647
- S. Aggarwal I. A. Karimi D. Y. Lee FEMS Microbiol. Lett. 2011 315 115 121
- (2011) FEMS Microbiol. Lett. , vol.315 , pp. 115-121
- Aggarwal, S.¹ Karimi, I.A.² Lee, D.Y.³

20
- 80054041941
- S. Aggarwal I. A. Karimi D. Y. Lee Mol. BioSyst. 2011 7 3122 3131
- (2011) Mol. BioSyst. , vol.7 , pp. 3122-3131
- Aggarwal, S.¹ Karimi, I.A.² Lee, D.Y.³

21
- 0344824417
- I. Famili J. Förster J. Nielsen B. O. Palsson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 13134 13139
- (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.100 , pp. 13134-13139
- Famili, I.¹ Förster, J.² Nielsen, J.³ Palsson, B.O.⁴

22
- 3843128481
- N. C. Duarte M. J. Herrgård B. Ø. Palsson Genome Res. 2004 14 1298 1309
- (2004) Genome Res. , vol.14 , pp. 1298-1309
- Duarte, N.C.¹ Herrgård, M.J.² Palsson, B.O.³

23
- 78751658356
- H. Widiastuti J. Y. Kim S. Selvarasu I. A. Karimi H. Kim J. S. Seo D. Y. Lee Biotechnol. Bioeng. 2011 108 655 665
- (2011) Biotechnol. Bioeng. , vol.108 , pp. 655-665
- Widiastuti, H.¹ Kim, J.Y.² Selvarasu, S.³ Karimi, I.A.⁴ Kim, H.⁵ Seo, J.S.⁶ Lee, D.Y.⁷

24
- 72949118860
- S. Selvarasu I. A. Karimi G. H. Ghim D. Y. Lee Mol. BioSyst. 2009 6 152 161
- (2009) Mol. BioSyst. , vol.6 , pp. 152-161
- Selvarasu, S.¹ Karimi, I.A.² Ghim, G.H.³ Lee, D.Y.⁴

25
- 63549149545
- S. Selvarasu V. V. T. Wong I. A. Karimi D. Y. Lee Biotechnol. Bioeng. 2009 102 1494 1504
- (2009) Biotechnol. Bioeng. , vol.102 , pp. 1494-1504
- Selvarasu, S.¹ Wong, V.V.T.² Karimi, I.A.³ Lee, D.Y.⁴

26
- 1642457253
- R. Mahadevan C. H. Schilling Metab. Eng. 2003 5 264 276
- (2003) Metab. Eng. , vol.5 , pp. 264-276
- Mahadevan, R.¹ Schilling, C.H.²

27
- 74549189330
- B. K. S. Chung D. Y. Lee BMC Syst. Biol. 2009 3 117
- (2009) BMC Syst. Biol. , vol.3 , pp. 117
- Chung, B.K.S.¹ Lee, D.Y.²

28
- 0034795348
- T. Matsui T. Onaka K. Maruhashi R. Kurane Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001 57 212 215
- (2001) Appl. Microbiol. Biotechnol. , vol.57 , pp. 212-215
- Matsui, T.¹ Onaka, T.² Maruhashi, K.³ Kurane, R.⁴

29
- 75549089640
- J. Gao L. B. M. Ellis L. P. Wackett Nucleic Acids Res. 2010 38 D488 D491
- (2010) Nucleic Acids Res. , vol.38
- Gao, J.¹ Ellis, L.B.M.² Wackett, L.P.³

30
- 26444496648
- S. Iida H. Taniguchi A. Kageyama K. Yazawa H. Chibana S. Murata F. Nomura R. M. Kroppenstedt Y. Mikami Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 55 1871 1876
- (2005) Int. J. Syst. Evol. Microbiol. , vol.55 , pp. 1871-1876
- Iida, S.¹ Taniguchi, H.² Kageyama, A.³ Yazawa, K.⁴ Chibana, H.⁵ Murata, S.⁶ Nomura, F.⁷ Kroppenstedt, R.M.⁸ Mikami, Y.⁹

31
- 0004250729
- Prentice Hall International, London
- R. K. Murray, D. K. Granner and P. A. R. V. W. Mayes, Harper's Biochemistry, Prentice Hall International, London, 1996
- (1996) Harper's Biochemistry
- Murray, R.K.¹ Granner, D.K.² Mayes, P.A.R.V.W.³

32
- 18844399657
- C. H. Del Olmo A. Alcon V. E. Santos F. Garcia-Ochoa Enzyme Microb. Technol. 2005 37 157 166
- (2005) Enzyme Microb. Technol. , vol.37 , pp. 157-166
- Del Olmo, C.H.¹ Alcon, A.² Santos, V.E.³ Garcia-Ochoa, F.⁴

33
- 0031972055
- H. Honda H. Sugiyama I. Saito T. Kobayashi J. Ferment. Bioeng. 1998 85 334 338
- (1998) J. Ferment. Bioeng. , vol.85 , pp. 334-338
- Honda, H.¹ Sugiyama, H.² Saito, I.³ Kobayashi, T.⁴

34
- 0034114656
- H. Yan M. Kishimoto T. Omasa Y. Katakura K. I. Suga K. Okumura O. Yoshikawa J. Biosci. Bioeng. 2000 89 361 366
- (2000) J. Biosci. Bioeng. , vol.89 , pp. 361-366
- Yan, H.¹ Kishimoto, M.² Omasa, T.³ Katakura, Y.⁴ Suga, K.I.⁵ Okumura, K.⁶ Yoshikawa, O.⁷

35
- 43449097526
- H. Yan X. Sun Q. Xu Z. Ma C. Xiao N. Jun J. Environ. Sci. 2008 20 613 618
- (2008) J. Environ. Sci. , vol.20 , pp. 613-618
- Yan, H.¹ Sun, X.² Xu, Q.³ Ma, Z.⁴ Xiao, C.⁵ Jun, N.⁶

36
- 0042417059
- E. Franchi F. Rodriguez L. Serbolisca F. de Ferra Oil Gas Sci. Technol. 2003 58 515 520
- (2003) Oil Gas Sci. Technol. , vol.58 , pp. 515-520
- Franchi, E.¹ Rodriguez, F.² Serbolisca, L.³ De Ferra, F.⁴

37
- 0031715972
- S. C. Gilbert J. Morton S. Buchanan C. Oldfield A. McRoberts Microbiology 1998 144 2545 2553
- (1998) Microbiology , vol.144 , pp. 2545-2553
- Gilbert, S.C.¹ Morton, J.² Buchanan, S.³ Oldfield, C.⁴ McRoberts, A.⁵

38
- 79959946634
- R. Saha P. F. Suthers C. D. Maranas PLoS One 2011 6 e21784
- (2011) PLoS One , vol.6 , pp. 21784
- Saha, R.¹ Suthers, P.F.² Maranas, C.D.³

39
- 40549120596
- R. K. Aziz D. Bartels A. Best M. DeJongh T. Disz R. A. Edwards K. Formsma S. Gerdes E. M. Glass M. Kubal F. Meyer G. J. Olsen R. Olson A. L. Osterman R. A. Overbeek L. K. McNeil D. Paarmann T. Paczian B. Parrello G. D. Pusch C. Reich R. Stevens O. Vassieva V. Vonstein A. Wilke O. Zagnitko BMC Genomics 2008 9 75
- (2008) BMC Genomics , vol.9 , pp. 75
- Aziz, R.K.¹ Bartels, D.² Best, A.³ Dejongh, M.⁴ Disz, T.⁵ Edwards, R.A.⁶ Formsma, K.⁷ Gerdes, S.⁸ Glass, E.M.⁹ Kubal, M.¹⁰ Meyer, F.¹¹ Olsen, G.J.¹² Olson, R.¹³ Osterman, A.L.¹⁴ Overbeek, R.A.¹⁵ McNeil, L.K.¹⁶ Paarmann, D.¹⁷ Paczian, T.¹⁸ Parrello, B.¹⁹ Pusch, G.D.²⁰ more..

40
- 0033982936
- M. Kanehisa S. Goto Nucleic Acids Res. 2000 28 27 30
- (2000) Nucleic Acids Res. , vol.28 , pp. 27-30
- Kanehisa, M.¹ Goto, S.²

41
- 38549117301
- R. Caspi H. Foerster C. A. Fulcher P. Kaipa M. Krummenacker M. Latendresse S. Paley S. Y. Rhee A. G. Shearer C. Tissier T. C. Walk P. Zhang P. D. Karp Nucleic Acids Res. 2008 36 D623 D631
- (2008) Nucleic Acids Res. , vol.36
- Caspi, R.¹ Foerster, H.² Fulcher, C.A.³ Kaipa, P.⁴ Krummenacker, M.⁵ Latendresse, M.⁶ Paley, S.⁷ Rhee, S.Y.⁸ Shearer, A.G.⁹ Tissier, C.¹⁰ Walk, T.C.¹¹ Zhang, P.¹² Karp, P.D.¹³

42
- 34547676311
- V. Satish Kumar M. S. Dasika C. D. Maranas BMC Bioinf. 2007 8 212
- (2007) BMC Bioinf. , vol.8 , pp. 212
- Satish Kumar, V.¹ Dasika, M.S.² Maranas, C.D.³

43
- 9344245047
- GAMS Development Corporation, Washington, DC
- A. Brooke, D. Kendrick, A. Meeraus and R. Raman, GAMS a User's Guide, GAMS Development Corporation, Washington, DC, 1998
- (1998) GAMS A User's Guide
- Brooke, A.¹ Kendrick, D.² Meeraus, A.³ Raman, R.⁴

44
- 0038293216
- A. P. Burgard C. D. Maranas Biotechnol. Bioeng. 2003 82 670 677
- (2003) Biotechnol. Bioeng. , vol.82 , pp. 670-677
- Burgard, A.P.¹ Maranas, C.D.²

45
- 58249089508
- K. R. Kjeldsen J. Nielsen Biotechnol. Bioeng. 2009 102 583 597
- (2009) Biotechnol. Bioeng. , vol.102 , pp. 583-597
- Kjeldsen, K.R.¹ Nielsen, J.²

46
- 69249154275
- Y. Shinfuku N. Sorpitiporn M. Sono C. Furusawa T. Hirasawa H. Shimizu Microb. Cell Fact. 2009 8 43
- (2009) Microb. Cell Fact. , vol.8 , pp. 43
- Shinfuku, Y.¹ Sorpitiporn, N.² Sono, M.³ Furusawa, C.⁴ Hirasawa, T.⁵ Shimizu, H.⁶

47
- 0242475329
- D. Y. Lee H. Yun S. Park S. Y. Lee Bioinformatics 2003 19 2144 214
- (2003) Bioinformatics , vol.19 , pp. 2144-2146
- Lee, D.Y.¹ Yun, H.² Park, S.³ Lee, S.Y.⁴

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.