SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 10, 2013, Pages 2401-2407

Signalling pathway database usability: Lessons learned

(2) Tieri, Paolo a,b Nardini, Christine a

a MAX PLANCK INSTITUTE (Germany)

b CNR (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGY; GENETIC DATABASE; HUMAN; INTERNET; PROCEDURES; SIGNAL TRANSDUCTION; ARTICLE; METHODOLOGY;

COMPUTATIONAL BIOLOGY; DATABASES, GENETIC; HUMANS; INTERNET; SIGNAL TRANSDUCTION;

EID: 84883325240 PISSN: 1742206X EISSN: 17422051 Source Type: Journal
DOI: 10.1039/c3mb70242a Document Type: Review

Times cited : (14)

References (43)

1
- 0033951108
- G. A. Evans Nat. Biotechnol. 2000 18 127
- (2000) Nat. Biotechnol. , vol.18 , pp. 127
- Evans, G.A.¹

2
- 84863190431
- T. Groves F. Godlee Br. Med. J. 2012 344 e4383
- (2012) Br. Med. J. , vol.344
- Groves, T.¹ Godlee, F.²

3
- 18344396568
- A. Brazma P. Hingamp J. Quackenbush G. Sherlock P. Spellman C. Stoeckert J. Aach W. Ansorge C. A. Ball H. C. Causton T. Gaasterland P. Glenisson F. C. Holstege I. F. Kim V. Markowitz J. C. Matese H. Parkinson A. Robinson U. Sarkans S. Schulze-Kremer J. Stewart R. Taylor J. Vilo M. Vingron Nat. Genet. 2001 29 365 371
- (2001) Nat. Genet. , vol.29 , pp. 365-371
- Brazma, A.¹ Hingamp, P.² Quackenbush, J.³ Sherlock, G.⁴ Spellman, P.⁵ Stoeckert, C.⁶ Aach, J.⁷ Ansorge, W.⁸ Ball, C.A.⁹ Causton, H.C.¹⁰ Gaasterland, T.¹¹ Glenisson, P.¹² Holstege, F.C.¹³ Kim, I.F.¹⁴ Markowitz, V.¹⁵ Matese, J.C.¹⁶ Parkinson, H.¹⁷ Robinson, A.¹⁸ Sarkans, U.¹⁹ Schulze-Kremer, S.²⁰ more..

4
- 34249107988
- S. Orchard L. Salwinski S. Kerrien L. Montecchi-Palazzi M. Oesterheld V. Stümpflen A. Ceol A. Chatr-aryamontri J. Armstrong P. Woollard J. J. Salama S. Moore J. Wojcik G. D. Bader M. Vidal M. E. Cusick M. Gerstein A. C. Gavin G. Superti-Furga J. Greenblatt J. Bader P. Uetz M. Tyers P. Legrain S. Fields N. Mulder M. Gilson M. Niepmann L. Burgoon J. De Las Rivas C. Prieto V. M. Perreau C. Hogue H. W. Mewes R. Apweiler I. Xenarios D. Eisenberg G. Cesareni H. Hermjakob Nat. Biotechnol. 2007 25 894 898
- (2007) Nat. Biotechnol. , vol.25 , pp. 894-898
- Orchard, S.¹ Salwinski, L.² Kerrien, S.³ Montecchi-Palazzi, L.⁴ Oesterheld, M.⁵ Stümpflen, V.⁶ Ceol, A.⁷ Chatr-Aryamontri, A.⁸ Armstrong, J.⁹ Woollard, P.¹⁰ Salama, J.J.¹¹ Moore, S.¹² Wojcik, J.¹³ Bader, G.D.¹⁴ Vidal, M.¹⁵ Cusick, M.E.¹⁶ Gerstein, M.¹⁷ Gavin, A.C.¹⁸ Superti-Furga, G.¹⁹ Greenblatt, J.²⁰ more..

5
- 42049114671
- S. Orchard H. Hermjakob Briefings Bioinf. 2008 9 166 173
- (2008) Briefings Bioinf. , vol.9 , pp. 166-173
- Orchard, S.¹ Hermjakob, H.²

6
- 79952424916
- J. Mendelsohn T. Tursz R. L. Schilsky V. Lazar Nat. Rev. Clin. Oncol. 2011 8 133 134
- (2011) Nat. Rev. Clin. Oncol. , vol.8 , pp. 133-134
- Mendelsohn, J.¹ Tursz, T.² Schilsky, R.L.³ Lazar, V.⁴

7
- 77956300684
- G. Wu L. Zhu J. E. Dent C. Nardini PLoS One 2010 5 e10137
- (2010) PLoS One , vol.5 , pp. 10137
- Wu, G.¹ Zhu, L.² Dent, J.E.³ Nardini, C.⁴

8
- 0037941585
- E. Segal M. Shapira A. Regev D. Pe'er D. Botstein D. Koller N. Friedman Nat. Genet. 2003 34 166 176
- (2003) Nat. Genet. , vol.34 , pp. 166-176
- Segal, E.¹ Shapira, M.² Regev, A.³ Pe'Er, D.⁴ Botstein, D.⁵ Koller, D.⁶ Friedman, N.⁷

9
- 79953125078
- R. Fronza M. Tramonti W. R. Atchley C. Nardini BMC Bioinf. 2011 12 86
- (2011) BMC Bioinf. , vol.12 , pp. 86
- Fronza, R.¹ Tramonti, M.² Atchley, W.R.³ Nardini, C.⁴

10
- 84867722812
- C. G. A. R. Network Nature 2011 474 609 615
- (2011) Nature , vol.474 , pp. 609-615
- Network, C.G.A.R.¹

11
- 70449331456
- R. Shen A. B. Olshen M. Ladanyi Bioinformatics 2009 25 2906 2912
- (2009) Bioinformatics , vol.25 , pp. 2906-2912
- Shen, R.¹ Olshen, A.B.² Ladanyi, M.³

12
- 77954195272
- C. J. Vaske S. C. Benz J. Z. Sanborn D. Earl C. Szeto J. Zhu D. Haussler J. M. Stuart Bioinformatics 2010 26 i237 i245
- (2010) Bioinformatics , vol.26
- Vaske, C.J.¹ Benz, S.C.² Sanborn, J.Z.³ Earl, D.⁴ Szeto, C.⁵ Zhu, J.⁶ Haussler, D.⁷ Stuart, J.M.⁸

13
- 78650647490
- E. Caron S. Ghosh Y. Matsuoka D. Ashton-Beaucage M. Therrien S. Lemieux C. Perreault P. P. Roux H. Kitano Mol. Syst. Biol. 2010 6 453
- (2010) Mol. Syst. Biol. , vol.6 , pp. 453
- Caron, E.¹ Ghosh, S.² Matsuoka, Y.³ Ashton-Beaucage, D.⁴ Therrien, M.⁵ Lemieux, S.⁶ Perreault, C.⁷ Roux, P.P.⁸ Kitano, H.⁹

14
- 84857706271
- P. Tieri A. Termanini E. Bellavista S. Salvioli M. Capri C. Franceschi PLoS One 2012 7 e32678
- (2012) PLoS One , vol.7 , pp. 32678
- Tieri, P.¹ Termanini, A.² Bellavista, E.³ Salvioli, S.⁴ Capri, M.⁵ Franceschi, C.⁶

15
- 84858983547
- M. Kanehisa S. Goto Y. Sato M. Furumichi M. Tanabe Nucleic Acids Res. 2012 40 D109 D114
- (2012) Nucleic Acids Res. , vol.40
- Kanehisa, M.¹ Goto, S.² Sato, Y.³ Furumichi, M.⁴ Tanabe, M.⁵

16
- 0038745614
- L. D. Stein Nat. Rev. Genet. 2003 4 337 345
- (2003) Nat. Rev. Genet. , vol.4 , pp. 337-345
- Stein, L.D.¹

17
- 44449113812
- G. A. Viswanathan J. Seto S. Patil G. Nudelman S. C. Sealfon PLoS Comput. Biol. 2008 4 e16
- (2008) PLoS Comput. Biol. , vol.4
- Viswanathan, G.A.¹ Seto, J.² Patil, S.³ Nudelman, G.⁴ Sealfon, S.C.⁵

19
- 0037342537
- M. Hucka A. Finney H. M. Sauro H. Bolouri J. C. Doyle H. Kitano A. P. Arkin B. J. Bornstein D. Bray A. Cornish-Bowden A. A. Cuellar S. Dronov E. D. Gilles M. Ginkel V. Gor I. I. Goryanin W. J. Hedley T. C. Hodgman J. H. Hofmeyr P. J. Hunter N. S. Juty J. L. Kasberger A. Kremling U. Kummer N. Le Novère L. M. Loew D. Lucio P. Mendes E. Minch E. D. Mjolsness Y. Nakayama M. R. Nelson P. F. Nielsen T. Sakurada J. C. Schaff B. E. Shapiro T. S. Shimizu H. D. Spence J. Stelling K. Takahashi M. Tomita J. Wagner J. Wang S. Forum Bioinformatics 2003 19 524 531
- (2003) Bioinformatics , vol.19 , pp. 524-531
- Hucka, M.¹ Finney, A.² Sauro, H.M.³ Bolouri, H.⁴ Doyle, J.C.⁵ Kitano, H.⁶ Arkin, A.P.⁷ Bornstein, B.J.⁸ Bray, D.⁹ Cornish-Bowden, A.¹⁰ Cuellar, A.A.¹¹ Dronov, S.¹² Gilles, E.D.¹³ Ginkel, M.¹⁴ Gor, V.¹⁵ Goryanin, I.I.¹⁶ Hedley, W.J.¹⁷ Hodgman, T.C.¹⁸ Hofmeyr, J.H.¹⁹ Hunter, P.J.²⁰ more..

20
- 68449103579
- N. Le Novere M. Hucka H. Mi S. Moodie F. Schreiber A. Sorokin E. Demir K. Wegner M. I. Aladjem S. M. Wimalaratne F. T. Bergman R. Gauges P. Ghazal H. Kawaji L. Li Y. Matsuoka A. Villeger S. E. Boyd L. Calzone M. Courtot U. Dogrusoz T. C. Freeman A. Funahashi S. Ghosh A. Jouraku S. Kim F. Kolpakov A. Luna S. Sahle E. Schmidt S. Watterson G. Wu I. Goryanin D. B. Kell C. Sander H. Sauro J. L. Snoep K. Kohn H. Kitano Nat. Biotechnol. 2009 27 735 741
- (2009) Nat. Biotechnol. , vol.27 , pp. 735-741
- Le Novere, N.¹ Hucka, M.² Mi, H.³ Moodie, S.⁴ Schreiber, F.⁵ Sorokin, A.⁶ Demir, E.⁷ Wegner, K.⁸ Aladjem, M.I.⁹ Wimalaratne, S.M.¹⁰ Bergman, F.T.¹¹ Gauges, R.¹² Ghazal, P.¹³ Kawaji, H.¹⁴ Li, L.¹⁵ Matsuoka, Y.¹⁶ Villeger, A.¹⁷ Boyd, S.E.¹⁸ Calzone, L.¹⁹ Courtot, M.²⁰ more..

21
- 67149131701
- D. A. Beard R. Britten M. T. Cooling A. Garny M. D. Halstead P. J. Hunter J. Lawson C. M. Lloyd J. Marsh A. Miller D. P. Nickerson P. M. Nielsen T. Nomura S. Subramanium S. M. Wimalaratne T. Yu Philos. Trans. R. Soc., A 2009 367 1845 1867
- (2009) Philos. Trans. R. Soc., A , vol.367 , pp. 1845-1867
- Beard, D.A.¹ Britten, R.² Cooling, M.T.³ Garny, A.⁴ Halstead, M.D.⁵ Hunter, P.J.⁶ Lawson, J.⁷ Lloyd, C.M.⁸ Marsh, J.⁹ Miller, A.¹⁰ Nickerson, D.P.¹¹ Nielsen, P.M.¹² Nomura, T.¹³ Subramanium, S.¹⁴ Wimalaratne, S.M.¹⁵ Yu, T.¹⁶

22
- 35348976204
- S. Kerrien S. Orchard L. Montecchi-Palazzi B. Aranda A. F. Quinn N. Vinod G. D. Bader I. Xenarios J. Wojcik D. Sherman M. Tyers J. J. Salama S. Moore A. Ceol A. Chatr-Aryamontri M. Oesterheld V. Stümpflen L. Salwinski J. Nerothin E. Cerami M. E. Cusick M. Vidal M. Gilson J. Armstrong P. Woollard C. Hogue D. Eisenberg G. Cesareni R. Apweiler H. Hermjakob BMC Biol. 2007 5 44
- (2007) BMC Biol. , vol.5 , pp. 44
- Kerrien, S.¹ Orchard, S.² Montecchi-Palazzi, L.³ Aranda, B.⁴ Quinn, A.F.⁵ Vinod, N.⁶ Bader, G.D.⁷ Xenarios, I.⁸ Wojcik, J.⁹ Sherman, D.¹⁰ Tyers, M.¹¹ Salama, J.J.¹² Moore, S.¹³ Ceol, A.¹⁴ Chatr-Aryamontri, A.¹⁵ Oesterheld, M.¹⁶ Stümpflen, V.¹⁷ Salwinski, L.¹⁸ Nerothin, J.¹⁹ Cerami, E.²⁰ more..

23
- 0036500993
- H. Kitano Science 2002 1662 1664
- (2002) Science , pp. 1662-1664
- Kitano, H.¹

24
- 33745588546
- A. C. Ahn M. Tewari C. S. Poon R. S. Phillips PLoS Med. 2006 3 e208
- (2006) PLoS Med. , vol.3 , pp. 208
- Ahn, A.C.¹ Tewari, M.² Poon, C.S.³ Phillips, R.S.⁴

26
- 34247535331
- A. Kuek B. L. Hazleman A. J. Ostör Postgrad. Med. J. 2007 83 251 260
- (2007) Postgrad. Med. J. , vol.83 , pp. 251-260
- Kuek, A.¹ Hazleman, B.L.² Ostör, A.J.³

27
- 79955663460
- A. D. Proal P. J. Albert G. P. Blaney I. A. Lindseth C. Benediktsson T. G. Marshall Cell. Mol. Immunol. 2011 8 213 225
- (2011) Cell. Mol. Immunol. , vol.8 , pp. 213-225
- Proal, A.D.¹ Albert, P.J.² Blaney, G.P.³ Lindseth, I.A.⁴ Benediktsson, C.⁵ Marshall, T.G.⁶

28
- 79955623575
- E. Ballestar Nat. Rev. Rheumatol. 2011 7 263 271
- (2011) Nat. Rev. Rheumatol. , vol.7 , pp. 263-271
- Ballestar, E.¹

29
- 84855172814
- I. B. McInnes G. Schett N. Engl. J. Med. 2011 365 2205 2219
- (2011) N. Engl. J. Med. , vol.365 , pp. 2205-2219
- McInnes, I.B.¹ Schett, G.²

30
- 33644873677
- G. D. Bader M. P. Cary C. Sander Nucleic Acids Res. 2006 34 D504 D506
- (2006) Nucleic Acids Res. , vol.34
- Bader, G.D.¹ Cary, M.P.² Sander, C.³

31
- 51049113607
- D. J. Lynn G. L. Winsor C. Chan N. Richard M. R. Laird A. Barsky J. L. Gardy F. M. Roche T. H. Chan N. Shah R. Lo M. Naseer J. Que M. Yau M. Acab D. Tulpan M. D. Whiteside A. Chikatamarla B. Mah T. Munzner K. Hokamp R. E. Hancock F. S. Brinkman Mol. Syst. Biol. 2008 4 218
- (2008) Mol. Syst. Biol. , vol.4 , pp. 218
- Lynn, D.J.¹ Winsor, G.L.² Chan, C.³ Richard, N.⁴ Laird, M.R.⁵ Barsky, A.⁶ Gardy, J.L.⁷ Roche, F.M.⁸ Chan, T.H.⁹ Shah, N.¹⁰ Lo, R.¹¹ Naseer, M.¹² Que, J.¹³ Yau, M.¹⁴ Acab, M.¹⁵ Tulpan, D.¹⁶ Whiteside, M.D.¹⁷ Chikatamarla, A.¹⁸ Mah, B.¹⁹ Munzner, T.²⁰ more..

32
- 84555188306
- M. Kotera M. Hirakawa T. Tokimatsu S. Goto M. Kanehisa Methods Mol. Biol. 2012 802 19 39
- (2012) Methods Mol. Biol. , vol.802 , pp. 19-39
- Kotera, M.¹ Hirakawa, M.² Tokimatsu, T.³ Goto, S.⁴ Kanehisa, M.⁵

33
- 78651332286
- E. G. Cerami B. E. Gross E. Demir I. Rodchenkov O. Babur N. Anwar N. Schultz G. D. Bader C. Sander Nucleic Acids Res. 2011 39 D685 D690
- (2011) Nucleic Acids Res. , vol.39
- Cerami, E.G.¹ Gross, B.E.² Demir, E.³ Rodchenkov, I.⁴ Babur, O.⁵ Anwar, N.⁶ Schultz, N.⁷ Bader, G.D.⁸ Sander, C.⁹

34
- 58149186477
- C. F. Schaefer K. Anthony S. Krupa J. Buchoff M. Day T. Hannay K. H. Buetow Nucleic Acids Res. 2009 37 D674 D679
- (2009) Nucleic Acids Res. , vol.37
- Schaefer, C.F.¹ Anthony, K.² Krupa, S.³ Buchoff, J.⁴ Day, M.⁵ Hannay, T.⁶ Buetow, K.H.⁷

35
- 78651275182
- D. Croft G. O'Kelly G. Wu R. Haw M. Gillespie L. Matthews M. Caudy P. Garapati G. Gopinath B. Jassal S. Jupe I. Kalatskaya S. Mahajan B. May N. Ndegwa E. Schmidt V. Shamovsky C. Yung E. Birney H. Hermjakob P. D'Eustachio L. Stein Nucleic Acids Res. 2011 39 D691 D697
- (2011) Nucleic Acids Res. , vol.39
- Croft, D.¹ O'Kelly, G.² Wu, G.³ Haw, R.⁴ Gillespie, M.⁵ Matthews, L.⁶ Caudy, M.⁷ Garapati, P.⁸ Gopinath, G.⁹ Jassal, B.¹⁰ Jupe, S.¹¹ Kalatskaya, I.¹² Mahajan, S.¹³ May, B.¹⁴ Ndegwa, N.¹⁵ Schmidt, E.¹⁶ Shamovsky, V.¹⁷ Yung, C.¹⁸ Birney, E.¹⁹ Hermjakob, H.²⁰ D'Eustachio, P.²¹ Stein, L.²² more..

36
- 84862203775
- T. Kelder M. P. van Iersel K. Hanspers M. Kutmon B. R. Conklin C. T. Evelo A. R. Pico Nucleic Acids Res. 2012 40 D1301 D1307
- (2012) Nucleic Acids Res. , vol.40
- Kelder, T.¹ Van Iersel, M.P.² Hanspers, K.³ Kutmon, M.⁴ Conklin, B.R.⁵ Evelo, C.T.⁶ Pico, A.R.⁷

37
- 48349105261
- A. R. Pico T. Kelder M. P. van Iersel K. Hanspers B. R. Conklin C. Evelo PLoS Biol. 2008 6 e184
- (2008) PLoS Biol. , vol.6
- Pico, A.R.¹ Kelder, T.² Van Iersel, M.P.³ Hanspers, K.⁴ Conklin, B.R.⁵ Evelo, C.⁶

38
- 80053980945
- M. D. Stobbe S. M. Houten G. A. Jansen A. H. van Kampen P. D. Moerland BMC Syst. Biol. 2011 5 165
- (2011) BMC Syst. Biol. , vol.5 , pp. 165
- Stobbe, M.D.¹ Houten, S.M.² Jansen, G.A.³ Van Kampen, A.H.⁴ Moerland, P.D.⁵

39
- 77956480115
- D. Soh D. Dong Y. Guo L. Wong BMC Bioinf. 2010 11 449
- (2010) BMC Bioinf. , vol.11 , pp. 449
- Soh, D.¹ Dong, D.² Guo, Y.³ Wong, L.⁴

40
- 62849094483
- I. Fraser R. Germain Nat. Immunol. 2009 10 327 331
- (2009) Nat. Immunol. , vol.10 , pp. 327-331
- Fraser, I.¹ Germain, R.²

41
- 79958268165
- P. Tieri A. de la Fuente A. Termanini C. Franceschi Methods Mol. Biol. 2011 719 415 433
- (2011) Methods Mol. Biol. , vol.719 , pp. 415-433
- Tieri, P.¹ De La Fuente, A.² Termanini, A.³ Franceschi, C.⁴

42
- 68749099453
- A. Bauer-Mehren L. I. Furlong F. Sanz Mol. Syst. Biol. 2009 5 290
- (2009) Mol. Syst. Biol. , vol.5 , pp. 290
- Bauer-Mehren, A.¹ Furlong, L.I.² Sanz, F.³

43
- 77957224952
- N. K. Henderson-Maclennan J. C. Papp C. C. Talbot E. R. McCabe A. P. Presson Mol. Genet. Metab. 2010 101 134 140
- (2010) Mol. Genet. Metab. , vol.101 , pp. 134-140
- Henderson-Maclennan, N.K.¹ Papp, J.C.² Talbot, C.C.³ McCabe, E.R.⁴ Presson, A.P.⁵

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.