Computational Investigations of a Peptide-Modified Dendrimer Interacting with Lipid Membranes

Macromolecular Rapid Communications

Volumn 34, Issue 15, 2013, Pages 1237-1242

  Tu, Chen Kun ^a   Chen, Kang ^a   Tian, Wen De ^a   Ma, Yu Qiang ^a,b  

^a SOOCHOW UNIVERSITY   (China)

^b NANJING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

dendrimers; electrostatic interations; gene delivery; membranes; molecular dynamics

Indexed keywords

COARSE-GRAINED MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; COMPUTATIONAL INVESTIGATION; ENHANCED PERMEABILITY; FUNCTIONAL OPTIMIZATION; GENE DELIVERY; GENE TRANSFECTION; NEGATIVELY CHARGED; POTENTIAL OF MEAN FORCE;

AMINO ACIDS; GENE TRANSFER; LIPID BILAYERS; MEMBRANES; MOLECULAR DYNAMICS; PEPTIDES; PH;

DENDRIMERS;

DENDRIMER; PEPTIDE;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; ELECTROSTATIC INTERATIONS; GENE TARGETING; LIPID BILAYER; MEMBRANE; MOLECULAR DYNAMICS; PH;

DENDRIMERS; ELECTROSTATIC INTERATIONS; GENE DELIVERY; MEMBRANES; MOLECULAR DYNAMICS;

COMPUTER SIMULATION; DENDRIMERS; HYDROGEN-ION CONCENTRATION; LIPID BILAYERS; MODELS, CHEMICAL; PEPTIDES;

EID: 84881480288     PISSN: 10221336     EISSN: 15213927     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/marc.201300360     Document Type: Article

References (41)

1. D. J. Bharali, M. Khalil, M. Gurbuz, T. M. Simone, S. A. Mousa, Nanomedicine 2009, 4, 1.
2. S. Ganta, H. Devalapally, A. Shahiwala, J. M. Amiji, J. Controlled Release 2008, 126, 187.
3. M. J. Cloninger, Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 742.
4. U. Boas, P. M. Heegaard, Chem. Soc. Rev. 2004, 33, 43.
5. Y. Y. Cheng, I. B. Zhao, Y. W Li, T. W. Xu, Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 2673.
6. N. Benseny-Cases, O. Klementieva, J. Cladera, New J. Chem. 2012, 36, 211.
7. R. Shukla, T. P. Thomas, J. Peters, A. Kotlyar, A. Mecke, J. R. Baker Jr., Chem. Commun. 2005, 46, 5739.
8. Y. Kim, A. M. Klutz, K. A. Jacobson, Bioconjugate Chem. 2008, 19, 1660.
9. S. Hong, A. U. Bielinska, A. Mecke, B. Keszler, J. L. Beals, X. Shi, L. Balogh, B. G. Orr, J. R. Baker Jr., M. M. B. Holl, Bioconj. Chem. 2004, 15, 774.
10. J. Liu, L. Chu, Y. Wang, Y. Duan, L. Feng, C. Yang, L. Wang, D. Kong, Int. J. Nanomedicine 2010, 6, 59.
11. J. S. Choi, K. Nam, J. Y. Park, J. B. Kim, J. K. Lee, J. Controlled Release 2004, 99, 445.
12. G. M. Soliman, A. Sharma, D. Maysinger, A. Kakkar, Chem. Commun. 2011, 47, 9572.
13. W. D Tian, Y. Q. Ma, Chem. Soc. Rev. 2013, 42, 705.
14. X. X. Liu, P. Rocchi, P. Ling, New J. Chem. 2012, 36, 256.
15. W. D Tian, Y. Q. Ma, Soft Matter 2012, 8, 2627.
16. A. Mecke, I. J. Majoros, A. K. Patri, J. R. Baker Jr., M. M. B. Holl, B. G. Orr, Langmuir 2005, 21, 10348.
17. P. R. Leroueil, S. Y. Hong, A. Mecke, J. R. Baker Jr., B. G. Orr, M. M. B. Holl, Acc. Chem. Res. 2007, 40, 335.
18. S. P. Hong, P. R. Leroueil, E. K. Janus, J. L. Peters, M. M. Kober, M. T. Islam, B. G. Orr, J. R. Baker Jr., M. M. B. Holl, Bioconjugate Chem. 2006, 17, 728.
19. A. Mecke, S. Uppuluri, T. M. Sassanella, D. K. Lee, A. Ramamoorthy, J. R. Baker Jr., B. G. Orr, M. M. B. Holl, Chem. Phys. Lipids 2004, 132, 3.
20. C. V. Kelly, M. G. Liroff, L. D. Triplett, P. R. Leroueil, D. G. Mullen, J. M. Wallace, S. Meshinchi, J. R. Baker Jr., B. G. Orr, M. M. B. Holl, ACS Nano 2009, 3, 1886.
21. G. van Meer, D. R. Voelker, G. W. Feigenson, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008, 9, 11.
22. H. Lee, R. G. Larson, Molecules 2009, 14, 423.
23. H. Lee, R. G. Larson, J. Phys. Chem. B 2006, 110, 18204.
24. W. D. Tian, Y. Q. Ma, Soft Matter 2012, 8, 6378.
25. W. D. Tian, Y. Q. Ma, Soft Matter 2011, 7, 500.
26. H. Lee, R. G. Larson, J. Phys. Chem. B 2008, 112, 12279.
27. W. D. Tian, Y. Q. Ma, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 13161.
28. C. V. Kelly, P. R. Leroueil, E. K. Nett, J. M. Wereszczynski, J. R. Baker Jr., B. G. Orr, M. M. B. Holl, I. Andricioaei, J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9337.
29. H. Lee, R. G. Larson, Macromolecules 2011, 44, 2291.
30. H. Lee, J. S. Choi, R. G. Larson, Macromolecules 2011, 44, 8681.
31. R. H. Garrett, C. M. Grisham, Biochemistry, Tomson Brooks/Cole: Davis Drive 2005.
32. P. K. Maiti, T. Çaǧin, S. T. Lin, W. A. Goddard, III, Macromolecules 2005, 38, 979.
33. S. Kraszewski, M. Tarek, C. Ramseyer, ACS Nano 2011, 5, 8571.
34. D. Van Der Spoel, E. Lindahl, B. Hess, G. Groenhof, A. E. Mark, H. J. C. Berendsen, J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701.
35. S. J. Marrink, H. J. Risselada, S. Yefimov, D. P. Tieleman, A. H. de Vries, J. Phys. Chem. B 2007, 111, 7812.
36. L. Monticelli, S. K. Kandasamy, X. Periole, R. G. Larson, D. P. Tieleman, S. J. Marrink, J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 819.
37. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. Van Gunsteren, A. Dinola, J. R. Haak, J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684
38. U. L. Essmann, L. Perera, M. L. Berkowitz, T. Darden, H. Lee, L. G. Pedersen, J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577
39. G. S. Yu, Y. M. Bae, H. Choi, B. Kong, I. S. Choi, J. S. Choi, Bioconjugate Chem. 2011, 22, 1046.
40. K. L. Brown, J. C. Conboy, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 8794.
41. W. D. Tian, Y. Q. Ma, Macromolecules 2010, 43, 1575.