In situ live cell sensing of multiple nucleotides exploiting DNA/RNA aptamers and graphene oxide nanosheets

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 14, 2013, Pages 6775-6782

  Wang, Ying ^a,b   Li, Zhaohui ^b,c   Weber, Thomas J ^b   Hu, Dehong ^b   Lin, Chiann Tso ^b   Li, Jinghong ^a   Lin, Yuehe ^b  

^a TSINGHUA UNIVERSITY   (China)

^b PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

^c ZHENGZHOU UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORESCENCE QUENCHING; GRAPHENE OXIDE NANOSHEETS; INTRACELLULAR TRANSPORT; MICROTUBULE ASSEMBLY; MULTIPLE NUCLEOTIDES; NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATES; PRIMARY ENERGY RESOURCES; PRODUCTION AND CONSUMPTION;

BIOCOMPATIBILITY; GRAPHENE; PROBES; VISUALIZATION;

BIOMOLECULES;

APTAMER; GRAPHITE; NANOMATERIAL; NUCLEOTIDE; OXIDE;

ARTICLE; CELL STRAIN MCF 7; CHEMISTRY; GENETIC PROCEDURES; HUMAN; METHODOLOGY; X RAY DIFFRACTION;

APTAMERS, NUCLEOTIDE; BIOSENSING TECHNIQUES; GRAPHITE; HUMANS; MCF-7 CELLS; NANOSTRUCTURES; NUCLEOTIDES; OXIDES; X-RAY DIFFRACTION;

EID: 84880564306     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac400858g     Document Type: Article

References (55)

1. Cassel, D.; Selinger, Z. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1977, 74, 3307-3311
2. Saraste, M.; Sibbald, P. R.; Wittinghofer, A. Trends Biochem. Sci. 1990, 15, 430-434
3. Ashcroft, S. J. H.; Ashcroft, F. M. Cell. Signalling 1990, 2, 197-214
4. Palleros, D. R.; Reid, K. L.; Shi, L.; Welch, W. J.; Fink, A. L. Nature 1993, 365, 664-666
5. Desai, A.; Verma, S.; Mitchison, T. J.; Walczak, C. E. Cell 1999, 96, 69-78
6. Davies, R. E. Nature 1963, 199, 1068-1074
7. Khakh, B. S.; North, R. A. Nature 2006, 442, 527-532
8. Brake, A. J.; Wagenbach, M. J.; Julius, D. Nature 1994, 371, 519-523
9. Finger, T. E.; Danilova, V.; Barrows, J.; Bartel, D. L.; Vigers, A. J.; Stone, L.; Hellekant, G.; Kinnamon, S. C. Science 2005, 310, 1495-1499
10. Blau, N.; Niederwieser, A. J. Clin. Chem. Clin. Biochem. 1985, 23, 169-176
11. Connolly, T.; Rapiejko, P. J.; Gilmore, R. Science 1991, 252, 1171-1173
12. Scheerer, P.; Park, J. H.; Hildebrand, P. W.; Kim, Y. J.; Krauss, N.; Choe, H. W.; Hofmann, K. P.; Ernst, O. P. Nature 2008, 455, 497-502
13. Prenzel, N.; Zwick, E.; Daub, H.; Leserer, M.; Abraham, R.; Wallasch, C.; Ullrich, A. Nature 1999, 402, 884-888
14. Hogg, T.; Mechold, U.; Malke, H.; Cashel, M.; Hilgenfeld, R. Cell 2004, 117, 57-68
15. Nadler, M. J. S.; Hermosura, M. C.; Inabe, K.; Perraud, A. L.; Zhu, Q. Q.; Stokes, A. J.; Kurosaki, T.; Kinet, J. P.; Penner, R.; Scharenberg, A. M.; Fleig, A. Nature 2001, 411, 590-595
16. Ikeuchi, Y.; Kitahara, K.; Suzuki, T. EMBO J. 2008, 27, 2194-2203
17. Pisareva, V. P.; Pisarev, A. V.; Komar, A. A.; Hellen, C. U. T.; Pestova, T. V. Cell 2008, 135, 1237-1250
18. Li, N.; Ho, C.-M. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 2380-2381
19. Wang, S. L.; Chang, Y. T. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10380-10381
20. McCleskey, S. C.; Griffin, M. J.; Schneider, S. E.; McDevitt, J. T.; Anslyn, E. V. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 1114-1115
21. Kwon, J. Y.; Singh, N. J.; Kim, H. N.; Kim, S. K.; Kim, K. S.; Yoon, J. Y. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8892-8893
22. Ojida, A.; Nonaka, H.; Miyahara, Y.; Tamaru, S. I.; Sada, K.; Hamachi, I. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 5518-5521
23. Li, C.; Numata, M.; Takeuchi, M.; Shinkai, S. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 6371-6374
24. Xu, Z.; Singh, N. J.; Lim, J.; Pan, J.; Kim, H. N.; Park, S.; Kim, K. S.; Yoon, J. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15528-15533
25. Chen, D.; Li, J. H. Chem. Rev. 2012, 112, 6027-6053
26. Wang, J.; Jiang, Y. X.; Zhou, C. S.; Fang, X. H. Anal. Chem. 2005, 77, 3542-3546
27. Neelakandan, P. P.; Hariharan, M.; Ramaiah, D. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 11334-11335
28. Geim, A. K. Science 2009, 324, 1530-1534
29. Zeng, Q.; Cheng, J.; Tang, L.; Liu, X.; Liu, Y.; Li, J. H.; Jiang, J. H. Adv. Funct. Mater. 2010, 20, 3366-3372
30. Wang, Y.; Li, Z. H.; Hu, D. H.; Lin, C. T.; Li, J. H.; Lin, Y. H. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 9274-9276
31. Wang, Y.; Lu, J.; Tang, L. H.; Chang, H. X.; Li, J. H. Anal. Chem. 2009, 81, 9710-9715
32. Wang, Y.; Li, Y. M.; Tang, L. H.; Lu, J.; Li, J. H. Electrochem. Commun. 2009, 11, 889-892
33. Feng, L.; Wu, L.; Wang, J.; Ren, J.; Miyoshi, D.; Sugimoto, N.; Qu, X. Adv. Mater. 2012, 3, 125-131
34. Liu, Z.; Robinson, J. T.; Sun, X. M.; Dai, H. J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10876-10877
35. Wu, M.; Kempaiah, R.; Huang, P. J.; Maheshwari, V.; Liu, J. W. Langmuir 2011, 27, 2731-2738
36. Huang, P. J.; Liu, J. W. Anal. Chem. 2012, 84, 4192-4198
37. Lu, C. H.; Zhu, C. L.; Li, J.; Liu, J. J.; Chen, X.; Yang, H. H. Chem. Commun. 2010, 46, 3116-3118
38. He, S. J.; Song, B.; Li, D.; Zhu, C. F.; Qi, W. P.; Wen, Y. Q.; Wang, L. H.; Song, S. P.; Fang, H. P.; Fan, C. H. Adv. Funct. Mater. 2010, 20, 453-459
39. Nie, H. H.; Liu, S. J.; Yu, R. Q.; Jiang, J. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 9862-9866
40. Wu, Z.; Zhen, Z.; Jiang, J. H.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 12325-12332
41. Huang, Y.; Zhang, Y. L.; Xu, X.; Jiang, J. H.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 2478-2480
42. Zhang, Y. L.; Wang, Y.; Wang, H. B.; Jiang, J. H.; Shen, G. L.; Yu, R. Q.; Li, J. H. Anal. Chem. 2009, 81, 1982-1987
43. Fang, X. H.; Tan, W. H. Acc. Chem. Res. 2010, 43, 48-57
44. Song, S.; Wang, L.; Li, J.; Zhao, J.; Fan, C. Trends Anal. Chem. 2008, 27, 108-117
45. Huizenga, D. E.; Szostak, J. W. Biochemistry 1995, 34, 656-665
46. Liu, J. W.; Cao, Z. H.; Lu, Y. Chem. Rev. 2009, 109, 1948-1998
47. Carothers, J. M.; Oestreich, S. C.; Szostak, J. W. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 7929-7937
48. Davis, J. H.; Szostak, J. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 11616-11621
49. Carothers, J. M.; Oestreich, S. C.; Davis, J. H.; Szostak, J. W. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5130-5137
50. Carothers, J. M.; Davis, J. H.; Chou, J. J.; Szostak, J. W. RNA 2006, 12, 567-579
51. Chen, D.; Feng, H. B.; Li, J. H. Chem. Soc. Rev. 2012, 112, 6027-6053
52. Lv, X. J.; Fu, W. F.; Chang, H. X.; Zhang, H.; Cheng, J. S.; Zhang, G. J.; Song, Y.; Hu, C. Y.; Li, J. H. J. Mater. Chem. 2012, 22, 1539-1546
53. Tang, L. H.; Wang, Y.; Liu, Y.; Li, J. H. ACS Nano 2011, 5, 3817-3822
54. Dreyer, D. R.; Park, S.; Bielawski, C. W.; Ruoff, R. S. Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 228-240
55. Wang, Y.; Zhang, S.; Du, D.; Shao, Y. Y.; Li, Z. H.; Wang, J.; Engelhard, M. H.; Li, J. H.; Lin, Y. H. J. Mater. Chem. 2011, 21, 5319-5325