Molecular view on protein sorting into liquid-ordered membrane domains mediated by gangliosides and lipid anchors

Faraday Discussions

Volumn 161, Issue , 2012, Pages 347-363

  De Jong, Djurre H ^a   Lopez, Cesar A ^a   Marrink, Siewert J ^a  

^a not available   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84878837411     PISSN: 13596640     EISSN: 13645498     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2fd20086d     Document Type: Article

References (61)

1. L. A. Bagatolli J. H. Ipsen A. C. Simonsen O. G. Mouritsen Prog. Lipid Res. 2010 49 378 389
2. D. Lingwood K. Simons Science 2010 327 46 50
3. G. van Meer D. R. Voelker G. W. Feigenson Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008 9 112 124
4. K. Simons D. Toomre Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2000 1 31 39
5. T. Baumgart A. T. Hammond P. Sengupta S. T. Hess D. A. Holowka B. A. Baird W. W. Webb Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 3165 3170
6. N. Kahya D. Scherfeld K. Bacia B. Poolman P. Schwille J. Biol. Chem. 2003 278 28109 28115
7. S. L. Veatch I. V. Polozov K. Gawrisch S. L. Keller Biophys. J. 2004 86 2910 2922
8. I. Levental M. Grzybek K. Simons Biochemistry 2010 49 6305 6316
9. F. X. Contreras A. M. Ernst P. Haberkant P. Björkholm E. Lindahl B. Gönen C. Tischer A. Elofsson G. Von Heijne C. Thiele R. Pepperkok F. Wieland B. Brügger Nature 2012 481 525 529
10. B. Thaa I. Levental A. Herrmann M. Veit Biochem. J. 2011 437 389 397
11. C. Yuan L. J. Johnston Biophys. J. 2000 79 2768 2781
12. A. Prinetti N. Loberto V. Chigorno S. Sonnino Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2009 1788 184 193
13. B. Westerlund J. P. Slotte Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2009 1788 194 201
14. S. Sonnino L. Mauri V. Chigorno A. Prinetti Glycobiology 2006 17 1R
15. R. K. Yu Y. T. Tsai T. Ariga M. Yanagisawa J. Oleo Sci. 2001 60 537 544
16. N. Ichikawa K. Iwabuchi H. Kurihara K. Ishii T. Kobayashi T. Sasaki N. Hattori Y. Mizuno K. Hozumi Y. Yamada E. Arikawa-Hirasawa J. Cell Sci. 2009 122 289 299
17. R. G. Zhang D. L. Scott M. L. Westbrook S. Nance B. D. Spangler G. G. Shipley E. M. Westbrook J. Mol. Biol. 1995 251 563 573
18. T. Mitsuda K. Furukawa S. Fukumoto H. Miyazaki T. Urano K. Furukawa J. Biol. Chem. 2002 277 11239 11246
19. N. Kawashima S. J. Yoon K. Itoh K. I. Nakayama J. Biol. Chem. 2009 284 6147 6155
20. H. J. Kaiser D. Lingwood I. Levental J. L. Sampaio L. Kalvodova L. Rajendran K. Simons Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 16645 16650
21. B. J. Reynwar M. Deserno Biointerphases 2008 3 FA117 FA124
22. F. J. M. de Meyer M. Venturoli B. Smit Biophys. J. 2008 95 1851 1865
23. X. Periole T. Huber S. J. Marrink T. P. Sakmar J. Am. Chem. Soc. 2007 129 10126 10132
24. D. L. Parton J. W. Klingelhoefer M. S. P. Sansom Biophys. J. 2011 101 691 699
25. S. J. Marrink H. J. Risselada S. Yefimov D. P. Tieleman A. H. de Vries J. Phys. Chem. B 2007 111 7812 7824
26. L. Monticelli S. K. Kandasamy X. Periole R. G. Larson D. P. Tieleman S. J. Marrink J. Chem. Theory Comput. 2008 4 819 834
27. L. V. Schäfer D. H. de Jong A. Holt A. J. Rzepiela A. H. de Vries B. Poolman J. A. Killian S. J. Marrink Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 1343 1348
28. J. Domanski S. J. Marrink L. V. Schäfer Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2011 1818 984 994
29. G. von Heijne EMBO J. 1986 5 3021 3027
30. E. Sparr W. L. Ash P. V. Nazarov D. T. S. Rijkers M. A. Hemminga D. P. Tieleman J. A. Killian J. Biol. Chem. 2005 280 39324 39331
31. H. J. Risselada S. J. Marrink Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 17367 17372
32. U. Krengel Thesis, Heidelberg 1991
33. A. Wernimont A. Edwards PLoS One 2009 4 e5094
34. The PyMOL Molecular Graphics System, Version 1.2r1, Schrödinger, LLC
35. D. H. de Jong W. F. D. Bennet G. Singh C. Arnarez T. A. Wassenaar L. V. Schäfer X. Periole D. P. Tieleman S. J. Marrink J. Chem. Theory Comput., In preparation 2012
36. X. Periole M. Cavalli S. J. Marrink M. A. Ceruso J. Chem. Theory Comput. 2009 5 2531 2543
37. T. M. Hall J. A. Porter P. A. Beachy D. J. Leahy Nature 1995 378 212 216
38. J. A. Killian I. Salemink M. R. R. de Planque G. Lindblom R. E. Koeppe II D. V. Greathous Biochemistry 1996 35 1037 1045
39. B. Y. Duyl D. T. S. Rijkers B. de Kruijff J. A. Killian FEBS Lett. 2002 523 79 84
40. C. A. Lopez A. Rzepiela A. H. de Vries L. Dijkhuizen P. H. Hünenberger S. J. Marrink J. Chem. Theory Comput. 2009 5 3195 3210
41. B. Hess C. Kutzner D. van der Spoel E. Lindahl J. Chem. Theory Comput. 2008 4 435 447
42. S. Ramadurai A. Holt L. V. Schäfer V. V. Krasnikov D. T. S. Rijkers S. J. Marrink J. A. Killian B. Poolman Biophys. J. 2010 99 1447 1454
43. K. Wennerberg, K. L. Rossman, and C. J. Der, J. Cell. Sci, 118, pp. 843-846
44. I. A. Prior J. F. Hancock J. Cell. Sci. 2001 114 1603 1608
45. C. Nicolini J. Baranski S. Schlummer J. Palomo M. Lumbierres-Burgues M. Kahms J. Kuhlmann S. Sanchez E. Gratton H. Waldmann R. Winter J. Am. Chem. Soc. 2006 128 192 201
46. K. Weise S. Kapoor C. Denter J. Nikolaus N. Opitz S. Koch G. Triola A. Herrmann H. Waldmann R. Winter J. Am. Chem. Soc. 2011 133 880 887
47. L. Janosi Z. Li J. F. Hancock A. A. Gorfe Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 109 8097 8102
48. I. A. Prior A. Harding J. Yan J. Sluimer R. G. Parton J. F. Hancock Nat. Cell Biol. 2001 3 368 375
49. H. Niv O. Gutman Y. Kloog Y. I. Henis J. Cell Biol. 2002 157 865 872
50. A. A. Gorfe M. Hanzal-Bayer D. Abankwa J. F. Hancock J. A. McCammon J. Med. Chem. 2007 50 674 684
51. R. Thapar J. G. Williams S. L. Campbell J. Mol. Biol. 2004 343 1391 1408
52. J. A. Porter K. E. Young P. A. Beachy Science 1996 274 255 259
53. R. B. Pepinsky C. Zeng D. Wen P. Rayhorn D. P. Baker K. P. Williams S. A. Bixler C. M. Ambrose E. A. Garber K. Miatkowski F. R. Taylor E. A. Wang A. Galdes J. Biol. Chem. 1998 273 14037 14045
54. A. Rietveld S. Neutz K. Simons S. Eaton J. Biol. Chem. 1999 274 12049 12054
55. M. R. R. de Planque J. A. Killian Mol. Membr. Biol. 2003 20 271 284
56. H. Shogomori A. T. Hammond A. G. Ostermeyer-Fay D. J. Barr G. W. Feigenson E. London D. A. Brown J. Biol. Chem. 2005 280 18931 18942
57. I. Levental D. Lingwood M. Gryzbek Ü. Coskun K. Simons Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 22050 22054
58. S. Trabelsi S. Zhang T. R. Lee D. K. Schwartz Phys. Rev. Lett. 2008 100 037802
59. A. Ferraretto M. Pitto P. Palestini M. Masserini Biochemistry 1997 36 9232 9236
60. D. Lingwood B. Binnington T. Rog I. Vattulainen M. Grzybek U. Coskun C. A. Lingwood K. Simons Nat. Chem. Biol. 2011 7 260 262
61. D. H. de Jong X. Periole S. J. Marrink J. Chem. Theory Comput. 2012 8 1003 1014