Binding energies of micro-hydrated carbohydrates: Measurements and interpretation

Chemical Science

Volumn 4, Issue 4, 2013, Pages 1830-1836

  Çarçabal, Pierre ^a   Cocinero, Emilio J ^b   Simons, John P ^c  

^a INSTITUT DES SCIENCES MOLÉCULAIRES D ORSAY   (France)

^b UNIVERSITY OF THE BASQUE COUNTRY UPV EHU   (Spain)

^c UNIVERSITY OF OXFORD   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBOHYDRATES; GLUCOSE;

COMPUTATIONAL TIME; CONFORMATIONAL CHANGE; DFT METHOD; DISSOCIATION THRESHOLD; EXPERIMENTAL MEASUREMENTS; GASPHASE; IDENTITY APPROXIMATION; RELATIVE BINDING ENERGIES; RELATIVE VALUE; RELIABLE ESTIMATES; STRUCTURAL DIFFERENCES; WATER MOLECULE;

BINDING ENERGY;

EID: 84874614716     PISSN: 20416520     EISSN: 20416539     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3sc50135c     Document Type: Article

References (41)

1. K. N. Kirschner, R. J. Woods, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A, 2001, 98, 10541-10545
2. A. Almond, J. K. Sheehan, Glycobiology, 2002, 13, 255-264
3. A. Almond, B. O. Petersen, J. Ø. Duus, Biochemistry, 2004, 43, 5853-5863
4. A. Almond, Carbohydr. Res, 2005, 340, 907-920
5. S. Vojtech, A. D. French, Mini-Rev. Org. Chem. 2011, 8, 249-255
6. K. L. Dashnau, K. A. Sharp, J. M. Vanderkooi, J. Phys. Chem. B, 2005, 109, 24152-24159
7. J. P. Simons, P. çarçabal, B. G. Davis, D. P. Gamblin, I. Hünig, R. A. Jockusch, R. T. Kroemer, E. M. Marzluff, L. C. Snoek, Int. Rev. Phys. Chem. 2005, 24, 489-532
8. N. A. Macleod, C. Johannessen, L. Hecht, L. D. Barron, J. P. Simons, Int. J. Mass Spectrom, 2006, 253, 193-200
9. E. C. Stanca-Kaposta, D. P. Gamblin, E. J. Cocinero, J. Frey, R. T. Kroemer, B. G. Davis, A. J. Fairbanks, J. P. Simons, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10691-10696
10. E. J. Cocinero, E. C. Stanca-Kaposta, E. M. Scanlan, D. P. Gamblin, B. G. Davis, J. P. Simons, Chem–Eur. J, 2008, 14, 8947-8955
11. J. P. Simons, Mol. Phys, 2009, 107, 2435-2458
12. R. Kadirvelraj, B. L. Foley, J. D. Dyekjaer, R. J. Woods, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 16933-16942
13. M. Pincu, R. B. Gerber, Chem. Phys. Lett, 2012, 531, 52-58
14. N. Mayorkas, S. Rudić, E. J. Cocinero, B. G. Davis, J. P. Simons, Phys. Chem. Chem. Phys, 2011, 13, 18671-18678
15. R. U. Lemieux, Acc. Chem. Res, 1996, 29, 373
16. A. V. Verde, R. K. Kampen, J. Phys. Chem. B, 2011, 115, 7069-7084
17. E. Klein, Y. Ferrand, N. P. Barwell, A. P. Davis, Angew. Chem. Int. Ed, 2008, 47, 2693-2697
18. G. Hummer, Nat. Chem. 2010, 2, 106-107
19. E. W. Sayers, J. H. Prestegard, Biophys. J, 2000, 79, 3313-3329
20. J. H. Prestegard, F. Yu, Biophys. J, 2006, 91, 1952-1959
21. H. Wincel, J. Am. Soc. Mass Spectrom, 2011, 22, 1570-1576
22. T. Wyttenbach, M. S. Bowers, Chem. Phys. Lett, 2009, 480, 1-16
23. R. K. van Kampen, J. D. Kubicki, J. Comput. Chem. 2010, 31, 963-972
24. A. Mandal, M. Prakash, R. M. Kumar, R. Parthasarathi, V. Subramanian, J. Phys. Chem. A, 2010, 114, 2250-2258
25. R. S. Fellers, C. Leforestier, L. B. Braly, M. G. Brown, R. J. Saykally, Science, 1999, 284, 945
26. K. Wendler, J. Thar, S. Zahn, B. Kirchner, J. Phys. Chem. A, 2010, 114, 9529-9536
27. P. çarçabal, R. A. Jockusch, I. Hünig, L. C. Snoek, R. T. Kroemer, B. G. Davis, D. P. Gamblin, I. Compagnon, J. Oomens, J. P. Simons, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11414-11425
28. M. Mons, I. Dimicoli, F. Piuzzi, Int. Rev. Phys. Chem. 2002, 21, 101-135
29. M. Mons, F. Piuzzi, I. Dimicoli, A. Zehnacker, F. Lahmani, Phys. Chem. Chem. Phys, 2000, 2, 5065-5070
30. E. Gloaguen, B. de Courcy, J.-P. Piquemal, J. Pilmé, O. Parisel, R. Pollet, H. S. Biswal, F. Piuzzi, B. Tardivel, M. Broquier, M. Mons, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 34, 11860-11863
31. H. S. Biswal, Y. Loquais, B. Tardivel, E. Gloaguen, M. Mons, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11, 3931-3942
32. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, T. Keith, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski and D. J. Fox, Gaussian 09, Revision. B.01, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2010
33. TURBOMOLE V6.2 2010, a development of University of Karlsruhe and Forschungszentrum Karlsruhe GmbH, 1989–2007
34. N. Mayorkas, S. Rudić, B. G. Davis, J. P. Simons, Chem. Sci, 2011, 2, 1128-1134
35. V. S. Bryantsev, M. S. Diallo, A. C. T. van Duin, W. Goddard III, J. Chem. Theory Comput, 2009, 5, 1016-1026
36. N. Marom, A. Tkatchenko, M. Rossi, V. V. Gobre, O. Hod, M. Scheffler, L. Kronik, J. Chem. Theory Comput, 2011, 7, 3944-3951
37. NIST Chemistry WebBook, webbook.NIST.gov/chemistry
38. E. G. Buchanan, W. H. James III, A. Gutberlet, J. C. Dean, L. Guo, S. H. Gellman, T. S. Zwier, Faraday Discuss, 2011, 150, 209-226
39. K. Sakota, Y. Kouno, S. Harada, M. Miyazaki, M. Fujii, H. Sekiya, J. Chem. Phys, 2012, 137, 22, 224311
40. M. Weiler, T. Nakamura, H. Sekiya, O. Dopfer, M. Miyazaki, M. Fujii, ChemPhysChem, 2012, 13, 17, 3875-3881
41. D. B. Wong, K. P. Sokolowsky, M. I. El-Barghouthi, E. E. Fenn, C. H. Giammanco, A. L. Sturlaugson, M. D. Fayer, J. Phys. Chem. B, 2012, 116, 18, 5479-5490