Conformation model of back-folding and looping of a single DNA molecule confined inside a nanochannel

ACS Macro Letters

Volumn 1, Issue 8, 2012, Pages 1046-1050

  Dai, Liang ^a   Siow, Yee Ng ^a   Doyle, Patrick S ^b   Van Der Maarel, Johan R C ^c  

^a SINGAPORE MIT ALLIANCE FOR RESEARCH AND TECHNOLOGY   (Singapore)

^b NATIONAL UNIVERSITY OF SINGAPORE   (Singapore)

^c Massachusetts Institute of Technology Cambridge   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84874274328     PISSN: None     EISSN: 21611653     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/mz300323a     Document Type: Article

References (25)

1. Reisner, W.; Morton, K. J.; Riehn, R.; Wang, Y. M.; Yu, Z.; Rosen, M.; Sturm, J. C.; Chou, S. Y.; Frey, E.; Austin, R. H. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 196101.
2. Mannion, J. T.; Reccius, C. H.; Cross, J. D.; Craighead, H. G. Biophys. J. 2006, 90, 4538.
3. Reisner, W.; Beech, J. P.; Larsen, N. B.; Flyvbjerg, H.; Kristensen, A.; Tegenfeldt, J. O. Phys. Rev. Lett. 2007, 99, 058302.
4. Jo, K.; Dhingra, D. M.; Odijk, T.; de Pablo, J. J.; Graham, M. D.; Runnheim, R.; Forrest, D.; Schwartz, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 2673.
5. Zhang, C.; Zhang, F.; van Kan, J. A.; van der Maarel, J. R. C. J. Chem. Phys. 2008, 128, 225109.
6. Persson, F.; Utko, P.; Reisner, W.; Larsen, N. B.; Kristensen, A. Nano Lett. 2009, 9, 1382.
7. Su, T.; Das, S. K.; Xiao, M.; Purohit, P. K. PLoS One 2011, 6, e16890.
8. Dai, L.; van der Maarel, J. R. C.; Doyle, P. S. ACS Macro Lett. 2012, 1, 732.
9. Zhang, C.; Shao, P. G.; van Kan, J. A.; van der Maarel, J. R. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 16651.
10. Jones, J. J.; van der Maarel, J. R. C.; Doyle, P. S. Nano Lett. 2011, 11, 5047.
11. Zhang, C.; Gong, Z.; Guttula, D.; Malar, P. P.; van Kan, J. A.; Doyle, P. S.; van der Maarel, J. R. C. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 3031.
12. Cifra, P.; Benkova, Z.; Bleha, T. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 1367.
13. Wang, Y.; Tree, D. R.; Dorfman, K. D. Macromolecules 2011, 44, 6594.
14. Cifra, P. J. Chem. Phys. 2012, 136, 024902.
15. Dai, L.; Jones, J. J.; van der Maarel, J. R. C.; Doyle, P. S. Soft Matter 2012, 8, 2972.
16. Williams, M. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 11125.
17. Jun, S.; Mulder, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 12388.
18. Odijk, T. Macromolecules 1983, 16, 1340.
19. Daoud, M.; de Gennes, P. G. J. Phys. (Paris) 1977, 38, 85.
20. Yang, Y. Z.; Burkhardt, T. W.; Gompper, G. Phys. Rev. E 2007, 76, 011804.
21. Odijk, T. Phys. Rev. E 2008, 77, 060901(R).
22. Odijk, T. J. Chem. Phys. 2006, 125, 204904.
23. Zimm, B. H.; Bragg, J. K. J. Chem. Phys. 1959, 31, 526.
24. Kramers, H. A.; Wannier, G. H. Phys. Rev. 1941, 60, 252.
25. Grosberg, A. Y.; Khokhlov, A. R. Statistical Physics of Macromolecules; AIP Press: New York, 1994.