Molecular dynamics simulations of mixed DOPC-β-sitosterol bilayers and their interactions with DMSO

Soft Matter

Volumn 9, Issue 10, 2013, Pages 2920-2935

  Hughes, Zak E ^a   Mancera, Ricardo L ^a  

^a CURTIN UNIVERSITY   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

1 ,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE; BI-LAYER; CRYO-PRESERVATION; DIFFUSION MECHANISMS; LARGE AMOUNTS; MEMBRANE PHOSPHOLIPIDS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PHOSPHOCHOLINE BILAYERS; PURE WATER; RELATIVE CONCENTRATION;

CELL MEMBRANES; CYTOLOGY; MEMBRANES; MOLECULAR DYNAMICS; PHOSPHOLIPIDS; SOLVENTS;

ALCOHOLS;

EID: 84874073645     PISSN: 1744683X     EISSN: 17446848     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3sm27805k     Document Type: Article

References (78)

1. H. T. Meryman R. J. Williams M. S. J. Douglas Cryobiology 1977 14 287 302
2. M. Wusteman M. Robinson D. Pegg Cryobiology 2004 48 179 189
3. F. Engelmann In Vitro Cell. Dev. Biol. 2004 40 427 433
4. J. G. Day K. C. Harding J. Nadarajan E. E. Benson Mol. Biomethods Handb. 2008 917 947
5. A. Kaczmarczyk V.-M. Rokka E. R. J. Keller Potato Res. 2011 54 45 79
6. A. Kaczmarczyk S. R. Turner E. Bunn R. L. Mancera K. W. Dixon In Vitro Cell. Dev. Biol. 2011 47 17 25
7. A. Kaczmarczyk, B. Funnekotter, A. Menon, P. Y. Phang, A. Al-Hanbali, E. Bunn and R. L. Mancera, in Current Issues in Plant Cryopreservation, ed., I. I. Katkov, InTech Open Access Publisher, 2012
8. A. Sakai S. Kobayashi I. Oiyama Plant Cell Rep. 1990 9 30 33
9. H. H. Kim E. G. Cho H. J. Baek C. Y. Kim E. R. J. Keller F. Engelmann CryoLetters 2004 25 59 70
10. E. E. Benson K. Harding J. W. Johnston Methods Mol. Biol. 2007 368 163 183
11. A. Sakai F. Engelmann CryoLetters 2007 28 151 172
12. E. E. Benson Crit. Rev. Plant Sci. 2008 27 141 219
13. J. E. Lovelock M. W. H. Bishop Nature 1959 183 1394 1395
14. J. Wolfe G. Bryant Int. J. Refrig. 2001 24 438 450
15. T. J. Anchordoguy J. F. Carpenter J. H. Crowe L. M. Crowe Biochim. Biophys. Acta 1992 1104 117 122
16. J. B. Mandumpal C. A. Kreck R. L. Mancera Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 3839 3842
17. C. A. Kreck J. B. Mandumpal R. L. Mancera Chem. Phys. Lett. 2011 501 273 277
18. Q. F. Ahkong D. Fisher W. Tampion J. A. Lucy Nature 1975 253 194 195
19. M. Colucci F. Maione M. C. Bonito A. Piscopo A. D. Giannuario S. Pieretti Pharmacol. Res. 2008 57 419 425
20. H. J. Haigler D. D. Spring Ann. N. Y. Acad. Sci. 1983 411 19 27
21. A. K. Sum J. J. de Pablo Biophys. J. 2003 85 3636 3645
22. R. Notman M. Noro B. O'Malley J. Anwar J. Am. Chem. Soc. 2006 128 13982 13983
23. A. A. Gurtovenko J. Anwar J. Phys. Chem. B 2007 111 13379 13382
24. A. A. Gurtovenko J. Anwar J. Phys. Chem. B 2007 111 10453 10460
25. R. Notman W. K. den Otter M. G. Noro W. J. Briels J. Anwar Biophys. J. 2007 93 2056 2068
26. A. A. Gurtovenko O. I. Onike J. Anwar Langmuir 2008 24 9656 9660
27. Z. E. Hughes A. E. Mark R. L. Mancera J. Phys. Chem. B 2012 116 11911 11923
28. J. Lin B. Novak D. Moldovan J. Phys. Chem. B 2012 116 1299 1308
29. R. Notman J. Anwar Adv. Drug Delivery Rev. 2012 10.1016/j.addr.2012.02. 011
30. S. N. Shashkov M. A. Kiselev S. N. Tioutiounnikov A. M. Kiselev P. Lesieur Phys. B 1999 271 184 191
31. M. A. Kiselev P. Lesieur A. M. Kisselev C. Grabielle-Madelmond M. Ollivon J. Alloys Compd. 1999 286 195 202
32. Y. Yamashita K. Kinoshita M. Yamazaki Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2000 1467 395 405
33. M.-A. de Ménorval L. M. Mir M. L. Fernandez R. Reigada PLoS One 2012 7 e41733
34. B. D. McKersie J. E. Thompson Plant Physiol. 1979 63 802 805
35. I. Schuler G. Duportail N. Glasser P. Benveniste M. A. Hartmann Biochim. Biophys. Acta 1990 1028 82 88
36. I. Schuler A. Milon Y. Nakatani G. Ourisson A. M. Albrecht P. Benveniste M. A. Hartmann Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 6926 6930
37. M. A. Hartmann Trends Plant Sci. 1998 3 170 175
38. M. Nielsen J. Thewalt L. Miao J. H. Ipsen M. Bloom M. J. Zuckermann O. G. Mouritsen Europhys. Lett. 2000 52 368 374
39. O. G. Mouritsen M. J. Zuckermann Lipids 2004 39 1101 1113
40. K. Simons W. L. C. Vaz Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2004 33 269 295
41. E. J. Dufourc J. Chem. Biol. 2008 1 63 77
42. M. A. Kamal V. A. Raghunathan Soft Matter 2012 8 8952 8958
43. C. Silva F. J. Aranda A. Ortiz V. Martinez M. Carvajal J. A. Teruel J. Colloid Interface Sci. 2011 358 192 201
44. C. Grunwald Plant Physiol. 1974 54 624 628
45. M. A. Krajewski-Bertrand A. Milon M. A. Hartmann Chem. Phys. Lipids 1992 63 235 241
46. T. H. Haines Prog. Lipid Res. 2001 40 299 324
47. S. W. Chiu E. Jakobsson H. L. Scott Biophys. J. 2001 80 1104 1114
48. A. M. Smondyrev M. L. Berkowitz Biophys. J. 2001 80 1649 1658
49. S. W. Chiu E. Jakobsson R. J. Mashl H. L. Scott Biophys. J. 2002 83 1842 1853
50. C. Hofsass E. Lindahl O. Edholm Biophys. J. 2003 84 2192 2206
51. S. A. Pandit D. Bostick M. L. Berkowitz Biophys. J. 2004 86 1345 1356
52. Z. Cournia G. M. Ullmann J. C. Smith J. Phys. Chem. B 2007 111 1786 1801
53. M. H. Cheng L. T. Liu A. C. Saladino Y. Xu P. Tang J. Phys. Chem. B 2007 111 14186 14192
54. T. Rog L. M. Stimson M. Pasenkiewicz-Gierula I. Vattulainen M. Karttunen J. Phys. Chem. B 2008 112 1946 1952
55. H. Martinez-Seara T. Rog M. Pasenkiewicz-Gierula I. Vattulainen M. Karttunen R. Reigada Biophys. J. 2008 95 3295 3305
56. S. J. Marrink A. H. de Vries T. A. Harroun J. Katsaras S. R. Wassall J. Am. Chem. Soc. 2008 130 10 11
57. W. F. D. Bennett J. L. MacCallum M. J. Hinner S. J. Marrink D. P. Tieleman J. Am. Chem. Soc. 2009 131 12714 12720
58. W. F. D. Bennett J. L. MacCallum D. P. Tieleman J. Am. Chem. Soc. 2009 131 1972 1978
59. S. Jo H. Rui J. B. Lim J. B. Klauda W. Im J. Phys. Chem. B 2010 114 13342 13348
60. M. L. Fernandez G. Marshall F. Sagues R. Reigada J. Phys. Chem. B 2010 114 6855 6865
61. T. Rog M. Pasenkiewicz-Gierula I. Vattulainen M. Karttunen Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2009 1788 97 121
62. A. P. Lyubartsev A. L. Rabinovich Soft Matter 2011 7 25 39
63. S. A. Pandit E. Jakobsson H. L. Scott Biophys. J. 2004 87 3312 3322
64. S. A. Pandit S. Vasudevan S. W. Chiu R. J. Mashl E. Jakobsson H. L. Scott Biophys. J. 2004 87 1092 1100
65. W. F. D. Bennett D. P. Tieleman J. Lipid Res. 2012 53 421 429
66. B. Funnekotter, A. Kaczmarczyk, S. R. Turner, E. Bunn, W. Zhou, S. Smith, G. Flematti and R. L. Mancera, submitted
67. D. Poger W. F. van Gunsteren A. E. Mark J. Comput. Chem. 2010 31 1117 1125
68. D. Poger A. E. Mark J. Chem. Theory Comput. 2010 6 325 336
69. A. K. Malde L. Zuo M. Breeze M. Stroet D. Poger P. C. Nair C. Oostenbrink A. E. Mark J. Chem. Theory Comput. 2011 7 4026 4037
70. N. Schmid A. P. Eichenberger A. Choutko S. Riniker M. Winger A. E. Mark W. F. van Gunsteren Eur. Biophys. J. 2011 40 843 856
71. T. J. Piggot A. Pineiro S. Khalid J. Chem. Theory Comput. 2012 8 4593 4609
72. D. Poger A. E. Mark J. Chem. Theory Comput. 2012 8 4807 4817
73. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. van Gunsteren and J. Hermans, in Intermolecular Forces, Reidel, Dordrecht, 1981
74. C. Oostenbrink A. Villa A. E. Mark W. F. van Gunsteren J. Comput. Chem. 2004 25 1656 1676
75. D. van der Spoel E. Lindahl B. Hess G. Groenhof A. E. Mark H. J. C. Berendsen J. Comput. Chem. 2005 26 1701 1718
76. M. P. Allen and D. J. Tildesley, Computer Simulation of Liquids, Oxford University Press, New York, 1989
77. H. J. C. Berendsen J. P. M. Postma W. F. van Gunsteren A. Dinola J. R. Haak J. Chem. Phys. 1984 81 3684 3690
78. G. Parisio M. M. Sperotto A. Ferrarini J. Am. Chem. Soc. 2012 134 12198 12208