Competition between covalent and noncovalent bond cleavages in dissociation of phosphopeptide-amine complexes

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 15, 2011, Pages 6936-6946

  Laskin, Julia ^a   Yang, Zhibo ^a,c   Woods, Amina S ^b  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

^b NATIONAL INSTITUTE ON DRUG ABUSE   (United States)

^c UNIVERSITY OF COLORADO   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINE; PHOSPHOPEPTIDE; SOLVENT;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ELECTRON; MASS SPECTROMETRY; PROTEIN CONFORMATION; QUANTUM THEORY; THERMODYNAMICS;

AMINES; ELECTRONS; MASS SPECTROMETRY; MODELS, MOLECULAR; PHOSPHOPEPTIDES; PROTEIN CONFORMATION; QUANTUM THEORY; SOLVENTS; THERMODYNAMICS;

EID: 84872881904     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1cp00029b     Document Type: Article

References (57)

1. K. T. Holman A. M. Pivovar J. A. Swift M. D. Ward Acc. Chem. Res. 2001 34 107 118
2. F. P. Schmidtchen M. Berger Chem. Rev. 1997 97 1609 1646
3. S. N. Jackson S. C. Moyer A. S. Woods J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008 19 1535 1541
4. J. F. Riordan K. D. McElvany C. L. Borders Science 1977 195 884 886
5. J. Tao A. D. Frankel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992 89 2723 2726
6. K. A. Schug W. Lindner Chem. Rev. 2005 105 67 113
7. A. S. Woods J. Proteome Res. 2004 3 478 484
8. A. S. Woods S. C. Moyer H. Y. J. Wang R. A. Wise J. Proteome Res. 2003 2 207 212
9. A. S. Woods R. Kaminski M. Oz Y. Wang K. Hauser R. Goody H. Y. J. Wang S. N. Jackson P. Zeitz K. P. Zeitz D. Zolkowska R. Schepers M. Nold J. Danielson A. Graslund V. Vukojevic G. Bakalkin A. Basbaum T. Shippenberg J. Proteome Res. 2006 5 1017 1023
10. Q. Wang J. L. Mynar M. Yoshida E. Lee M. Lee K. Okuro K. Kinbara T. Aida Nature 2010 463 339 343
11. K. Okuro K. Kinbara K. Tsumoto N. Ishii T. Aida J. Am. Chem. Soc. 2009 131 1626 1627
12. Y. X. Jiang V. Ruta J. Y. Chen A. Lee R. MacKinnon Nature 2003 423 42 48
13. Y. P. Xu Y. Ramu Z. Lu Nature 2008 451 826 U828
14. B. J. Calnan B. Tidor S. Biancalana D. Hudson A. D. Frankel Science 1991 252 1167 1171
15. A. S. Woods S. C. Moyer S. N. Jackson J. Proteome Res. 2008 7 3423 3427
16. A. S. Woods S. Ferre J. Proteome Res. 2005 4 1397 1402
17. F. Ciruela J. Burgueno V. Casado M. Canals D. Marcellino S. R. Goldberg M. Bader K. Fuxe L. F. Agnati C. Lluis R. Franco S. Ferre A. S. Woods Anal. Chem. 2004 76 5354 5363
18. S. N. Jackson H. Y. J. Wang A. Yergey A. S. Woods J. Proteome Res. 2006 5 122 126
19. K. Fuxe D. Marcellino G. Leo L. F. Agnati Curr. Opin. Pharmacol. 2010 10 14 22
20. P. J. Boersema S. Mohammed A. J. R. Heck J. Mass Spectrom. 2009 44 861 878
21. T. F. Wang H. J. Andreazza D. Bilusich J. H. Bowie Rapid Commun. Mass Spectrom. 2009 23 1669 1677
22. A. M. Palumbo G. E. Reid Anal. Chem. 2008 80 9735 9747
23. M. Edelson-Averbukh A. Shevchenko R. d. Pipkorn W. D. Lehmann Anal. Chem. 2009 81 4369 4381
24. P. F. James M. A. Perugini R. A. J. O'Hair J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006 17 384 394
25. S. Alves A. Woods J. C. Tabet J. Mass Spectrom. 2007 42 1613 1622
26. S. Yin Y. Xie J. A. Loo J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008 19 1199 1208
27. J. Laskin J. H. Futrell Mass Spectrom. Rev. 2003 22 158 181
28. J. Laskin J. H. Futrell J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2003 14 1340 1347
29. J. Laskin E. Denisov J. Futrell J. Am. Chem. Soc. 2000 122 9703 9714
30. J. Laskin T. H. Bailey J. H. Futrell Int. J. Mass Spectrom. 2004 234 89 99
31. J. Laskin J. Phys. Chem. A 2006 110 8554 8562
32. J. Laskin J. H. Futrell I. K. Chu J. Am. Chem. Soc. 2007 129 9598 9599
33. J. Laskin Z. Yang I. K. Chu J. Am. Chem. Soc. 2008 130 3218 3230
34. Z. B. Yang E. R. Vorpagel J. Laskin J. Am. Chem. Soc. 2008 130 13013 13022
35. Z. B. Yang E. R. Vorpagel J. Laskin Chem.-Eur. J. 2009 15 2081 2090
36. J. Laskin E. V. Denisov A. K. Shukla S. E. Barlow J. H. Futrell Anal. Chem. 2002 74 3255 3261
37. S. A. Shaffer K. Q. Tang G. A. Anderson D. C. Prior H. R. Udseth R. D. Smith Rapid Commun. Mass Spectrom. 1997 11 1813 1817
38. T. H. Mize I. Taban M. Duursma M. Seynen M. Konijnenburg A. Vijftigschild C. V. Doornik G. V. Rooij R. M. A. Heeren Int. J. Mass Spectrom. 2004 235 243 253
39. L. M. Taban Y. E. M. van der Burgt M. Duursma Z. Takats M. Seynen M. Konijnenburg A. Vijftigschild I. Attema R. M. A. Heeren Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008 22 1245 1256
40. A. R. Dongre A. Somogyi V. H. Wysocki J. Mass Spectrom. 1996 31 339 350
41. J. Laskin J. H. Futrell J. Chem. Phys. 2003 119 3413 3420
42. V. Grill J. Shen C. Evans R. G. Cooks Rev. Sci. Instrum. 2001 72 3149 3179
43. J. Laskin P. Wang O. Hadjar Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 1079 1090
44. J. Laskin M. Byrd J. Futrell Int. J. Mass Spectrom. 2000 195-196 285 302
45. M. J. P. Kenneth, A. Holbrook and Struan. H. Robertson, Unimolecular Reactions, John Wiley & Sons, New York, 2nd edn, 1996
46. J. Laskin J. Futrell J. Phys. Chem. A 2000 104 5484 5494
47. A. B. Schmidt R. M. Fine Mol. Simul. 1994 13 347 365
48. R. Fletcher, FORTRAN Subroutines for Minimization by Quasi-Newton Methods, U.K. Atom Energy Authority Research Group, NAERE R7125, 1972, p. 29
49. E. J. Bylaska, et al., NWChem, A Computational Chemistry Package for Parallel Computers, Version 5.1, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, WA, 2007
50. D. S. Gross E. R. Williams Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1996 157-158 305 318
51. S. Gronert J. Azebu Org. Lett. 1999 1 503 506
52. R. Hodyss H. A. Cox J. L. Beauchamp J. Phys. Chem. A 2004 108 10030 10034
53. H. A. Cox R. Hodyss J. L. Beauchamp J. Am. Chem. Soc. 2005 127 4084 4090
54. C. Lifshitz Eur. J. Mass Spectrom. 2002 8 85 98
55. H. J. Andreazza M. Fitzgerald D. Bilusich R. Hoffmann P. Hoffmann P. C. H. Elchinger J. H. Bowie Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008 22 3305 3312
56. N. Felitsyn E. N. Kitova J. S. Klassen Anal. Chem. 2001 73 4647 4661
57. J. Laskin J. H. Futrell J. Phys. Chem. A 2003 107 5836 5839