Predictions for cholesterol interaction sites on the A2A adenosine receptor

Journal of the American Chemical Society

Volumn 134, Issue 40, 2012, Pages 16512-16515

  Lee, Ji Young ^a   Lyman, Edward ^a  

^a UNIVERSITY OF DELAWARE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENOSINE RECEPTOR; EXTRACELLULAR; HIGH-RESOLUTION STRUCTURES; INTERACTION SITE; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; SPECIFIC SITES;

ENZYME ACTIVITY; MOLECULAR DYNAMICS;

CHOLESTEROL;

ADENOSINE A2A RECEPTOR; CHOLESTEROL;

ARTICLE; BINDING SITE; CRYSTALLIZATION; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR INTERACTION; PROTEIN INTERACTION;

BINDING SITES; CHOLESTEROL; HUMANS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; RECEPTOR, ADENOSINE A2A;

EID: 84867366833     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja307532d     Document Type: Article

References (31)

1. van Meer, G.; Voelker, D. R.; Feigenson, G. W. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008, 9, 112-124
2. Lingwood, D.; Simons, K. Science 2010, 327, 46-50
3. Pan, J.; Mills, T.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. Phys. Rev. Lett. 2008, 100, 198103
4. Ruprecht, J. J.; Mielke, T.; Vogel, R.; Villa, C.; Schertler, G. F. X. EMBO J. 2004, 23, 3609-3620
5. Cherezov, V.; Rosenbaum, D. M.; Hanson, M. A.; Rasmussen, S. G. F.; Thian, F. S.; Kobilka, T. S.; Choi, H.-J.; Kuhn, P.; Weis, W. I.; Kobilka, B. K.; Stevens, R. C. Science 2007, 318, 1258-1265
6. Hanson, M. A.; Cherezov, V.; Griffith, M. T.; Roth, C. B.; Jaakola, V.-P.; Chien, E. Y. T.; Velasquez, J.; Kuhn, P.; Stevens, R. C. Structure 2008, 16, 897-905
7. Shinoda, T.; Ogawa, H.; Cornelius, F.; Toyoshima, C. Nature 2009, 459, 446-450
8. Liu, W.; Chun, E.; Thompson, A. A.; Chubukov, P.; Xu, F.; Katritch, V.; Han, G. W.; Roth, C. B.; Heitman, L. H.; IJzerman, A. P.; Cherezov, V.; Stevens, R. C. Science 2012, 337, 232-236
9. Gilchrist, A. GPCR molecular pharmacology and drug targeting; John Wiley & Sons: Hoboken, NJ, 2010.
10. Fredholm, B. B.; Ijzerman, A. P.; Jacobson, K. A.; Linden, J.; Mu, C. E. Pharmacol. Rev. 2011, 63, 1-34
11. Simons, K. Science 2000, 290, 1721-1726
12. O'Malley, M. A.; Helgeson, M. E.; Wagner, N. J.; Robinson, A. S. Biophys. J. 2011, 101, 1938-1948
13. O'Malley, M. A.; Helgeson, M. E.; Wagner, N. J.; Robinson, A. S. Biophys. J. 2011, 100, L11-13
14. Chini, B.; Parenti, M. J. Mol. Endocrinol. 2009, 42, 371-379
15. Pucadyil, T. J.; Chattopadhyay, A. Prog. Lipid Res. 2006, 45, 295-333
16. Paila, Y. D.; Tiwari, S.; Chattopadhyay, A. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 295-302
17. Khelashvili, G.; Grossfield, A.; Feller, S. E.; Pitman, M. C.; Weinstein, H. Proteins 2009, 76, 403-417
18. Jafurulla, M.; Tiwari, S.; Chattopadhyay, A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011, 404, 569-573
19. Yao, Z.; Kobilka, B. Anal. Biochem. 2005, 343, 344-346
20. Gimpl, G.; Burger, K.; Fahrenholz, F. Biochemistry 1997, 36, 10959-10974
21. Lyman, E.; Higgs, C.; Kim, B.; Lupyan, D.; Shelley, J. C.; Farid, R.; Voth, G. A. Structure 2009, 17, 1660-1668
22. Doré, A. S.; Robertson, N.; Errey, J. C.; Ng, I.; Hollenstein, K.; Tehan, B.; Hurrell, E.; Bennett, K.; Congreve, M.; Magnani, F.; Tate, C. G.; Weir, M.; Marshall, F. H. Structure 2011, 19, 1283-1293
23. Xu, F.; Wu, H.; Katritch, V.; Han, G. W.; Jacobson, K. A.; Gao, Z.-G.; Cherezov, V.; Stevens, R. C. Science 2011, 332, 322-327
24. Lebon, G.; Warne, T.; Edwards, P. C.; Bennett, K.; Langmead, C. J.; Leslie, A. G. W.; Tate, C. G. Nature 2011, 474, 521-525
25. Hino, T.; Arakawa, T.; Iwanari, H.; Yurugi-Kobayashi, T.; Ikeda-Suno, C.; Nakada-Nakura, Y.; Kusano-Arai, O.; Weyand, S.; Shimamura, T.; Nomura, N.; Cameron, A. D.; Kobayashi, T.; Hamakubo, T.; Iwata, S.; Murata, T. Nature 2012, 482, 237-240
26. Jaakola, V.-P.; Griffith, M. T.; Hanson, M. A.; Cherezov, V.; Chien, E. Y. T.; Lane, J. R.; Ijzerman, A. P.; Stevens, R. C. Science 2008, 322, 1211-1217
27. Lee, J. Y.; Lyman, E. Biophys. J. 2012, 102, 2114-2120
28. Jo, S.; Kim, T.; Iyer, V. G.; Im, W. J. Comput. Chem. 2008, 29, 1859-1865
29. Bowers, K. J.; Chow, E.; Xu, H.; Dror, R. O.; Eastwood, M. P.; Gregersen, B. A.; Klepeis, J. L.; Kolossvary, I.; Moraes, M. A.; Sacerdoti, F. D.; Salmon, J. K.; Shan, Y.; Shaw, D. E. ACM/IEEE Conference on Supercomputing; ACM Press: New York, 2006.
30. Martyna, G. J.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4177-4189
31. Adamian, L.; Naveed, H.; Liang, J. Biochim. Biophys. Acta 2011, 1808, 1092-1102