Structural and spectroscopic properties of water around small hydrophobic solutes

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 116, Issue 38, 2012, Pages 11695-11700

  Montagna, Maria ^a   Sterpone, Fabio ^b   Guidoni, Leonardo ^a  

^a UNIVERSITY OF L'AQUILA   (Italy)

^b CNRS   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HYDROGEN BONDS; HYDROPHOBICITY; METHANE; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULES;

CAR-PARRINELLO MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; GEOMETRICAL PARAMETERS; HYDROGEN BONDING PROPERTIES; HYDROPHOBIC SOLUTES; IN-SHELL; INFRARED SPECTRUM; LIQUID WATER; MOLECULAR DIPOLE MOMENT; SPECTROSCOPIC PROPERTY; STRETCHING REGION; VIBRATIONAL DENSITY OF STATE; WATER MOLECULE;

SHELLS (STRUCTURES);

EID: 84866864020     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp303213m     Document Type: Article

References (47)

1. Scatena, L. F.; Richmond, G. L. J. Phys. Chem. B 2001, 135, 11240
2. Moore, F. G.; Richmond, G. L. Acc. Chem. Res. 2008, 41, 739-748
3. Beaman, D. K.; Robertson, E. J.; Richmond, G. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109 (9) 3226-3231
4. Sharma, M.; Donadio, D.; Schwegler, E.; Galli, G. Nano Lett. 2008, 8, 2959-2962
5. Stirnemann, G.; Rossky, P. J.; Hynes, J. T.; Laage, D. Faraday Discuss. 2010, 146, 263-281
6. Dec, S. F.; Bowler, K. E.; Stadterman, L. L.; Koh, C. A.; Sloan, E. D. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128 (2) 414-415
7. Koh, C. A.; Wisbey, R. P.; Wu, X.; Westacott, R. E.; Soper, A. K. J. Chem. Phys. 2000, 113, 6390
8. Zichi, D. A.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 1985, 83, 797
9. Matysiak, S.; Debenedetti, P. G.; Rossky, P. J. J. Phys. Chem. B 2011, 115 (49) 14859-14865
10. Perera, P. N.; Fega, K. R.; Lawrence, C.; Sundstrom, E. J.; Tomlinson-Phillips, J.; Ben-Amotz, D. J. Chem. Phys. 2009, 106 (30) 12230-12234
11. Cheng, Y. K.; Rossky, P. Nature 1998, 392, 696
12. Rezus, Y. L. A.; Bakker, H. J. Phys. Rev. Lett. 2007, 99, 148301(1)-(4)
13. Bakulin, A. A.; Liang, C.; la Cour Jansen, T.; Wiersma, D. A.; Bakker, H. J.; Pshenichnikov, M. S. Acc. Chem. Res. 2009, 42 (9) 1229
14. Laage, D.; Stirnemann, G.; Hynes, J. T. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 2428-2435
15. Laage, D.; Stirnemann, G.; Sterpone, F.; Hynes, J. T. Acc. Chem. Res. 2012, 45 (1) 53
16. Qvist, J.; Halle, B. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10345-10353
17. Heyden, M.; Sun, J.; Funkner, S.; Mathias, G.; Forbert, H.; Havenith, M.; Marx, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107 (27) 12068
18. Sterpone, F.; Spanu, L.; Ferraro, L.; Sorella, S.; Guidoni, L. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1428
19. Jonchiere, R.; Seitsonen, A. P.; Ferlat, G.; Saitta, A. M.; Vuilleumier, R. J. Chem. Phys. 2011, 135 (15) 154503
20. Lin, I. C.; Seitsonen, A. P.; Continho-Neto, M. D.; Tavernelli, I.; Rothlisberger, U. J. Chem. Phys. B 2009, 113, 1127-1131
21. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. L.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Koll-man., P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179
22. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926
23. Hess, B.; Kutzner, C.; der Spoel, D. V.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435
24. The code CPMD (http://www.cpmd.org) was used (2011).
25. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471
26. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. Phys. Rev. B. 1988, 37, 785
27. Hohenberg, P.; Kohn, W. Phys. Rev. 1964, 136, B864
28. Kohn, W.; Sham, L. J. Phys. Rev. 1965, 140, A1133
29. von Lilienfeld, O. A.; Tavernelli, I.; Rothlisberger, U.; Sebastiani, D. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 153004
30. Troullier, N.; Martins, J. L. Solid State Commun. 1990, 74, 613
31. Nose, S. Mol. Phys. 1985, 52, 255
32. Hoover, W. Phys. Rev. A 1986, 34, 2499
33. Marzari, N.; Vanderbilt, D. Phys. Rev. B 1997, 56, 12847
34. Ramirez, R.; Ciudad, T. L.; Kumar, P. P.; Marx, D. J. Chem. Phys. 2004, 121, 3973
35. Cheng, Y.; Sheu, W. S.; Rossky, P. J. Biophys. J. 1999, 76, 1734-1743
36. Babiaczyk, W. I.; Bonella, S.; Guidoni, L.; Ciccotti, G. J. Phys. Chem. B 2004, 114, 15018
37. Impey, R. W.; Madden, P. A.; McDonald, I. R. J. Phys. Chem. 1983, 87, 5071
38. de Jong, P. H. K.; Wilson, J. E.; Neilson, G. W.; Buckingham, A. D. Mol. Phys. 1997, 91, 99
39. Grossman, J. C.; Schwegler, E.; Galli, G. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 15865
40. Buchanan, P.; Soper, A. K.; Thompson, H.; Westacott, R. E.; Creek, J. L.; Hobson, G.; Koh, C. A. J. Chem. Phys. 2005, 123, 164507
41. Changman, M. P.; Taylor, P. C.; Rodger, P. M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4706-4707
42. Frank, H. S.; Evans, M. W. J. Chem. Phys. 1945, 13, 507-532
43. Silvestrelli, P. L. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 10728
44. Sterpone, F.; Stirnemann, G.; Laage, D. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 4116-9
45. Rossato, L.; Rossetto, F.; Silvestrelli, P. L. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 4552-4560
46. Kuo, I.-F. W.; Mundy, C. J.; McGrath., M. J.; Siepmann, J. I.; VandeVondele, J.; Sprik, M.; Hutter, J.; Klein, M. L.; Mohamed, F.; Krack, M.; Parrinello, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 12990
47. Chavent, M.; Vanel, A.; Tek, A.; Levy, B.; Robert, S.; Raffin, B.; Baaden, M. J. Comput. Chem. 2011, 32, 2924