Modelling peptide-metal dication interactions: Formamide-Ca2+ reactions in the gas phase

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 10, Issue 37, 2012, Pages 7552-7561

  Eizaguirre, Ane ^a   Mó, Otilia ^a   Yáñez, Manuel ^a   Salpin, Jean Yves ^b,c   Tortajada, Jeanine ^b,c  

^a UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MADRID   (Spain)

^b UNIVERSITÉ D EVRY VAL D ESSONNE   (France)

^c CNRS   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

B3LYP CALCULATIONS; BASIS SETS; CARBENES; CHARGE SEPARATIONS; COLLISION INDUCED DISSOCIATION; COULOMB EXPLOSION; DICATIONS; FORMAMIDES; FRAGMENTATION PROCESS; GASPHASE; MOLECULAR CATIONS; MULTI-STEP MECHANISM; NANOELECTROSPRAY IONIZATION; UNIMOLECULAR;

AMIDES; GASES; QUANTUM CHEMISTRY;

CALCIUM;

CALCIUM; FORMAMIDE; FORMAMIDE DERIVATIVE; PEPTIDE;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; GAS; QUANTUM THEORY;

CALCIUM; FORMAMIDES; GASES; MOLECULAR STRUCTURE; PEPTIDES; QUANTUM THEORY;

EID: 84865680709     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2ob26166a     Document Type: Article

References (62)

1. P. G. Jasien W. J. Stevens J. Chem. Phys. 1986 84 3271 3277
2. X. C. Wang J. Nichols M. Feyereisen M. Gutowski J. Boatz A. D. J. Haymet J. Simons J. Phys. Chem. 1991 95 10419 10424
3. J. S. Kwiatkowski J. Leszczynski J. Mol. Struct. 1992 270 67 86
4. J. Tortajada E. Leon J. P. Morizur A. Luna O. Mó M. Yáñez J. Phys. Chem. 1995 99 13890 13898
5. O. N. Ventura J. B. Rama L. Turi J. J. Dannenberg J. Phys. Chem. 1995 99 131 136
6. M. Alcamí O. Mó M. Yáñez A. Luna J. P. Morizur J. Tortajada J. Phys. Chem. A 1998 102 10120 10127
7. A. Luna B. Amekraz J. Tortajada J. P. Morizur M. Alcamí O. Mó M. Yáñez J. Am. Chem. Soc. 1998 120 5411 5426
8. A. Luna J. P. Morizur J. Tortajada M. Alcamí O. Mó M. Yáñez J. Phys. Chem. A 1998 102 4652 4659
9. M. Remko B. M. Rode Chem. Phys. Lett. 2000 316 489 494
10. L. Rodriguez-Santiago J. Tortajada Int. J. Mass Spectrom. 2002 219 429 443
11. J. M. Mercero J. I. Mujika J. M. Matxain X. Lopez J. M. Ugalde Chem. Phys. 2003 295 175 184
12. M. Remko B. M. Rode Struct. Chem. 2004 15 223 232
13. A. Eizaguirre O. Mó M. Yáñez J. Y. Salpin Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 18409 18417
14. J. V. Burda J. Sponer J. Leszczynski P. Hobza J. Phys. Chem. B 1997 101 9670 9677
15. J. Sponer M. Sabat J. V. Burda J. Leszczynski P. Hobza J. Phys. Chem. B 1999 103 2528 2534
16. M. Noguera J. Bertran M. Sodupe J. Phys. Chem. A 2004 108 333 341
17. W. L. Zhu X. M. Luo C. M. Puah X. J. Tan J. H. Shen J. D. Gu K. X. Chen H. L. Jiang J. Phys. Chem. A 2004 108 4008 4018
18. J. Poater M. Sodupe J. Bertran M. Sola Mol. Phys. 2005 103 163 173
19. M. Franska Eur. J. Mass Spectrom. 2007 13 339 346
20. N. Russo M. Toscano A. Grand J. Phys. Chem. A 2003 107 11533 11538
21. C. F. Chapman M. Maroncelli J. Phys. Chem. 1991 95 9095 9114
22. F. Brette K. Komukai C. H. Orchard Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2002 283 H1720 H1728
23. J. Monterrubio G. Ortiz P. M. Orkand C. Zuazaga J. Muscle Res. Cell Motil. 2002 23 167 174
24. S. Despa F. Brette C. H. Orchard D. M. Bers Biophys. J. 2003 85 3388 3396
25. J. R. Brucato G. Strazzulla G. A. Baratta A. Rotundi L. Colangeli Origins Life Evol. Biosphere 2006 36 451 457
26. R. K. Khanna M. S. Lowenthal H. L. Ammon M. H. Moore Astrophys. J. Suppl. 2002 140 457 464
27. M. Winnewisser I. R. Medvedev F. C. De Lucia E. Herbst J. Koput K. Sastry R. A. H. Butler Astrophys. J. Suppl. 2005 159 189 195
28. J. R. Brucato G. A. Baratta G. Strazzulla Astron. Astrophys. 2006 455 395 399
29. B. M. Jones C. J. Bennett R. I. Kaiser Astrophys. J. 2011 734 78
30. D. T. Halfen V. Ilyushin L. M. Ziurys Astrophys. J. 2011 743 60
31. C. L. Perrin Acc. Chem. Res. 1989 22 268 275
32. J. Bertran A. Oliva L. Rodriguez-Santiago M. Sodupe J. Am. Chem. Soc. 1998 120 8159 8167
33. S. Antonczak M. F. Ruiz-Lopez J. L. Rivail J. Am. Chem. Soc. 1994 116 3912 3921
34. G. A. McGibbon P. C. Burgers J. K. Terlouw Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1994 136 191 208
35. H. Sigel Chem. Soc. Rev. 1993 22 255 267
36. A. Eizaguirre A. M. Lamsabhi O. Mó M. Yáñez Theor. Chem. Acc. 2011 128 457 464
37. P. J. Silver J. Dachiw J. M. Ambrose P. B. Pinto J. Pharmacol. Exp. Ther. 1985 234 629 635
38. C. C. Ashley T. J. Lea I. P. Mullingan R. E. Palmer S. J. Simnett Adv. Exp. Med. Biol. 1993 332 97 115
39. A. A. Saboury M. S. Atri M. H. Sanati A. A. Moosavi-Movahedi K. Haghbeen Int. J. Biol. Macromol. 2005 36 305 309
40. I. V. Chernushevich A. V. Loboda B. A. Thomson J. Mass Spectrom. 2001 36 849 865
41. I. Corral O. Mó M. Yáñez A. Scott L. Radom J. Phys. Chem. A 2003 107 10456 10461
42. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 1372 1377
43. C. Lee R. G. Parr Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1990 42 193 200
44. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski and D. J. Fox, GAUSSIAN09 (Revision A.02), Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009
45. M. A. Iron M. Oren J. M. L. Martin Mol. Phys. 2003 101 1345 1361
46. A. Schulz B. J. Smith L. Radom J. Phys. Chem. A 1999 103 7522 7527
47. M. B. Sullivan M. A. Iron P. C. Redfern J. M. L. Martin L. A. Curtiss L. Radom J. Phys. Chem. A 2003 107 5617 5630
48. R. F. W. Bader, Atoms in Molecules. A Quantum Theory, Clarendon Press, Oxford, 1990
49. R. F. W. Bader and J. R. Cheeseman, AIMPAC Programs, 2000
50. A. D. Becke K. E. Edgecombe J. Chem. Phys. 1990 92 5397 5403
51. O. Mó M. Yáñez A. M. Pendas J. E. Del Bene I. Alkorta J. Elguero Phys. Chem. Chem. Phys. 2007 9 3970 3977
52. C. Trujillo O. Mó M. Yáñez B. Silvi J. Chem. Theory Comput. 2008 4 1593
53. S. Noury X. Krokidis F. Fuster B. Silvi Comput. Chem. 1999 23 597 604
54. I. Corral O. Mó M. Yáñez J. Y. Salpin J. Tortajada L. Radom J. Phys. Chem. A 2004 108 10080 10088
55. I. Corral O. Mó M. Yáñez J. Y. Salpin J. Tortajada D. Moran L. Radom Chem.-Eur. J. 2006 12 6787 6796
56. C. Trujillo A. Lamsabhi O. Mó M. Yáñez J. Y. Salpin Int. J. Mass Spectrom. 2011 306 27 36
57. I. Corral, C. Trujillo, J. Y. Salpin and M. Yáñez, in Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics. Vol. 12 Kinetics and Dynamics: From Nano- to Bio-Scale, ed., P. Paneth, and, A. Dybala-Defratyka, Springer, London, 2010, vol. 12
58. C. Trujillo O. Mó M. Yáñez J.-Y. Salpin J. Tortajada ChemPhysChem 2007 8 1330 1337
59. A. Eizaguirre O. Mó M. Yáñez J. Y. Salpin Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 18409 18417
60. C. Trujillo A. M. Lamsabhi O. Mó M. Yáñez J. Y. Salpin Org. Biomol. Chem. 2008 6 3695 3702
61. A. M. Lamsabhi O. Mó M. Yáñez R. J. Boyd J. Chem. Theory Comput. 2008 4 1002 1011
62. A. Eizaguirre O. Mó M. Yáñez R. J. Boyd Org. Biomol. Chem. 2011 9 423 431