Direct Cloning, Genetic Engineering, and Heterologous Expression of the Syringolin Biosynthetic Gene Cluster in E. coli through Red/ET Recombineering

ChemBioChem

Volumn 13, Issue 13, 2012, Pages 1946-1952

  Bian, Xiaoying ^a   Huang, Fan ^b,c   Stewart, Francis A ^b   Xia, Liqiu ^c   Zhang, Youming ^d   Müller, Rolf ^a  

^a SAARLAND UNIVERSITY   (Germany)

^b DRESDEN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Germany)

^c HUNAN NORMAL UNIVERSITY   (China)

^d SAARLAND UNIVERSITY   (Germany)

Author keywords

Biosynthesis; Gene expression; Natural products; Red ET recombineering; Syringolin

Indexed keywords

GENOMIC DNA; PROTEASOME INHIBITOR; SYRINGOLIN A; SYRINGOLIN B; SYRINGOLIN C; SYRINGOLIN D; SYRINGOLIN E; SYRINGOLIN F; SYRINGOLIN G; SYRINGOLIN H; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; BIOSYNTHESIS; CONTROLLED STUDY; ESCHERICHIA COLI; GENE CLUSTER; GENETIC ENGINEERING; HETEROLOGOUS EXPRESSION; HOMOLOGOUS RECOMBINATION; METABOLITE; MOLECULAR CLONING; NONHUMAN; PLASMID; PRIORITY JOURNAL; PROMOTER REGION; PSEUDOMONAS SYRINGAE;

BIOSYNTHETIC PATHWAYS; CLONING, MOLECULAR; ESCHERICHIA COLI; GENETIC ENGINEERING; MULTIGENE FAMILY; PEPTIDES, CYCLIC; PSEUDOMONAS SYRINGAE; UREA;

ESCHERICHIA COLI; PSEUDOMONAS SYRINGAE;

EID: 84865541446     PISSN: 14394227     EISSN: 14397633     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.201200310     Document Type: Article

References (41)

1. R. H. Baltz, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 1533-1540.
2. J. Staunton, K. J. Weissman, Nat. Prod. Rep. 2001, 18, 380-416.
3. M. A. Marahiel, T. Stachelhaus, H. D. Mootz, Chem. Rev. 1997, 97, 2651-2674.
4. M. A. Fischbach, C. T. Walsh, Chem. Rev. 2006, 106, 3468-3496.
5. B. A. Pfeifer, S. J. Admiraal, H. Gramajo, D. E. Cane, C. Khosla, Science 2001, 291, 1790-1792.
6. K. Watanabe, K. Hotta, A. P. Praseuth, K. Koketsu, A. Migita, C. N. Boddy, C. C. Wang, H. Oguri, H. Oikawa, Nat. Chem. Biol. 2006, 2, 423-428.
7. W. S. Jung, S. K. Lee, J. S. J. Hong, S. R. Park, S. J. Jeong, A. R. Han, J. K. Sohng, B. G. Kim, C. Y. Choi, D. H. Sherman, Y. J. Yoon, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2006, 72, 763-769.
8. L. Tang, S. Shah, L. Chung, J. Carney, L. Katz, C. Khosla, B. Julien, Science 2000, 287, 640-642.
9. Y. Chai, S. Shan, K. J. Weissman, S. Hu, Y. Zhang, R. Müller, Chem. Biol. 2012, 19, 361-371.
10. S. C. Wenzel, F. Gross, Y. Zhang, J. Fu, F. A. Stewart, R. Müller, Chem. Biol. 2005, 12, 349-356.
11. F. Gross, M. W. Ring, O. Perlova, J. Fu, S. Schneider, K. Gerth, S. Kuhlmann, A. F. Stewart, Y. Zhang, R. Müller, Chem. Biol. 2006, 13, 1253-1264.
12. Y. Zhang, J. P. P. Muyrers, G. Testa, A. F. Stewart, Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1314-1317.
13. Y. Zhang, J. P. Muyrers, J. Rientjes, A. F. Stewart, BMC Mol. Biol. 2003, 4, 1.
14. Y. Zhang, F. Buchholz, J. P. Muyrers, F. A. Stewart, Nat. Genet. 1998, 20, 123-128.
15. J. Fu, S. C. Wenzel, O. Perlova, J. Wang, F. Gross, Z. Tang, Y. Yin, A. F. Stewart, R. Müller, Y. Zhang, Nucleic Acids Res. 2008, 36, e113.
16. T. M. Binz, S. C. Wenzel, H. J. Schnell, A. Bechthold, R. Müller, ChemBioChem 2008, 9, 447-454.
17. M. Wolpert, L. Heide, B. Kammerer, B. Gust, ChemBioChem 2008, 9, 603-612.
18. O. Perlova, J. Fu, S. Kuhlmann, D. Krug, F. Stewart, Y. Zhang, R. Müller, Appl. Environ. Microbiol. 2006, 72, 7485-7494.
19. J. Fu, X. Bian, S. Hu, H. Wang, F. Huang, P. M. Seibert, A. Plaza, L. Xia, R. Muller, A. F. Stewart, Y. Zhang, Nat. Biotechnol. 2012, 30, 440-446.
20. J. Clerc, M. Groll, D. J. Illich, A. S. Bachmann, R. Huber, B. Schellenberg, R. Dudler, M. Kaiser, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 6507-6512.
21. M. Groll, B. Schellenberg, A. S. Bachmann, C. R. Archer, R. Huber, T. K. Powell, S. Lindow, M. Kaiser, R. Dudler, Nature 2008, 452, 755-758.
22. C. R. Archer, D. L. T. Koomoa, E. M. Mitsunaga, J. Clerc, M. Shimizu, M. Kaiser, B. Schellenberg, R. Dudler, A. S. Bachmann, Biochem. Pharmacol. 2010, 80, 170-178.
23. J. Clerc, B. I. Florea, M. Kraus, M. Groll, R. Huber, A. S. Bachmann, R. Dudler, C. Driessen, H. S. Overkleeft, M. Kaiser, ChemBioChem 2009, 10, 2638-2643.
24. C. S. Coleman, J. P. Rocetes, D. J. Park, C. J. Wallick, B. J. Warn-Cramer, K. Michel, R. Dudler, A. S. Bachmann, Cell Proliferation 2006, 39, 599-609.
25. M. Oka, Y. Nishiyama, S. Ohta, H. Kamei, M. Konishi, T. Miyaki, T. Oki, H. Kawaguchi, J. Antibiot. 1988, 41, 1331-1337.
26. U. Wäspi, D. Blanc, T. Winkler, P. Ruedi, R. Dudler, Mol. Plant-Microbe Interact. 1998, 11, 727-733.
27. U. Wäspi, P. Hassa, A. A. Staempfli, L. P. Molleyres, T. Winkler, R. Dudler, Microbiol. Res. 1999, 154, 89-93.
28. H. Amrein, S. Makart, J. Granado, R. Shakya, J. Schneider-Pokorny, R. Dudler, Mol. Plant-Microbe Interact. 2004, 17, 90-97.
29. H. J. Imker, C. T. Walsh, W. M. Wuest, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 18263-18265.
30. C. Ramel, M. Tobler, M. Meyer, L. Bigler, M. O. Ebert, B. Schellenberg, R. Dudler, BMC Biochem. 2009, 10, 26.
31. J. P. P. Muyrers, Y. Zhang, G. Testa, A. F. Stewart, Nucleic Acids Res. 1999, 27, 1555-1557.
32. D. G. Yu, H. M. Ellis, E. C. Lee, N. A. Jenkins, N. G. Copeland, D. L. Court, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 5978-5983.
33. W. M. Wuest, D. Krahn, M. Kaiser, C. T. Walsh, Org. Lett. 2011, 13, 4518-4521.
34. B. D. Bennett, E. H. Kimball, M. Gao, R. Osterhout, S. J. Van Dien, J. D. Rabinowitz, Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 593-599.
35. J. Sambrook, D. W. Russell in Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2001, Section A2.2.
36. G. Miksch, F. Bettenworth, K. Friehs, E. Flaschel, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005, 69, 312-320.
37. P. R. Jensen, K. Hammer, Appl. Environ. Microbiol. 1998, 64, 82-87.
38. J. Fu, M. Teucher, K. Anastassiadis, W. Skarnes, A. F. Stewart, Methods Enzymol. 2010, 477, 125-144.
39. N. Gaitatzis, A. Hans, R. Müller, S. Beyer, J. Biochem. 2001, 129, 119-124.
40. B. Silakowski, H. U. Schairer, H. Ehret, B. Kunze, S. Weinig, G. Nordsiek, P. Brandt, H. Blöcker, G. Höfle, S. Beyer, R. Müller, J. Biol. Chem. 1999, 274, 37391-37399.
41. W. W. Metcalf, W. H. Jiang, B. L. Wanner, Gene 1994, 138, 1-7.