Photodetachment spectra of deprotonated fluorescent protein chromophore anions

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 116, Issue 30, 2012, Pages 7943-7949

  Mooney, Ciarán R S ^a   Sanz, M Eugenia ^a,b   McKay, Adam R ^a   Fitzmaurice, Richard J ^a   Aliev, Abil E ^a   Caddick, Stephen ^a   Fielding, Helen H ^a  

^a UNIVERSITY COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

^b KING'S COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AUTOIONIZATION; BIOLOGICAL FUNCTIONS; CYAN FLUORESCENT PROTEIN; ELECTRON DONORS; ELECTROSPRAY ION SOURCES; EXCITED ELECTRONIC STATE; FLUORESCENT PROTEIN; GREEN FLUORESCENT PROTEIN; GROUND ELECTRONIC STATE; NEUTRAL RADICAL; PHOTO-DETACHMENT; PHOTODETACHMENT SPECTRUM; PHOTOELECTRON IMAGING; QUANTUM CHEMISTRY CALCULATIONS;

CHROMOPHORES; ELECTRONIC STATES; FLUORESCENCE; ION SOURCES; PHENOLS; PHOTOELECTRON SPECTROSCOPY; PROTEINS; QUANTUM CHEMISTRY;

NEGATIVE IONS;

ANION; GREEN FLUORESCENT PROTEIN; PROTON;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ELECTRON; QUANTUM THEORY; X RAY PHOTOELECTRON SPECTROSCOPY;

ANIONS; ELECTRONS; GREEN FLUORESCENT PROTEINS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; PHOTOELECTRON SPECTROSCOPY; PROTONS; QUANTUM THEORY;

EID: 84864743003     PISSN: 10895639     EISSN: 15205215     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp3058349     Document Type: Article

References (48)

1. Chalfie, M.; Tu, Y.; Euskirchen, G.; Ward, W. W.; Prasher, D. C. Science 1994, 263, 802
2. Inouye, S.; Tsuji, F. I. FEBS Lett. 1994, 341, 277
3. Zimmer, M. Chem. Rev. 2002, 102, 759
4. Misteli, T.; Spector, D. L. Nat. Biotechnol. 1997, 15, 961
5. Chudakov, D. M.; Matz, M. V.; Lukyanov, S.; Lukyanov, K. A. Physiol. Rev. 2010, 90, 1103
6. Yu, Y. A.; Shabahang, S.; Timiryasova, T. M.; Zhang, Q.; Beltz, R.; Gentschev, I.; Goebel, R.; Szalay, A. A. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 313
7. Hoffman, R. M. Nat. Rev. Cancer 2005, 5, 796
8. Miyawaki, A. Neuron 2005, 48, 189
9. Livet, J.; Weissman, T. A.; Kang, H.; Draft, R. W.; Lu, J.; Bennis, R. A.; Sanes, J. R.; Lichtman, J. W. Nature 2007, 450, 56
10. Kanda, T.; Sullivan, K. F.; Wahl, G. M. Curr. Biol. 1998, 8, 377
11. Chattoraj, M.; King, B. A.; Bublitz, G. U.; Boxer, S. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 8362
12. Bonsma, S.; Purchase, R.; Jezowski, S.; Gallus, J.; Konz, F.; Volker, S. ChemPhysChem 2005, 6, 838
13. Forbes, M. W.; Nagy, A. M.; Jockusch, R. A. Int. J. Mass. Spectrom. 2011, 308, 155
14. Nielsen, S. B.; Lapierre, A.; Andersen, J. U.; Pedersen, U. V.; Tomita, S.; Andersen, L. H. Phys. Rev. Lett. 2001, 87, 228102
15. Andersen, L. H.; Bluhme, H.; Boye, S.; Jorgensen, T. J. D.; Krogh, H.; Nielsen, I. B.; Nielsen, S. B.; Svendsen, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2617
16. Andersen, L. H.; Lapierre, A.; Nielsen, S. B.; Nielsen, I. B.; Pedersen, S. U.; Pedersen, U. V.; Tomita, S. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 597
17. Horke, D. A.; Verlet, J. R. R. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 8511
18. Toker, Y.; Rahbek, D.; Klærke, B.; Bochenkova, A. V.; Andersen, L. H. Private communication.
19. Bogdanov, A. M.; Mishin, A. S.; Yampolsky, I. V.; Belousov, V. V.; Chudakov, D. M.; Subach, F. V.; Verkhusha, V. V.; Lukyanov, S.; Lukyanov, K. A. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 459
20. Epifanovsky, E.; Polyakov, I.; Grigorenko, B.; Nemukhin, A.; Krylov, A. I. J. Chem. Phys. 2010, 132, 115104
21. Tsien, R. Y. Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 509
22. Lossau, H.; Kummer, A.; Heinecke, R.; Pollinger-Dammer, F.; Kompa, C.; Bieser, G.; Jonsson, T.; Silva, C. M.; Yang, M. M.; Youvan, D. C.; Michel-Beyerle, M. E. Chem. Phys. 1996, 213, 1
23. Niwa, H.; Inouye, S.; Hirano, T.; Matsuno, T.; Kojima, S.; Kubota, M.; Ohashi, M.; Tsuji, F. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 13617
24. Forbes, M. W.; Jockusch, R. A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17038
25. Conyard, J.; Kondo, M.; Heisler, I. A.; Jones, G.; Baldridge, A.; Tolbert, L. M.; Solntsev, K. M.; Meech, S. R. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 1571
26. Dong, J.; Solntsev, K. M.; Tolbert, L. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12038
27. Bravaya, K. B.; Khrenova, M. G.; Grigorenko, B. L.; Nemukhin, A. V.; Krylov, A. I. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 8296
28. Boye, S. V.; Nielsen, I. B.; Nielsen, S. B.; Krogh, H.; Lapierre, A.; Pedersen, H. B.; Pedersen, S. U.; Pedersen, U. V.; Andersen, L. H. J. Chem. Phys. 2003, 119, 338
29. Weber, W.; Helms, V.; McCammon, J. A.; Langhoff, P. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 6177
30. Martin, M. E.; Negri, F.; Olivucci, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5452
31. Olsen, S.; Smith, S. C. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 8677
32. Epifanovsky, E.; Polyakov, I.; Grigorenko, B.; Nemukhin, A.; Krylov, A. I. J. Chem. Theor. & Comp. 2009, 5, 1895
33. Sawin, K. E.; Nurse, P. Curr. Biol. 1997, 7, R606
34. Elowitz, M. B.; Surette, M. G.; Wolf, P. E.; Stock, J.; Leibler, S. Curr. Biol. 1997, 7, 809
35. McKay, A. R.; Sanz, M. E.; Mooney, C. R. S.; Minns, R. S.; Gill, E. M.; Fielding, H. H. Rev. Sci. Instrum. 2010, 81, 123101
36. Eppink, A. T. J. B.; Parker, D. H. Rev. Sci. Instrum. 1997, 68, 3477
37. Voliani, V.; Bizzarri, R.; Nifosì, R.; Abbruzzetti, S.; Grandi, E.; Viappiani, C.; Beltram, F. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 10714
38. Garcia, G. A.; Nahon, L.; Powis, I. Rev. Sci. Instrum. 2004, 75, 4989
39. Arnold, D. W.; Bradforth, S.; Kim, E.; Neumark, D. J. Chem. Phys. 1992, 97, 9468
40. Zheng, W. J.; Nilles, J. M.; Thomas, O. C.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 044306
41. Yang, X.; Wang, X. B.; Vorpagel, E. R.; Wang, L. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 17588
42. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Robb, M. A.; Scuseria, G. E.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, J. A., Jr.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, J. M.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, O.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. In Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.
43. Tao, J.; Perdew, J. P.; Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 146401
44. Mozhayskiy, V. A.; Krylov, A. I. ezSpectrum version 3.0, 2012, http://iopenshell.usc.edu/downloads/
45. Gunion, R.; Gilles, M.; Polak, M.; Lineberger, W. Int. J. Mass. Spectrom. Ion Processes 1992, 117, 601
46. Flores-Moreno, R.; Melin, J.; Dolgounitcheva, O.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V. Int. J. Quantum Chem. 2010, 110, 706
47. Zuev, D.; Bravaya, K. B.; Makarova, M. V.; Krylov, A. I. J. Chem. Phys. 2011, 135, 194304
48. Meech, S. R. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 2922